BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128M24
Chromosome4 (Build37)
Map Location 75,387,186 - 75,499,351
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039884
Upstream geneLOC636847, 3110001D03Rik, LOC623529, LOC100039833
Downstream geneLOC667845, Ptprd, LOC667858, LOC667862
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128M24.bB6Ng01-128M24.g
ACCDH930565DH930566
length1,0681,091
definitionDH930565|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128M24, 5' end.DH930566|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128M24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,498,262 - 75,499,351)(75,387,186 - 75,388,272)
sequence
gaattcagccacacagtctgtcaggatgactgctcaaatccccttctaca
tgtggttgctagaaaccatgaggatagtcttggattatacctcctattat
cagaaccttctctttcttgtccccaataggagctctgtctttattttagc
atatggctcagctttgaactcactgcatttacactgcagatagattgatg
cttcgttgttatcttacactccactaatatttctgtcctatcactcaaat
attcttgaaggcaggaggttatatctatgctttctatgcttgacattgct
acatatgaagatactcagcagtagccatagtttagattttaaaagaatat
cattatgatgtctatagcaagcaaatgtaaaacgacaaacagaaagtagc
agacagatagaggcagcacatagcaacacaacacaccttcaaattgggtg
cttactgaattcagcagcaatgattggggaagccttgtggaaagggctgg
agttcccagttcatagaattttaggcagagcaagagttcttgccatgcac
aagcctttgctttcccactgcagggtttttaatgccatgcaataaagact
tctgtgggaaaggatttctctctagttgttctcagggaaccatgttttta
ttcaagctacttactctccttctgttttcaacagcatgatgtttttactc
tgtggtgggctgctgttctttctcttctctcatcccaagacaaaggacac
tttggcatgaacatacttgggtttgaatgaggatgtatgtttgtcttctc
cacttctacaggcagggcctcagtaagcttaaacaagagtaacagtacac
cagtgtattttacattacagtatctttaggaagtaaaacaatacttagaa
aagtaggtagaaatagcagtaaattagtctgatgatgggtgcacagcttc
tcatgacacagtacgctctgtatactgtgctagattcttatgctctgagt
acacatgtgtgtcatttgatgtgatggacatgtgtgtgctggagcatgtg
ctgtgatgttgtgccatt
gaattcagaaaggaacagacaaggatgagagaacctgaagaaggtggagg
acacagggcaatgagaagggattcgccttaagtctcacaattcagaaact
atcaaactcataatcatcaggaggcttctctggaagtaaaaattccaaat
gatgaacactgaggcagtctaggtaagaggtaaaatcccagtgagttaca
tggcccaatcaattcattaaaaatatagatggagcataataaggtcagaa
atccatgctaacagctgtgaggaaactctcaaatgtagcagacctgcccc
aaacccctggccttggtacacctggaaagtcaaattttatactcacattc
tggcaagtattttcactttaagtcaactttgtgagctttaacagctgaaa
ccaagtcatttaaaaaatacaatgaaagctggagttataaagactatgga
aacttacttaacagcatgagctaaagataaccaggaatttgccactggga
gctatttaatgcttttgatggagttgcagcatatagggcctaaggtaatt
gatgtgcagaatgaacaagctaataaatactcactctagaatttctatga
tttaagggggttgggagtactaagttgatgaataagtcccacagtgctct
ttttaaaaatgaggtatgctaagtcttgttggcaatacagtcatatgtca
aatccatttcataaagtcaccatagaagaatagaaagcaagtcatgtgtc
tgaacagtaacaaaaaatttaacaaaagttagtatacatgtttcagattt
taaaaatgtgctaaaccgttacttctggtgaatccagtcaacatgttttt
cctattgtctgaaatttaagtcgttctctaacctacagctttaaagaagc
ccttaagaatccaaaaagttaaacaccaaagtattcagattattttgatc
cataattgagcaaatgaaatgaaaacattcttggaaatatgaaaatacac
atgggccaacagaaccataaaaggatgttcagttattccttagccagtac
aaggatgcatcaactatgctgggattcccaattagcccctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_75498262_75499351
seq2: B6Ng01-128M24.b_49_1116 (reverse)

seq1  AATGTGCACAAACATACACAGGCACATGCTCACAAGCACACACATGTGCA  50
      |||| |||| ||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||| | 
seq2  AATG-GCAC-AACAT-CACA-GCACATGCT--CCAGCACACACATGT-CC  43

seq1  ATCACATCAAAATGAACACACATGTGTACTCAGAGGCATAAGATATCTAA  100
      |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
seq2  ATCACATC-AAATG-ACACACATGTGTACTCAGA-GCATAAGA-ATCT-A  88

seq1  GCACCAAGTAATACAAGAGCGTACTGTGTCATGAGAAAGCTGTGCAACCC  150
      ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  GCAC--AGT-ATAC-AGAGCGTACTGTGTCATGAG-AAGCTGTGC-ACCC  132

