BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-106G22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 126,679,736 - 126,808,423
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSfpq, Zmym1, LOC665245, Zmym6, LOC100039968
Upstream geneCsf3r, Mrps15, 1810007P19Rik, LOC100039645, Lsm10, Stk40, 2610027C15Rik, 1700029G01Rik, Thrap3, Mtap7d1, Trappc3, Col8a2, EG667193, Adprhl2, Tekt2, Eif2c3, Eif2c1, LOC100039351, Eif2c4, Clspn, LOC665197, 5730409E04Rik, LOC620877, Psmb2, Tcfap2e, Ncdn, AU040320
Downstream geneLOC621588, Dlgap3, BC003266, Gja4, Gjb3, Gjb4, Gjb5, LOC667296, LOC635169
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-106G22.bB6Ng01-106G22.g
ACCDH914175DH914176
length1,122985
definitionDH914175|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106G22, 5' end.DH914176|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-106G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,807,281 - 126,808,423)(126,679,736 - 126,680,724)
sequence
gaattccattcctcctcatcagtgatcggtttaaggattgaaatataact
tcattctgtcgttagatataaggaatgacctggggttttctgaaagcttt
ccattctctacttacccttggatatcacatgcaaacataccaccttgagc
tgcagctatttttacaactctgaaggcagtcgccaataaattgatgggtg
aaagaatggatgttggaccttgatgtcttcatgaagtagcccagttaacc
aatgctgaaactaaatcatctctggaccagagagagagacagagagactg
actaagagaatgagtgtaccacagggcatgtgagagtcagaagacaatct
tccagagctggttctatctttccactatgtaggtcctggatgaaatgggt
catcaggcttggcagcaatcacccttatccagaattatctcattagtccc
ctgctatgatgttgtcacataatttatgatgggcctgtctattgagctct
acccttgctgttggtgaagcacatcactgtgctttcagacccaagaagat
ccaactaagaattatcagcttgcccgaggttcatgcaagcatgggcacag
cagaaactaccattcagcactgagcatgaagtggactatcaaaactttcg
cctgtgttccctaaagctaaattcctatgcccaaaatgtcatctaggcgg
gtagttaaaatgtgcatagataaaactctagctagccccagtgcaggcct
ttaatcccagctactggagagactgagactgaaggatccaagtgcaaggc
ttgttcaagaccagcgtaggcaacttagtgagaccttgtctcagaataaa
agacaaggggcgaggctcagaagatctgtgcgtgcctctcgtgtgtgatg
cttcagagctgcaaaacagaaaatcttctacttcactaccttttctcata
gaagaaacatcatttcccaaaaggacacagtggacccgggcagagggcct
ggggacacacacaagggctcaacattttcccatgggcactgtgctttctt
cctcctccctatcacctcacaccaccccctcccacatcacatcaagcagc
tgaattaaaaactgctgagcca
gaattcagcatagcgacacactattggcttattcaaacattaacagaaag
attacagggcatcaggactttgttcctgtgggctgggggcttatctttgt
tcacatagcaaccagttgatgtatgactttacccggcgccaagtggcaat
agacagaggggaggttccggccagatggtgtcgactcagacaagatagcc
ttgcctgtgcgtccttgcattctttttcatctttacagtcaagagccctg
ccctggcatccgggctcatggacaactcttttacatgaatcacaagttac
aaaatctcattttccttcaatacacagacatacatgcatatatatataca
tatatatatggaatttaaaaaaacaaataaaaaacatatgcctgaacata
ttcatgtaaccaatgtgtggtaagaatcccatcaatttggttcaatttat
ttcttcaccttcttatcctataaactggtatgcaccaggactggagagat
ggttcaacaattaagggcatgtgctgctattccaaaggaccttaattcaa
ttcccagcacctatgttgggcaacttatagccacctgtgacccccaactc
cagggcaccagaccccaccttttggccttctgagagcacctgcatatata
catgcacgcatgcacacacacctatgcatacaatgtacctcataacccac
tttatcatctcaattagtattgaagtgttctttagtgagatgtagtgaaa
atactactcttgggaaagcagaggcaggagaattaggagttcaaggtcat
cttctacatgtttttaaattttaaaaaatatttaaaaacaaaatccaaaa
agcatcccaaggagtctgggagggggtggtggtttcattagaaccctaag
ctcaagagcagagtattgttaaagtttgaggccagcctaggctttatagt
gggtcttagtggttagagtgttcattagtggggct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_126807281_126808423
seq2: B6Ng01-106G22.b_48_1169 (reverse)

seq1  TGGCTCAGCAGTCTCTCTAAATCCAGCTGTCTTGGTGGTGGTGGTGGGGG  50
      ||||||||||||   | | ||| |||||| |||| |    ||| || |||
seq2  TGGCTCAGCAGT---TTTTAATTCAGCTG-CTTGAT----GTGATGTGGG  42

