BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118L23
Chromosome4 (Build37)
Map Location 10,178,124 - 10,328,123
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039584, 4933402J24Rik, Asph, Gdf6, 4930448K20Rik
Downstream geneLOC666840, 1700123O12Rik, LOC383991, LOC100039656, LOC545589, 2610301B20Rik, LOC383992, LOC100039746, Plekhf2, 2310030N02Rik, LOC546828, LOC666897, Trp53inp1, Ccne2, Ints8, Dpy19l4, Rbm35a, LOC634834
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118L23.bB6Ng01-118L23.g
ACCDH923145DH923146
length1,0871,094
definitionDH923145|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118L23, 5' end.DH923146|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118L23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,327,040 - 10,328,123)(10,178,124 - 10,179,222)
sequence
gaattcagttagtaacaattactttcatatcagcagggaagcacttgcaa
cactcaagagaggcatttcaggacctagaccaggctagccctacaggacc
gcagcactttgactcttttgctgcttcttcttgctgctccttcattagtt
ctttcttgtgatggaaaagaagcaatgacctagttcaaggacaacaggaa
aggaaggagccaagccaaaggattgcagagtcaacacccggcatgatttc
atttaccacatctagtccgtcaaccttttgggagatgtttatatttatcc
ccttctctcttttgtcaccaaggaatttcatttccctcttaagtggcttt
cctgagagaggaagtgggaagggaggaatgggacccaaaccaccacgttg
gttgttcttttggagcctgtcctgccctcctgtttgaagttatgtctgtg
gctttgttctgcctgtacctgctctctctagagtaggagcttgtaaagtg
gcagaagtctgaacctttagtaaacgtttcttcttaaaatgagtatactg
ctgtgagagccatctgttccaaaggggtctaactactaactgttcctctg
aagcagtatgcacaggtcacaggcatttcctggatggtggtggtggtaga
gtgcctaccaatcttccaccagcaccatgcattaattatcctggctatga
gggagctctctttagggtctggtctttagggttctctttagggtttttat
tcacagaggactttatcattctatatacatgccaacaagctgctttcttc
catagaaacctgactccagcactggacaccagtgtccaacttcaggtgtt
tttttttaggctttgctattttctaagaaaagaccagaagtttttgtgaa
tgaagagaataaaagcatttggaatgatctcacagcttctcactctctct
tttcaacccggtgaagaaccaggtcagctgtgggggtttggataagtcag
agatgaagaacaagttttgtgtctattgtaccagtgacccaatgcactta
caggcagaaaatgcttgaatataaaggattgtggggg
gaattcactcacattagagccacttaaatgtgccaagtagaaacccaagg
gacaaaccattactaaatgtgccccagcaccgcatctgtccttccttgct
ttccgtttctttttatgagctcatttttggtttcaccgggttctttattc
ctgctgtaactgttttatccaactttaaaaatacattttaaagcaataca
attatttacaagaaggctgaagaaacaggatggaataaagaatatacttg
atatgtgaactttgcttctatcacttggcaaaggttgtaacgttatttag
atagaaaaaaacattaatggtcttatgagctgtgagtataagttgataca
gtgtttctggaaggtagttaggaaatatgtatcaaagaacttaagagcat
ttagtaatgcaattctatctttatgaatttatctggaaaaaataactaaa
caagtatacagagaccaatgtaagagcatgtttattgcaacattgagtaa
aaggaactaaacatgacattcaataacagggaattgtttcaataaaataa
gattccatgtacatatggaaatatatacagatattacaagttttgactta
agtttgtgtttacagtagtggaagtacaccgatgttaagccattaaataa
aaatggcaggttgcagagtctcttggtgtagaacgatccctcctaggtaa
taaagacatctgcatatatgtgccagagcagaaagcctggattccatttg
ctggcatgtctgcccagcatgagagaaaaggataatggagagaagtgtta
gggacactggtaaaggaaaagagaaaaacaggaactcagacaattaacca
gccctcactgaccttaaccccttttgagtcaacctaaagcgttcaattcc
aacctagtagagttcggcggccctgggtgggaagggagtgctggcaccac
attctacctgtagagggcccagtctggagacagcatgactctactgcctg
gtgcactgtatctatctaaacagcgctgagagcagagctagcttacagaa
agaaaaaagactgctataaaaggtacatatggcctggattcttg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_10327040_10328123
seq2: B6Ng01-118L23.b_46_1132 (reverse)

seq1  CCCCCAC-ATCC-TTAAATTCAA-CATTTTCTGCCTGTAAGTGCATTGGG  47
      ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACAATCCTTTATATTCAAGCATTTTCTGCCTGTAAGTGCATTGGG  50

seq1  TCACTGGTACAATAGACACAAAACTTGTTCTTCCTTCTCTGACTTATCCC  97
      |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| 
seq2  TCACTGGTACAATAGACACAAAACTTGTTCTT-CATCTCTGACTTATCCA  99

