BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-112B15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 136,364,482 - 136,492,864
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEphb2, C1qb, C1qc, C1qa, Epha8
Upstream geneMyom3, Fusip1, Pnrc2, Cnr2, Fuca1, Hmgcl, Gale, Lypla2, 1110049F12Rik, LOC669445, Tceb3, Rpl11, Id3, E2f2, Ddefl1, Tcea3, Zfp46, Hnrpr, Htr1d, LOC100042540, Luzp1, Aof2, LOC667080, LOC433770, 4930549C01Rik, BC029684
Downstream geneZbtb40, Wnt4, Cdc42, LOC665533, LOC242711, Ela3, 1700013G24Rik, Hspg2, Ldlrad2, Usp48, Rap1gap, Akp2, Ece1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-112B15.bB6Ng01-112B15.g
ACCDH918260DH918261
length7061,007
definitionDH918260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112B15, 5' end.DH918261|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-112B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,492,159 - 136,492,864)(136,364,482 - 136,365,482)
sequence
gaattcatgttgattgtcttgcctccaccccatgtgttgggattgcaggt
gggagccatcatccccagctcacttcattgtttggccttgggtatagctc
taagtgaccttcaagcatacttgggagagagcaccgagtacctgcagata
aagccaagggttggggacagggcacctcctgtgaccaaagaatccctgaa
catacacaggcctgctcacctcctgcccctcgctgtccagagctgcccca
gccaggactccagcccagagtccttcctcaagcaaggctgaggcccagct
gcatccagacctctacttggggtggaggccctgggtgtaactagagctga
aactggccccgaggaatgacccaagaggcaaccagtgcctctccaggata
tggggctgcagactgtcttggtgtagaaacaggagggtcgacgagctgag
cctgggaaagactgggcagaggcctgggcttggcccatgctgggcctgat
gggtagctgccaccccagccccgtcccaggtggtggtgatccggcaggag
cgggctgggcagaccagcgtgtcactcctgtggcaggaaccagaacagcc
caacggcgtcattctggagtacgagatcaagtactacgagaaggtttgcg
aaagttctggaggtgggtgggtgaggagccaccagggagccttgggcagt
gaggag
gaattcaaaaccacaaactcccgggcagtcctctgcagcctgagcccttt
ctgcagagtcaggctgtgagtcagggcagagccatgctgggctggaggag
gggcacgctcctctcggctctcccactgccccagttgtgacgctttgctc
tggagggaaccagcttggggtggataccaggatgcccaggtggatgggcg
tgtcttcaatacggggcttttctccgagctgagcatccctgcagcctcag
agagaccagtcagtggtgtttggctcagaaacatatgaggaacataatgg
aggaagtgcgcaaggagaaagaacaagggtcacagggtgactgcagcacg
tttggtagagtgcctagcgtacatgagaccctggattctacccctagtta
tacagcataaactagatgtgatggcctgtgcttgtaatctagcaatccca
gcactccagaggcagagagagaagaatcactaattcaagatcatacttgg
ctacacatggaggctgatgctagcctaaactacatgagactctgacttta
tatatacatacatgcacatatattatacatatgcatacatacatacatac
atacatacatacatacatacatacatacatacatctgtgtatgtttgtgt
atatttatctctagaaattactgggacccaagtgtggcccatggtgcaac
ggagcctccaagagcatgcaggctcatggccaacccaaccttcctgacgt
ggttccagggtgaccttcagatgacaaggaagcatcctgacctcgtgaac
acctctcctacgtgcccatgccaccttcaaagcttgcagccagcctcacc
tcccaaagctctgcagcacaagtcctgacacacggtagattttcagcaag
caactgtttagtacggggacaaataagtgactaaacaggcaacgggacgt
atgttgttaaatcgtcactggtacggatggatggggtgagtggacggacg
agtggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_136492159_136492864
seq2: B6Ng01-112B15.b_44_749 (reverse)

