BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134F23
Chromosome4 (Build37)
Map Location 30,511,463 - 30,632,197
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC619906
Upstream geneLOC665185
Downstream geneLOC100040864, LOC100040891
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134F23.bB6Ng01-134F23.g
ACCDH934687DH934688
length1,1281,095
definitionDH934687|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134F23, 5' end.DH934688|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134F23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,631,070 - 30,632,197)(30,511,463 - 30,512,571)
sequence
gaattcaaccgatgaattgggcagtataaacagcattgctccctcccttg
tatttatctgcaaagtaagtattcatggcacatccacaatatgttagatt
gttgttggagctgaggacagaacattgaaataagtatttgctcttatggg
tgtttcatatcagaacaagaacatcaggtaaataaaaaaattcaaagtaa
ttttcttatgatatttttatcgattatttgagaacgtcatatcaggaacc
ctgagcgcactgttcagtccttttagatctgtgcaccccctatgaccact
ctctcaaaaaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaaaatgcaagtc
taatttgtgttacccatatactcactggagcatggtcaaactcccagtgg
ccaggcccttagataaaactgaattttccctcatcttcactcttgtcaaa
agtcatcagttgtagcatccttatcacaatttctaagaatttgctttgat
ggctttctgtcccagctgtcactttggggggtgggagcagtgttggtggt
tgtcacaaggaccttctatgttcctctttctcaactgtgagctgcagtca
atatcatggcaagagtagcttccttaagtacccaaggagcttaagggttt
tgcagtcccataggagaaacaacaatatgaactatccagtacccccagag
ctccctgggactaaaccaccaatcaaagatgaatatatgtgatatgtaaa
gtcattacagatcatctcaaaggattatgggactgagaaatctgaccaga
cattagcaagaggaaatagtgtaaattacatcccatacttaaaaaccaag
agcaatgaaggttcatcctgagtccataggccaggattagttaacacagg
taaaggcagactgatcagcattactccccgtgtttatatgttgtccattt
aaggtattcagctcactaagatgattatcaactatgagattgagtttctt
ccctaaatcactcagtgaaaaatggaaatcattgaatggaatgctgtcta
gcagaacagggctaatgaggaattaaat
gaattctccttttaaacacattagcgaataaaagaacaatataaatgatc
attgcctatggaaacttaatgagaaagaaatctaacattcgcacaatcct
cccccacgatagcatgcatggaagacagtcattctcagagaaaacataag
gttgcacaacactttccctttaacagtgattggtactaaattgaatattt
aaaattggaaaagtttaaaatatcacattgcaaagcatctaacaggtaaa
ggacccaaacctcagctgatatgcctaagagtgtgaacactatgctgata
tacattcgagtgaaactacattccactaccacatctcctatctctcccaa
attaaacacccttatcactggaggcaaatacagaacaacgcattggtggt
cagagaagcagatgccacttctagtgaatgattccttcttagctctcaag
ctatttttagtcaaaatgtaagttggaatactagagagaaaaggagaaaa
ggcttgcttttagccattatcatggaatataatctgctgtcataatatgt
tacagaagctcacaggcagatgcttccataattacagcgttcaaaatggt
aagtgcaagagtggaaggagttacagagacaaagtttggagctgagacaa
aaggatggaccatctagagactgccatatccagggatccatcctataatt
agcctccaaacgatgacaccattgcatacactagcaagattttgctgaaa
ggaccctgacatagctgtctattgtgagactaggccgggcctagcaaaca
cagaagtggatgctcacagtcagctattggatggatcacagggcccccaa
tagaggagctagagaaagtacccaaggagctaaagggatctgcaaccctg
taagtgcaacaacataaaaactaaccagtacccggagctctgactctagc
tgcatatgtatcaaagatggcctagttggccatcactggaaagagaggct
cattggacacacaaactttatatgcctcagtacaggaaacgtcagggcca
aaagtggcatggtggggcatggggattcgatagcatttgaatgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_30631070_30632197
seq2: B6Ng01-134F23.b_43_1170 (reverse)

seq1  ATTTAATCACTCATTAGACCCTATCTGCTAG-CACCATT-CAATCAATGA  48
      |||||||  |||||||| ||   |||||||| || |||| || |||||||
seq2  ATTTAATTCCTCATTAGCCCTGTTCTGCTAGACAGCATTCCATTCAATGA  50