seq1  AACCCCCACAGCTGACTTGGTTCTTCACCGGGTTGAAAAGAGAGAGTGAG  147
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCCACAGCTGACCTGGTTCTTCACCGGGTTGAAAAGAGAGAGTGAG  149

seq1  AAGCTGTGAGATCATTCC-AATGCTTTTATTTCTCTTCATTCACAAAAAC  196
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGTGAGATCATTCCAAATGCTTTTA-TTCTCTTCATTCACAAAAAC  198

seq1  TTCTGGTCTTTTCTTAGAAAATAGCAAAGCCT-AAAAAAAACACCTGAAG  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTCTGGTCTTTTCTTAGAAAATAGCAAAGCCTAAAAAAAAACACCTGAAG  248

seq1  TTGGACACTGGTGTCCAGTGCTGGAGTCAGGTTTCTATGGAAGAAAGCAG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACACTGGTGTCCAGTGCTGGAGTCAGGTTTCTATGGAAGAAAGCAG  298

seq1  CTTGTTGGCATGTATATAGAATGATAAAGTCCTCTGTGAATAAAAACCCT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTGGCATGTATATAGAATGATAAAGTCCTCTGTGAATAAAAACCCT  348

seq1  AAAGAGAACCCTAAAGACCAGACCCTAAAGAGAGCTCCCTCATAGCCAGG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAACCCTAAAGACCAGACCCTAAAGAGAGCTCCCTCATAGCCAGG  398

seq1  ATAATTAATGCATGGTGCTGGTGGAAGATTGGTAGGCACTCTACCACCAC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTAATGCATGGTGCTGGTGGAAGATTGGTAGGCACTCTACCACCAC  448

seq1  CACCATCCAGGAAATGCCTGTGACCTGTGCATACTGCTTCAGAGGAACAG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCCAGGAAATGCCTGTGACCTGTGCATACTGCTTCAGAGGAACAG  498

seq1  TTAGTAGTTAGACCCCTTTGGAACAGATGGCTCTCACAGCAGTATACTCA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGTTAGACCCCTTTGGAACAGATGGCTCTCACAGCAGTATACTCA  548

seq1  TTTTAAGAAGAAACGTTTACTAAAGGTTCAGACTTCTGCCACTTTACAAG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAAGAAACGTTTACTAAAGGTTCAGACTTCTGCCACTTTACAAG  598

seq1  CTCCTACTCTAGAGAGAGCAGGTACAGGCAGAACAAAGCCACAGACATAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACTCTAGAGAGAGCAGGTACAGGCAGAACAAAGCCACAGACATAA  648

seq1  CTTCAAACAGGAGGGCAGGACAGGCTCCAAAAGAACAACCAACGTGGTGG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAACAGGAGGGCAGGACAGGCTCCAAAAGAACAACCAACGTGGTGG  698

seq1  TTTGGGTCCCATTCCTCCCTTCCCACTTCCTCTCTCAGGAAAGCCACTTA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGTCCCATTCCTCCCTTCCCACTTCCTCTCTCAGGAAAGCCACTTA  748

seq1  AGAGGGAAATGAAATTCCTTGGTGACAAAAGAGAGAAGGGGATAAATATA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAAATGAAATTCCTTGGTGACAAAAGAGAGAAGGGGATAAATATA  798

seq1  AACATCTCCCAAAAGGTTGACGGACTAGATGTGGTAAATGAAATCATGCC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCTCCCAAAAGGTTGACGGACTAGATGTGGTAAATGAAATCATGCC  848

seq1  GGGTGTTGACTCTGCAATCCTTTGGCTTGGCTCCTTCCTTTCCTGTTGTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTTGACTCTGCAATCCTTTGGCTTGGCTCCTTCCTTTCCTGTTGTC  898

seq1  CTTGAACTAGGTCATTGCTTCTTTTCCATCACAAGAAAGAACTAATGAAG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACTAGGTCATTGCTTCTTTTCCATCACAAGAAAGAACTAATGAAG  948

seq1  GAGCAGCAAGAAGAAGCAGCAAAAGAGTCAAAGTGCTGCGGTCCTGTAGG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCAAGAAGAAGCAGCAAAAGAGTCAAAGTGCTGCGGTCCTGTAGG  998

seq1  GCTAGCCTGGTCTAGGTCCTGAAATGCCTCTCTTGAGTGTTGCAAGTGCT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCCTGGTCTAGGTCCTGAAATGCCTCTCTTGAGTGTTGCAAGTGCT  1048

seq1  TCCCTGCTGATATGAAAGTAATTGTTACTAACTGAATTC  1084
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGCTGATATGAAAGTAATTGTTACTAACTGAATTC  1087

seq1: chr4_10178124_10179222
seq2: B6Ng01-118L23.g_69_1162

seq1  GAATTCACTCACATTAGAGCCACTTAAATGTGCCAAGTAGAAACCCAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCACATTAGAGCCACTTAAATGTGCCAAGTAGAAACCCAAGG  50

