BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-163G07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 61,819,616 - 61,956,462
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp37, Slc31a2
Upstream geneLOC667234, LOC100039089, LOC667239, LOC100039116, LOC667242, LOC100039150, LOC100039019, LOC100039177, LOC621093, LOC100039206, LOC621127, LOC100039228, LOC384021, LOC100039247, LOC667278, Mup5, LOC435785, LOC667295, LOC100039305, LOC546832, OTTMUSG00000007485, Mup3, LOC100039345, OTTMUSG00000000231
Downstream geneFkbp15, Slc31a1, Cdc26, Prpf4, Rnf183, Wdr31, Bspry, Hdhd3, Alad, Pole3, 4933430I17Rik, Rgs3, Zfp618, Ambp, Kif12, Col27a1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-163G07.bB6Ng01-163G07.g
ACCDH955991DH955992
length1,124865
definitionDH955991|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163G07, 5' end.DH955992|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-163G07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,955,336 - 61,956,462)(61,819,616 - 61,820,484)
sequence
gaattcccagcactgggagagcaaacataaccagattcatgggcttgctg
gctagcccaacctagcttatggagtcaagtcagttagaaaccgtatctca
aaaacaacaaagatgtcatatgataaataatagccaaggttgtcctctga
catgcacacataagcaaatccacttccacacataagtacacatgcatata
tgtgcaagtgcatataaataaagaagcaagctggatgttggacacagcat
gtatgtaattctaggtcctcggatagctgaggcagaccgactacaagttc
agggctgccttgaactggagagtgaattctaggccattctaaacaactta
gtgagactatatctcaaaatgttaaaaggcctggaaacagagtgcttgcc
tgacacaagtgaggtccaaggtttggtccgcagtgccccagaacaagaag
gtcaagttgtagagctagcctggcaaacactgcttctctggacactttcc
aggggcctagtccaggaggcaagagagcccaattccccatccctctgaat
ccactccagtcacctgcctcttcttcctcaccttcattaggctgagacct
tcatcatcttataggttcatccccatatatcccaaccataccctcattcc
accccagggtgggagccatgttccttccctttagcctagagagtcaaagc
gtcagtcaataaggctaggaaaatgctatgtaacttccaactgtaggttt
tacctttgtgtgtatatgtacacacaatatgtatatatgtgtatttgttc
atgtgtgcatgtatgtgagtgagtaaactgtgaccctcaagattgtgtta
tttactgcaaaaacctgtttctacttgtggtatggctcagctctagcaca
cacctttaatccaagagcttttctgtttattgtaaacaggattaaagtca
accaaagtcaagaggtggaagacctcagccatttgacagagagtgaacca
ccggaccaaagcacagagaagtaagaaggaaagcccgagaattgaaggga
agaaagaatgaggaaggactccctttaagggtttagaaggcattgatgaa
ttcctctgggatgacagctctgga
gaattcaacagactggacataatttcgtcattaatgaaaaacataactat
tgtgcaaagtcatatttgctgatggaggtccaagtacaaatcttgccaaa
aatcattcttccaaaaacatacagctacattggaaacatattttgtatca
gttgacatttcatttacccttgaactagaaacataaactactgtttgatg
tgaggaaataaagaattcaagaatgaggcaagtactcgatatgctttact
tcaactttgaatcagttttatatggtatgtactatttaattcttcttatc
acagtattagtaagactcagaaatattaagtaactgtataaggacatata
atcagtaaacatgagaacttagatttaaacccaagactctctaactcagg
agcctttgttcttgactccactacagaggtcaggatgtttttacaattta
ggggggatggttaaatagggaaagaggagtaatagtgctatagagttcca
gacatgtcagactggcaggtactagcaaagaaacttcacatgggtctctt
taaaataagagtagttggtgtggtccaagattgaatgaggcatgacaaca
ggctgtctcttggtctacaagtgtttggtggatgctctactaggggatta
tcacattcttccctcccttctcctcctcctctccctcctcctcctttcca
cctcctcttcctccttctcttcctcctcctccttcccttcctcctcctcc
tcttcctcttcttgccaccgcttcctttttttcattgaaaaggtatgtgc
acactcgtgaacacactattgcttttgaaaattatgcataaaatagcaca
ggaaataattgtttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_61955336_61956462
seq2: B6Ng01-163G07.b_46_1169 (reverse)

seq1  TCCAGAGCTGTCATCCCAGAAGGGAACTCCTACATGCCCTCTCAAAAACC  50
      ||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||| |||    || |
seq2  TCCAGAGCTGTCATCCCAGA--GGAATTCATCAATGCCTTCT----AAAC  44

