BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128H09
Chromosome4 (Build37)
Map Location 151,790,468 - 151,950,078
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKcnab2, LOC100042028, Nphp4
Upstream geneCamta1, LOC100041960, Dnajc11, Thap3, Phf13, Klhl21, Zbtb48, Tas1r1, Nol9, EG666980, Plekhg5, Tnfrsf25, Espn, LOC100043284, Hes2, Acot7, Gpr153, Hes3, Icmt, Rnf207, Rpl22, Chd5
Downstream geneLOC667039, Gm833, LOC100042089, Ajap1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128H09.bB6Ng01-128H09.g
ACCDH930305DH930306
length1,103890
definitionDH930305|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128H09, 5' end.DH930306|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128H09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,790,468 - 151,791,573)(151,949,188 - 151,950,078)
sequence
gaattcaagcaaacacatacatacacacatacatacacacacacacacac
acatacacaatattatatatacacatacattcatgcacatgtacacacat
acatacatatgtatgtgtaaacatatacatatgaacacatgtatacaggc
atgcatacatatatacatatacattcatgcatatgtacttacatatacac
acatatgtacacacagcatgcatgcatactatatgcatatattcatgcat
atgtacacaatacatgtacttgcatacacacacacatatatatacacaat
atacatacacatacatgcatgtattatgtatacatgtccacacatatata
catatgcacacacacatgtacaagcatatgcacacacatgcatacaccca
tgcatacatatatatttccacgtagtcccagcttttaatggccactgaga
caaagacataaaccacagagactctaggacagagaattccattctgactg
tccccgtcaagcctagaggatgggaaatgagttctttacccaagaggttt
gctgaagaccacctaaccaacatcccggggacccgggaggccagggtgtg
agagcatgtccaggaccccagcctcgtgcgagcatttaccatgatgcgac
ctctgggctgtgactcctttacatcggggccaccttctgagtgctggtac
aggggaggttttagctgcctatcgtaacaccaatcataaactcagacgac
cctcctatattctgcaaggaccacctatgttgcagctgtgtgaggtcacc
aggtagctgctgcatcggactcctgctttgaggaaggagccttccttagt
gggctgcctcagggccagagggctcctttgagctgttcagcctgaacaaa
tccgggaagatccttttccttggagaccctgtgtggagaggccccatccc
cttcttccacacagacccttcggctctgagtctacatgggcccaggggat
ccttcctatgaagccaggtccttccttccccgtgtgggagctctgcagtc
agcttcaggttgaaaggcagaggtggtaaggagaaaaggccatgacacct
gga
gaattcctcctccttgcagctacctagaacacaggcacaaggccccagct
cccgctcaaggaacccatagcggggcacagcaaagcctgagcggcagctc
actgtgtaaccagacctgcaggatgcggtttttgcctccagaaacttgtg
atgcttggactccagcagggtttaaagtgcccatggcagatgggagtctc
tatggagcctgtgctgaattgcaatgggggggggggcaaccctaagacaa
ttcccttgtgttctggggcaaagagatggtgtccttggcagataccttgg
ctcctttagggacagttcaacaattgctcagtgtggttgtcatagccttg
attgtcttggtgagacttagagtcacctaggagacacacctctgcatgtg
tctgtctgtgaggacactttcagtaggtgggaagtcacgtcctaaatgtg
agcggcaccattccttgtgctggggtctccagctgaataaaactgaggaa
gcgagctgaataccagcattacatctttctctccctccttcctgacagcg
gaggcagcgtgaccagtgcctcatgctcctgtcatggcgccctcctcacc
atggtgatggtaccttcaaaccgtgatccaaataacctctcttttttccc
tttctttttggatgcttcttatgagatatgtggtcactgtgacgagaggt
agctaatacactgaagtatgcctgtgttcatggattccctaagggacaca
tggcaccaaaggtaagccacatctcctagaccaagctgtagaccaacatg
gtgtcattggtgggtggtaatgcgccagagagtatggtactttgggccat
agtgatgtctgaatggggtgatgtgattgtgaaaatgata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_151790468_151791573
seq2: B6Ng01-128H09.b_48_1150

seq1  GAATTCAAGCAAACACATACATACACACATACATACACACACACACACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGCAAACACATACATACACACATACATACACACACACACACAC  50

seq1  ACATACACAATATTATATATACACATACATTCATGCACATGTACACACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACACAATATTATATATACACATACATTCATGCACATGTACACACAT  100