seq1  ATCATTCAAGACCTAATTTACTTGCTATTTCTACCTACTTTTCTAAGTAT  200
      |||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAT--CAGA-CTAATTTAC-TGCTATTTCTACCTACTTTTCTAAGTAT  178

seq1  TGTTTTACTTCCTAAAGATACTGTAATGTAAAATACACTGGTGTACTGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTACTTCCTAAAGATACTGTAATGTAAAATACACTGGTGTACTGTT  228

seq1  ACTCTTGTTTAAGCTTACTGAGGCCCTGCCTGTAGAAGTGGAGAAGACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTGTTTAAGCTTACTGAGGCCCTGCCTGTAGAAGTGGAGAAGACAA  278

seq1  ACATACATCCTCATTCAAACCCAAGTATGTTCATGCCAAAGTGTCCTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACATCCTCATTCAAACCCAAGTATGTTCATGCCAAAGTGTCCTTTG  328

seq1  TCTTGGGATGAGAGAAGAGAAAGAACAGCAGCCCACCACAGAGTAAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGGATGAGAGAAGAGAAAGAACAGCAGCCCACCACAGAGTAAAAAC  378

seq1  ATCATGCTGTTGAAAACAGAAGGAGAGTAAGTAGCTTGAATAAAAACATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGCTGTTGAAAACAGAAGGAGAGTAAGTAGCTTGAATAAAAACATG  428

seq1  GTTCCCTGAGAACAACTAGAGAGAAATCCTTTCCCACAGAAGTCTTTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCCTGAGAACAACTAGAGAGAAATCCTTTCCCACAGAAGTCTTTATT  478

seq1  GCATGGCATTAAAAACCCTGCAGTGGGAAAGCAAAGGCTTGTGCATGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGCATTAAAAACCCTGCAGTGGGAAAGCAAAGGCTTGTGCATGGCA  528

seq1  AGAACTCTTGCTCTGCCTAAAATTCTATGAACTGGGAACTCCAGCCCTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTCTTGCTCTGCCTAAAATTCTATGAACTGGGAACTCCAGCCCTTT  578

seq1  CCACAAGGCTTCCCCAATCATTGCTGCTGAATTCAGTAAGCACCCAATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAGGCTTCCCCAATCATTGCTGCTGAATTCAGTAAGCACCCAATTT  628

seq1  GAAGGTGTGTTGTGTTGCTATGTGCTGCCTCTATCTGTCTGCTACTTTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTGTGTTGTGTTGCTATGTGCTGCCTCTATCTGTCTGCTACTTTCT  678

seq1  GTTTGTCGTTTTACATTTGCTTGCTATAGACATCATAATGATATTCTTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCGTTTTACATTTGCTTGCTATAGACATCATAATGATATTCTTTT  728

seq1  AAAATCTAAACTATGGCTACTGCTGAGTATCTTCATATGTAGCAATGTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCTAAACTATGGCTACTGCTGAGTATCTTCATATGTAGCAATGTCA  778

seq1  AGCATAGAAAGCATAGATATAACCTCCTGCCTTCAAGAATATTTGAGTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGAAAGCATAGATATAACCTCCTGCCTTCAAGAATATTTGAGTGA  828

seq1  TAGGACAGAAATATTAGTGGAGTGTAAGATAACAACGAAGCATCAATCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACAGAAATATTAGTGGAGTGTAAGATAACAACGAAGCATCAATCTA  878

seq1  TCTGCAGTGTAAATGCAGTGAGTTCAAAGCTGAGCCATATGCTAAAATAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGTGTAAATGCAGTGAGTTCAAAGCTGAGCCATATGCTAAAATAA  928

seq1  AGACAGAGCTCCTATTGGGGACAAGAAAGAGAAGGTTCTGATAATAGGAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGCTCCTATTGGGGACAAGAAAGAGAAGGTTCTGATAATAGGAG  978

seq1  GTATAATCCAAGACTATCCTCATGGTTTCTAGCAACCACATGTAGAAGGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAATCCAAGACTATCCTCATGGTTTCTAGCAACCACATGTAGAAGGG  1028

seq1  GATTTGAGCAGTCATCCTGACAGACTGTGTGGCTGAATTC  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGAGCAGTCATCCTGACAGACTGTGTGGCTGAATTC  1068

seq1: chr4_75387186_75388272
seq2: B6Ng01-128M24.g_67_1157

seq1  GAATTCAGAAAGGAACAGACAAGGATGAGAGAACCTGAAGAAGGTGGAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAAGGAACAGACAAGGATGAGAGAACCTGAAGAAGGTGGAGG  50

seq1  ACACAGGGCAATGAGAAGGGATTCGCCTTAAGTCTCACAATTCAGAAACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGGGCAATGAGAAGGGATTCGCCTTAAGTCTCACAATTCAGAAACT  100