seq1  TTTCTA-TTTTCACTGAGTGAATTTTAGGGAAGAAACTCAATCTCATAGT  97
      |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCATTTTTCACTGAGTGA--TTTAGGGAAGAAACTCAATCTCATAGT  98

seq1  TGAT-ATCATC-TAGTGAGCTGAATACCTAAAATGGACAAACATATAAAC  145
      |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  TGATAATCATCTTAGTGAGCTGAATACCTTAAATGGAC-AACATATAAAC  147

seq1  ACGGGGAGTAATGCTGATCAGTCTGCCTTTACCTGTTGTTAACTAATCCT  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACGGGGAGTAATGCTGATCAGTCTGCCTTTACCTG-TGTTAACTAATCCT  196

seq1  GGCCTATGGACTCAGGATGAAACCTTCATTGCTCTTGGTTTTTAAGTATG  245
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTATGGACTCAGGATG-AACCTTCATTGCTCTTGGTTTTTAAGTATG  245

seq1  GGATGTAATTTACACTATTTCCTCTTGCTAATGTCTGGTCAGATTTCTCA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTAATTTACACTATTTCCTCTTGCTAATGTCTGGTCAGATTTCTCA  295

seq1  GTCCCATAATCCTTTGAGATGATCTGTAATGACTTTACATATCACATATA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCATAATCCTTTGAGATGATCTGTAATGACTTTACATATCACATATA  345

seq1  TTCATCTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCAGGGAGCTCTGGGGGTACTGGAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTTTGATTGGTGGTTTAGTCCCAGGGAGCTCTGGGGGTACTGGAT  395

seq1  AGTTCATATTGTTGTTTCTCCTATGGGACTGCAAAACCCTTAAGCTCCTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATATTGTTGTTTCTCCTATGGGACTGCAAAACCCTTAAGCTCCTT  445

seq1  GGGTACTTAAGGAAGCTACTCTTGCCATGATATTGACTGCAGCTCACAGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACTTAAGGAAGCTACTCTTGCCATGATATTGACTGCAGCTCACAGT  495

seq1  TGAGAAAGAGGAACATAGAAGGTCCTTGTGACAACCACCAACACTGCTCC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAAGAGGAACATAGAAGGTCCTTGTGACAACCACCAACACTGCTCC  545

seq1  CACCCCCCAAAGTGACAGCTGGGACAGAAAGCCATCAAAGCAAATTCTTA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCCCAAAGTGACAGCTGGGACAGAAAGCCATCAAAGCAAATTCTTA  595

seq1  GAAATTGTGATAAGGATGCTACAACTGATGACTTTTGACAAGAGTGAAGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTGTGATAAGGATGCTACAACTGATGACTTTTGACAAGAGTGAAGA  645

seq1  TGAGGGAAAATTCAGTTTTATCTAAGGGCCTGGCCACTGGGAGTTTGACC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGAAAATTCAGTTTTATCTAAGGGCCTGGCCACTGGGAGTTTGACC  695

seq1  ATGCTCCAGTGAGTATATGGGTAACACAAATTAGACTTGCATTTTTCTTC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCAGTGAGTATATGGGTAACACAAATTAGACTTGCATTTTTCTTC  745

seq1  TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT  795

seq1  CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTGAGAGAGTGGTCATAGGGGGTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTGAGAGAGTGGTCATAGGGGGTG  845

seq1  CACAGATCTAAAAGGACTGAACAGTGCGCTCAGGGTTCCTGATATGACGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGATCTAAAAGGACTGAACAGTGCGCTCAGGGTTCCTGATATGACGT  895

seq1  TCTCAAATAATCGATAAAAATATCATAAGAAAATTACTTTGAATTTTTTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAATAATCGATAAAAATATCATAAGAAAATTACTTTGAATTTTTTT  945

seq1  ATTTACCTGATGTTCTTGTTCTGATATGAAACACCCATAAGAGCAAATAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACCTGATGTTCTTGTTCTGATATGAAACACCCATAAGAGCAAATAC  995

seq1  TTATTTCAATGTTCTGTCCTCAGCTCCAACAACAATCTAACATATTGTGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTCAATGTTCTGTCCTCAGCTCCAACAACAATCTAACATATTGTGG  1045

seq1  ATGTGCCATGAATACTTACTTTGCAGATAAATACAAGGGAGGGAGCAATG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCCATGAATACTTACTTTGCAGATAAATACAAGGGAGGGAGCAATG  1095

