BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-145P03
Chromosome4 (Build37)
Map Location 80,582,082 - 80,723,728
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD4Bwg0951e
Upstream geneTyrp1
Downstream geneMpdz, LOC100040131, LOC100040144, EG668895, LOC100040164, EG545641
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-145P03.bB6Ng01-145P03.g
ACCDH943216DH943217
length1,113922
definitionDH943216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145P03, 5' end.DH943217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-145P03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,582,082 - 80,583,203)(80,722,976 - 80,723,728)
sequence
gaattctccttgttcctactccaaagatgtgtttatttagttattcttgg
agtattaagttcagtgtgtgaaaaaaaaagttcagtgtgtgtctgtgctg
ggcaattgttgttttgttatatgaacaaaaggtgaagaataaataaacta
agatgaacgatgggctgaaggcaagggacacaaacttaatggtcatgtgc
taagccactgtcatgttttctacctgcctgcttcttctgcattatctgca
ctgtacctaaactacctgtgtgtgagtgcgttctcagaagagtcttctca
accgctatcagatgataccatcaaagaacttattttttccaaacaggcaa
agaatagtaaagacagacccaaaacaagctttttttgaggacttataagg
ctcagtgattgcagccattagaatggaaagggtggatgaaggaagactcc
aagggccagagttccagtgaactagaagaaaagcacttggaaaagttctc
caggaatcatcttgccctcttcctctttcttccatgcccccttttaattc
attgcagctgggatttagaaaacccagttcccccattgagctctcttatg
ttttgtaaatattttcgttgggtcccagcatgattgttctgtggcttctg
tctggctttgttcatggaggccattcacccagagcccttgcaagacaagc
taggctacaaaagacatttttaaattctaccccctgaacttggacttcta
tttagaagggaaagtttgaaggattcttggagtagatttagttatttgat
taaaacactacagtgtgcacttaagaacaataaacaactacagtttgaag
ttaggacactttaaaaataaagatatatccattttttaaatttgatgtgt
atgaaagttctgcctgtatatgtgtaaatgcagtgcatgtatgcctgatg
atcatgaaagtcaaaagaagatagccttgggtcccttggtctggaattag
agtggttgtgagctgcatgtgggtgctgggaatagaactcagcctctgga
agagcaactgggttcttaactattgagccattctccagcttcctcataat
ctttaaagtatat
gaattccttagcaatctgagactccacttgacttaggctaaaacacacag
tccttcccaagcaatgtacctagtgacctaggacaccctacttgtataaa
gatgcatatatacttgcttaaaacaaggaaaacacgttcatactctttgt
tatcttttaataatactattcctctccaaacatttgctgaaaaacatcca
cctacatgccaataggccaatccattagatcaatccagccgagactggtt
ttgaatgcatgtacaataaggcaaaaccatattccctagtgaacctatat
gaagactcccttatttattatcttatacttatgcatggttggacatgcat
agggtatgtgggactgggttaccagacatacataagaactggcaaggttg
agtgagttcagactcaggaactcttagagatctgagaaagtaggaatgga
gctgctacatacctgtctgtatacctgccctggaacacaaaaccacaaca
ccccactctggaccatagggactgagtcacatagtataatacctggagtt
cttctccatgttaatgaggtatctagatagccttgagccttcatataatt
agcttcccttcctgaaaagggtattcagttcctggttcaactttaataaa
gtgtatgtattttcattcaccatcaaataaaccagtatgaacaagcaagg
atcttctcagagatctatatcgttatcactctcgggaagaccttcaaatg
aagagcaatgaaaggaaggctttctcccctccagcccctccagtacttta
ggcacttactcccaattgtggagagccgtgcctcgagcaatcgcgtgtgt
gtcgtgagcaatcgccattataagatggcgctggcttccactgcgcctaa
ctagtaaacaggcttatgcgca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_80582082_80583203
seq2: B6Ng01-145P03.b_49_1161

seq1  GAATTCTCCTTGTTCCTACTCCAAAGATGTGTTTATTTAGTTATTCTTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTTGTTCCTACTCCAAAGATGTGTTTATTTAGTTATTCTTGG  50

seq1  AGTATTAAGTTCAGTGTGTGAAAAAAAAAGTTCAGTGTGTGTCTGTGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTAAGTTCAGTGTGTGAAAAAAAAAGTTCAGTGTGTGTCTGTGCTG  100