seq1  CCTCAAAGTGATGTCCCTCCCTCATACTTTCCTCCCCTCCATTCTCCTGC  100
      ||| |||| || || ||| |||||| ||||| |||| || ||||||  ||
seq2  CCTTAAAGGGA-GT-CCTTCCTCATTCTTTCTTCCCTTCAATTCTCGGGC  92

seq1  CTTCC-TCTTAC-TCTCTGTGCTTTGGTCCTGT-GTTCACTCTCTGTCAA  147
       |||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTCTTACTTCTCTGTGCTTTGGTCCGGTGGTTCACTCTCTGTCAA  142

seq1  ATGGCTGA-GTGCTCCACCTCTTGACCTTGGTTGACTTTAATCCTGTTTA  196
      |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTGAGGTCTTCCACCTCTTGACTTTGGTTGACTTTAATCCTGTTTA  192

seq1  CAATAAACAG-AAAGCTCTTGGATTAAAGGTGTGTGCTAGAGCTGAGCCA  245
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAAACAGAAAAGCTCTTGGATTAAAGGTGTGTGCTAGAGCTGAGCCA  242

seq1  TACCACAAGTAGAAACAGGTTTTTGCAGTAAATAACACAATCTTGAGGGT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACAAGTAGAAACAGGTTTTTGCAGTAAATAACACAATCTTGAGGGT  292

seq1  CACAGTTTACTCACTCACATACATGCACACATGAACAAATACACATATAT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTTACTCACTCACATACATGCACACATGAACAAATACACATATAT  342

seq1  ACATATTGTGTGTACATATACACACAAAGGTAAAACCTACAGTTGGAAGT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATTGTGTGTACATATACACACAAAGGTAAAACCTACAGTTGGAAGT  392

seq1  TACATAGCATTTTCCTAGCCTTATTGACTGACGCTTTGACTCTCTAGGCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGCATTTTCCTAGCCTTATTGACTGACGCTTTGACTCTCTAGGCT  442

seq1  AAAGGGAAGGAACATGGCTCCCACCCTGGGGTGGAATGAGGGTATGGTTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGAAGGAACATGGCTCCCACCCTGGGGTGGAATGAGGGTATGGTTG  492

seq1  GGATATATGGGGATGAACCTATAAGATGATGAAGGTCTCAGCCTAATGAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATATGGGGATGAACCTATAAGATGATGAAGGTCTCAGCCTAATGAA  542

seq1  GGTGAGGAAGAAGAGGCAGGTGACTGGAGTGGATTCAGAGGGATGGGGAA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGGAAGAAGAGGCAGGTGACTGGAGTGGATTCAGAGGGATGGGGAA  592

seq1  TTGGGCTCTCTTGCCTCCTGGACTAGGCCCCTGGAAAGTGTCCAGAGAAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCTCTCTTGCCTCCTGGACTAGGCCCCTGGAAAGTGTCCAGAGAAG  642

seq1  CAGTGTTTGCCAGGCTAGCTCTACAACTTGACCTTCTTGTTCTGGGGCAC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTTGCCAGGCTAGCTCTACAACTTGACCTTCTTGTTCTGGGGCAC  692

seq1  TGCGGACCAAACCTTGGACCTCACTTGTGTCAGGCAAGCACTCTGTTTCC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGGACCAAACCTTGGACCTCACTTGTGTCAGGCAAGCACTCTGTTTCC  742

seq1  AGGCCTTTTAACATTTTGAGATATAGTCTCACTAAGTTGTTTAGAATGGC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTTTTAACATTTTGAGATATAGTCTCACTAAGTTGTTTAGAATGGC  792

seq1  CTAGAATTCACTCTCCAGTTCAAGGCAGCCCTGAACTTGTAGTCGGTCTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAATTCACTCTCCAGTTCAAGGCAGCCCTGAACTTGTAGTCGGTCTG  842

seq1  CCTCAGCTATCCGAGGACCTAGAATTACATACATGCTGTGTCCAACATCC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGCTATCCGAGGACCTAGAATTACATACATGCTGTGTCCAACATCC  892

seq1  AGCTTGCTTCTTTATTTATATGCACTTGCACATATATGCATGTGTACTTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGCTTCTTTATTTATATGCACTTGCACATATATGCATGTGTACTTA  942

seq1  TGTGTGGAAGTGGATTTGCTTATGTGTGCATGTCAGAGGACAACCTTGGC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGAAGTGGATTTGCTTATGTGTGCATGTCAGAGGACAACCTTGGC  992