seq1  CTCCTCACTGCCCACGGCTCCCTGGTGGCTCCTCACCCACCCACCTCCAG  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCACTGCCCAAGGCTCCCTGGTGGCTCCTCACCCACCCACCTCCAG  50

seq1  AACTTTCGCAAACCTTCTCGTAGTACTTGATCTCGTACTCCAGAATGATG  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AACTTTCGCAAACCTTCTCGTAGTACTTGATCTCGTACTCCAGAATGACG  100

seq1  CCGTTGGGCTGCTCTGGTTCCTGCCACAGGAGTGACACGCTGGTCTGCCC  150
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTTGGGCTGTTCTGGTTCCTGCCACAGGAGTGACACGCTGGTCTGCCC  150

seq1  AGCCCGCTCCTGCCGGATCACCACCACCTGGGACGGGGCTGGGGTGGCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCGCTCCTGCCGGATCACCACCACCTGGGACGGGGCTGGGGTGGCAG  200

seq1  CTACCCATCAGGCCCAGCATGGGCCAAGCCCAGGCCTCTGCCCAGTCTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCCATCAGGCCCAGCATGGGCCAAGCCCAGGCCTCTGCCCAGTCTTT  250

seq1  CCCAGGCTCAGCTCGTCGACCCTCCTGTTTCTACACCAAGACAGTCTGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCTCAGCTCGTCGACCCTCCTGTTTCTACACCAAGACAGTCTGCA  300

seq1  GCCCCATATCCTGGAGAGGCACTGGTTGCCTCCTGGGTCATTCCTCGGGG  350
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GCCCCATATCCTGGAGAGGCACTGGTTGCCTCTTGGGTCATTCCTCGGGG  350

seq1  CCAGTTTCAGCTCTAGTTACACCCAGGGCCTCCACCCCAAGTAGAGGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTTTCAGCTCTAGTTACACCCAGGGCCTCCACCCCAAGTAGAGGTCT  400

seq1  GGATGCAGCTGGGCCTCAGCCTTGCTTGAGGAAGGACTCTGGGCTGGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCAGCTGGGCCTCAGCCTTGCTTGAGGAAGGACTCTGGGCTGGAGT  450

seq1  CCTGGCTGGGGCAGCTCTGGACAGCGAGGGGCAGGAGGTGAGCAGGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTGGGGCAGCTCTGGACAGCGAGGGGCAGGAGGTGAGCAGGCCTG  500

seq1  TGTATGTTCAGGGATTCTTTGGTCACAGGAGGTGCCCTGTCCCCAACCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTTCAGGGATTCTTTGGTCACAGGAGGTGCCCTGTCCCCAACCCT  550

seq1  TGGCTTTATCTGCAGGTACTCGGTGCTCTCTCCCAAGTATGCTTGAAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTATCTGCAGGTACTCGGTGCTCTCTCCCAAGTATGCTTGAAGGT  600

seq1  CACTTAGAGCTATACCCAAGGCCAAACAATGAAGTGAGCTGGGGATGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGAGCTATACCCAAGGCCAAACAATGAAGTGAGCTGGGGATGATG  650

seq1  GCTCCCACCTGCAATCCCAACACTTGGGGTGGAGGCAAGACAATCAACAT  700
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCACCTGCAATCCCAACACATGGGGTGGAGGCAAGACAATCAACAT  700

seq1  GAATTC  706
      ||||||
seq2  GAATTC  706

seq1: chr4_136364482_136365482
seq2: B6Ng01-112B15.g_66_1072

seq1  GAATTCAAAACCACAAACTCCCGGGCAGTCCTCTGCAGCCTGAGCCCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAACCACAAACTCCCGGGCAGTCCTCTGCAGCCTGAGCCCTTT  50

seq1  CTGCAGAGTCAGGCTGTGAGTCAGGGCAGAGCCATGCTGGGCTGGAGGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAGTCAGGCTGTGAGTCAGGGCAGAGCCATGCTGGGCTGGAGGAG  100

seq1  GGGCACGCTCCTCTCGGCTCTCCCACTGCCCCAGTTGTGACGCTTTGCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCACGCTCCTCTCGGCTCTCCCACTGCCCCAGTTGTGACGCTTTGCTC  150