seq1  GACAAACCATTACTAAATGTGCCCCAGCACCGCATCTGTCCTTCCTTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAACCATTACTAAATGTGCCCCAGCACCGCATCTGTCCTTCCTTGCT  100

seq1  TTCCGTTTCTTTTTATGAGCTCATTTTTGGTTTCACCGGGTTCTTTATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGTTTCTTTTTATGAGCTCATTTTTGGTTTCACCGGGTTCTTTATTC  150

seq1  CTGCTGTAACTGTTTTATCCAACTTTAAAAATACATTTTAAAGCAATACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTAACTGTTTTATCCAACTTTAAAAATACATTTTAAAGCAATACA  200

seq1  ATTATTTACAAGAAGGCTGAAGAAACAGGATGGAATAAAGAATATACTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTACAAGAAGGCTGAAGAAACAGGATGGAATAAAGAATATACTTG  250

seq1  ATATGTGAACTTTGCTTCTATCACTTGGCAAAGGTTGTAACGTTATTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGAACTTTGCTTCTATCACTTGGCAAAGGTTGTAACGTTATTTAG  300

seq1  ATAGAAAAAAACATTAATGGTCTTATGAGCTGTGAGTATAAGTTGATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAAAAAAACATTAATGGTCTTATGAGCTGTGAGTATAAGTTGATACA  350

seq1  GTGTTTCTGGAAGGTAGTTAGGAAATATGTATCAAAGAACTTAAGAGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCTGGAAGGTAGTTAGGAAATATGTATCAAAGAACTTAAGAGCAT  400

seq1  TTAGTAATGCAATTCTATCTTTATGAATTTATCTGGAAAAAATAACTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAATGCAATTCTATCTTTATGAATTTATCTGGAAAAAATAACTAAA  450

seq1  CAAGTATACAGAGACCAATGTAAGAGCATGTTTATTGCAACATTGAGTAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTATACAGAGACCAATGTAAGAGCATGTTTATTGCAACATTGAGTAA  500

seq1  AAGGAACTAAACATGACATTCAATAACAGGGAATTGTTTCAATAAAATAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACTAAACATGACATTCAATAACAGGGAATTGTTTCAATAAAATAA  550

seq1  GATTCCATGTACATATGGAAATATATACAGATATTACAAGTTTTGACTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCCATGTACATATGGAAATATATACAGATATTACAAGTTTTGACTTA  600

seq1  AGTTTGTGTTTACAGTAGTGGAAGTACACCGATGTTAAGCCATTAAATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGTGTTTACAGTAGTGGAAGTACACCGATGTTAAGCCATTAAATAA  650

seq1  AAATGGCAGGTTGCAGAGTCTCTTGGTGTAGAACGATCCCTCCTAGGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGCAGGTTGCAGAGTCTCTTGGTGTAGAACGATCCCTCCTAGGTAA  700

seq1  TAAAGACATCTGCATATATGTGCCAGAGCAGAAAGCCTGGATTCCATTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACATCTGCATATATGTGCCAGAGCAGAAAGCCTGGATTCCATTTG  750

seq1  CTGGCATGTCTGCCCAGCATGAGAGAAAAGGATAATGGAGAGAAGTGTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCATGTCTGCCCAGCATGAGAGAAAAGGATAATGGAGAGAAGTGTTA  800

seq1  GGGACACTGGTAAAGGAAAAGAGAAAAACAGGAACTCAGACAATTAACCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACACTGGTAAAGGAAAAGAGAAAAACAGGAACTCAGACAATTAACCA  850

seq1  GCCCTCACTGACCTTAACCCCTTTTGAGTCAACCTAAAGCGTTCAATTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCACTGACCTTAACCCCTTTTGAGTCAACCTAAAGCGTTCAATTCC  900

seq1  AACCTAGTAGAGTTCGGCGGCCCTGGGTGGGAAGGGAGTGCTGGCACCAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAGTAGAGTTCGGCGGCCCTGGGTGGGAAGGGAGTGCTGGCACCAC  950

seq1  ATTCTACCTGTAGAGGGCCCAGTCTGGAGACAGCATGACTCTTACTTGCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
seq2  ATTCTACCTGTAGAGGGCCCAGTCTGGAGACAGCATGACTC-TAC-TGCC  998

seq1  T-GTGCACTGTATCTATCTAAACAGCGCTGAGAGCAAGGAGCTAGC-TAC  1048
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||
seq2  TGGTGCACTGTATCTATCTAAACAGCGCTGAGAGCA--GAGCTAGCTTAC  1046

seq1  AGAAAGAAAAAAGACTGCTTATAAAAGTTACATAATGGCCTGGATTTCTT  1098
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||
seq2  AGAAAGAAAAAAGACTGC-TATAAAAGGTACAT-ATGGCCTGGA-TTCTT  1093

seq1  G  1099
      |
seq2  G  1094