seq1  TATTATTTATCATATGACATCTTTGTTGTTTTTGAGATACGGTTTCTAAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATTTATCATATGACATCTTTGTTGTTTTTGAGATACGGTTTCTAAC  1042

seq1  TGACTTGACTCCATAAGCTAGGTTGGGCTAGCCAGCAAGCCCATGAATCT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTGACTCCATAAGCTAGGTTGGGCTAGCCAGCAAGCCCATGAATCT  1092

seq1  GGTTATGTTTGCTCTCCCAGTGCTGGGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATGTTTGCTCTCCCAGTGCTGGGAATTC  1124

seq1: chr4_61819616_61820484
seq2: B6Ng01-163G07.g_68_932

seq1  GAATTCAACAGACTGGACATAATTTCGTCATTAATGAAAAACATAACTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACAGACTGGACATAATTTCGTCATTAATGAAAAACATAACTAT  50

seq1  TGTGCAAAGTCATATTTGCTGATGGAGGTCCAAGTACAAATCTTGCCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCAAAGTCATATTTGCTGATGGAGGTCCAAGTACAAATCTTGCCAAA  100

seq1  AATCATTCTTCCAAAAACATACAGCTACATTGGAAACATATTTTGTATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATTCTTCCAAAAACATACAGCTACATTGGAAACATATTTTGTATCA  150

seq1  GTTGACATTTCATTTACCCTTGAACTAGAAACATAAACTACTGTTTGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACATTTCATTTACCCTTGAACTAGAAACATAAACTACTGTTTGATG  200

seq1  TGAGGAAATAAAGAATTCAAGAATGAGGCAAGTACTCGATATGCTTTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAAATAAAGAATTCAAGAATGAGGCAAGTACTCGATATGCTTTACT  250

seq1  TCAACTTTGAATCAGTTTTATATGGTATGTACTATTTAATTCTTCTTATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACTTTGAATCAGTTTTATATGGTATGTACTATTTAATTCTTCTTATC  300

seq1  ACAGTATTAGTAAGACTCAGAAATATTAAGTAACTGTATAAGGACATATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATTAGTAAGACTCAGAAATATTAAGTAACTGTATAAGGACATATA  350

seq1  ATCAGTAAACATGAGAACTTAGATTTAAACCCAAGACTCTCTAACTCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTAAACATGAGAACTTAGATTTAAACCCAAGACTCTCTAACTCAGG  400

seq1  AGCCTTTGTTCTTGACTCCACTACAGAGGTCAGGATGTTTTTACAATTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTTGTTCTTGACTCCACTACAGAGGTCAGGATGTTTTTACAATTTA  450

seq1  GGGGGGATGGTTAAATAGGGAAAGAGGAGTAATAGTGCTATAGAGTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGATGGTTAAATAGGGAAAGAGGAGTAATAGTGCTATAGAGTTCCA  500

seq1  GACATGTCAGACTGGCAGGTACTAGCAAAGAAACTTCACATGGGTCTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGTCAGACTGGCAGGTACTAGCAAAGAAACTTCACATGGGTCTCTT  550

seq1  TAAAATAAGAGTAGTTGGTGTGGTCCAAGATTGAATGAGGCATGACAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAAGAGTAGTTGGTGTGGTCCAAGATTGAATGAGGCATGACAACA  600

seq1  GGCTGTCTCTTGGTCTACAAGTGTTTGGTGGATGCTCTACTAGGGGATTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCTCTTGGTCTACAAGTGTTTGGTGGATGCTCTACTAGGGGATTA  650

seq1  TCACATTCTTCCCTCCCTTCTCCTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCTCTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCACATTCTTCCCTCCCTTCTCCTCCTCCTCTCCCTCCTCCTCCT-TTCC  699

seq1  CCCTCCTCTTCCTCCTTCTCTTCCTCCTCCTCCTTCCCTTCCTCCTCCTC  750
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCTCTTCCTCCTTCTCTTCCTCCTCCTCCTTCCCTTCCTCCTCCTC  749

seq1  CTCTTCCTCTTCTTTCCACCCTCTTCC-ATTTTTCATTGATAATGGTATG  799
      |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| || ||||||
seq2  CTCTTCCTCTTCTTGCCA-CCGCTTCCTTTTTTTCATTGA-AAAGGTATG  797

seq1  TGCACACCTGTGAACACACTAATGCTTTTGAAAATATATGCAGAAATCAG  849
      |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||
seq2  TGCACACTCGTGAACACACTATTGCTTTTGAAAAT-TATGCATAAAATAG  846

seq1  CACAGGACATCAATTGTCTC  869
      ||||||| || |||||| ||
seq2  CACAGGAAAT-AATTGTTTC  865