BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-149K14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 85,713,666 - 85,847,113
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneD530005L17Rik, LOC100040303, Sh3gl2, A930009N24, LOC668052
Downstream geneAdamtsl1, 4930500O09Rik, Rraga, 6230416J20Rik, LOC100040388, Adfp, EG624685, Dennd4c, Rps6, Asah3l, Slc24a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-149K14.bB6Ng01-149K14.g
ACCDH945941DH945942
length7951,051
definitionDH945941|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149K14, 5' end.DH945942|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-149K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,846,319 - 85,847,113)(85,713,666 - 85,714,722)
sequence
gaattccattaagagtgaccttttaaatgcattttaaaaataaaaaaata
aatgtatccaacccaaatttcagagacttaaaaaagagttttgcctctct
atccagctctggtttccatcttctgactttcttagttattcgtcatataa
aagaagctatgagcatatgtgagcaacatacatgaccaaagaaaactttt
tcctggatgtgctatatcaatgtccaagtcatcccatccttcattttagc
tgccagacattttagaagttttactttttaagagaatatcattttcccat
gcctccagagcagtgaaaatgtggtgagtatcctacatgggcagctctaa
ttcttcacatgctcaactgtccctggccactcttcctgcctcttttccca
attgtccctcccctttggcgaggtgccttttcaggccttcacagactagt
gctccagtgctgccccaagcagcttcatctgctctcctcttgacccacag
gcctgtttatagccatacgtctgccacacatcaattgttttcctctaact
agtctacaagtgcagagaacaaaacgacattcaaaaatttattctcgttc
ccaagctgggggagacatatgaaagtagatattgagaaatgacatactga
agggtggtagataatgaaaacattaggacagggtcaaaatggctcttaaa
ttccatgcctttgagtaaaagggccatgcttctttctgtgcagtggtttt
tcatagaggaaactattagataattcacaagcaacttcatgggtt
gaattctttgtaacttcccctcttcaactctgcaactctcctagtagctc
acctagtggacgggagtggactgtgtatgtgaatggtagggatgcacgtc
agacagaaggacaatgcctagtgtgaagatggctatcctcacatgtaaca
gtgtgcacagaaaacacttcttgccctcttgtatagtagcaaaacaactc
atttgaacagctaaatgttttaattaaaaaaaaatagaggccacggacag
aacaaagcatttggtacaagatagaaattagagctttcccagtctgattt
gaagaaacaaagcaggcactctgaggcctctggccttctgtgtatccttt
gtcatttaaaccttttgtttccttttttctctctcaatggccactgtgtc
agattttggatgcaggactgctgtcctcgggcagctgagcttagttctga
tctggatgactaactcttaccgagccgtatctcatttaatcagacaggga
gtctaagttgctcttatctgttattgaaatggttgttgagattaattcct
cacttagtactttggcagcaactttctgtgctgttctttctttcaagccg
tccatgtacctttagtgcccataggggtactgtgagctctaaacgaatag
taaaccctgtggactctgaaccccaaacacatcacacaccacacaaatgc
ctttactctgggctcaatccctctcctggaactccaggctccatgagaca
ccaccattgccgcctcacccacagctttcttccttagagtatctgggcac
acatagtcacactgccaaggcgctgacctggctgaagtcatgagcaccct
tcaaaatggctgtgtgtcatgtcaacagtaagaaggagctcctttggggt
actaattggaggagtgaagggggacggaaggaggcactctactaaagaga
cacacagcacggctaatggaggtggtgggagtgtgaaccctgtgtcatgt
ttatgggcaagatgaaggagcttgaggaagggcatgcctatattgttgtt
a
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_85846319_85847113
seq2: B6Ng01-149K14.b_43_837 (reverse)

seq1  AAACCATGAAGTTGCTTGTGAATTATTCTAATAGTTTCCTCTATG-AAAA  49
      || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||
seq2  AACCCATGAAGTTGCTTGTGAATTA-TCTAATAGTTTCCTCTATGAAAAA  49

seq1  CCACTGCACAGAAAGAAGCATGGCCCTTTTACTCAAAGGCATGGAATTTA  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCACAGAAAGAAGCATGGCCCTTTTACTCAAAGGCATGGAATTTA  99

