BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154F04
Chromosome4 (Build37)4 (Build37)
Map Location 31,388,919 - 31,390,06531,692,532 - 31,693,649
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC619906, LOC100040864, LOC100040891
Downstream geneMap3k7, LOC665218, LOC665228, LOC665232, Bach2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154F04.bB6Ng01-154F04.g
ACCDH949398DH949399
length1,1331,111
definitionDH949398|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154F04, 5' end.DH949399|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154F04, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(31,388,919 - 31,390,065)(31,692,532 - 31,693,649)
sequence
gaattccctgaagtttaagatagggaccccaagattatgccagggataaa
aaacgttccttgaaaattcttgattgactccactaatgagagactgagat
ttcttcctcataaccctgtgcttgtctcccgattaatttcctccagtact
taatcttcagtgcatgacactttaaccactgagcttattatcctaaaaat
agtcttctagctgtgccatctcagaagaacatatgtgagtgcctccttgc
ctacatgatttccttagttgtttaaatgttaataccatacttgtaccaaa
cgaaataaacagccatacgaacagagacaagtaaattttcatacagcaga
atttctcagcttctccgtgcaaaaagattttgagtattttcttaatctga
aacctcactggaattgatagatgttcttttaagggaacaaagaggagagt
cagcattcccacctgagagctgtagtgtttctccatctatacgaacagat
caaggcagctcactccacaccacctcgggctgagcctcgtcagtgcattt
ttatgacaaatttgaagataaaaataaattatgtaggattttatcgaaac
tctaggttaagaaattcattatgccaggggaacacggcgcgaatcaggca
ttcagacagaatgagagagaacaaattaggtttggtaataagatgagatt
tatgtttcaatcccttctctcttggcagagtggctggatgcaaggaaaaa
gtatcttggtgcacataaaaccttttcgagaagcataagatgagctaaaa
ccagactgtagtctgttgaacagcacggcactctctgtcatgaatgagga
ggccaccatgtgtccgattttctaaaattctaacgtgcctgctagaccac
ctgctagaatgctgcctgcttctgggacacagtccctcctcattgctggc
tggaattcagatgacctggctctttccaggagctcacgaatgcatgatcc
atacgaaaagcagctgagcttggatttcttcttcacttgttcttcagtag
agctcctaccatttctactaaccaagcgatgttacctaacaatttctgac
aagcagtgcttgaatacattcttaagagtgaga
gaattcaagggacaaagtgtcaacgagaacaatgagcagaagatccagag
agcttagagaagtcaaggagacagtgtttgatggatgtgagaaacagcaa
ggcttcatatactcagcatgggaacagggtcccagggtcatctgtgacag
gtgtcacatatcacgaacacaagtcaggaacccaaatattcagttaacat
tgggtggagtccagagcagggttattaagaaataactgagaagtcaaagt
cagaggacaggtgactgctcctaaagactcatttggtcccatcagatctg
tgaggacgactctcagctagggaggagaggggcaaagagctgtagatacc
catgaggttcactctgagttaaaccaacttgagttccaagctgcagccaa
gctaagaagcctcattattattactttaccttatttctaactctccaatg
atagatttgtcctgtctgttcacccacatttgctagagattatgttacct
ctagctcatgcttccatgtctgcctttaggctcctctcttccctggagag
tcttctgtcaatccaaatatgaggagctcactcctctctcatcaagaatg
ggttcagggatccttgtcaaagcattgcttcagaaagatactaacccagc
tacccataacttacccagctataatatgcacaaaacagccttctcattgc
tagatgtgtacattcagtaactcatgtgcccctctctccctccttcctta
cccaaaccactggagtaacaccatttcccctacaaagatgactgactatg
tcttaattgccagaacatgactctgtgcatctcttggaaagtggtagtca
aggccttcgattggtaaccttggggatgggaaatattccaattatcccag
aggacatgacatatttgtaaaggctctcatctgaagaggcaggctgtaag
agtcagagatgatatgacaacacaatggtccagacagtcatgtgtagcat
gcctgtaatcccagcagctagagaagatacaggaagaaactagttcatgg
ccaccctgtactagaatagcctgggcttacatatggtaccttatctccaa
taataatagta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_31388919_31390065
seq2: B6Ng01-154F04.b_44_1176

seq1  GAATTCCCTGAAGTTTAAGATAGGGACCCCAAGATTATGCCAGGGATAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGAAGTTTAAGATAGGGACCCCAAGATTATGCCAGGGATAAA  50

seq1  AAACGTTCCTTGAAAATTCTTGATTGACTCCACTAATGAGAGACTGAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGTTCCTTGAAAATTCTTGATTGACTCCACTAATGAGAGACTGAGAT  100

seq1  TTCTTCCTCATAACCCTGTGCTTGTCTCCCGATTAATTTCCTCCAGTACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCTCATAACCCTGTGCTTGTCTCCCGATTAATTTCCTCCAGTACT  150

seq1  TAATCTTCAGTGCATGACACTTTAACCACTGAGCTTATTATCCTAAAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCTTCAGTGCATGACACTTTAACCACTGAGCTTATTATCCTAAAAAT  200

