MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-128I18
Chromosome	4 (Build37)
Map Location	7,979,173 - 8,129,817
singlet/doublet	doublet
Overlap gene	Car8, LOC100039494
Upstream gene	LOC666700
Downstream gene	LOC100039505, LOC100039478, Rab2, EG666752, LOC666760, Chd7, LOC666782
Link	Open Mouse BAC browser

no map image available.

Click to get alignment info.

BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-128I18.b	B6Ng01-128I18.g
ACC	DH930369	DH930370
length	800	1,040
definition	DH930369\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I18, 5' end.	DH930370\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128I18, 3' end.
singlet/doublet	doublet	doublet
BLAST hit	unique	unique
Map location.	(8,129,021 - 8,129,817)	(7,979,173 - 7,980,214)
sequence	gaattcctggtactaaaaagagctcacatcagtaactgttagcatacttg aaatagttaatataagtcaagtcatgtttgtcacacttgatgactatgga aagatgttctgtttggacactgtagactccagattccgttaactgctctg tgggcagtgatgtattctgaggaaacagtggaagataaagggggtggatg ggtgggaaacaccagctttagaggcattgactacacttagatttggatgg taagtatgacttagatacctcaagtaaggaatgggcaagacttggctaaa agggtaaatttgggaactttgtggagatggaaggtgagatgtaactcttg gctgtgcataaaaaggacatgttggagcagatttctggtttgggttctgc cattagagttgagaaacaagaaacaacagagcagtgtggaacaataaggg ctgagatacatcaaatttaaaataccctgcaggagggcttttactaggca tcttagcacagagacctaggctcaagagtctgtttggatcaaagatgttg attttggaatcataaacttataggtgatggagtagataagatcacccatc aacaatagataaagggaaggaaaggaaagaggctgaaagatgggaccagg acccaaccaggggagccaagtcataagaaaggaattagcagagttggagg cagaggggatgtagaagtaggtacacattgagtagcccacagcccaggag atgtgagcgtgaggaatggggacaacagatgctgtgaagtgagcaagtat	gaattcatcttgaaaattgtacctgtgggtggtgaaattgtaagtgatgc agatagcatgggtgaaatcctgtggattggctcataaattgcaaacacgg aaatacgaagggaaaggggtaagattatttcccagcaagctaaaggtaca aacatcagcaagatgtgaatagcagcctggtaagccagagcctgcagtga cgatgcacagaaacagctggactagcctaagtcacatgggtatgaagtag aatcttccactgatggccacatctctccaaaactatcagtaaaaaaatgt cagaagcagaaaagtagttaaaaatggagagaggatgggatggctttcta acgtgtggattctgcaccatcagagatcttaaccacagagaatttcttaa aatctttgcttgaggttaggtaactggctttgtttgttttcacccttatt tctaactcatagttttgagtctaacatcaacatcatcatcccaactattt cattttagtagcatatatttaatcataatgtattaggcagtgatacttca aacaatatttttgattttaaaatctgtctgggtaaagtagcaacgtaatg cagtatgtggattactatgtagaggccatgagaatagagacaaattttga acatattgaatctctacaacacacaatataactttccttactttttatat aatttccttttttaaaatatttatttatttattcatttatttacttactt acttatttatttattatatgtgagtacactgtagctgtcttcagacactc cagaagagagcatcggattttgttacggatggttgtgagccaccatgtgg ttgctgggatttgaactcagaacctttggaagaagcagtcggtgcttctt aaccactgagctatctcaccagccccctttatatatttttctatttatgt tttttttatctttgaatggtcataaatgtatacaataaatctttcttttt ggttttgctttttatttgtttggttggtgggttggggttt
quality values	Open. Hide. 61 47 35 38 61 61 61 47 55 55 61 52 61 61 55 61 61 61 55 59 61 61 61 61 15 14 24 15 25 14 10 8 13 13 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 55 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 52 52 30 30 28 28 30 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 59 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 59 59 59 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 59 43 55 59 59 59 61 61 59 61 61 61 61 59 59 59 59 61 61 61 59 61 61 59 52 61 59 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 55 55 52 