seq1  AGAGCCATTTTGACCCTGTCCTAATGTTTTCATTATCTACCACCCTTCAG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCATTTTGACCCTGTCCTAATGTTTTCATTATCTACCACCCTTCAG  149

seq1  TATGTCATTTCTCAATATCTACTTTCATATGTCTCCCCCAGCTTGGGAAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCATTTCTCAATATCTACTTTCATATGTCTCCCCCAGCTTGGGAAC  199

seq1  GAGAATAAATTTTTGAATGTCGTTTTGTTCTCTGCACTTGTAGACTAGTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATAAATTTTTGAATGTCGTTTTGTTCTCTGCACTTGTAGACTAGTT  249

seq1  AGAGGAAAACAATTGATGTGTGGCAGACGTATGGCTATAAACAGGCCTGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAAAACAATTGATGTGTGGCAGACGTATGGCTATAAACAGGCCTGT  299

seq1  GGGTCAAGAGGAGAGCAGATGAAGCTGCTTGGGGCAGCACTGGAGCACTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCAAGAGGAGAGCAGATGAAGCTGCTTGGGGCAGCACTGGAGCACTA  349

seq1  GTCTGTGAAGGCCTGAAAAGGCACCTCGCCAAAGGGGAGGGACAATTGGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGAAGGCCTGAAAAGGCACCTCGCCAAAGGGGAGGGACAATTGGG  399

seq1  AAAAGAGGCAGGAAGAGTGGCCAGGGACAGTTGAGCATGTGAAGAATTAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGGCAGGAAGAGTGGCCAGGGACAGTTGAGCATGTGAAGAATTAG  449

seq1  AGCTGCCCATGTAGGATACTCACCACATTTTCACTGCTCTGGAGGCATGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCCATGTAGGATACTCACCACATTTTCACTGCTCTGGAGGCATGG  499

seq1  GAAAATGATATTCTCTTAAAAAGTAAAACTTCTAAAATGTCTGGCAGCTA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATGATATTCTCTTAAAAAGTAAAACTTCTAAAATGTCTGGCAGCTA  549

seq1  AAATGAAGGATGGGATGACTTGGACATTGATATAGCACATCCAGGAAAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAGGATGGGATGACTTGGACATTGATATAGCACATCCAGGAAAAA  599

seq1  GTTTTCTTTGGTCATGTATGTTGCTCACATATGCTCATAGCTTCTTTTAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTTTGGTCATGTATGTTGCTCACATATGCTCATAGCTTCTTTTAT  649

seq1  ATGACGAATAACTAAGAAAGTCAGAAGATGGAAACCAGAGCTGGATAGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACGAATAACTAAGAAAGTCAGAAGATGGAAACCAGAGCTGGATAGAG  699

seq1  AGGCAAAACTCTTTTTTAAGTCTCTGAAATTTGGGTTGGATACATTTATT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAAACTCTTTTTTAAGTCTCTGAAATTTGGGTTGGATACATTTATT  749

seq1  TTTTTATTTTTAAAATGCATTTAAAAGGTCACTCTTAATGGAATTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATTTTTAAAATGCATTTAAAAGGTCACTCTTAATGGAATTC  795

seq1: chr4_85713666_85714722
seq2: B6Ng01-149K14.g_69_1119

seq1  GAATTCTTTGTAACTTCCCCTCTTCAACTCTGCAACTCTCCTAGTAGCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGTAACTTCCCCTCTTCAACTCTGCAACTCTCCTAGTAGCTC  50

seq1  ACCTAGTGGACGGGAGTGGACTGTGTATGTGAATGGTAGGGATGCACGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGTGGACGGGAGTGGACTGTGTATGTGAATGGTAGGGATGCACGTC  100

seq1  AGACAGAAGGACAATGCCTAGTGTGAAGATGGCTATCCTCACATGTAACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAAGGACAATGCCTAGTGTGAAGATGGCTATCCTCACATGTAACA  150

seq1  GTGTGCACAGAAAACACTTCTTGCCCTCTTGTATAGTAGCAAAACAACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCACAGAAAACACTTCTTGCCCTCTTGTATAGTAGCAAAACAACTC  200