seq1  ACATACATATGTATGTGTAAACATATACATATGAACACATGTATACAGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATATGTATGTGTAAACATATACATATGAACACATGTATACAGGC  150

seq1  ATGCATACATATATACATATACATTCATGCATATGTACTTACATATACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATACATATATACATATACATTCATGCATATGTACTTACATATACAC  200

seq1  ACATATGTACACACAGCATGCATGCATACTATATGCATATATTCATGCAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATGTACACACAGCATGCATGCATACTATATGCATATATTCATGCAT  250

seq1  ATGTACACAATACATGTACTTGCATACACACACACATATATATACACAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACACAATACATGTACTTGCATACACACACACATATATATACACAAT  300

seq1  ATACATACACATACATGCATGTATTATGTATACATGTCCACACATATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACACATACATGCATGTATTATGTATACATGTCCACACATATATA  350

seq1  CATATGCACACACACATGTACAAGCATATGCACACACATGCATACACCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGCACACACACATGTACAAGCATATGCACACACATGCATACACCCA  400

seq1  TGCATACATATATATTTCCACGTAGTCCCAGCTTTTAATGGCCACTGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATACATATATATTTCCACGTAGTCCCAGCTTTTAATGGCCACTGAGA  450

seq1  CAAAGACATAAACCACAGAGACTCTAGGACAGAGAATTCCATTCTGACTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACATAAACCACAGAGACTCTAGGACAGAGAATTCCATTCTGACTG  500

seq1  TCCCCGTCAAGCCTAGAGGATGGGAAATGAGTTCTTTACCCAAGAGGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCGTCAAGCCTAGAGGATGGGAAATGAGTTCTTTACCCAAGAGGTTT  550

seq1  GCTGAAGACCACCTAACCAACATCCCGGGGACCCGGGAGGCCAGGGTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAGACCACCTAACCAACATCCCGGGGACCCGGGAGGCCAGGGTGTG  600

seq1  AGAGCATGTCCAGGACCCCAGCCTCGTGCGAGCATTTACCATGATGCGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATGTCCAGGACCCCAGCCTCGTGCGAGCATTTACCATGATGCGAC  650

seq1  CTCTGGGCTGTGACTCCTTTACATCGGGGCCACCTTCTGAGTGCTGGTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGCTGTGACTCCTTTACATCGGGGCCACCTTCTGAGTGCTGGTAC  700

seq1  AGGGGAGGTTTTAGCTGCCTATCGTAACACCAATCATAAACTCAGACGAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGGTTTTAGCTGCCTATCGTAACACCAATCATAAACTCAGACGAC  750

seq1  CCTCCTATATTCTGCAAGGACCACCTATGTTGCAGCTGTGTGAGGTCACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTATATTCTGCAAGGACCACCTATGTTGCAGCTGTGTGAGGTCACC  800

seq1  AGGTAGCTGCTGCATCGGACTCCTGCTTTGAGGAAGGAGCCTTCCTTAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGCTGCTGCATCGGACTCCTGCTTTGAGGAAGGAGCCTTCCTTAGT  850

seq1  GGGCTGCCTCAGGGCCAGAGGGCTCCTTTGAGCTGTTCAGCCTGAACAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTGCCTCAGGGCCAGAGGGCTCCTTTGAGCTGTTCAGCCTGAACAAA  900

seq1  TCCGGGAAGATCCTTTTCCCTGGAGACCCTGTGTGGAGAGGCCCCCATCC  950
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCCGGGAAGATCCTTTTCCTTGGAGACCCTGTGTGGAGAGG-CCCCATCC  949

seq1  CCTTCCTCCACACAGACCCTTCGGCTCTGAGTCTTACATGGGCCCAGGGG  1000
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTCCACACAGACCCTTCGGCTCTGAGTC-TACATGGGCCCAGGGG  998

seq1  ATCCTTCCTATGAAGCCAGGCCCTTCCTTCCCCGTGTGGGAGCTCTGCAG  1050
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTCCTATGAAGCCAGGTCCTTCCTTCCCCGTGTGGGAGCTCTGCAG  1048

seq1  CCAGCTCCAGGTGGACA-GCAGAGGTGGAAAGAAGAAAAAGGCCATGGAC  1099
       ||||| ||||| || | |||||||||| ||| || |||||||||| |||
seq2  TCAGCTTCAGGTTGAAAGGCAGAGGTGGTAAGGAG-AAAAGGCCAT-GAC  1096