seq1  ATCAAACTCATAATCATCAGGAGGCTTCTCTGGAAGTAAAAATTCCAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAACTCATAATCATCAGGAGGCTTCTCTGGAAGTAAAAATTCCAAAT  150

seq1  GATGAACACTGAGGCAGTCTAGGTAAGAGGTAAAATCCCAGTGAGTTACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAACACTGAGGCAGTCTAGGTAAGAGGTAAAATCCCAGTGAGTTACA  200

seq1  TGGCCCAATCAATTCATTAAAAATATAGATGGAGCATAATAAGGTCAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCAATCAATTCATTAAAAATATAGATGGAGCATAATAAGGTCAGAA  250

seq1  ATCCATGCTAACAGCTGTGAGGAAACTCTCAAATGTAGCAGACCTGCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATGCTAACAGCTGTGAGGAAACTCTCAAATGTAGCAGACCTGCCCC  300

seq1  AAACCCCTGGCCTTGGTACACCTGGAAAGTCAAATTTTATACTCACATTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCCTGGCCTTGGTACACCTGGAAAGTCAAATTTTATACTCACATTC  350

seq1  TGGCAAGTATTTTCACTTTAAGTCAACTTTGTGAGCTTTAACAGCTGAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAGTATTTTCACTTTAAGTCAACTTTGTGAGCTTTAACAGCTGAAA  400

seq1  CCAAGTCATTTAAAAAATACAATGAAAGCTGGAGTTATAAAGACTATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCATTTAAAAAATACAATGAAAGCTGGAGTTATAAAGACTATGGA  450

seq1  AACTTACTTAACAGCATGAGCTAAAGATAACCAGGAATTTGCCACTGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTACTTAACAGCATGAGCTAAAGATAACCAGGAATTTGCCACTGGGA  500

seq1  GCTATTTAATGCTTTTGATGGAGTTGCAGCATATAGGGCCTAAGGTAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTAATGCTTTTGATGGAGTTGCAGCATATAGGGCCTAAGGTAATT  550

seq1  GATGTGCAGAATGAACAAGCTAATAAATACTCACTCTAGAATTTCTATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGCAGAATGAACAAGCTAATAAATACTCACTCTAGAATTTCTATGA  600

seq1  TTTAAGGGGGTTGGGAGTACTAAGTTGATGAATAAGTCCCACAGTGCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGGGGTTGGGAGTACTAAGTTGATGAATAAGTCCCACAGTGCTCT  650

seq1  TTTTAAAAATGAGGTATGCTAAGTCTTGTTGGCAATACAGTCATATGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAATGAGGTATGCTAAGTCTTGTTGGCAATACAGTCATATGTCA  700

seq1  AATCCA-TTCATAAAGTCACCATAGAAGAATAGAAAGCAAGTCATGTGTC  749
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATTTCATAAAGTCACCATAGAAGAATAGAAAGCAAGTCATGTGTC  750

seq1  TGAACAGTAACAAAAAATTTAACAAAAGTTAGTATACATGTTTCAAGATT  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TGAACAGTAACAAAAAATTTAACAAAAGTTAGTATACATGTTTC-AGATT  799

seq1  TTAAAAATGTGCTAAACCGTTACTTCTGGTGAATCCAGTCAACATGTTTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATGTGCTAAACCGTTACTTCTGGTGAATCCAGTCAACATGTTTT  849

seq1  TCCTA-TGTCTGAAAATTTAAGTCG-TCTCTAACCTACAGCTTTAAAGAA  897
      ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTGTCTG-AAATTTAAGTCGTTCTCTAACCTACAGCTTTAAAGAA  898

seq1  GCCTTTAAGAATTCAAAAAGTTAAACACCAAAGTA-TCAGA-TAATTTGA  945
      ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||
seq2  GCCCTTAAGAATCCAAAAAGTTAAACACCAAAGTATTCAGATTATTTTGA  948

seq1  TCCATAAATGAGCAAATGAAATGGACAAACAATTCTT-GAAATATG-AAA  993
      ||||||| |||||||||||||||   |||  |||||| |||||||| |||
seq2  TCCATAATTGAGCAAATGAAATG---AAAACATTCTTGGAAATATGAAAA  995

seq1  TACACAT-GGCCAACAGACACATAAAAGAATGTTCAGT--ATCCTTAGCC  1040
      ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||   |||||||||
seq2  TACACATGGGCCAACAGAACCATAAAAGGATGTTCAGTTATTCCTTAGCC  1045

seq1  AGTACAAAGATGCAATCAAACTATGCTGGGATT-CCAATTAGCCCCTG  1087
      ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGTACAAGGATGC-ATC-AACTATGCTGGGATTCCCAATTAGCCCCTG  1091