BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168F04
Chromosome4 (Build37)
Map Location 56,416,061 - 56,532,746
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041348, Klf4
Downstream geneActl7b, Actl7a, Ikbkap, BC026590, Ctnnal1, D730040F13Rik, 6430704M03Rik, Epb4.1l4b, Ptpn3, LOC100041460, 1700042G15Rik, LOC100041342, LOC619973, LOC667049
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168F04.bB6Ng01-168F04.g
ACCDH959590DH959591
length1,0751,064
definitionDH959590|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168F04, 5' end.DH959591|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168F04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,531,663 - 56,532,746)(56,416,061 - 56,417,131)
sequence
gaattcccaagccagatgtctctatgtgactcctcatctcccactcatga
ggcttttcatgatgtcacctggattctgtatggtgtcattctggttagtc
ctttcttatttgctattctccttgcattgaggaaggtgctactaagtgga
ctgtggacttgaatgtaagagcaacaacattcatccagcttctctctgct
gggactgtgatgtccattgtaccagtttccatggcttttcctagccactg
atgcttgtaggtctaactcattgaccaatctcttcctacattgtagctca
agagaaacacagcaaaacaaagtaatttcttttactctccaaaacttggc
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agagagagagattgaggttcatgaatagcatgatttccaaacgatgcaca
ttttccagtggcttttccctacctagctctttatcttagctccttgctct
ggaaactagggcttcctaattagtttacagattcaggccaactcagtaaa
gtctcagatggccactggcctggtctcttaccctatagtgtctccttcaa
agagttataccacattttcacaatggggcatttgaggatggttttcaaag
caagaccaagtattcggtaaaaatagatttgtatttctctttccaccgtc
ccaggcatagctataaatactctcaagattttggtaaaaacaaaacaaaa
caaaacaaaacaaaacaaaaagtgagtgaaaaatttgaagatttgaagca
aaattgtcctagttagtgttgagggtctcatagagttctgagaaggcatt
ccacactaggaaagaagatcctgtctgtatgttcacagacacctataatt
agacatctccaaacaaattaaaaagaaacagaaaccttaaaatcagaaag
gaaggaaaggcaatagccagtgtgtgagtcgtgttagcaagagttgggaa
agtatgtgttaactgggaatgtccctatagctcatagatctgatgctagt
caccagggggtgcactatttgaaag
gaattcaatgaacttccccagcagaaaaaccacaatgattagaaataagt
tcagagaaattaaggaaaatgagctcctaatcgaaaacatgaaaatctaa
gtcaaatgagtaaggtaatacaagatgtgaaagaggaattcaacaaaggg
acacaaataaaaggctgattgaaagtgcttgaaatgaaagatgtataggt
caatcaaaaacttccatgaaaagactcagcaatagaataaaacaaagaaa
tggcagactatatgagtttgaaaacaacgtggaagtaatgcagcaatcaa
acaaagatgaagataaaatagtaaggtattgatatgagctgtaatatacc
cagggcacccccctaaaatataaaagctatggataataggcaaagaaaga
gactaacctaatcataaaggcatagaaaacattacttaaaagaatgataa
ggaaaaaattcccggagttacaaacagagatgtcaacccaaacacctaga
ataccaaaaaacaggaccagaaaagaacaaccaattgtcatatatagaac
aggaaaagaatattgacaacagtccttccggtctgcaccagctcagggcc
accttgggctcgaactcagctgacagtcccatggtccccagaggactctc
catgccccaccccagtgccttagcacacccaggatcttaggatcactgat
gagtggaacacaacatctgttccaacacaactgggagtgcatgcggacag
caggagcaaggacacaggagtccagtcttactaatggcttgggttccttc
tggtcggtcagcatggctctaccttgattttgaactcagtggacagcctc
atggtccccagaggaggtaccacttccaggctctctaacacacccaggat
cttaggatctggggatcccaggagcttggtcacaccagaatctcaggtct
cagaggaagtttgacttccaagaactctgacacacccagaatcctcagca
tcacagatctcagggaaagctgactctgaggagttctgactcatcagatt
atagagacaaattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_56531663_56532746
seq2: B6Ng01-168F04.b_48_1122 (reverse)