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 55 61 61 61 61 61 61 47 61 61 61 61 55 61 55 61 61 61 61 55 61 37 55 50 55 55 49 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 61 61 55 47 55 61 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 31 47 43 61 61 43 47 32 61 61 61 61 61 53 61 61 61 61 37 53 53 52 47 50 52 45 50 50 53 61 61 50 52 50 38 47 47 61 43 38 50 42 47 43 45 50 38 53 52 61 61 50 52 43 39 40 42 42 45 39 61 61 45 42 47 33 47 47 43 42 61 41 47 61 61 61 42 34 45 45 31 37 42 42 47 14 31 24 14 23 14 50 39 39 31 42 39 35 23 47 47 35 12 47 47 29 52 35 36 28 30 28 40 28 38 36 32 27 27 31 20 27 32 47 39 52 28 36 32 22 20 17 8 15 11 16 27 45 38 53 39 47 47 53 47 40 40 57 50 45 47 37 21 57 32 53 38 20 30 28 12 26 19 21 17 23 6 27 47 42 50 38 50 45 30 36 57 53 28 42 42 37 38 12 23 38 17 50 25 36 33 42 31 16 12 45 17 47 47 50 30 35 16 8 10 17 9 5 11 6 28 14 21 26 25 23 32 34 26 38 27 52 18 25 23 36 10 14 17 28 42 35 33 15 14 20 14 19 11 8 28 29 20 20 20 19 11 8 23 13 10 23 23 12 14 17 13 30 14 23 21 16	Open. Hide. 61 47 55 55 49 38 24 11 27 12 12 19 12 18 18 21 24 55 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 52 45 31 37 44 50 52 59 52 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 59 59 59 61 59 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 59 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 52 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 61 59 61 61 61 61 61 61 61 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 59 44 55 59 59 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 61 61 55 61 61 61 61 61 61 47 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 55 55 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 61 52 61 61 53 61 61 61 61 61 61 61 61 50 61 53 61 61 61 53 61 61 61 61 34 41 47 61 61 52 61 61 53 61 61 61 61 61 39 61 61 53 53 61 61 61 61 61 61 57 57 57 53 28 53 57 50 53 57 53 57 53 57 42 42 38 53 53 57 57 57 52 53 57 47 53 38 53 50 53 53 53 53 47 47 57 39 42 53 45 57 53 53 53 40 53 40 53 53 38 33 52 53 53 53 53 52 57 36 47 45 53 43 46 34 34 34 45 27 30 9 19 22 24 53 50 53 52 45 50 39 57 57 39 57 57 57 52 53 53 37 32 43 50 53 57 50 52 47 38 42 52 53 50 45 52 33 57 53 50 52 50 40 27 57 30 57 41 41 35 34 52 57 41 41 53 52 41 41 39 57 57 57 57 23 32 38 42 42 45 43 43 34 37 50 53 28 57 57 57 57 42 40 57 57 57 30 38 17 46 25 39 31 34 32 38 32 57 34 52 34 23 26 24 53 53 38 44 28 53 53 28 41 52 31 33 57 44 37 36 53 29 37 37 23 57 53 37 40 57 33 33 36 40 57 35 39 31 41 29 48 41 33 33 28 41 17 36 32 57 20 33 24 36 34 37 22 23 12 7 13 10 11 37 21 17 32 40 22 37 37 20 48 46 14 40 24 44 17 28 24 28 29 26 24 27 17 51 51 30 17 9 15 20 34 9 15 32 28 33 40 24 35 34 18 28 26 12 8 8 14 30 23 18 24 31 25 28 47 20 26 18 25 28 43 45 29 22 13 51 31 30 36 28 28 29 29 28 6 43 16 21 20 27 30 31 29 37 35 39 9 11 29 16 14 31 18 29 31 29 31 16 33 17 12 9 12 22 25 8 12 18 31 17 24 29 29 23 17 25 26 20 20 29 26 28 31 29 29 18 22 43 43 43 43 30 18 41 43 16 12 10 10 16 15 46 41 41 9 23 17 29 28 46 25 20 12 34 29 46 51 41 51 46 51 30 19 12 24 36 51 46 33 28 13 10 23 16 4 21 11 14 13 41 40 20 26 6 7 10 14 29 28 19 12 18 31 32 31 19 21 51 20 13 18 38 51 38 36 23 20 6 38 38 19 14 14 8 22 33 25 18 12 18 28 8 30 23 30 18 16 22 7 12 30 8 17 9 28 16 4 11 8 25 25 21 8 14 9

Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr4_8129021_8129817 seq2: B6Ng01-128I18.b_48_847 (reverse) seq1 ATACTTGCTCACTTCACAGCATCTGTTGTCCCCA-TCCTCACGCTCACAT 49 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATACTTGCTCACTTCACAGCATCTGTTGTCCCCATTCCTCACGCTCACAT 50 seq1 CTCCT-GGCTGTGGGCTACTCAATGTGTACCTACTTCTACAT-CCCTCTG 97 \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCCTGGGCTGTGGGCTACTCAATGTGTACCTACTTCTACATCCCCTCTG 100 seq1 CCTCCAACTCTGCTAATTCCTTTCTTATGACTTGGCTCCCCTGGTTGGGT 147 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTCCAACTCTGCTAATTCCTTTCTTATGACTTGGCTCCCCTGGTTGGGT 150 seq1 CCTGGTCCCATCTTTCAGCCTCTTTCCTTTCCTTCCCTTTATCTATTGTT 197 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTGGTCCCATCTTTCAGCCTCTTTCCTTTCCTTCCCTTTATCTATTGTT 200 seq1 GATGGGTGATCTTATCTACTCCATCACCTATAAGTTTATGATTCCAAAAT 247 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GATGGGTGATCTTATCTACTCCATCACCTATAAGTTTATGATTCCAAAAT 250 seq1 CAACATCTTTGATCCAAACAGACTCTTGAGCCTAGGTCTCTGTGCTAAGA 297 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAACATCTTTGATCCAAACAGACTCTTGAGCCTAGGTCTCTGTGCTAAGA 300 seq1 TGCCTAGTAAAAGCCCTCCTGCAGGGTATTTTAAATTTGATGTATCTCAG 347 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCCTAGTAAAAGCCCTCCTGCAGGGTATTTTAAATTTGATGTATCTCAG 350 seq1 CCCTTATTGTTCCACACTGCTCTGTTGTTTCTTGTTTCTCAACTCTAATG 397 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTTATTGTTCCACACTGCTCTGTTGTTTCTTGTTTCTCAACTCTAATG 400 seq1 GCAGAACCCAAACCAGAAATCTGCTCCAACATGTCCTTTTTATGCACAGC 447 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCAGAACCCAAACCAGAAATCTGCTCCAACATGTCCTTTTTATGCACAGC 450 seq1 CAAGAGTTACATCTCACCTTCCATCTCCACAAAGTTCCCAAATTTACCCT 497 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAGAGTTACATCTCACCTTCCATCTCCACAAAGTTCCCAAATTTACCCT 500 seq1 TTTAGCCAAGTCTTGCCCATTCCTTACTTGAGGTATCTAAGTCATACTTA 547 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTAGCCAAGTCTTGCCCATTCCTTACTTGAGGTATCTAAGTCATACTTA 550 seq1 CCATCCAAATCTAAGTGTAGTCAATGCCTCTAAAGCTGGTGTTTCCCACC 597 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCATCCAAATCTAAGTGTAGTCAATGCCTCTAAAGCTGGTGTTTCCCACC 600 seq1 CATCCACCCCCTTTATCTTCCACTGTTTCCTCAGAATACATCACTGCCCA 647 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATCCACCCCCTTTATCTTCCACTGTTTCCTCAGAATACATCACTGCCCA 650 seq1 CAGAGCAGTTAACGGAATCTGGAGTCTACAGTGTCCAAACAGAACATCTT 697 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGAGCAGTTAACGGAATCTGGAGTCTACAGTGTCCAAACAGAACATCTT 700 seq1 TCCATAGTCATCAAGTGTGACAAACATGACTTGACTTATATTAACTATTT 747 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCATAGTCATCAAGTGTGACAAACATGACTTGACTTATATTAACTATTT 750 seq1 CAAGTATGCTAACAGTTACTGATGTGAGCTCTTTTTAGTACCAGGAATTC 797 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAGTATGCTAACAGTTACTGATGTGAGCTCTTTTTAGTACCAGGAATTC 800	seq1: chr4_7979173_7980214 seq2: B6Ng01-128I18.g_68_1107 seq1 GAATTCATCTTGAAAATTGTACCTGTGGGTGGTGAAATTGTAAGTGATGC 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCATCTTGAAAATTGTACCTGTGGGTGGTGAAATTGTAAGTGATGC 50 seq1 AGATAGCATGGGTGAAATCCTGTGGATTGGCTCATAAATTGCAAACACGG 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGATAGCATGGGTGAAATCCTGTGGATTGGCTCATAAATTGCAAACACGG 