seq1  ATTTGAACAGCTAAATGTTTTAATTAAAAAAAAATAGAGGCCACGGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAACAGCTAAATGTTTTAATTAAAAAAAAATAGAGGCCACGGACAG  250

seq1  AACAAAGCATTTGGTACAAGATAGAAATTAGAGCTTTCCCAGTCTGATTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGCATTTGGTACAAGATAGAAATTAGAGCTTTCCCAGTCTGATTT  300

seq1  GAAGAAACAAAGCAGGCACTCTGAGGCCTCTGGCCTTCTGTGTATCCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAACAAAGCAGGCACTCTGAGGCCTCTGGCCTTCTGTGTATCCTTT  350

seq1  GTCATTTAAACCTTTTGTTTCCTTTTTTCTCTCTCAATGGCCACTGTGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTAAACCTTTTGTTTCCTTTTTTCTCTCTCAATGGCCACTGTGTC  400

seq1  AGATTTTGGATGCAGGACTGCTGTCCTCGGGCAGCTGAGCTTAGTTCTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTTGGATGCAGGACTGCTGTCCTCGGGCAGCTGAGCTTAGTTCTGA  450

seq1  TCTGGATGACTAACTCTTACCGAGCCGTATCTCATTTAATCAGACAGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGATGACTAACTCTTACCGAGCCGTATCTCATTTAATCAGACAGGGA  500

seq1  GTCTAAGTTGCTCTTATCTGTTATTGAAATGGTTGTTGAGATTAATTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAGTTGCTCTTATCTGTTATTGAAATGGTTGTTGAGATTAATTCCT  550

seq1  CACTTAGTACTTTGGCAGCAACTTTCTGTGCTGTTCTTTCTTTCAAGCCG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTAGTACTTTGGCAGCAACTTTCTGTGCTGTTCTTTCTTTCAAGCCG  600

seq1  TCCATGTACCTTTAGTGCCCATAGGGGTACTGTGAGCTCTAAACGAATAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGTACCTTTAGTGCCCATAGGGGTACTGTGAGCTCTAAACGAATAG  650

seq1  TAAACCCTGTGGACTCTGAACCCCAAACACATCACACACCACACAAATGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACCCTGTGGACTCTGAACCCCAAACACATCACACACCACACAAATGC  700

seq1  CTTTACTCTGGGCTCAATCCCTCTCCTGGAACTCCAGGCTCCATGAGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACTCTGGGCTCAATCCCTCTCCTGGAACTCCAGGCTCCATGAGACA  750

seq1  CCACCATTGCCGCCTCACCCACAGCTTTCTTCCTTAGAGTATCTGGGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATTGCCGCCTCACCCACAGCTTTCTTCCTTAGAGTATCTGGGCAC  800

seq1  ACATAGTCACACTGCCAAGGCGCTGACCTGGCTGAAGTCATGAGCACCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGTCACACTGCCAAGGCGCTGACCTGGCTGAAGTCATGAGCACCCT  850

seq1  TCAAAAATGGCTGTGTGTCATGTCAACAGTAAGAA-GAGCTCCTTTGGGG  899
      || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TC-AAAATGGCTGTGTGTCATGTCAACAGTAAGAAGGAGCTCCTTTGGGG  899

seq1  TACTAATTGGAGGAGTGGAAGGGGGACGGAAGGAGGCACTCTACTAAGGA  949
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TACTAATTGGAGGAGT-GAAGGGGGACGGAAGGAGGCACTCTACTAAAGA  948

seq1  GAACACACAGCACGGCTAATGGAGTGTGTGTGAGTGTGAACCCATGTGTC  999
      | ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||
seq2  G-ACACACAGCACGGCTAATGGAGGTGGTGGGAGTGTGAACCC-TGTGTC  996

seq1  TATG-TTATGGGC-AGATGAAGGAGGCTTGAGGGAAGGGGCATGCTTTAT  1047
       ||| |||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||  |||
seq2  -ATGTTTATGGGCAAGATGAAGGA-GCTTGAGG--AAGGGCATGC-CTAT  1041

seq1  ATTGATGTTA  1057
      |||| |||||
seq2  ATTGTTGTTA  1051