seq1  TGGAGGGAACCAGCTTGGGGTGGATACCAGGATGCCCAGGTGGATGGGCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGGAACCAGCTTGGGGTGGATACCAGGATGCCCAGGTGGATGGGCG  200

seq1  TGTCTTCAATACGGGGCTTTTCTCCGAGCTGAGCATCCCTGCAGCCTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCAATACGGGGCTTTTCTCCGAGCTGAGCATCCCTGCAGCCTCAG  250

seq1  AGAGACCAGTCAGTGGTGTTTGGCTCAGAAACATATGAGGAACATAATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCAGTCAGTGGTGTTTGGCTCAGAAACATATGAGGAACATAATGG  300

seq1  AGGAAGTGCGCAAGGAGAAAGAACAAGGGTCACAGGGTGACTGCAGCACG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTGCGCAAGGAGAAAGAACAAGGGTCACAGGGTGACTGCAGCACG  350

seq1  TTTGGTAGAGTGCCTAGCGTACATGAGACCCTGGATTCTACCCCTAGTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTAGAGTGCCTAGCGTACATGAGACCCTGGATTCTACCCCTAGTTA  400

seq1  TACAGCATAAACTAGATGTGATGGCCTGTGCTTGTAATCTAGCAATCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCATAAACTAGATGTGATGGCCTGTGCTTGTAATCTAGCAATCCCA  450

seq1  GCACTCCAGAGGCAGAGAGAGAAGAATCACTAATTCAAGATCATACTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCCAGAGGCAGAGAGAGAAGAATCACTAATTCAAGATCATACTTGG  500

seq1  CTACACATGGAGGCTGATGCTAGCCTAAACTACATGAGACTCTGACTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACATGGAGGCTGATGCTAGCCTAAACTACATGAGACTCTGACTTTA  550

seq1  TATATACATACATGCACATATATTATACATATG----CATACATACATAC  596
      |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
seq2  TATATACATACATGCACATATATTATACATATGCATACATACATACATAC  600

seq1  ATACATACATACATACATACATACATACATACATCTGTGTATGTTTGTGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATACATACATACATACATACATACATCTGTGTATGTTTGTGT  650

seq1  ATATTTATCTCTAGAAATTACTGGGACCCAAGTGTGGCCCATGGTGCAAC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTATCTCTAGAAATTACTGGGACCCAAGTGTGGCCCATGGTGCAAC  700

seq1  GGAGCCTCCAAGAGCATGCAGGCTCATGGCCAACCCAACCTTCCTGACGT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCTCCAAGAGCATGCAGGCTCATGGCCAACCCAACCTTCCTGACGT  750

seq1  GGTTCCAGGGTGACCTTCAGATGACAAGGAAGCATCCTGACCTCGTGAAC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCAGGGTGACCTTCAGATGACAAGGAAGCATCCTGACCTCGTGAAC  800

seq1  ACCTCTCCTACGTGCCCATGCCACCTTCAAAGCTTGCAGCCAGCCTCACC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCCTACGTGCCCATGCCACCTTCAAAGCTTGCAGCCAGCCTCACC  850

seq1  TCCCAAAGCTCTGCAGCACAAG-CCTGACACACGGTAGATTTTCAGCAAG  895
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAAGCTCTGCAGCACAAGTCCTGACACACGGTAGATTTTCAGCAAG  900

seq1  CAACTGTTTAGTACGGGGACAAATAAGTGACTAAAACAGGCAACGGGACG  945
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CAACTGTTTAGTACGGGGACAAATAAGTGACT-AAACAGGCAACGGGACG  949

seq1  TATGTGTTAAAATCGTCACTGG-ACGGATGGAT-GGGTGAGTGGACGGAC  993
      |||||  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TATGTTGTTAAATCGTCACTGGTACGGATGGATGGGGTGAGTGGACGGAC  999

seq1  GAGTGGAT  1001
      ||||||||
seq2  GAGTGGAT  1007