seq1  GGGGGTGGTGGTGGGAGGGTGATAAAGGGGAGAGAGAAAGGAAAGGCACA  100
       |||  ||||||| || |||||||   ||||| ||| |||  || |||| 
seq2  AGGG--GGTGGTGTGA-GGTGATA---GGGAG-GAGGAAG--AAAGCAC-  82

seq1  AGTGCCCATGGGGAAAATGTTGAGCCCCTTGTGTTGTGTCCCCAGGCCCT  150
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCAT-GGGAAAATGTTGAG-CCCTTGTG-TGTGTCCCCAGGCCCT  129

seq1  CTGCCCGGGTCCACTGGTGTCCTTTTGGGAAATGATGTTTCTTCTATGAG  200
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCGGGTCCACT-GTGTCCTTTTGGGAAATGATGTTTCTTCTATGAG  178

seq1  AAAAGGTAGTGAAGTAGAAGATTTTCTGTTTTGCAGCTCTGAAGCATCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTAGTGAAGTAGAAGATTTTCTGTTTTGCAGCTCTGAAGCATCAC  228

seq1  ACACGAGAGGCACGCACAGATCTTCTGAGCCTCGCCCCTTGTC-TTTATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ACACGAGAGGCACGCACAGATCTTCTGAGCCTCGCCCCTTGTCTTTTATT  278

seq1  CTGAGACAAGGTCTCACTAAGTTGCCTACGCTGGTCTTGAACAAGCCTTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGACAAGGTCTCACTAAGTTGCCTACGCTGGTCTTGAACAAGCCTTG  328

seq1  CACTTGGATCCTTCAGTCTCAGTCTCTCCAGTAGCTGGGATTAAAGGCCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGATCCTTCAGTCTCAGTCTCTCCAGTAGCTGGGATTAAAGGCCT  378

seq1  GCACTGGGGCTAGCTAGAGTTTTATCTATGCACATTTTAACTACCCGCCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGGGGCTAGCTAGAGTTTTATCTATGCACATTTTAACTACCCGCCT  428

seq1  AGATGACATTTTGGGCATAGGAATTTAGCTTTAGGGAACACAGGCGAAAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACATTTTGGGCATAGGAATTTAGCTTTAGGGAACACAGGCGAAAG  478

seq1  TTTTGATAGTCCACTTCATGCTCAGTGCTGAATGGTAGTTTCTGCTGTGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATAGTCCACTTCATGCTCAGTGCTGAATGGTAGTTTCTGCTGTGC  528

seq1  CCATGCTTGCATGAACCTCGGGCAAGCTGATAATTCTTAGTTGGATCTTC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCTTGCATGAACCTCGGGCAAGCTGATAATTCTTAGTTGGATCTTC  578

seq1  TTGGGTCTGAAAGCACAGTGATGTGCTTCACCAACAGCAAGGGTAGAGCT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTCTGAAAGCACAGTGATGTGCTTCACCAACAGCAAGGGTAGAGCT  628

seq1  CAATAGACAGGCCCATCATAAATTATGTGACAACATCATAGCAGGGGACT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGACAGGCCCATCATAAATTATGTGACAACATCATAGCAGGGGACT  678

seq1  AATGAGATAATTCTGGATAAGGGTGATTGCTGCCAAGCCTGATGACCCAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGATAATTCTGGATAAGGGTGATTGCTGCCAAGCCTGATGACCCAT  728

seq1  TTCATCCAGGACCTACATAGTGGAAAGATAGAACCAGCTCTGGAAGATTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCCAGGACCTACATAGTGGAAAGATAGAACCAGCTCTGGAAGATTG  778

seq1  TCTTCTGACTCTCACATGCCCTGTGGTACACTCATTCTCTTAGTCAGTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGACTCTCACATGCCCTGTGGTACACTCATTCTCTTAGTCAGTCT  828

seq1  CTCTGTCTCTCTCTCTGGTCCAGAGATGATTTAGTTTCAGCATTGGTTAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTCTCTCTCTCTGGTCCAGAGATGATTTAGTTTCAGCATTGGTTAA  878

seq1  CTGGGCTACTTCATGAAGACATCAAGGTCCAACATCCATTCTTTCACCCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTACTTCATGAAGACATCAAGGTCCAACATCCATTCTTTCACCCA  928

seq1  TCAATTTATTGGCGACTGCCTTCAGAGTTGTAAAAATAGCTGCAGCTCAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTTATTGGCGACTGCCTTCAGAGTTGTAAAAATAGCTGCAGCTCAA  978

seq1  GGTGGTATGTTTGCATGTGATATCCAAGGGTAAGTAGAGAATGGAAAGCT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTATGTTTGCATGTGATATCCAAGGGTAAGTAGAGAATGGAAAGCT  1028

