BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113F05
Chromosome4 (Build37)
Map Location 72,544,062 - 72,631,724
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG384113
Upstream geneTle1, Aldoa-ps2
Downstream geneLOC667713, LOC100039698, OTTMUSG00000001246, LOC100039726, LOC667722, LOC623115, OTTMUSG00000000281, OTTMUSG00000000280, OTTMUSG00000000282, OTTMUSG00000000283, Gm428, Rasef, LOC667768, LOC545637, LOC623272, OTTMUSG00000014862, OTTMUSG00000004010, 2310002L09Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113F05.bB6Ng01-113F05.g
ACCDH919150DH919151
length1,0521,120
definitionDH919150|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113F05, 5' end.DH919151|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113F05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,630,675 - 72,631,724)(72,544,062 - 72,545,194)
sequence
gaattctttgaaaaattctttgaaaacaaaaggaaattctctccttttgt
tttctttgaaaatttatacacacctacactatattataatcacaattaac
cctctttccctcacaattttatgttatcttcctttctggttcttgatact
ttactaactccattaagtgctgtccctttattcatacaggtgtgtggtca
tctactgaggcatagtctccctaccagtgatcataaaaccaaagaaaaat
gattattctgagatcgaatccatagctaacatcaactgctattaactcat
taggttgtggaaggatcaggtaagatcctacaacatctattttgggaatt
ttactggattgatcttgtatttattggactgttcctctgttatcttgtgc
agggaatagaagttgttgtgaacccatgagtgcaatagctactgcacatc
cagaaaacacaggacatttctctattctctagttcttatattccttgacc
tccattaatttaatgttatctgaggcttggggtacaagtagtggatagat
ataaatatcacattgaaagctgagcacccacagtcaataattattataat
tattagcattgaccagttatgactacacactcataatgctgcctaatgca
aaaagaaatttctctaaccaaggttgaaagtggtccagatattgttcttg
cattatattgcatgttgttccatgagccttggttgaggtgttatgaatgt
tttgtttaagagaaaccacttaagtaatcacttattttctgtgacttgaa
cagatataattctctgtgttcattatatttcattatgtgcagaagttttc
tctgattaagacagagtatagcgtttgtaatgaatattataatcatcatg
tgttcacattttctgctattacagcactcactttttgctagccccaaccc
tttgaacatcccacataccaatgatccttttcattttctagatactccag
tttaaaagcatatgtatatatatatatatattataaaatatatattaata
aa
gaattcaagagaacagagagaaagagtagcatgaaaatactgagcaccat
taagtttcatgatagttttgtgtaggatagtgttggaaaggcattctatt
ttactaaccaattgatgtttctataacattttgaatatgctgtcttattt
tcacccatatagttgattttatttttgttttagcaaggttagttaaactt
tctatcatatatatttatttaatatttatcagggcactgtatatataaat
ttataattgatttggaaattaaaagcattataaggtacatagaaacacat
ttaagcttattgttaaatgtattttaatttttaaacaatgattttgtgag
tttctattcagagcaagagagggtgctaagaatttggggaagtgtttttc
atacttgttagatacattatttcaacttgctttcagtccataaggtggat
ccattccaaatactaataatatctcagcaagctgccttatctctggaatc
agttcagttagtgggaggagactgaggaaggctgtctgattcacctgcct
tctagcctattgcatcatccttgacagagagatgtctgtatagcacaatc
ttctttggggatcaggttctctctttggagtaaacccagcttaagagcat
tggaagtagtgaatgcaggctgcccttactcattcaagccaaaacagggc
agagctatagttactgatctttcatacttcttagcaaagacaacatcctt
tctgctcatgatttttccagttatctcctttataaaattcagcaaacact
gatctttttaaaatgtaccatcactaacagactggatatgaacttatgct
aagtaaatcagaaggtcactaccggacaagaaaggaatgctttaaaatat
atcagaagaaagactacttgtgaagtggaatagttaagatgtatgtaggt
tctatagatgctcagccctgcttacttctaataacagtgactacttatca
ctggaaattacttgaatttcagtatcttaaatggcaaaataagaggacaa
gtaggtgtggtttagatgctggtctaagatcaggcatgtggatcagtgtc
tcttgagggttgcgaaagtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_72630675_72631724
seq2: B6Ng01-113F05.b_47_1098 (reverse)

seq1  TTTATTTATATATA-TATAT-ATATATATATATATATATATATGCTTTTA  48
      |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTTATTAATATATATTTTATAATATATATATATATATACATATGCTTTTA  50

seq1  AACTGGAGTATCTAGAAAATGAAAAGGATCATTGGTATGTGGGATGTTCA  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGGAGTATCTAGAAAATGAAAAGGATCATTGGTATGTGGGATGTTCA  100

