BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166L12
Chromosome4 (Build37)
Map Location 149,391,972 - 149,581,279
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGpr157, Slc2a5, LOC435818, Car6
Upstream genePex14, LOC670864, Dffa, Cort, Apitd1, LOC666774, Pgd, Kif1b, LOC100041794, Ube4b, Rbp7, LOC627985, Nmnat1, Lzic, Ctnnbip1, Clstn1, Pik3cd, D4Ertd429e, Slc25a33, Spsb1, H6pd
Downstream geneLOC100041882, Eno1, LOC666880, LOC384091, Rere, Slc45a1, LOC677027, Errfi1, Park7, Tnfrsf9, Uts2, Per3, Vamp3, Camta1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166L12.bB6Ng01-166L12.g
ACCDH958414DH958415
length1,078980
definitionDH958414|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166L12, 5' end.DH958415|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166L12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,580,209 - 149,581,279)(149,391,972 - 149,392,947)
sequence
gaattccatcactgcaaacctgggaatcactgtctttttctgttctagct
gccacggctaccaagcaaaggcattttctgctccaacgtggcatcaggtt
aagcccagaaggaaaaatactacactgatgtgtatgtgctaaggcaagac
acttggtaagagtgagttgggatctggggtgagactattggggttctcag
gagggtcaggattgtaacctcaaggagggaataggagtggggtgacagag
gccagagatctgagtgatttgggggtgagggcacaggctggatgcaggtg
gccaccggaggctaaagaatgcattgtttacttgagtcctgtaaggcact
agtcgagcaagcatttagacttgacctcctgacctattagacacggagtc
tgtgtccctgtttctcacatgtgtcagtacacacatgtgtgtggatgccc
atgtcagtgtgtgcatgtgtgtgtagatcagaggaccacctctggatatc
attccccaggagccttccacctttgatttgagagtcctctattagcctag
aacatcaccaaacaagctgatagcgtaagcttgcagggatccacctgtcc
ctgcctcccatcccactgtttctggaattctaagtgcccatcacctgggt
cctcaggcctttgaggcaaacactttccagactgagccatcgctccagtc
agagtttgcctccttttaagcactgagtttgtggatatttgtttcagtgg
caccaagaaaccaacagaaacttctttcttgccaggttacatacaccaca
gatttacaatggacttgatcagtcaagggtaaattgatagggagacactg
ggcagatagagcaggatccaggctccattcaataagtcagctggtccaat
ttagcaaggagaggctaggggagcagctagtcctggtgcctggaactctg
ctgcgtttgcaacaagaagggtgtgagtcaggcaaagctactcataattt
tagatatttaggtcccgtgttgcttgtatctgagttattagtaggaagac
attttcctaacaagcttttggggatggg
gaattccaacacttgggaggcaggtggatctctgcgagctgaggacaacc
cagtctacaaagcaagttgttgacagccagggctctgttaaacagataaa
gtctgtcttgaaaaaacaaaaacaaaaacaaaaagaacaataaaaggggg
ggggggtggacactcacacgagctgctcaggaggtaaagcaagcaagagg
ataattgaacagttgggcacaaaggagcacagtgtctgccatgaggaaca
gtgacccagagtaagcaggtctgtggatgggtagcgctccgggcaatgaa
gccccactcatccatttcccatcgctataatggaatacttgagactgctc
ctttataacagaagaggcttattggggtcgtagtttgaagggtcaagaac
atggcatcaattgggtcatgtggaggcgtacagatcccagagagacagga
agttaagcaatgcaagggacaggcttttccttttacaacaaactgcctta
gcaagagtaacaaggatgccacgagaactaccttaacaccccctgagggc
caagcacccgagggcctcacctccctcctgacagaaccacctgagaacca
agcttccgacgtgcatgtgtgcgtagcaccacctgccctctgctctctgt
gcttggctctggggtgaggaaggcaggggcatcatgatctcggaatgtgg
tgtggagccgtagatgttcaatttggacatgaaaagctcccaggcaaact
cttgataactctattaccagcttgacctgaggttcaaagcctcctgtgtc
tggggcatagggccccaaatgtcagggcttccagaacagtgtacacactt
gggggagggacaactagcaggactgactgttagaacagacatcccgtcca
ggaagaaggggaatcttgaagacattgcctacaagaagccttgttatgat
tttgttttaccttctttcatgggacagaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_149580209_149581279
seq2: B6Ng01-166L12.b_44_1121 (reverse)

seq1  CCCAT-CCCAAAAGCTGGTTAG--AAATGTCTTCCTTACTATTAATTCAG  47
      ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||
seq2  CCCATCCCCAAAAGCTTGTTAGGAAAATGTCTTCC-TACTAATAACTCAG  49