seq1  AGTCTTCTAGCTGTGCCATCTCAGAAGAACATATGTGAGTGCCTCCTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCTAGCTGTGCCATCTCAGAAGAACATATGTGAGTGCCTCCTTGC  250

seq1  CTACATGATTTCCTTAGTTGTTTAAATGTTAATACCATACTTGTACCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATGATTTCCTTAGTTGTTTAAATGTTAATACCATACTTGTACCAAA  300

seq1  CGAAATAAACAGCCATACGAACAGAGACAAGTAAATTTTCATACAGCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAATAAACAGCCATACGAACAGAGACAAGTAAATTTTCATACAGCAGA  350

seq1  ATTTCTCAGCTTCTCCGTGCAAAAAGATTTTGAGTATTTTCTTAATCTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCTCAGCTTCTCCGTGCAAAAAGATTTTGAGTATTTTCTTAATCTGA  400

seq1  AACCTCACTGGAATTGATAGATGTTCTTTTAAGGGAACAAAGAGGAGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTCACTGGAATTGATAGATGTTCTTTTAAGGGAACAAAGAGGAGAGT  450

seq1  CAGCATTCCCACCTGAGAGCTGTAGTGTTTCTCCATCTATACAAACAGAT  500
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAGCATTCCCACCTGAGAGCTGTAGTGTTTCTCCATCTATACGAACAGAT  500

seq1  CAAGGCAGCTCACTCCACACCACCTCGGGCTGAGCCTCGTCAGTGCATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCAGCTCACTCCACACCACCTCGGGCTGAGCCTCGTCAGTGCATTT  550

seq1  TTATGACAAATTTGAAGATAAAAATAAATTATGTAGGATTTTATCGAAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGACAAATTTGAAGATAAAAATAAATTATGTAGGATTTTATCGAAAC  600

seq1  TCTAGGTTAAGAAATTCATTATGCCAGGGGAACACGGCGCGAATCAGGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTTAAGAAATTCATTATGCCAGGGGAACACGGCGCGAATCAGGCA  650

seq1  TTCAGACAGAATGAGAGAGAACAAATTAGGTTTGGTAATAAGATGAGATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGACAGAATGAGAGAGAACAAATTAGGTTTGGTAATAAGATGAGATT  700

seq1  TATGTTTCAATCCCTTCTCTCTTGGCAGAGTGGCTGGATGCAAGG-AAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TATGTTTCAATCCCTTCTCTCTTGGCAGAGTGGCTGGATGCAAGGAAAAA  750

seq1  GTATCTTGGTGCACATAAAACCTTTTCGAGAAGCATAAGATGAGCTAAAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTTGGTGCACATAAAACCTTTTCGAGAAGCATAAGATGAGCTAAAA  800

seq1  CCAGACTGTAGTCTGTTGAACAGCACAGCACTCGCTGTCATGAATGAGGA  849
      |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAGACTGTAGTCTGTTGAACAGCACGGCACTCTCTGTCATGAATGAGGA  850

seq1  GGCCACCATGTGTCCGATTTTCCTAAAATTCTAACGTGCCTGCTAGTCCC  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  GGCCACCATGTGTCCGATTTT-CTAAAATTCTAACGTGCCTGCTAG-ACC  898

seq1  ACCTGCTAGAAATGCTGCCCTGCTTCCTGGGCACACAGTCCCTCCCTCAT  949
      ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| 
seq2  ACCTGCTAG-AATGCTG-CCTGCTT-CTGGG-ACACAGTCCCT-CCTCA-  942

seq1  TTGCTGGCTGGAATTCAAGATGAACCTGGCTCCTTTCCAGGGTGCCCAAG  999
      |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || || || |
seq2  TTGCTGGCTGGAATTC-AGATG-ACCTGGCT-CTTTCCA-GGAGCTCACG  988

seq1  AATACATAATCAATAGGAAAAGCAAGCTGACCTTGGATTTCTCCTTCACT  1049
      ||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||
seq2  AATGCATGATCCATACGAAAAGC-AGCTGAGCTTGGATTTCTTCTTCACT  1037

seq1  TGTTCTTCAAGTAAGAGCTCTTACC-TTTCTATTAACAAAACGATGTTAC  1098
      |||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| || |||||||||
seq2  TGTTCTTC-AGT-AGAGCTCCTACCATTTCTACTAACCAAGCGATGTTAC  1085

seq1  CTATACAATTTCTGAAAGAGCAGTG-TTAAATAAATTCTTAAGAGTGAGA  1147
      ||| ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||
seq2  CTA-ACAATTTCTGACA-AGCAGTGCTTGAATACATTCTTAAGAGTGAGA  1133

seq1: chr4_31692532_31693649
seq2: B6Ng01-154F04.g_66_1176 (reverse)

seq1  TACTATTATTATTTTGAGATTAGGTACCATTATGT-AGCCCAGGCTGATC  49
      ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||
seq2  TACTATTATTA-TTGGAGATAAGGTACCA-TATGTAAGCCCAGGCTATTC  48