seq1  TTCAGAAAACCCCAGGTCATTCCTTATATCTAACGACAGAATGAAGTTAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAAACCCCAGGTCATTCCTTATATCTAACGACAGAATGAAGTTAT  1078

seq1  ATTTCAATCCTTAAACCGATCACTGATGAGGAGGAATGGAATTC  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAATCCTTAAACCGATCACTGATGAGGAGGAATGGAATTC  1122

seq1: chr4_126679736_126680724
seq2: B6Ng01-106G22.g_66_1050

seq1  GAATTCAGCATAGCGACACACTATTGGCTTATTCAAACATTAACAGAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCATAGCGACACACTATTGGCTTATTCAAACATTAACAGAAAG  50

seq1  ATTACAGGGCATCAGGACTTTGTTCCTGTGGGCTGGGGGCTTATCTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACAGGGCATCAGGACTTTGTTCCTGTGGGCTGGGGGCTTATCTTTGT  100

seq1  TCACATAGCAACCAGTTGATGTATGACTTTACCCGGCGCCAAGTGGCAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATAGCAACCAGTTGATGTATGACTTTACCCGGCGCCAAGTGGCAAT  150

seq1  AGACAGAGGGGAGGTTCCGGCCAGATGGTGTCGACTCAGACAAGATAGCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGGGGAGGTTCCGGCCAGATGGTGTCGACTCAGACAAGATAGCC  200

seq1  TTGCCTGTGCGTCCTTGCATTCTTTTTCATCTTTACAGTCAAGAGCCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTGTGCGTCCTTGCATTCTTTTTCATCTTTACAGTCAAGAGCCCTG  250

seq1  CCCTGGCATCCGGGCTCATGGACAACTCTTTTACATGAATCACAAGTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCATCCGGGCTCATGGACAACTCTTTTACATGAATCACAAGTTAC  300

seq1  AAAATCTCATTTTCCTTCAATACACAGACATACATGCATATATATATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTCATTTTCCTTCAATACACAGACATACATGCATATATATATACA  350

seq1  TATATATATGGAATTTAAAAAAACAAATAAAAAACATATGCCTGAACATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATGGAATTTAAAAAAACAAATAAAAAACATATGCCTGAACATA  400

seq1  TTCATGTAACCAATGTGTGGTAAGAATCCCATCAATTTGGTTCAATTTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGTAACCAATGTGTGGTAAGAATCCCATCAATTTGGTTCAATTTAT  450

seq1  TTCTTCACCTTCTTATCCTATAAACTGGTATGCACCAGGACTGGAGAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCACCTTCTTATCCTATAAACTGGTATGCACCAGGACTGGAGAGAT  500

seq1  GGTTCAACAATTAAGGGCATGTGCTGCTATTCCAAAGGACCTTAATTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAACAATTAAGGGCATGTGCTGCTATTCCAAAGGACCTTAATTCAA  550

seq1  TTCCCAGCACCTATGTTGGGCAACTTATAGCCACCTGTGACCCCCAACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGCACCTATGTTGGGCAACTTATAGCCACCTGTGACCCCCAACTC  600

seq1  CAGGGCACCAGACCCCACCTTTTGGCCTTCTGAGAGCACCTGCATATATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCACCAGACCCCACCTTTTGGCCTTCTGAGAGCACCTGCATATATA  650

seq1  CATGCACGCATGCACACACACCTATGCATACAATGTACCTCATAACCCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCACGCATGCACACACACCTATGCATACAATGTACCTCATAACCCAC  700

seq1  TTTATCATCTCAATTAGTATTGAAGTGTTCTTTAGTGAGATGTAGTGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCATCTCAATTAGTATTGAAGTGTTCTTTAGTGAGATGTAGTGAAA  750

seq1  ATACTACTCTTGGGAAAGCAGAGGCAGGAGAATTAGGAGTTCAAGGTCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTACTCTTGGGAAAGCAGAGGCAGGAGAATTAGGAGTTCAAGGTCAT  800

seq1  CTTCTACATGTTTTTAAATTTTAAAAAATATTTAAAAACAAAATCCAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTACATGTTTTTAAATTTTAAAAAATATTTAAAAACAAAATCCAAAA  850

seq1  AGCATCCCAAAGGAGTCTGGGA-GGGGTGGTGG-TTCATTAGAACCCTAA  898
      |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AGCATCCC-AAGGAGTCTGGGAGGGGGTGGTGGTTTCATTAGAACCCTAA  899

seq1  GGCTCAGGAGGCAAGAGTATTGTTAAAAGTTTGAGGCCAGCCTAGGCTTT  948
       ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  -GCTCAAGAG--CAGAGTATTGTT-AAAGTTTGAGGCCAGCCTAGGCTTT  945

seq1  ATAGTGGGTCTTAGTGGTTAAGAGTGTTCATTAGTGGGGCT  989
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGGGTCTTAGTGGTT-AGAGTGTTCATTAGTGGGGCT  985