seq1  AAGGGGTTGGGGCTAGCAAAAAGTGAGTGCTGTAATAGCAGAAAATGTGA  148
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AA-GGGTTGGGGCTAGCAAAAAGTGAGTGCTGTAATAGCAGAAAATGTGA  149

seq1  ACACATGATGATTATAATATTCATTACAAACGCTATACTCTGTCTTAATC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGATGATTATAATATTCATTACAAACGCTATACTCTGTCTTAATC  199

seq1  AGAG-AAACTTCTGCACATAATGAAATATAATGAACACAGAGAATTATAT  247
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAACTTCTGCACATAATGAAATATAATGAACACAGAGAATTATAT  249

seq1  CTGTTCAAGTCACAGAAAATAAGTGATTACTTAAGTGGTTTCTCTTAAAC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCAAGTCACAGAAAATAAGTGATTACTTAAGTGGTTTCTCTTAAAC  299

seq1  AAAACATTCATAACACCTCAACCAAGGCTCATGGAACAACATGCAATATA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACATTCATAACACCTCAACCAAGGCTCATGGAACAACATGCAATATA  349

seq1  ATGCAAGAACAATATCTGGACCACTTTCAACCTTGGTTAGAGAAATTTCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAGAACAATATCTGGACCACTTTCAACCTTGGTTAGAGAAATTTCT  399

seq1  TTTTGCATTAGGCAGCATTATGAGTGTGTAGTCATAACTGGTCAATGCTA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCATTAGGCAGCATTATGAGTGTGTAGTCATAACTGGTCAATGCTA  449

seq1  ATAATTATAATAATTATTGACTGTGGGTGCTCAGCTTTCAATGTGATATT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTATAATAATTATTGACTGTGGGTGCTCAGCTTTCAATGTGATATT  499

seq1  TATATCTATCCACTACTTGTACCCCAAGCCTCAGATAACATTAAATTAAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCTATCCACTACTTGTACCCCAAGCCTCAGATAACATTAAATTAAT  549

seq1  GGAGGTCAAGGAATATAAGAACTAGAGAATAGAGAAATGTCCTGTGTTTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTCAAGGAATATAAGAACTAGAGAATAGAGAAATGTCCTGTGTTTT  599

seq1  CTGGATGTGCAGTAGCTATTGCACTCATGGGTTCACAACAACTTCTATTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATGTGCAGTAGCTATTGCACTCATGGGTTCACAACAACTTCTATTC  649

seq1  CCTGCACAAGATAACAGAGGAACAGTCCAATAAATACAAGATCAATCCAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCACAAGATAACAGAGGAACAGTCCAATAAATACAAGATCAATCCAG  699

seq1  TAAAATTCCCAAAATAGATGTTGTAGGATCTTACCTGATCCTTCCACAAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTCCCAAAATAGATGTTGTAGGATCTTACCTGATCCTTCCACAAC  749

seq1  CTAATGAGTTAATAGCAGTTGATGTTAGCTATGGATTCGATCTCAGAATA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGAGTTAATAGCAGTTGATGTTAGCTATGGATTCGATCTCAGAATA  799

seq1  ATCATTTTTCTTTGGTTTTATGATCACTGGTAGGGAGACTATGCCTCAGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTTTCTTTGGTTTTATGATCACTGGTAGGGAGACTATGCCTCAGT  849

seq1  AGATGACCACACACCTGTATGAATAAAGGGACAGCACTTAATGGAGTTAG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACCACACACCTGTATGAATAAAGGGACAGCACTTAATGGAGTTAG  899

seq1  TAAAGTATCAAGAACCAGAAAGGAAGATAACATAAAATTGTGAGGGAAAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTATCAAGAACCAGAAAGGAAGATAACATAAAATTGTGAGGGAAAG  949

seq1  AGGGTTAATTGTGATTATAATATAGTGTAGGTGTGTATAAATTTTCAAAG  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTAATTGTGATTATAATATAGTGTAGGTGTGTATAAATTTTCAAAG  999

seq1  AAAACAAAAGGAGAGAATTTCCTTTTGTTTTCAAAGAATTTTTCAAAGAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAAAAGGAGAGAATTTCCTTTTGTTTTCAAAGAATTTTTCAAAGAA  1049

seq1  TTC  1050
      |||
seq2  TTC  1052

seq1: chr4_72544062_72545194
seq2: B6Ng01-113F05.g_67_1186

seq1  GAATTCAAGAGAACAGAGAGAAAGAGTAGCATGAAAATACTGAGCACCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGAGAACAGAGAGAAAGAGTAGCATGAAAATACTGAGCACCAT  50

seq1  TAAGTTTCATGATAGTTTTGTGTAGGATAGTGTTGGAAAGGCATTCTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTCATGATAGTTTTGTGTAGGATAGTGTTGGAAAGGCATTCTATT  100

