BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-154N20
Chromosome4 (Build37)
Map Location 58,764,150 - 58,864,405
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOlfr267, AI314180
Upstream geneAkap2, D630039A03Rik, Txn1, Txndc8, Svep1, Musk, Edg2, LOC675306, LOC433711
Downstream geneLOC100041581, Ltb4dh, 2010203O07Rik, Gng10, AI481877, LOC433712, Ugcg, LOC100041535, LOC634731, LOC666719, Rod1, Hsdl2, E130308A19Rik, LOC100041592, 1110054O05Rik, Snx30
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-154N20.bB6Ng01-154N20.g
ACCDH949794DH949795
length1,1541,058
definitionDH949794|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154N20, 5' end.DH949795|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-154N20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,764,150 - 58,765,318)(58,863,342 - 58,864,405)
sequence
gaattcttagactggtcctcagtttccctgaatttcaccgtgactcttac
atgagagatcactagaacctcagttatatcagaagagaaacctggctatg
ataaaatgaagaaaatgctcatattttgcactggctataaattagtgcca
taacccactggatactagttatacccaattcatctattgctaagacttaa
ttctgctgatgtccactatgtaactgattgtttatacttcttttcctatc
ttggtatcctcaaaagttcaagccaagcatgatgtcactatatgatgtca
cctatattctcagcactggaaaggctgagggaggagaatgatgagttcaa
gaactaacttgcacagtgagaccctatctcaaataaaaattttgatgact
ccttgtatgtactgatattttttcaaaaaccagccacacttgattgtcgt
atacgatatttcattttctaaaattgagaggagaagagcaataatatttt
accttaataaaattaacttttacttatatgtgtatgtgttccctatagta
agactatacaggacagcactgaaaggcattcaacagttctcaagccaaca
caatggttttatattaaaaaaaaaaaatccctgccactcagaggttaagg
caaggggatcgctttgagtttaaagctagtctgacctacaaagcagtatg
agaccctgtctcaagaaaacaagcaaaagaaaaccaaacaaacgcttgca
tgttttgaataagtaagacttcttgaagctgttgtgctttcagggctggc
tttagcaaaagcaacaagaattaacactttgtttttgttccactggagta
aacatgtggagagattctagacagaaagaacaaagctgtcacccaaacat
ggaaacactgagtaagtaagcattacagctcaactatggggcaagtgggc
ttgctccagaggcatggaaacacttaacacagactcagtgtcagatgggg
tagcgtgagcactttctgaaatacaacatcttaaatttattctagatggt
ggtctggcatcatggcacatgttctttcattccagatggggagggctgag
cagagatcagaaatcaggccactgaggtaccccaggcttgttctcaaaaa
ataa
gaattctaggttaaatggacaagattgatcttacaggagttttactgtgt
tctgagtaatgctgattctcagtgtttgtgacactgtaaagctgtgtatc
ttaggtggaggccactaatttccataatgactatgatctcagtaatttgt
taacagtataagaaatgaaaagaagccatttattttattacaggtgttta
ggtaattgtactaatgcttattacagttttgttgggggaagttaagataa
tagtttgtcagagcagggataaatttcccaataagtcaagtgtattggta
attaatttgctgttgacaggatacatggtattgaaaataacatgaagcta
gtgcaagataagagaaatctttcacttgtgaccagtgtatttggagtgaa
ttaaggattttgtttgtgtgctcttttgttctgggtttggatgttttgtt
gttttgatggcattattatgtaggacactgtgattgagaagtcaaataac
aaatgttgttgtggcaaaggggtttgctgtttattgcatttttttgtgtg
tgatttttgttcctttctaaaaattttaaggaccctaaactactgtcaat
ggcatattcagctgttgggaaactctccaggtgagtaaagttttttcttc
catttttgctttttttctgtgggagacacctgttggtaattgagaaaaat
ttatctggtattaatagatggagaataatttgctatgattccaacaagaa
atgtattttatggcaataagctaatgtcttctttttttttagaaaggata
taaatcatttaagtttacatttgaaatacagtcttaaatttagtcttgaa
attagctttttaaactaattgtgtcaaaataggtcaccattatggttgca
taagggattacaatctagacatctaattaaccttaagtgttcctgtgctt
ttatcactaaatcttatatgcttgtctgaaatatgaacatgaatgatcct
gtttcaagaatttatctatttccttctgctcaatatgattcttcattcca
aatccttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_58764150_58765318
seq2: B6Ng01-154N20.b_46_1199

seq1  GAATTCTTAGACTGGTCCTCAGTTTCCCTGAATTTCACCGTGACTCTTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGACTGGTCCTCAGTTTCCCTGAATTTCACCGTGACTCTTAC  50

seq1  ATGAGAGATCACTAGAACCTCAGTTATATCAGAAGAGAAACCTGGCTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAGATCACTAGAACCTCAGTTATATCAGAAGAGAAACCTGGCTATG  100