seq1  ATACAAGCAACACGGGACCTAAATATCTAAAATTATGAGTAGCTTTGCCT  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAGCAACACGGGACCTAAATATCTAAAATTATGAGTAGCTTTGCCT  99

seq1  GACTCACACCCTTCTTGTTGCAAACGCAGCAGAGTTCCAGGCACCAGGAC  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTCACACCCTTCTTGTTGCAAACGCAGCAGAGTTCCAGGCACCAGGAC  149

seq1  TAGCTGCT-CCCTAGCCTCTCC-TGCT-AATTGGACCAGCTG-CTTATTG  193
      |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||
seq2  TAGCTGCTCCCCTAGCCTCTCCTTGCTAAATTGGACCAGCTGACTTATTG  199

seq1  -ATGGAGCCTGGATCCTGCTCTATCTGCCCAGTGTCTCCCTATCAATTTA  242
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAGCCTGGATCCTGCTCTATCTGCCCAGTGTCTCCCTATCAATTTA  249

seq1  CCCTTGACTGATCAAGTCCATTGTAAATCTGTGGTGTATGTAACCTGGCA  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGACTGATCAAGTCCATTGTAAATCTGTGGTGTATGTAACCTGGCA  299

seq1  AGAAAGAAGTTTCTGTTGGTTTCTTGGTGCCACTGAAACAAATATCCACA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGAAGTTTCTGTTGGTTTCTTGGTGCCACTGAAACAAATATCCACA  349

seq1  AACTCAGTGCTTAAAAGGAGGCAAACTCTGACTGGAGCGATGGCTCAGTC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAGTGCTTAAAAGGAGGCAAACTCTGACTGGAGCGATGGCTCAGTC  399

seq1  TGGAAAGTGTTTGCCTCAAAGGCCTGAGGACCCAGGTGATGGGCACTTAG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAAGTGTTTGCCTCAAAGGCCTGAGGACCCAGGTGATGGGCACTTAG  449

seq1  AATTCCAGAAACAGTGGGATGGGAGGCAGGGACAGGTGGATCCCTGCAAG  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAGAAACAGTGGGATGGGAGGCAGGGACAGGTGGATCCCTGCAAG  499

seq1  CTTACGCTATCAGCTTGTTTGGTGATGTTCTAGGCTAATAGAGGACTCTC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACGCTATCAGCTTGTTTGGTGATGTTCTAGGCTAATAGAGGACTCTC  549

seq1  AAATCAAAGGTGGAAGGCTCCTGGGGAATGATATCCAGAGGTGGTCCTCT  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAAGGTGGAAGGCTCCTGGGGAATGATATCCAGAGGTGGTCCTCT  599

seq1  GATCTACACACACATGCACACACTGACATGGGCATCCACACACATGTGTG  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTACACACACATGCACACACTGACATGGGCATCCACACACATGTGTG  649

seq1  TACTGACACATGTGAGAAACAGGGACACAGACTCCGTGTCTAATAGGTCA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGACACATGTGAGAAACAGGGACACAGACTCCGTGTCTAATAGGTCA  699

seq1  GGAGGTCAAGTCTAAATGCTTGCTCGACTAGTGCCTTACAGGACTCAAGT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGTCAAGTCTAAATGCTTGCTCGACTAGTGCCTTACAGGACTCAAGT  749

seq1  AAACAATGCATTCTTTAGCCTCCGGTGGCCACCTGCATCCAGCCTGTGCC  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAATGCATTCTTTAGCCTCCGGTGGCCACCTGCATCCAGCCTGTGCC  799

seq1  CTCACCCCCAAATCACTCAGATCTCTGGCCTCTGTCACCCCACTCCTATT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCCCCAAATCACTCAGATCTCTGGCCTCTGTCACCCCACTCCTATT  849

seq1  CCCTCCTTGAGGTTACAATCCTGACCCTCCTGAGAACCCCAATAGTCTCA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCTTGAGGTTACAATCCTGACCCTCCTGAGAACCCCAATAGTCTCA  899

seq1  CCCCAGATCCCAACTCACTCTTACCAAGTGTCTTGCCTTAGCACATACAC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGATCCCAACTCACTCTTACCAAGTGTCTTGCCTTAGCACATACAC  949

seq1  ATCAGTGTAGTATTTTTCCTTCTGGGCTTAACCTGATGCCACGTTGGAGC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGTGTAGTATTTTTCCTTCTGGGCTTAACCTGATGCCACGTTGGAGC  999

seq1  AGAAAATGCCTTTGCTTGGTAGCCGTGGCAGCTAGAACAGAAAAAGACAG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGCCTTTGCTTGGTAGCCGTGGCAGCTAGAACAGAAAAAGACAG  1049