seq1  GGCAATTGTTGTTTTGTTATATGAACAAAAGGTGAAGAATAAATAAACTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATTGTTGTTTTGTTATATGAACAAAAGGTGAAGAATAAATAAACTA  150

seq1  AGATGAACGATGGGCTGAAGGCAAGGGACACAAACTTAATGGTCATGTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAACGATGGGCTGAAGGCAAGGGACACAAACTTAATGGTCATGTGC  200

seq1  TAAGCCACTGTCATGTTTTCTACCTGCCTGCTTCTTCTGCATTATCTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCACTGTCATGTTTTCTACCTGCCTGCTTCTTCTGCATTATCTGCA  250

seq1  CTGTACCTAAACTACCTGTGTGTGAGTGCGTTCTCAGAAGAGTCTTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTACCTAAACTACCTGTGTGTGAGTGCGTTCTCAGAAGAGTCTTCTCA  300

seq1  ACCGCTATCAGATGATACCATCAAAGAACTTATTTTTTCCAAACAGGCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCTATCAGATGATACCATCAAAGAACTTATTTTTTCCAAACAGGCAA  350

seq1  AGAATAGTAAAGACAGACCCAAAACAAGCTTTTTTTGAGGACTTATAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGTAAAGACAGACCCAAAACAAGCTTTTTTTGAGGACTTATAAGG  400

seq1  CTCAGTGATTGCAGCCATTAGAATGGAAAGGGTGGATGAAGGAAGACTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGATTGCAGCCATTAGAATGGAAAGGGTGGATGAAGGAAGACTCC  450

seq1  AAGGGCCAGAGTTCCAGTGAACTAGAAGAAAAGCACTTGGAAAAGTTCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCCAGAGTTCCAGTGAACTAGAAGAAAAGCACTTGGAAAAGTTCTC  500

seq1  CAGGAATCATCTTGCCCTCTTCCTCTTTCTTCCATGCCCCCTTTTAATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAATCATCTTGCCCTCTTCCTCTTTCTTCCATGCCCCCTTTTAATTC  550

seq1  ATTGCAGCTGGGATTTAGAAAACCCAGTTCCCCCATTGAGCTCTCTTATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCAGCTGGGATTTAGAAAACCCAGTTCCCCCATTGAGCTCTCTTATG  600

seq1  TTTTGTAAATATTTTCGTTGGGTCCCAGCATGATTGTTCTGTGGCTTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAAATATTTTCGTTGGGTCCCAGCATGATTGTTCTGTGGCTTCTG  650

seq1  TCTGGCTTTGTTCATGGAGGCCATTCACCCAGAGCCCTTGCAAGACAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGCTTTGTTCATGGAGGCCATTCACCCAGAGCCCTTGCAAGACAAGC  700

seq1  TAGGCTACAAAAGACATTTTTAAATTCTACCCCCTGAACTTGGACTTCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTACAAAAGACATTTTTAAATTCTACCCCCTGAACTTGGACTTCTA  750

seq1  TTTAGAAGGGAAAGTTTGAAGGATTCTTGGAGTAGATTTAGTTATTTGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGAAGGGAAAGTTTGAAGGATTCTTGGAGTAGATTTAGTTATTTGAT  800

seq1  TAAAACACTACAGTGTGCACTTAAGAACAATAAACAACTACAGTTTGAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACACTACAGTGTGCACTTAAGAACAATAAACAACTACAGTTTGAAG  850

seq1  TTAGGACACTTTAAAAATAAAGATATATCCATTTTTTAAATTTGATGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACACTTTAAAAATAAAGATATATCCATTTTTTAAATTTGATGTGT  900

seq1  ATGAAAGTTCTGCCTGTATATGTGTAAATGCAGTGCATGTATGCCTGATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAGTTCTGCCTGTATATGTGTAAATGCAGTGCATGTATGCCTGATG  950

seq1  ATCATGAAGGTCAAAAGAAGATAGCCTTGGGTCCCCTGGGTCTGGAATTA  1000
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||
seq2  ATCATGAAAGTCAAAAGAAGATAGCCTTGGGT-CCCTTGGTCTGGAATTA  999

seq1  GAGGTGGTTGTGAGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATAGAACTCAGGCCCT  1050
      || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  GA-GTGGTTGTGAGCTG-CATGTGGGTGCTGGGAATAGAACTCAG--CCT  1045

seq1  CTGGAAGAGCAACCTGTGTTCTTAACCATTGAGCCATCTCTCCAGCTCCC  1100
      |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||
seq2  CTGGAAGAGCAA-CTGGGTTCTTAACTATTGAGCCAT-TCTCCAGCTTCC  1093

seq1  TCATAATCTTTTAAAAGTATAT  1122
      |||||||||||  |||||||||
seq2  TCATAATCTTT--AAAGTATAT  1113

seq1: chr4_80722976_80723728
seq2: B6Ng01-145P03.g_68_820 (reverse)

seq1  CTTCATTTGAAGGTCTTCCCGAGAGTGATAACGATATAGATCTCTGAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTTGAAGGTCTTCCCGAGAGTGATAACGATATAGATCTCTGAGAA  50

seq1  GATCCTTGCTTGTTCATACTGGTTTATTTGATGGTGAATGAAAATACATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTTGCTTGTTCATACTGGTTTATTTGATGGTGAATGAAAATACATA  100

seq1  CACTTTATTAAAGTTGAACCAGGAACTGAATACCCTTTTCAGGAAGGGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTATTAAAGTTGAACCAGGAACTGAATACCCTTTTCAGGAAGGGAA  150

seq1  GCTAATTATATGAAGGCTCAAGGCTATCTAGATACCTCATTAACATGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATTATATGAAGGCTCAAGGCTATCTAGATACCTCATTAACATGGAG  200

seq1  AAGAACTCCAGGTATTATACTATGTGACTCAGTCCCTATGGTCCAGAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACTCCAGGTATTATACTATGTGACTCAGTCCCTATGGTCCAGAGTG  250

seq1  GGGTGTTGTGGTTTTGTGTTCCAGGGCAGGTATACAGACAGGTATGTAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTTGTGGTTTTGTGTTCCAGGGCAGGTATACAGACAGGTATGTAGC  300

seq1  AGCTCCATTCCTACTTTCTCAGATCTCTAAGAGTTCCTGAGTCTGAACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCATTCCTACTTTCTCAGATCTCTAAGAGTTCCTGAGTCTGAACTC  350

seq1  ACTCAACCTTGCCAGTTCTTATGTATGTCTGGTAACCCAGTCCCACATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAACCTTGCCAGTTCTTATGTATGTCTGGTAACCCAGTCCCACATAC  400

seq1  CCTATGCATGTCCAACCATGCATAAGTATAAGATAATAAATAAGGGAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGCATGTCCAACCATGCATAAGTATAAGATAATAAATAAGGGAGTC  450

seq1  TTCATATAGGTTCACTAGGGAATATGGTTTTGCCTTATTGTACATGCATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATATAGGTTCACTAGGGAATATGGTTTTGCCTTATTGTACATGCATT  500

seq1  CAAAACCAGTCTCGGCTGGATTGATCTAATGGATTGGCCTATTGGCATGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACCAGTCTCGGCTGGATTGATCTAATGGATTGGCCTATTGGCATGT  550

seq1  AGGTGGATGTTTTTCAGCAAATGTTTGGAGAGGAATAGTATTATTAAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGATGTTTTTCAGCAAATGTTTGGAGAGGAATAGTATTATTAAAAG  600

seq1  ATAACAAAGAGTATGAACGTGTTTTCCTTGTTTTAAGCAAGTATATATGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACAAAGAGTATGAACGTGTTTTCCTTGTTTTAAGCAAGTATATATGC  650

seq1  ATCTTTATACAAGTAGGGTGTCCTAGGTCACTAGGTACATTGCTTGGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTATACAAGTAGGGTGTCCTAGGTCACTAGGTACATTGCTTGGGAA  700

seq1  GGACTGTGTGTTTTAGCCTAAGTCAAGTGGAGTCTCAGATTGCTAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTGTGTTTTAGCCTAAGTCAAGTGGAGTCTCAGATTGCTAAGGAA  750

seq1  TTC  753
      |||
seq2  TTC  753