seq1  ATAAAATGAAGAAAATGCTCATATTTTGCACTGGCTATAAATTAGTGCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATGAAGAAAATGCTCATATTTTGCACTGGCTATAAATTAGTGCCA  150

seq1  TAACCCACTGGATACTAGTTATACCCAATTCATCTATTGCTAAGACTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCACTGGATACTAGTTATACCCAATTCATCTATTGCTAAGACTTAA  200

seq1  TTCTGCTGATGTCCACTATGTAACTGATTGTTTATACTTCTTTTCCTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCTGATGTCCACTATGTAACTGATTGTTTATACTTCTTTTCCTATC  250

seq1  TTGGTATCCTCAAAAGTTCAAGCCAAGCATGATGTCACTATATGATGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTATCCTCAAAAGTTCAAGCCAAGCATGATGTCACTATATGATGTCA  300

seq1  CCTATATTCTCAGCACTGGAAAGGCTGAGGGAGGAGAATGATGAGTTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATATTCTCAGCACTGGAAAGGCTGAGGGAGGAGAATGATGAGTTCAA  350

seq1  GAACTAACTTGCACAGTGAGACCCTATCTCAAATAAAAATTTTGATGACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAACTTGCACAGTGAGACCCTATCTCAAATAAAAATTTTGATGACT  400

seq1  CCTTGTATGTACTGATATTTTTTCAAAAACCAGCCACACTTGATTGTCGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTATGTACTGATATTTTTTCAAAAACCAGCCACACTTGATTGTCGT  450

seq1  ATACGATATTTCATTTTCTAAAATTGAGAGGAGAAGAGCAATAATATTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGATATTTCATTTTCTAAAATTGAGAGGAGAAGAGCAATAATATTTT  500

seq1  ACCTTAATAAAATTAACTTTTACTTATATGTGTATGTGTTCCCTATAGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAATAAAATTAACTTTTACTTATATGTGTATGTGTTCCCTATAGTA  550

seq1  AGACTATACAGGACAGCACTGAAAGGCATTCAACAGTTCTCAAGCCAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTATACAGGACAGCACTGAAAGGCATTCAACAGTTCTCAAGCCAACA  600

seq1  CAATGGTTTTATATTAAAAAAAAAAAATCCCTGCCACTCAGAGGTTAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGGTTTTATATTAAAAAAAAAAAATCCCTGCCACTCAGAGGTTAAGG  650

seq1  CAAGGGGATCGCTTTGAGTTTAAAGCTAGTCTGACCTACAAAGCAGTATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGGGATCGCTTTGAGTTTAAAGCTAGTCTGACCTACAAAGCAGTATG  700

seq1  AGACCCTGTCTCAAGAAAACAAGCAAAAGAAAACCAAACAAACGCTTGCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTGTCTCAAGAAAACAAGCAAAAGAAAACCAAACAAACGCTTGCA  750

seq1  TGTTTTGAATAAGTAAGACTTCTTGAAGCTGTTGTGCTTTCAGGGCTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTGAATAAGTAAGACTTCTTGAAGCTGTTGTGCTTTCAGGGCTGGC  800

seq1  TTTAGCAAAAGCAACAAGAATTAACACTTTGTTTTTGTTCCACTGGAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCAAAAGCAACAAGAATTAACACTTTGTTTTTGTTCCACTGGAGTA  850

seq1  AACATGTGGAGAGATTCTAGACAGAAAGAACAAAGCTGTCACCCAAACAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGTGGAGAGATTCTAGACAGAAAGAACAAAGCTGTCACCCAAACAT  900

seq1  GGAAACACTGAGTAAGTAAGCATTACAGCTCAACTATTGGGCAAGTGGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGAAACACTGAGTAAGTAAGCATTACAGCTCAACTATGGGGCAAGTGGGC  950

seq1  TTGCTCCAGAGGCATGGAAAACAACCTTAACACAGACTCAGTGTCAGATG  1000
      ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCAGAGGCATGG-AAACA--CTTAACACAGACTCAGTGTCAGATG  997

seq1  GGGTAGCGTGAGCCACTTTCTGAGATACAACATCTTAAATTTATTCTAGA  1050
      |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAGCGTGAG-CACTTTCTGAAATACAACATCTTAAATTTATTCTAGA  1046

seq1  TGGTGGTCTGGCATCATGGCACATG-TCTATCATTCCAGAATTGGAGAGG  1099
      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |||| ||
seq2  TGGTGGTCTGGCATCATGGCACATGTTCTTTCATTCCAGATGGGGAG-GG  1095

seq1  CTGAAGCAGGAAGATCAGAAATTCAAGGCCAACTTGAGGTTACACCACAA  1149
      ||| |||||  |||||||||||   ||||||   ||||||   ||| || 
seq2  CTG-AGCAG--AGATCAGAAAT--CAGGCCA--CTGAGGT---ACCCCAG  1135