seq1  TGATTCCCAGGTTTGCAGTGATGGAATTC  1071
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTCCCAGGTTTGCAGTGATGGAATTC  1078

seq1: chr4_149391972_149392947
seq2: B6Ng01-166L12.g_67_1046

seq1  GAATTCCAACACTTGGGAGGCAGGTGGATCTCTGCGAGCTGAGGACAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAACACTTGGGAGGCAGGTGGATCTCTGCGAGCTGAGGACAACC  50

seq1  CAGTCTACAAAGCAAGTTGTTGACAGCCAGGGCTCTGTTAAACAGATAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTACAAAGCAAGTTGTTGACAGCCAGGGCTCTGTTAAACAGATAAA  100

seq1  GTCTGTCTTGAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGAACAATAAAAGGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTCTTGAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGAACAATAAAAGGGGG  150

seq1  GGGGGGTGGACACTCACACGAGCTGCTCAGGAGGTAAAGCAAGCAAGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGTGGACACTCACACGAGCTGCTCAGGAGGTAAAGCAAGCAAGAGG  200

seq1  ATAATTGAACAGTTGGGCACAAAGGAGCACAGTGTCTGCCATGAGGAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATTGAACAGTTGGGCACAAAGGAGCACAGTGTCTGCCATGAGGAACA  250

seq1  GTGACCCAGAGTAAGCAGGTCTGTGGATGGGTAGCGCTCCGGGCAATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCCAGAGTAAGCAGGTCTGTGGATGGGTAGCGCTCCGGGCAATGAA  300

seq1  GCCCCACTCATCCATTTCCCATCGCTATAATGGAATACTTGAGACTGCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCACTCATCCATTTCCCATCGCTATAATGGAATACTTGAGACTGCTC  350

seq1  CTTTATAACAGAAGAGGCTTATTGGGGTCGTAGTTTGAAGGGTCAAGAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATAACAGAAGAGGCTTATTGGGGTCGTAGTTTGAAGGGTCAAGAAC  400

seq1  ATGGCATCAATTGGGTCATGTGGAGGCGTACAGATCCCAGAGAGACAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCATCAATTGGGTCATGTGGAGGCGTACAGATCCCAGAGAGACAGGA  450

seq1  AGTTAAGCAATGCAAGGGACAGGCTTTTCCTTTTACAACAAACTGCCTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAGCAATGCAAGGGACAGGCTTTTCCTTTTACAACAAACTGCCTTA  500

seq1  GCAAGAGTAACAAGGATGCCACGAGAACTACCTTAACACCCCCTGAGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGTAACAAGGATGCCACGAGAACTACCTTAACACCCCCTGAGGGC  550

seq1  CAAGCACCCGAGGGCCTCACCTCCCTCCTGACAGAACCACCTGAGAACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCACCCGAGGGCCTCACCTCCCTCCTGACAGAACCACCTGAGAACCA  600

seq1  AGCTTCCGACGTGCATGTGTGCGTAGCACCACCTGCCCTCTGCTCTCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCCGACGTGCATGTGTGCGTAGCACCACCTGCCCTCTGCTCTCTGT  650

seq1  GCTTGGCTCTGGGGTGAGGAAGGCAGGGGCATCATGATCTCGGAATGTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGCTCTGGGGTGAGGAAGGCAGGGGCATCATGATCTCGGAATGTGG  700

seq1  TGTGGAGCCGTAGATGTTCAATTTGGACATGAAAAGCTCCCAGGCAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAGCCGTAGATGTTCAATTTGGACATGAAAAGCTCCCAGGCAAACT  750

seq1  CTTGATAACTCTATTAACCAGCTTGACCTGAGGTTCAAAGCCTCCTGTGT  800
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATAACTCTATT-ACCAGCTTGACCTGAGGTTCAAAGCCTCCTGTGT  799

seq1  CTGGGGCATAGGGCCCCAAATGTCAGGGC-TCCAGAACAGTGTACACACT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCATAGGGCCCCAAATGTCAGGGCTTCCAGAACAGTGTACACACT  849

seq1  T-GGGGAGGGACAACTAGCAGGACTGACTGTTAG-ACAGACAT-CCGCCC  896
      | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
seq2  TGGGGGAGGGACAACTAGCAGGACTGACTGTTAGAACAGACATCCCGTCC  899

seq1  AGGAAG-AGGGGAA-CCTGAAGACATTGCCTACAAGTAGCCCTGTTTATG  944
      |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| || |||||
seq2  AGGAAGAAGGGGAATCTTGAAGACATTGCCTACAAGAAGCCTTG-TTATG  948

seq1  ATTTTGTTTTAACTTCTTTCATGGGACAGGAT  976
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  ATTTTGTTTTACCTTCTTTCATGGGACAGAAT  980