seq1  TAGTACAGGGTGGCCCTGAACTAGTATCTTCCTGTATCTTCCTCTTAGCT  99
      ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||
seq2  TAGTACAGGGTGGCCATGAACTAGTTTCTTCCTGTATCTT-CTC-TAGCT  96

seq1  GCTGGGATTACAGGCATGCTACACCATGACTGTCTGGACCATTGTTGTTG  149
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCTGGGATTACAGGCATGCTACA-CATGACTGTCTGGACCATTG-TGTTG  144

seq1  TCATATCATCTCTGACTCTTTACAGCCTGCCTCTTCAGATGAGAGCCTTT  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATCATCTCTGACTC-TTACAGCCTGCCTCTTCAGATGAGAGCCTTT  193

seq1  ACAAATATGTCATGTCCTCTGGGATAATTGGAATATTTTCCCAT-CCCAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  ACAAATATGTCATGTCCTCTGGGATAATTGGAATA-TTTCCCATCCCCAA  242

seq1  GGTTACCCAATCGAAGGCCTTGACTACCACTTTCCAAGAGATGCACAGAG  298
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTA-CCAATCGAAGGCCTTGACTACCACTTTCCAAGAGATGCACAGAG  291

seq1  TCATGTTCTGGCAATTAAGACATAGTCAGTCATCTTTGTAGGGGAAATGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTTCTGGCAATTAAGACATAGTCAGTCATCTTTGTAGGGGAAATGG  341

seq1  TGTTACTCCAGTGGTTTGGGTAAGGAAGGAGGGAGAGAGGGGCACATGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTACTCCAGTGGTTTGGGTAAGGAAGGAGGGAGAGAGGGGCACATGAG  391

seq1  TTACTGAATGTACACATCTAGCAATGAGAAGGCTGTTTTGTGCATATTAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGAATGTACACATCTAGCAATGAGAAGGCTGTTTTGTGCATATTAT  441

seq1  AGCTGGGTAAGTTATGGGTAGCTGGGTTAGTATCTTTCTGAAGCAATGCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGTAAGTTATGGGTAGCTGGGTTAGTATCTTTCTGAAGCAATGCT  491

seq1  TTGACAAGGATCCCTGAACCCATTCTTGATGAGAGAGGAGTGAGCTCCTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAAGGATCCCTGAACCCATTCTTGATGAGAGAGGAGTGAGCTCCTC  541

seq1  ATATTTGGATTGACAGAAGACTCTCCAGGGAAGAGAGGAGCCTAAAGGCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTGGATTGACAGAAGACTCTCCAGGGAAGAGAGGAGCCTAAAGGCA  591

seq1  GACATGGAAGCATGAGCTAGAGGTAACATAATCTCTAGCAAATGTGGGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGGAAGCATGAGCTAGAGGTAACATAATCTCTAGCAAATGTGGGTG  641

seq1  AACAGACAGGACAAATCTATCATTGGAGAGTTAGAAATAAGGTAAAGTAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACAGGACAAATCTATCATTGGAGAGTTAGAAATAAGGTAAAGTAA  691

seq1  TAATAATGAGGCTTCTTAGCTTGGCTGCAGCTTGGAACTCAAGTTGGTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATGAGGCTTCTTAGCTTGGCTGCAGCTTGGAACTCAAGTTGGTTT  741

seq1  AACTCAGAGTGAACCTCATGGGTATCTACAGCTCTTTGCCCCTCTCCTCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAGAGTGAACCTCATGGGTATCTACAGCTCTTTGCCCCTCTCCTCC  791

seq1  CTAGCTGAGAGTCGTCCTCACAGATCTGATGGGACCAAATGAGTCTTTAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGAGAGTCGTCCTCACAGATCTGATGGGACCAAATGAGTCTTTAG  841

seq1  GAGCAGTCACCTGTCCTCTGACTTTGACTTCTCAGTTATTTCTTAATAAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTCACCTGTCCTCTGACTTTGACTTCTCAGTTATTTCTTAATAAC  891

seq1  CCTGCTCTGGACTCCACCCAATGTTAACTGAATATTTGGGTTCCTGACTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTCTGGACTCCACCCAATGTTAACTGAATATTTGGGTTCCTGACTT  941

seq1  CTGTTCCTGATATGTGACACCTGTCACAGATGACCCTGGGACCCTGTTAC  998
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTGTTCGTGATATGTGACACCTGTCACAGATGACCCTGGGACCCTGTTCC  991

seq1  CATGCTGAGTATATGAAGCCTTGCTGTTTCTCACATCCATCAAACACTGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGAGTATATGAAGCCTTGCTGTTTCTCACATCCATCAAACACTGT  1041

seq1  CTCCTTGACTTCTCTAAGCTCTCTGGATCTTCTGCTCATTGTTCTCGTTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTGACTTCTCTAAGCTCTCTGGATCTTCTGCTCATTGTTCTCGTTG  1091

seq1  ACACTTTGTCCCTTGAATTC  1118
      ||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTTGTCCCTTGAATTC  1111