BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154G13
Chromosome4 (Build37)
Map Location 69,917,073 - 70,086,995
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCdk5rap2
Upstream geneLOC622491, LOC433716, LOC100039888, LOC242497, LOC671064
Downstream geneMegf9, LOC100039565, LOC100039979
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154G13.bB6Ng01-154G13.g
ACCDH949460DH949461
length975895
definitionDH949460|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154G13, 5' end.DH949461|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154G13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,917,073 - 69,918,046)(70,086,093 - 70,086,995)
sequence
gaattcctaacacagcttctgcggatcacttggtggtcccagcttgtccc
tccagccatgtctcctttgcatctgccatagacataatctagggaggtcc
tagctcctccgctggtttgatttttcagaccccttgattaggtgggacca
gtgccactcaatgaagcatgcctttccatctccacagctgccagcaggat
atgaaataaatatggatgtatagattgaactaggagggatctttggtgat
actgcagagggaagaatgtttcttttatgactatagaagtcttgagaggg
acaccccacttcctgctctctgtatccatgtatctctgtatctctatgct
tctgcatccagactatccatttcttcatttcaccccaaggactcccaatg
gacacacatatgaaagaaggtgtttcacagcgtttggagcagcgaaatgt
ttggacagaagtaggcaagtcctcagaacagacaggtggccaaaagaaag
tatacaatccatgtttcatccttatccttaaatggcggcacagaaaacca
ggtgccagagcaagaaagacttaaggtctagtcctagctcggccactcaa
ttgctgatgtgtagctctgacccacaggctcctcattctgaatagcaaat
ggaaatgcttgccttgtggccttagaagcaacaagggtaatttccagttg
gtgctagatatagctgtctttgaagaggggtgagccaaatgggaaagtag
tgcaaaccacagttaagtgcctcatgtaactatgtcaagtgacagggcaa
gaacagctgatcttgaaacagagagaaacatggtgttggcgagatgtgtg
gtcatttctgctccaaggaatggctttcctactgctcggtggcagagtac
cgagctatgcagagccgtagtcaggagaataatgagccatgggggaagaa
ggagggtaggaggttgatggaaagg
gaattcaacacagtcagcaggattatgatattgtttccccctttctgaca
cctgttaccttttttctctcctgtctagtataagggggttgaaagggtag
gagaaaaggggtggaagagggtggaggaaaaaagaaccacaaagtagcaa
aagacacctacagattttctaatgcttctctttataaaatgaaagccatt
gtacaatgtcaaatggtattgttcacttcattatattaataaataatttt
aaaacattcgggatagggctggggagatgattctatcagtgttcgttgta
catgcatgagcacttgggctcagattcccagaactcacagaacaaccaca
tatggcagtatatgtctgtgacaccagtgttgtacagccagaataggcag
ctcccagtagctctctggccagtcaatgctgccagtcaatgcagtggctt
acagaatcagtgagagaccatgtctcaaaaacagaaaaaacagtagagac
gcatgatactaacctctaggactacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacattcctgaatacgtatgtgcacaggcatgca
catacaaactactgaacaagtagacatgcataggcatgtgcatgcgcacg
cacaaacacacacaccaaatgaaaaacattgtgtgctgctgaattgagca
ctgcactccacatagtgcactccatatgctgtacatgttacttttgcttc
ctctgtagactctgttttccttacactagggcgtttaaggaaacctggta
tgtgacatattgctgaactttaagacctcttacatgtggtggtttaaatc
aatgggactcgatgataccaacatagtcggttatgaactttccag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_69917073_69918046
seq2: B6Ng01-154G13.b_45_1019

seq1  GAATTCCTAACACAGCTTCTGCGGATCACTTGGTGGTCCCAGCTTGTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAACACAGCTTCTGCGGATCACTTGGTGGTCCCAGCTTGTCCC  50

seq1  TCCAGCCATGTCTCCTTTGCATCTGCCATAGACATAATCTAGGGAGGTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCATGTCTCCTTTGCATCTGCCATAGACATAATCTAGGGAGGTCC  100

seq1  TAGCTCCTCCGCTGGTTTGATTTTTCAGACCCCTTGATTAGGTGGGACCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCTCCGCTGGTTTGATTTTTCAGACCCCTTGATTAGGTGGGACCA  150

seq1  GTGCCACTCAATGAAGCATGCCTTTCCATCTCCACAGCTGCCAGCAGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCACTCAATGAAGCATGCCTTTCCATCTCCACAGCTGCCAGCAGGAT  200

seq1  ATGAAATAAATATGGATGTATAGATTGAACTAGGAGGGATCTTTGGTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAATAAATATGGATGTATAGATTGAACTAGGAGGGATCTTTGGTGAT  250

seq1  ACTGCAGAGGGAAGAATGTTTCTTTTATGACTATAGAAGTCTTGAGAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAGAGGGAAGAATGTTTCTTTTATGACTATAGAAGTCTTGAGAGGG  300

seq1  ACACCCCACTTCCTGCTCTCTGTATCCATGTATCTCTGTATCTCTATGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCCACTTCCTGCTCTCTGTATCCATGTATCTCTGTATCTCTATGCT  350

seq1  TCTGCATCCAGACTATCCATTTCTTCATTTCACCCCAAGGACTCCCAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCATCCAGACTATCCATTTCTTCATTTCACCCCAAGGACTCCCAATG  400

seq1  GACACACATATGAAAGAAGGTGTTTCACAGCGTTTGGAGCAGCGAAATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACATATGAAAGAAGGTGTTTCACAGCGTTTGGAGCAGCGAAATGT  450

seq1  TTGGACAGAAGTAGGCAAGTCCTCAGAACAGACAGGTGGCCAAAAGAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACAGAAGTAGGCAAGTCCTCAGAACAGACAGGTGGCCAAAAGAAAG  500

seq1  TATACAATCCATGTTTCATCCTTATCCTTAAATGGCGGCACAGAAAACCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAATCCATGTTTCATCCTTATCCTTAAATGGCGGCACAGAAAACCA  550

seq1  GGTGCCAGAGCAAGAAAGACTTAAGGTCTAGTCCTAGCTCGGCCACTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCCAGAGCAAGAAAGACTTAAGGTCTAGTCCTAGCTCGGCCACTCAA  600

seq1  TTGCTGATGTGTAGCTCTGACCCACAGGCTCCTCATTCTGAATAGCAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGATGTGTAGCTCTGACCCACAGGCTCCTCATTCTGAATAGCAAAT  650

seq1  GGAAATGCTTGCCTTGTGGCCTTAGAAGCAACAAGGGTAATTTCCAGTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATGCTTGCCTTGTGGCCTTAGAAGCAACAAGGGTAATTTCCAGTTG  700

seq1  GTGCTAGATATAGCTGTCTTTGAAGAGGGGTGAGCCAAATGGGAAAGTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTAGATATAGCTGTCTTTGAAGAGGGGTGAGCCAAATGGGAAAGTAG  750

seq1  TGCAAACCACAGTTAAGTGCCTCATGTAACTATGTCAAGTGACAGGGCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACCACAGTTAAGTGCCTCATGTAACTATGTCAAGTGACAGGGCAA  800

seq1  GAACAGCTGATCTTGAAACAGAGAGAAACATGGTGTTGGCGAGATGTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGCTGATCTTGAAACAGAGAGAAACATGGTGTTGGCGAGATGTGTG  850

seq1  GTCATTTCTGCTCCAAGGAATGGCTTTCCTACTGCTCGGTGGCAGAGTAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTCTGCTCCAAGGAATGGCTTTCCTACTGCTCGGTGGCAGAGTAC  900

seq1  CGAGCTATGCAGAGCCGTAGTCAGGAGAATAAGGAGCCATGGGGGAGGAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2  CGAGCTATGCAGAGCCGTAGTCAGGAGAATAATGAGCCATGGGGGAAGAA  950

seq1  -GAAGGTAGGAGGTTGAAGGAAAGG  974
       || ||||||||||||| |||||||
seq2  GGAGGGTAGGAGGTTGATGGAAAGG  975

seq1: chr4_70086093_70086995
seq2: B6Ng01-154G13.g_65_959 (reverse)

seq1  CTGGAAAGTTCATAAACCGACTATGTTGGTATCATCAAGTACCATTTGTT  50
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |
seq2  CTGGAAAGTTCAT-AACCGACTATGTTGGTATCATCGAGTCCCA-TTGAT  48

seq1  TTAAACCACCACATAGTAAGAGGTCATGAAGTATCAGCAATATGTCACAT  100
      |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||
seq2  TTAAACCACCACAT-GTAAGAGGTCTTAAAGT-TCAGCAATATGTCACAT  96

seq1  ACCAGGTTTCCTTAAAACGCCCTAGTTGTAAGGAAAACAGAGTCTACAGA  150
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGTTTCCTT-AAACGCCCTAG-TGTAAGGAAAACAGAGTCTACAGA  144

seq1  GGAAGGCAGAAAGTAACATGTACAGCATATGGAGTGCACTATGTGGAGTG  200
      |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAA-GCA-AAAGTAACATGTACAGCATATGGAGTGCACTATGTGGAGTG  192

seq1  CAGTGCTCAATTCAGCAGCACACAATGTTTTTCATTTGGTGTGTGTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCTCAATTCAGCAGCACACAATGTTTTTCATTTGGTGTGTGTGTTT  242

seq1  GTGCGTGCGCATGCACATGCCTATGCATGTCTACTTGTTCAGTAGTTTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGTGCGCATGCACATGCCTATGCATGTCTACTTGTTCAGTAGTTTGT  292

seq1  ATGTGCATGCCTGTGCACATACGTATTCAGGAATGTGTGTGTGTGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCATGCCTGTGCACATACGTATTCAGGAATGTGTGTGTGTGTGTGT  342

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTCCTAGAGGTTAGTATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTCCTAGAGGTTAGTATCA  392

seq1  TGCGTCTCTACTGTTTTTTCTGTTTTTGAGACATGGTCTCTCACTGATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGTCTCTACTGTTTTTTCTGTTTTTGAGACATGGTCTCTCACTGATTC  442

seq1  TGTAAGCCACTGCATTGACTGGCAGCATTGACTGGCCAGAGAGCTACTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGCCACTGCATTGACTGGCAGCATTGACTGGCCAGAGAGCTACTGG  492

seq1  GAGCTGCCTAATCTGGCTGTACAACACTGGTGTCACAGACATATACTGCC  550
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGCCTATTCTGGCTGTACAACACTGGTGTCACAGACATATACTGCC  542

seq1  ATATGTGGTTGTTCTGTGAGTTCTGGGAATCTGAGCCCAAGTGCTCATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGGTTGTTCTGTGAGTTCTGGGAATCTGAGCCCAAGTGCTCATGC  592

seq1  ATGTACAACGAACACTGATAGAATCATCTCCCCAGCCCTATCCCGAATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACAACGAACACTGATAGAATCATCTCCCCAGCCCTATCCCGAATGT  642

seq1  TTTAAAATTATTTATTAATATAATGAAGTGAACAATACCATTTGACATTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAATTATTTATTAATATAATGAAGTGAACAATACCATTTGACATTG  692

seq1  TACAATGGCTTTCATTTTATAAAGAGAAGCATTAGAAAATCTGTAGGTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATGGCTTTCATTTTATAAAGAGAAGCATTAGAAAATCTGTAGGTGT  742

seq1  CTTTTGCTACTTTGTGGTTCTTTTTTCCTCCACCCTCTTCCACCCCTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGCTACTTTGTGGTTCTTTTTTCCTCCACCCTCTTCCACCCCTTTT  792

seq1  CTCCTACCCTTTCAACCCCCTTATACTAGACAGGAGAGAAAAAAGGTAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACCCTTTCAACCCCCTTATACTAGACAGGAGAGAAAAAAGGTAAC  842

seq1  AGGTGTCAGAAAGGGGGAAACAATATCATAATCCTGCTGACTGTGTTGAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCAGAAAGGGGGAAACAATATCATAATCCTGCTGACTGTGTTGAA  892

seq1  TTC  903
      |||
seq2  TTC  895