seq1  ACCTGGA  1106
      |||||||
seq2  ACCTGGA  1103

seq1: chr4_151949188_151950078
seq2: B6Ng01-128H09.g_67_955 (reverse)

seq1  ATCATTATCACCATCACCATCACCACACTTCAGACATCACTATGG-CCAA  49
      |||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||
seq2  ATCATTTTCACAATCA-CATCACCCCA-TTCAGACATCACTATGGCCCAA  48

seq1  TGTGACACTACTCTCTGGCACCATTACCACCCACCAATGACACCATGTTG  99
       || ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGT-ACCATACTCTCTGGC-GCATTACCACCCACCAATGACACCATGTTG  96

seq1  GTCTACAGCTTGGTCTAGGAGATGTGGCTTACCTTTGGTGCCATGTGTCC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACAGCTTGGTCTAGGAGATGTGGCTTACCTTTGGTGCCATGTGTCC  146

seq1  CTTAGGGAATCCATGAACACAGGCATACTTCAGTGTATTAGCTACCTCTC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGGAATCCATGAACACAGGCATACTTCAGTGTATTAGCTACCTCTC  196

seq1  GTCACAGTGACCACATATCTCATAAGAAGCATCCAAAAAGAAAGGG-AAA  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  GTCACAGTGACCACATATCTCATAAGAAGCATCCAAAAAGAAAGGGAAAA  246

seq1  AAGAGAGGTTATTTGGATCACGGTTTGAAGGTACCATCACCATGGTGAGG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAGGTTATTTGGATCACGGTTTGAAGGTACCATCACCATGGTGAGG  296

seq1  AGGGCGCCATGACAGGAGCATGAGGCACTGGTCACGCTGCCTCCGCTGTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCGCCATGACAGGAGCATGAGGCACTGGTCACGCTGCCTCCGCTGTC  346

seq1  AGGAAGGAGGGAGAGAAAGATGTAATGCTGGTATTCAGCTCGCTTCCTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGAGGGAGAGAAAGATGTAATGCTGGTATTCAGCTCGCTTCCTCA  396

seq1  GTTTTATTCAGCTGGAGACCCCAGCACAAGGAATGGTGCCGCTCACATTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATTCAGCTGGAGACCCCAGCACAAGGAATGGTGCCGCTCACATTT  446

seq1  AGGACGTGACTTCCCACCTACTGAAAGTGTCCTCACAGACAGACACATGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACGTGACTTCCCACCTACTGAAAGTGTCCTCACAGACAGACACATGC  496

seq1  AGAGGTGTGTCTCCTAGGTGACTCTAAGTCTCACCAAGACAATCAAGGCT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGTGTCTCCTAGGTGACTCTAAGTCTCACCAAGACAATCAAGGCT  546

seq1  ATGACAACCACACTGAGCAATTGTTGAACTGTCCCTAAAGGAGCCAAGGT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAACCACACTGAGCAATTGTTGAACTGTCCCTAAAGGAGCCAAGGT  596

seq1  ATCTGCCAAGGACACCATCTCTTTGCCCCAGAACACAAGGGAATTGTCTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCCAAGGACACCATCTCTTTGCCCCAGAACACAAGGGAATTGTCTT  646

seq1  AGGGTTGCCCCCCCCCCCATTGCAATTCAGCACAGGCTCCATAGAGACTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTGCCCCCCCCCCCATTGCAATTCAGCACAGGCTCCATAGAGACTC  696

seq1  CCATCTGCCATGGGCACTTTAAACCCTGCTGGAGTCCAAGCATCACAAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGCCATGGGCACTTTAAACCCTGCTGGAGTCCAAGCATCACAAGT  746

seq1  TTCTGGAGGCAAAAACCGCATCCTGCAGGTCTGGTTACACAGTGAGCTGC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGAGGCAAAAACCGCATCCTGCAGGTCTGGTTACACAGTGAGCTGC  796

seq1  CGCTCAGGCTTTGCTGTGCCCCGCTATGGGTTCCTTGAGCGGGAGCTGGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTCAGGCTTTGCTGTGCCCCGCTATGGGTTCCTTGAGCGGGAGCTGGG  846

seq1  GCCTTGTGCCTGTGTTCTAGGTAGCTGCAAGGAGGAGGAATTC  891
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGTGCCTGTGTTCTAGGTAGCTGCAAGGAGGAGGAATTC  889