BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-140E22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 122,570,484 - 122,719,785
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMfsd2, Mycl1, Trit1
Upstream geneLOC666931, LOC666937, LOC633269, LOC633279, 9530002B09Rik, Ppt1, Cap1
Downstream geneBmp8b, Oxct2b, Ppie, Hpcal4, Nt5c1a, Heyl, LOC194197, LOC622334, Pabpc4, Bmp8a, Oxct2a, Macf1, D830031N03Rik, LOC100039110, Ndufs5, 6330407G11Rik, Rhbdl2, LOC667064, Mycbp, Rragc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-140E22.bB6Ng01-140E22.g
ACCDH939074DH939075
length1,0741,130
definitionDH939074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-140E22, 5' end.DH939075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-140E22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(122,718,700 - 122,719,785)(122,570,484 - 122,571,617)
sequence
gaattctatcagttcatggctagcctgtgctacatagcaaaaatacaccc
agccagaactacacagaccttatctcaaaaaacagacaggggctagcagg
atggctcagtaggtacaggtgcttgccacccagtctgcggacacaagcag
aggctagccttgaatgccccatcttcatgcatgggattctggagctcact
gggacactttcagtttgacactgtgacttctatgctcttaaccaaccttc
aaatctagcctagagctagtctggtgaagctgtcctctgctgcctctgtg
cctggaaaacatccaaccctctccacgtcatatcattctttaggagcaat
ctgactgtctcagagtaaaacctcatctttagctgtcaacctgaaaggga
tttcatatgtatactatctcatctgacacaacagccctgcaaagtaggca
gacttgaaattattatctacattttaatctacccatttgataggcaaagc
cactatctcattgtctggatttgaatgccatgattagtaaggagggcaaa
ccttttccatgcttatcatctgtgcttgctcctatgtgaataccagccct
ataagtaccttcatattcacaggagagtccttcatttattaagaacatta
gtcacttgttctctgtgttataaacgttttccccaagcttatatatgtcc
tgtttgctcaaagctgggttgaactgctgtgtagccaatggccttacgat
ccactcctaggggctgggattgcaggcgtataccacaccaagcatagttt
gcttttcaacttttgtagttataactgtggcaaaaccccacatgtatctt
gcaattctcaacatttatattgtttataaattcttccatgctgactgatg
catctacaatctattcatctttactgttacaaggacctctatgagtaaac
aaattttgtacattctttgagagtacaaatttgggtgtttactgctatta
gggcaaattttatgttcctagatcaactgcctgaactagagtgtctaggc
acatgcctagtgttctggatgaca
gaattcaaagagatggttcagtgaataaatgtaattgctgcagacgcctc
gtgatctatctgagtttgatatctggaacctgtgtaaggaggaagaagaa
gagaactgactccacaaaattgtctcctgaccaccacgtgtatactgtgg
catgctccgtgtccctccaacccccaattacacacaccactaggtgccca
caggaaaacaggcacacatagatacccacaaattaattttaaaagggaat
ggacttggttgggcctagtacgctaggaaattaacagtaagtattgttag
ctttggtagtagaaggtgtaccctctcacatgtgggataatgcctgctac
catttaaatctgaaaagtgaccccaaaaggtacaagctttgagcatgctt
ggtccccacttgtgccactatttggaaagctgtggaacctttcagaagtg
agtcctgactgctgaaaacgggtgaccagaagagggtctttgaaggttat
actcactcatgatgctaatatccctcctctgtttcctggatgaccgtcat
gtgaacagctctgcgatatgctccctcctctgggacagccacaacatgct
cctgcccctttctctttgaggggctgagacccctcggaaactgtgaacca
aaataagttgttgttctctcaagctgtttcgggcaaacagtctgcgacag
taacacacactgtccaagcatatgaaggtggcaccgttgaggactgtcca
gagataatgacagacgtacactatgtctagacttttttgaatgctcaata
tcagcacataccctttctctctatgcttgcacttcaaaaactaagcatcc
ccgaagtcttcaacaatttcttttataatctaaagagtaggctctcacat
tcaccttctaccctaaactgggaatcatctcaatcaagcaggaagctcta
agatcaccaagataacattcttacaggctgtagtgactccatctcctgtg
ttctgttgctgtgatagtggaataaaaaatgactcctctagctcatgggg
actgcactgtggaagggtgctcttctctggtgaatctgagaggaacgata
gtcttgaaattcaaaatcaaaacctgacca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_122718700_122719785
seq2: B6Ng01-140E22.b_46_1119 (reverse)

seq1  TGTCAAACCAGAACACCTAGGCATGTGCCCTAGGACACTCTAGTTCAGGC  50
      |||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||
seq2  TGTC-ATCCAGAACA-CTAGGCATGTG-CCTA-GACACTCTAGTTCAGGC  46

seq1  AGTTTGATCTAGGTATACAATAAAATTTTGCCCTAATAGCAGTAAACACC  100
      || ||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AG-TTGATCTAGG---AACATAAAA-TTTGCCCTAATAGCAGTAAACACC  91

seq1  CAAATTTGTACTCTCAAAGAATGTACAAAATTTGTTTTACTCATAGAGGT  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| 
seq2  CAAATTTGTACTCTCAAAGAATGTACAAAATTTG-TTTACTCATAGAGG-  139

seq1  TCTTTGTAACAGTAAAGATGAATAGATTGTAGATGCATCAGTCAGCATGG  200
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGTAACAGTAAAGATGAATAGATTGTAGATGCATCAGTCAGCATGG  189

seq1  AAGAATTTTATAAACAATATAAATGTTGAGAATTGCAAGATACATGTGGG  250
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAA-TTTATAAACAATATAAATGTTGAGAATTGCAAGATACATGTGGG  238

seq1  GTTTTGCCACAGTTATAACTACAAAAGTTGAAAAGCAAACTATGCTTGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGCCACAGTTATAACTACAAAAGTTGAAAAGCAAACTATGCTTGGT  288

seq1  GTGGTATACGCCTGCAATCCCAGCCCCTAGGAGTGGATCGTAAGGCCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTATACGCCTGCAATCCCAGCCCCTAGGAGTGGATCGTAAGGCCATT  338

seq1  GGCTACACAGCAGTTCAACCCAGCTTTGAGCAAACAGGACATATATAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACACAGCAGTTCAACCCAGCTTTGAGCAAACAGGACATATATAAGC  388

seq1  TTGGGGAAAACGTTTATAACACAGAGAACAAGTGACTAATGTTCTTAATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAAAACGTTTATAACACAGAGAACAAGTGACTAATGTTCTTAATA  438

seq1  AATGAAGGACTCTCCTGTGAATATGAAGGTACTTATAGGGCTGGTATTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAAGGACTCTCCTGTGAATATGAAGGTACTTATAGGGCTGGTATTCA  488

seq1  CATAGGAGCAAGCACAGATGATAAGCATGGAAAAGGTTTGCCCTCCTTAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGGAGCAAGCACAGATGATAAGCATGGAAAAGGTTTGCCCTCCTTAC  538

seq1  TAATCATGGCATTCAAATCCAGACAATGAGATAGTGGCTTTGCCTATCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCATGGCATTCAAATCCAGACAATGAGATAGTGGCTTTGCCTATCAA  588

seq1  ATGGGTAGATTAAAATGTAGATAATAATTTCAAGTCTGCCTACTTTGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGTAGATTAAAATGTAGATAATAATTTCAAGTCTGCCTACTTTGCAG  638

seq1  GGCTGTTGTGTCAGATGAGATAGTATACATATGAAATCCCTTTCAGGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTTGTGTCAGATGAGATAGTATACATATGAAATCCCTTTCAGGTTG  688

seq1  ACAGCTAAAGATGAGGTTTTACTCTGAGACAGTCAGATTGCTCCTAAAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTAAAGATGAGGTTTTACTCTGAGACAGTCAGATTGCTCCTAAAGA  738

seq1  ATGATATGACGTGGAGAGGGTTGGATGTTTTCCAGGCACAGAGGCAGCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATGACGTGGAGAGGGTTGGATGTTTTCCAGGCACAGAGGCAGCAG  788

seq1  AGGACAGCTTCACCAGACTAGCTCTAGGCTAGATTTGAAGGTTGGTTAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGCTTCACCAGACTAGCTCTAGGCTAGATTTGAAGGTTGGTTAAG  838

seq1  AGCATAGAAGTCACAGTGTCAAACTGAAAGTGTCCCAGTGAGCTCCAGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATAGAAGTCACAGTGTCAAACTGAAAGTGTCCCAGTGAGCTCCAGAA  888

seq1  TCCCATGCATGAAGATGGGGCATTCAAGGCTAGCCTCTGCTTGTGTCCGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATGCATGAAGATGGGGCATTCAAGGCTAGCCTCTGCTTGTGTCCGC  938

seq1  AGACTGGGTGGCAAGCACCTGTACCTACTGAGCCATCCTGCTAGCCCCTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTGGGTGGCAAGCACCTGTACCTACTGAGCCATCCTGCTAGCCCCTG  988

seq1  TCTGTTTTTTGAGATAAGGTCTGTGTAGTTCTGGCTGGGTGTATTTTTGC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTTTTGAGATAAGGTCTGTGTAGTTCTGGCTGGGTGTATTTTTGC  1038

seq1  TATGTAGCACAGGCTAGCCATGAACTGATAGAATTC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGCACAGGCTAGCCATGAACTGATAGAATTC  1074

seq1: chr4_122570484_122571617
seq2: B6Ng01-140E22.g_68_1197

seq1  GAATTCAAAGAGATGGTTCAGTGAATAAATGTAATTGCTGCAGACGCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGAGATGGTTCAGTGAATAAATGTAATTGCTGCAGACGCCTC  50

seq1  GTGATCTATCTGAGTTTGATATCTGGAACCTGTGTAAGGAGGAAGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCTATCTGAGTTTGATATCTGGAACCTGTGTAAGGAGGAAGAAGAA  100

seq1  GAGAACTGACTCCACAAAATTGTCTCCTGACCACCACGTGTATACTGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACTGACTCCACAAAATTGTCTCCTGACCACCACGTGTATACTGTGG  150

seq1  CATGCTCCGTGTCCCTCCAACCCCCAATTACACACACCACTAGGTGCCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTCCGTGTCCCTCCAACCCCCAATTACACACACCACTAGGTGCCCA  200

seq1  CAGGAAAACAGGCACACATAGATACCCACAAATTAATTTTAAAAGGGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAAACAGGCACACATAGATACCCACAAATTAATTTTAAAAGGGAAT  250

seq1  GGACTTGGTTGGGCCTAGTACGCTAGGAAATTAACAGTAAGTATTGTTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGGTTGGGCCTAGTACGCTAGGAAATTAACAGTAAGTATTGTTAG  300

seq1  CTTTGGTAGTAGAAGGTGTACCCTCTCACATGTGGGATAATGCCTGCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTAGTAGAAGGTGTACCCTCTCACATGTGGGATAATGCCTGCTAC  350

seq1  CATTTAAATCTGAAAAGTGACCCCAAAAGGTACAAGCTTTGAGCATGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAATCTGAAAAGTGACCCCAAAAGGTACAAGCTTTGAGCATGCTT  400

seq1  GGTCCCCACTTGTGCCACTATTTGGAAAGCTGTGGAACCTTTCAGAAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCCCACTTGTGCCACTATTTGGAAAGCTGTGGAACCTTTCAGAAGTG  450

seq1  AGTCCTGACTGCTGAAAACGGGTGACCAGAAGAGGGTCTTTGAAGGTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGACTGCTGAAAACGGGTGACCAGAAGAGGGTCTTTGAAGGTTAT  500

seq1  ACTCACTCATGATGCTAATATCCCTCCTCTGTTTCCTGGATGACCGTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTCATGATGCTAATATCCCTCCTCTGTTTCCTGGATGACCGTCAT  550

seq1  GTGAACAGCTCTGCGATATGCTCCCTCCTCTGGGACAGCCACAACATGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACAGCTCTGCGATATGCTCCCTCCTCTGGGACAGCCACAACATGCT  600

seq1  CCTGCCCCTTTCTCTTTGAGGGGCTGAGACCCCTCGGAAACTGTGAACCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCCCTTTCTCTTTGAGGGGCTGAGACCCCTCGGAAACTGTGAACCA  650

seq1  AAATAAGTTGTTGTTCTCTCAAGCTGTTTCGGGCAAACAGTCTGCGACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAGTTGTTGTTCTCTCAAGCTGTTTCGGGCAAACAGTCTGCGACAG  700

seq1  TAACACACACTGTCCAAGCATATGAAGGTGGCACCGTTGAGGACTGTCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACACACTGTCCAAGCATATGAAGGTGGCACCGTTGAGGACTGTCCA  750

seq1  GAGATAATGACAGACGTACACTATGCCTAGAC-TTTTTGAATGCTCAATA  799
      ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  GAGATAATGACAGACGTACACTATGTCTAGACTTTTTTGAATGCTCAATA  800

seq1  TCAGCACATACCC-TTCTCTCTATGCTTGCACTTCAAAAACTAAAGCAAC  848
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
seq2  TCAGCACATACCCTTTCTCTCTATGCTTGCACTTCAAAAACT-AAGCATC  849

seq1  CCCGAAGCCTCAAACAA-TTCTTTTATAACCTAAAGAGTAAGC-CCCACA  896
      ||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||
seq2  CCCGAAGTCTTCAACAATTTCTTTTATAATCTAAAGAGTAGGCTCTCACA  899

seq1  TCCACCTTCTACCCTAAAACTGGAATCAT-TCCATCCAGCAAGGAGC-CC  944
      | ||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||| | ||| | 
seq2  TTCACCTTCTACCCTAAACTGGGAATCATCTCAATCAAGCAGGAAGCTCT  949

seq1  AAGATCACC-AGATAACATTCCTTCAGGCCTGTAGTGACTCCATCT-CTG  992
      ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||
seq2  AAGATCACCAAGATAACATTCTTACAGG-CTGTAGTGACTCCATCTCCTG  998

seq1  TGTTCTGTTGCTGTGATAGTTGGAATAAAAAATGACCCCATAAGCTCATG  1042
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||
seq2  TGTTCTGTTGCTGTGATAG-TGGAATAAAAAATGACTCCTCTAGCTCATG  1047

seq1  GGGACTGGCACTGTTGGAAAGGGTGGCTC-TCTCTGTGTGATCTTGTGAG  1091
      |||||| |||||||  | |||||| |||| |||||| ||||   | ||||
seq2  GGGACT-GCACTGT--GGAAGGGT-GCTCTTCTCTG-GTGA--ATCTGAG  1090

seq1  AGGACGTATGGGCTTTGAAATTTCAAATACTCAAACCTGACCA  1134
      ||||   || | | ||||||||  ||||    |||||||||||
seq2  AGGAACGATAGTC-TTGAAATTCAAAAT--CAAAACCTGACCA  1130