seq1  GCCCTTG-TCTCAAAAAATAA  1169
      |  |||| |||||||||||||
seq2  G--CTTGTTCTCAAAAAATAA  1154

seq1: chr4_58863342_58864405
seq2: B6Ng01-154N20.g_67_1124 (reverse)

seq1  GAAGGAATTGGAATGAAGAAATCATATTGAGCAGAGGGAAATAGATATAT  50
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||
seq2  GAAGGATTTGGAATGAAG-AATCATATTGAGCAGAAGGAAATAGATAAAT  49

seq1  CTTTGAAAACAGGATCATTCATGTTCATAATATCAGAC-AGCATTATAAG  99
        ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||
seq2  TCTTG-AAACAGGATCATTCATGTTCAT-ATTTCAGACAAGCA-TATAAG  96

seq1  ATTTAGTGATAAAAAGCAACAGGAACACTTAAGGTTAATTAGATGTCTAG  149
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGTGAT-AAAAGC-ACAGGAACACTTAAGGTTAATTAGATGTCTAG  144

seq1  ATTGTAATCCCTTATGCAACCATAATGGTGACCTATTTTGACACAATTAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTGTAATCCCTTATGCAACCATAATGGTGACCTATTTTGACACAATTAG  194

seq1  GTTTAAAAGCTAATTTCAAGACTAAATTTAAGACTGTATTTTCAAATGTA  249
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTTAAAAAGCTAATTTCAAGACTAAATTTAAGACTGTA-TTTCAAATGTA  243

seq1  AACTTAAATGATTTATATCCTTTCTAAAAAAAAAGAAGACATTAGCTTAT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAATGATTTATATCCTTTCTAAAAAAAAAGAAGACATTAGCTTAT  293

seq1  TGCCATAAAATACATTTCTTGTTGGAATCATAGCAAATTATTCTCCATCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATAAAATACATTTCTTGTTGGAATCATAGCAAATTATTCTCCATCT  343

seq1  ATTAATACCAGATAAATTTTTCTCAATTACCAACAGGTGTCTCCCACAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATACCAGATAAATTTTTCTCAATTACCAACAGGTGTCTCCCACAGA  393

seq1  AAAAAAGCAAAAATGGAAGAAAAAACTTTACTCACCTGGAGAGTTTCCCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGCAAAAATGGAAGAAAAAACTTTACTCACCTGGAGAGTTTCCCA  443

seq1  ACAGCTGAATATGCCATTGACAGTAGTTTAGGGTCCTTAAAATTTTTAGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTGAATATGCCATTGACAGTAGTTTAGGGTCCTTAAAATTTTTAGA  493

seq1  AAGGAACAAAAATCACACACAAAAAAATGCAATAAACAGCAAACCCCTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAACAAAAATCACACACAAAAAAATGCAATAAACAGCAAACCCCTTT  543

seq1  GCCACAACAACATTTGTTATTTGACTTCTCAATCACAGTGTCCTACATAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAACAACATTTGTTATTTGACTTCTCAATCACAGTGTCCTACATAA  593

seq1  TAATGCCATCAAAACAACAAAACATCCAAACCCAGAACAAAAGAGCACAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCCATCAAAACAACAAAACATCCAAACCCAGAACAAAAGAGCACAC  643

seq1  AAACAAAATCCTTAATTCACTCCAAATACACTGGTCACAAGTGAAAGATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAATCCTTAATTCACTCCAAATACACTGGTCACAAGTGAAAGATT  693

seq1  TCTCTTATCTTGCACTAGCTTCATGTTATTTTCAATACCATGTATCCTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTATCTTGCACTAGCTTCATGTTATTTTCAATACCATGTATCCTGT  743

seq1  CAACAGCAAATTAATTACCAATACACTTGACTTATTGGGAAATTTATCCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGCAAATTAATTACCAATACACTTGACTTATTGGGAAATTTATCCC  793

seq1  TGCTCTGACAAACTATTATCTTAACTTCCCCCAACAAAACTGTAATAAGC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTGACAAACTATTATCTTAACTTCCCCCAACAAAACTGTAATAAGC  843

seq1  ATTAGTACAATTACCTAAACACCTGTAATAAAATAAATGGCTTCTTTTCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTACAATTACCTAAACACCTGTAATAAAATAAATGGCTTCTTTTCA  893

seq1  TTTCTTATACTGTTAACAAATTACTGAGATCATAGTCATTATGGAAATTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTATACTGTTAACAAATTACTGAGATCATAGTCATTATGGAAATTA  943

seq1  GTGGCCTCCACCTAAGATACACAGCTTTACAGTGTCACAAACACTGAGAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTCCACCTAAGATACACAGCTTTACAGTGTCACAAACACTGAGAA  993

seq1  TCAGCATTACTCAGAACACAGTAAAACTCCTGTAAGATCAATCTTGTCCA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCATTACTCAGAACACAGTAAAACTCCTGTAAGATCAATCTTGTCCA  1043

seq1  TTTAACCTAGAATTC  1064
      |||||||||||||||
seq2  TTTAACCTAGAATTC  1058