100 seq1 AAATACGAAGGGAAAGGGGTAAGATTATTTCCCAGCAAGCTAAAGGTACA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAATACGAAGGGAAAGGGGTAAGATTATTTCCCAGCAAGCTAAAGGTACA 150 seq1 AACATCAGCAAGATGTGAATAGCAGCCTGGTAAGCCAGAGCCTGCAGTGA 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACATCAGCAAGATGTGAATAGCAGCCTGGTAAGCCAGAGCCTGCAGTGA 200 seq1 CGATGCACAGAAACAGCTGGACTAGCCTAAGTCACATGGGTATGAAGTAG 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGATGCACAGAAACAGCTGGACTAGCCTAAGTCACATGGGTATGAAGTAG 250 seq1 AATCTTCCACTGATGGCCACATCTCTCCAAAACTATCAGTAAAAAAATGT 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATCTTCCACTGATGGCCACATCTCTCCAAAACTATCAGTAAAAAAATGT 300 seq1 CAGAAGCAGAAAAGTAGTTAAAAATGGAGAGAGGATGGGATGGCTTTCTA 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGAAGCAGAAAAGTAGTTAAAAATGGAGAGAGGATGGGATGGCTTTCTA 350 seq1 ACGTGTGGATTCTGCACCATCAGAGATCTTAACCACAGAGAATTTCTTAA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACGTGTGGATTCTGCACCATCAGAGATCTTAACCACAGAGAATTTCTTAA 400 seq1 AATCTTTGCTTGAGGTTAGGTAACTGGCTTTGTTTGTTTTCACCCTTATT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATCTTTGCTTGAGGTTAGGTAACTGGCTTTGTTTGTTTTCACCCTTATT 450 seq1 TCTAACTCATAGTTTTGAGTCTAACATCAACATCATCATCCCAACTATTT 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTAACTCATAGTTTTGAGTCTAACATCAACATCATCATCCCAACTATTT 500 seq1 CATTTTAGTAGCATATATTTAATCATAATGTATTAGGCAGTGATACTTCA 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATTTTAGTAGCATATATTTAATCATAATGTATTAGGCAGTGATACTTCA 550 seq1 AACAATATTTTTGATTTTAAAATCTGTCTGGGTAAAGTAGCAACGTAATG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACAATATTTTTGATTTTAAAATCTGTCTGGGTAAAGTAGCAACGTAATG 600 seq1 CAGTATGTGGATTACTATGTAGAGGCCATGAGAATAGAGACAAATTTTGA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGTATGTGGATTACTATGTAGAGGCCATGAGAATAGAGACAAATTTTGA 650 seq1 ACATATTGAATCTCTACAACACACAATATAACTTTCCTTACTTTTTATAT 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACATATTGAATCTCTACAACACACAATATAACTTTCCTTACTTTTTATAT 700 seq1 AATTTCCTTTTTTAAAATATTTATTTATTTATTCATTTATTTACTTACTT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATTTCCTTTTTTAAAATATTTATTTATTTATTCATTTATTTACTTACTT 750 seq1 ACTTATTTATTTATTATATGTGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTTATTTATTTATTATATGTGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTC 800 seq1 CAGAAGAGAGCATCGGATTTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGAAGAGAGCATCGGATTTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG 850 seq1 TTGCTGGGATTTGAACTCAGAACCTTTGGAAG-AGCAGTCGGTGC-TCTT 898 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| seq2 TTGCTGGGATTTGAACTCAGAACCTTTGGAAGAAGCAGTCGGTGCTTCTT 900 seq1 AACCACTGAGCTATCTCACCAGCCCCCTTTATATAATTTTCTATTTATGT 948 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AACCACTGAGCTATCTCACCAGCCCCCTTTATATATTTTTCTATTTATG- 949 seq1 TTTTTTTTATCTTTTGAAATGGTCATAAATGTATACAATAAATCTTTCTT 998 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| seq2 TTTTTTTTATCTTT--GAATGGTCATAAATGTATACAATAAATCTTTC-T 996 seq1 TTTTGGTTTTGC-TTTTATTTGTTTGGTTGGTTGGTTTGGGGTTT 1042 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTGGTTTTGCTTTTTATTTGTTTGGTTGG-TGGGTTGGGGTTT 1040

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr4_8129021_8129817
seq2: B6Ng01-128I18.b_48_847 (reverse)

seq1  ATACTTGCTCACTTCACAGCATCTGTTGTCCCCA-TCCTCACGCTCACAT  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATACTTGCTCACTTCACAGCATCTGTTGTCCCCATTCCTCACGCTCACAT  50

seq1  CTCCT-GGCTGTGGGCTACTCAATGTGTACCTACTTCTACAT-CCCTCTG  97
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CTCCTGGGCTGTGGGCTACTCAATGTGTACCTACTTCTACATCCCCTCTG  100

seq1  CCTCCAACTCTGCTAATTCCTTTCTTATGACTTGGCTCCCCTGGTTGGGT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAACTCTGCTAATTCCTTTCTTATGACTTGGCTCCCCTGGTTGGGT  150

seq1  CCTGGTCCCATCTTTCAGCCTCTTTCCTTTCCTTCCCTTTATCTATTGTT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCCCATCTTTCAGCCTCTTTCCTTTCCTTCCCTTTATCTATTGTT  200

seq1  GATGGGTGATCTTATCTACTCCATCACCTATAAGTTTATGATTCCAAAAT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGTGATCTTATCTACTCCATCACCTATAAGTTTATGATTCCAAAAT  250

seq1  CAACATCTTTGATCCAAACAGACTCTTGAGCCTAGGTCTCTGTGCTAAGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATCTTTGATCCAAACAGACTCTTGAGCCTAGGTCTCTGTGCTAAGA  300

seq1  TGCCTAGTAAAAGCCCTCCTGCAGGGTATTTTAAATTTGATGTATCTCAG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGTAAAAGCCCTCCTGCAGGGTATTTTAAATTTGATGTATCTCAG  350

seq1  CCCTTATTGTTCCACACTGCTCTGTTGTTTCTTGTTTCTCAACTCTAATG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTATTGTTCCACACTGCTCTGTTGTTTCTTGTTTCTCAACTCTAATG  400

seq1  GCAGAACCCAAACCAGAAATCTGCTCCAACATGTCCTTTTTATGCACAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACCCAAACCAGAAATCTGCTCCAACATGTCCTTTTTATGCACAGC  450

seq1  CAAGAGTTACATCTCACCTTCCATCTCCACAAAGTTCCCAAATTTACCCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTTACATCTCACCTTCCATCTCCACAAAGTTCCCAAATTTACCCT  500

seq1  TTTAGCCAAGTCTTGCCCATTCCTTACTTGAGGTATCTAAGTCATACTTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCCAAGTCTTGCCCATTCCTTACTTGAGGTATCTAAGTCATACTTA  550

seq1  CCATCCAAATCTAAGTGTAGTCAATGCCTCTAAAGCTGGTGTTTCCCACC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCAAATCTAAGTGTAGTCAATGCCTCTAAAGCTGGTGTTTCCCACC  600

seq1  CATCCACCCCCTTTATCTTCCACTGTTTCCTCAGAATACATCACTGCCCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCACCCCCTTTATCTTCCACTGTTTCCTCAGAATACATCACTGCCCA  650

seq1  CAGAGCAGTTAACGGAATCTGGAGTCTACAGTGTCCAAACAGAACATCTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAGTTAACGGAATCTGGAGTCTACAGTGTCCAAACAGAACATCTT  700

seq1  TCCATAGTCATCAAGTGTGACAAACATGACTTGACTTATATTAACTATTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAGTCATCAAGTGTGACAAACATGACTTGACTTATATTAACTATTT  750

seq1  CAAGTATGCTAACAGTTACTGATGTGAGCTCTTTTTAGTACCAGGAATTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTATGCTAACAGTTACTGATGTGAGCTCTTTTTAGTACCAGGAATTC  800

seq1: chr4_7979173_7980214
seq2: B6Ng01-128I18.g_68_1107

seq1  GAATTCATCTTGAAAATTGTACCTGTGGGTGGTGAAATTGTAAGTGATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTTGAAAATTGTACCTGTGGGTGGTGAAATTGTAAGTGATGC  50

seq1  AGATAGCATGGGTGAAATCCTGTGGATTGGCTCATAAATTGCAAACACGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGCATGGGTGAAATCCTGTGGATTGGCTCATAAATTGCAAACACGG  100