seq1  CTGTTTATACTGCCCAATTCATCGGTTGAATTC  1128
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTATACTGCCCAATTCATCGGTTGAATTC  1128

seq1: chr4_30511463_30512571
seq2: B6Ng01-134F23.g_68_1162

seq1  GAATTCTCCTTTTAAACACATTAGCGAATAAAAGAACAATATAAATGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTTTAAACACATTAGCGAATAAAAGAACAATATAAATGATC  50

seq1  ATTGCCTATGGAAACTTAATGAGAAAGAAATCTAACATTCGCACAATCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCTATGGAAACTTAATGAGAAAGAAATCTAACATTCGCACAATCCT  100

seq1  CCCCCACGATAGCATGCATGGAAGACAGTCATTCTCAGAGAAAACATAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACGATAGCATGCATGGAAGACAGTCATTCTCAGAGAAAACATAAG  150

seq1  GTTGCACAACACTTTCCCTTTAACAGTGATTGGTACTAAATTGAATATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGCACAACACTTTCCCTTTAACAGTGATTGGTACTAAATTGAATATTT  200

seq1  AAAATTGGAAAAGTTTAAAATATCACATTGCAAAGCATCTAACAGGTAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTGGAAAAGTTTAAAATATCACATTGCAAAGCATCTAACAGGTAAA  250

seq1  GGACCCAAACCTCAGCTGATATGCCTAAGAGTGTGAACACTATGCTGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCAAACCTCAGCTGATATGCCTAAGAGTGTGAACACTATGCTGATA  300

seq1  TACATTCGAGTGAAACTACATTCCACTACCACATCTCCTATCTCTCCCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTCGAGTGAAACTACATTCCACTACCACATCTCCTATCTCTCCCAA  350

seq1  ATTAAACACCCTTATCACTGGAGGCAAATACAGAACAACGCATTGGTGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAACACCCTTATCACTGGAGGCAAATACAGAACAACGCATTGGTGGT  400

seq1  CAGAGAAGCAGATGCCACTTCTAGTGAATGATTCCTTCTTAGCTCTCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAAGCAGATGCCACTTCTAGTGAATGATTCCTTCTTAGCTCTCAAG  450

seq1  CTATTTTTAGTCAAAATGTAAGTTGGAATACTAGAGAGAAAAGGAGAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTTTAGTCAAAATGTAAGTTGGAATACTAGAGAGAAAAGGAGAAAA  500

seq1  GGCTTGCTTTTAGCCATTATCATGGAATATAATCTGCTGTCATAATATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGCTTTTAGCCATTATCATGGAATATAATCTGCTGTCATAATATGT  550

seq1  TACAGAAGCTCACAGGCAGATGCTTCCATAATTACAGCGTTCAAAATGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAAGCTCACAGGCAGATGCTTCCATAATTACAGCGTTCAAAATGGT  600

seq1  AAGTGCAAGAGTGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGCAAGAGTGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGACAA  650

seq1  AAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCATCCTATAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCATCCTATAATT  700

seq1  AGCCTCCAAACGATGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCAAACGATGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAA  750

seq1  GGACCCTGACATAGCTGTCTATTGTGAGACTAGGCCGGGCCTAGCAAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCTGACATAGCTGTCTATTGTGAGACTAGGCCGGGCCTAGCAAACA  800

seq1  CAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCCCAA  850

seq1  TAGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTG  900

seq1  TAGGTGCAACAACATTATAAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCT  950
      || ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  TAAGTGCAACAACA-TAAAAACTAACCAGTA-CCCGGAGCTC-TGACTCT  947

seq1  AGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTTGGCCATCACTGGAAAGAGA  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCATATGTATC-AAAGATGGCCTAGTTGGCCATCACTGGAAAGAGA  996

seq1  GGCCCATTGGACACACAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGAAACGCCAG  1050
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||
seq2  GGCTCATTGGACACACAAACTTTATATGCCTCAGTACA-GGAAACGTCAG  1045

seq1  GGCCAAAAAGTGGGAATGGGTGGGGCATGGGGGAATTTTGGAATAGCATT  1100
      |||| |||||||| |   ||||||||||||||  |||     ||||||||
seq2  GGCC-AAAAGTGGCA--TGGTGGGGCATGGGG--ATT---CGATAGCATT  1087

seq1  GGAAATGTA  1109
       | ||||||
seq2  TG-AATGTA  1095