seq1  TTACTAACCAATTGATGTTTCTATAACATTTTGAATATGCTGTCTTATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAACCAATTGATGTTTCTATAACATTTTGAATATGCTGTCTTATTT  150

seq1  TCACCCATATAGTTGATTTTATTTTTGTTTTAGCAAGGTTAGTTAAACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCATATAGTTGATTTTATTTTTGTTTTAGCAAGGTTAGTTAAACTT  200

seq1  TCTATCATATATATTTATTTAATATTTATCAGGGCACTGTATATATAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCATATATATTTATTTAATATTTATCAGGGCACTGTATATATAAAT  250

seq1  TTATAATTGATTTGGAAATTAAAAGCATTATAAGGTACATAGAAACACAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATTGATTTGGAAATTAAAAGCATTATAAGGTACATAGAAACACAT  300

seq1  TTAAGCTTATTGTTAAATGTATTTTAATTTTTAAACAATGATTTTGTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCTTATTGTTAAATGTATTTTAATTTTTAAACAATGATTTTGTGAG  350

seq1  TTTCTATTCAGAGCAAGAGAGGGTGCTAAGAATTTGGGGAAGTGTTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATTCAGAGCAAGAGAGGGTGCTAAGAATTTGGGGAAGTGTTTTTC  400

seq1  ATACTTGTTAGATACATTATTTCAACTTGCTTTCAGTCCATAAGGTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGTTAGATACATTATTTCAACTTGCTTTCAGTCCATAAGGTGGAT  450

seq1  CCATTCCAAATACTAATAATATCTCAGCAAGCTGCCTTATCTCTGGAATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCCAAATACTAATAATATCTCAGCAAGCTGCCTTATCTCTGGAATC  500

seq1  AGTTCAGTTAGTGGGAGGAGACTGAGGAAGGCTGTCTGATTCACCTGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAGTTAGTGGGAGGAGACTGAGGAAGGCTGTCTGATTCACCTGCCT  550

seq1  TCTAGCCTATTGCATCATCCTTGACAGAGAGATGTCTGTATAGCACAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGCCTATTGCATCATCCTTGACAGAGAGATGTCTGTATAGCACAATC  600

seq1  TTCTTTGGGGATCAGGTTCTCTCTTTGGAGTAAACCCAGCTTAAGAGCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGGGGATCAGGTTCTCTCTTTGGAGTAAACCCAGCTTAAGAGCAT  650

seq1  TGGAAGTAGTGAATGCAGGCTGCCCTTACTCATTCAAGCCAAAACAGGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTAGTGAATGCAGGCTGCCCTTACTCATTCAAGCCAAAACAGGGC  700

seq1  AGAGCTATAGTTACTGATCTTTCATACTTCTTAGCAAAGACAACATCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTATAGTTACTGATCTTTCATACTTCTTAGCAAAGACAACATCCTT  750

seq1  TCTGCTCATGATTTTTCCAGTTATCTCC-TTATAAAATTCAGCAAACACT  799
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCATGATTTTTCCAGTTATCTCCTTTATAAAATTCAGCAAACACT  800

seq1  GATCTTTTTAAAATGTACCATCACTTAACAGACTGGATATGAACTTATGC  849
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTTTTAAAATGTACCATCAC-TAACAGACTGGATATGAACTTATGC  849

seq1  TAAAGTAAATCAGAAGGTCACTACCGGACAAGGAAAGGAAATGCTTTAAA  899
      | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  T-AAGTAAATCAGAAGGTCACTACCGGACAA-GAAAGG-AATGCTTTAAA  896

seq1  ATATATCAGAAGAAAGACTAC-TGTGAAGTGGAATAGTAAAGATGTATGT  948
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATATATCAGAAGAAAGACTACTTGTGAAGTGGAATAGTTAAGATGTATGT  946

seq1  AGGTTCTATAGATGCTCAGCCCTGCTTTACTTCTAAATAACAGTGACTAC  998
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  AGGTTCTATAGATGCTCAGCCCTGC-TTACTTCT-AATAACAGTGACTAC  994

seq1  TTAATCACTGGACATTACTTTGAATATCAGTATCTTTAAATGCAAAATAA  1048
      || ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| |
seq2  TT-ATCACTGGAAATTAC-TTGAATTTCAGTATCTTAAATGGCAAAAT-A  1041

seq1  AGAGGACAAAGTAGGTGTGGTTTTAGATGCTGCTCAATGATCAGGGTATG  1098
      ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||| || |||
seq2  AGAGGAC-AAGTAGGTGTGG-TTTAGATGCTGGTCTAAGATCA-GGCATG  1088

seq1  T-GATCAAGTGGTCTCTATGAGGTTTGCAGAAAGTG  1133
      | |||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||
seq2  TGGATC-AGT-GTCTCT-TGAGGGTTGC-GAAAGTG  1120