seq1  AAATACGAAGGGAAAGGGGTAAGATTATTTCCCAGCAAGCTAAAGGTACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACGAAGGGAAAGGGGTAAGATTATTTCCCAGCAAGCTAAAGGTACA  150

seq1  AACATCAGCAAGATGTGAATAGCAGCCTGGTAAGCCAGAGCCTGCAGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCAGCAAGATGTGAATAGCAGCCTGGTAAGCCAGAGCCTGCAGTGA  200

seq1  CGATGCACAGAAACAGCTGGACTAGCCTAAGTCACATGGGTATGAAGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATGCACAGAAACAGCTGGACTAGCCTAAGTCACATGGGTATGAAGTAG  250

seq1  AATCTTCCACTGATGGCCACATCTCTCCAAAACTATCAGTAAAAAAATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTCCACTGATGGCCACATCTCTCCAAAACTATCAGTAAAAAAATGT  300

seq1  CAGAAGCAGAAAAGTAGTTAAAAATGGAGAGAGGATGGGATGGCTTTCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGCAGAAAAGTAGTTAAAAATGGAGAGAGGATGGGATGGCTTTCTA  350

seq1  ACGTGTGGATTCTGCACCATCAGAGATCTTAACCACAGAGAATTTCTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGTGGATTCTGCACCATCAGAGATCTTAACCACAGAGAATTTCTTAA  400

seq1  AATCTTTGCTTGAGGTTAGGTAACTGGCTTTGTTTGTTTTCACCCTTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTGCTTGAGGTTAGGTAACTGGCTTTGTTTGTTTTCACCCTTATT  450

seq1  TCTAACTCATAGTTTTGAGTCTAACATCAACATCATCATCCCAACTATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTCATAGTTTTGAGTCTAACATCAACATCATCATCCCAACTATTT  500

seq1  CATTTTAGTAGCATATATTTAATCATAATGTATTAGGCAGTGATACTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAGTAGCATATATTTAATCATAATGTATTAGGCAGTGATACTTCA  550

seq1  AACAATATTTTTGATTTTAAAATCTGTCTGGGTAAAGTAGCAACGTAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATATTTTTGATTTTAAAATCTGTCTGGGTAAAGTAGCAACGTAATG  600

seq1  CAGTATGTGGATTACTATGTAGAGGCCATGAGAATAGAGACAAATTTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGTGGATTACTATGTAGAGGCCATGAGAATAGAGACAAATTTTGA  650

seq1  ACATATTGAATCTCTACAACACACAATATAACTTTCCTTACTTTTTATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTGAATCTCTACAACACACAATATAACTTTCCTTACTTTTTATAT  700

seq1  AATTTCCTTTTTTAAAATATTTATTTATTTATTCATTTATTTACTTACTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCTTTTTTAAAATATTTATTTATTTATTCATTTATTTACTTACTT  750

seq1  ACTTATTTATTTATTATATGTGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATTTATTTATTATATGTGAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACACTC  800

seq1  CAGAAGAGAGCATCGGATTTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAGAGCATCGGATTTTGTTACGGATGGTTGTGAGCCACCATGTGG  850

seq1  TTGCTGGGATTTGAACTCAGAACCTTTGGAAG-AGCAGTCGGTGC-TCTT  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  TTGCTGGGATTTGAACTCAGAACCTTTGGAAGAAGCAGTCGGTGCTTCTT  900

seq1  AACCACTGAGCTATCTCACCAGCCCCCTTTATATAATTTTCTATTTATGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| 
seq2  AACCACTGAGCTATCTCACCAGCCCCCTTTATATATTTTTCTATTTATG-  949

seq1  TTTTTTTTATCTTTTGAAATGGTCATAAATGTATACAATAAATCTTTCTT  998
      ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTTTTTTATCTTT--GAATGGTCATAAATGTATACAATAAATCTTTC-T  996

seq1  TTTTGGTTTTGC-TTTTATTTGTTTGGTTGGTTGGTTTGGGGTTT  1042
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  TTTTGGTTTTGCTTTTTATTTGTTTGGTTGG-TGGGTTGGGGTTT  1040

BAC Information

Search Parameter

Search Result

BAC

no map image available.

BAC End Information

Alignment Information