seq1  CTTTCAAATAGTGCCACCCCCTGGTGACTAAGCATCCAGATCTATGAGCC  50
      ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
seq2  CTTTCAAATAGTG-CACCCCCTGGTGACT-AGCAT-CAGATCTATGAG-C  46

seq1  TATAGGGACATTCCCAGTTAAACCACCATACTTTCCCAACCTCTTGCTAC  100
      |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| 
seq2  TATAGGGACATTCCCAGTTAA--CA-CATACTTTCCCAA-CTCTTGCTAA  92

seq1  CACGACTCCACACACTGGCTATTGCCTTTCCTTCCTTTCTGATTTTAAGG  150
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGACT-CACACACTGGCTATTGCCTTTCCTTCCTTTCTGATTTTAAGG  141

seq1  TTTCTGTTTCTTTTTAATTTGTTTGGAGATGTCTAATTATAGGTGTCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTTCTTTTTAATTTGTTTGGAGATGTCTAATTATAGGTGTCTGT  191

seq1  GAACATACAGACAGGATCTTCTTTCCTAGTGTGGAATGCCTTCTCAGAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATACAGACAGGATCTTCTTTCCTAGTGTGGAATGCCTTCTCAGAAC  241

seq1  TCTATGAGACCCTCAACACTAACTAGGACAATTTTGCTTCAAATCTTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGAGACCCTCAACACTAACTAGGACAATTTTGCTTCAAATCTTCAA  291

seq1  ATTTTTCACTCACTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCACTCACTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTA  341

seq1  CCAAAATCTTGAGAGTATTTATAGCTATGCCTGGGACGGTGGAAAGAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAATCTTGAGAGTATTTATAGCTATGCCTGGGACGGTGGAAAGAGAA  391

seq1  ATACAAATCTATTTTTACCGAATACTTGGTCTTGCTTTGAAAACCATCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAATCTATTTTTACCGAATACTTGGTCTTGCTTTGAAAACCATCCT  441

seq1  CAAATGCCCCATTGTGAAAATGTGGTATAACTCTTTGAAGGAGACACTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGCCCCATTGTGAAAATGTGGTATAACTCTTTGAAGGAGACACTAT  491

seq1  AGGGTAAGAGACCAGGCCAGTGGCCATCTGAGACTTTACTGAGTTGGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTAAGAGACCAGGCCAGTGGCCATCTGAGACTTTACTGAGTTGGCCT  541

seq1  GAATCTGTAAACTAATTAGGAAGCCCTAGTTTCCAGAGCAAGGAGCTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTGTAAACTAATTAGGAAGCCCTAGTTTCCAGAGCAAGGAGCTAAG  591

seq1  ATAAAGAGCTAGGTAGGGAAAAGCCACTGGAAAATGTGCATCGTTTGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAGCTAGGTAGGGAAAAGCCACTGGAAAATGTGCATCGTTTGGAA  641

seq1  ATCATGCTATTCATGAACCTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGCTATTCATGAACCTCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT  691

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCAAGTTTTGGAGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCAAGTTTTGGAGAG  741

seq1  TAAAAGAAATTACTTTGTTTTGCTGTGTTTCTCTTGAGCTACAATGTAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGAAATTACTTTGTTTTGCTGTGTTTCTCTTGAGCTACAATGTAGG  791

seq1  AAGAGATTGGTCAATGAGTTAGACCTACAAGCATCAGTGGCTAGGAAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATTGGTCAATGAGTTAGACCTACAAGCATCAGTGGCTAGGAAAAG  841

seq1  CCATGGAAACTGGTACAATGGACATCACAGTCCCAGCAGAGAGAAGCTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGAAACTGGTACAATGGACATCACAGTCCCAGCAGAGAGAAGCTGG  891

seq1  ATGAATGTTGTTGCTCTTACATTCAAGTCCACAGTCCACTTAGTAGCACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATGTTGTTGCTCTTACATTCAAGTCCACAGTCCACTTAGTAGCACC  941

seq1  TTCCTCAATGCAAGGAGAATAGCAAATAAGAAAGGACTAACCAGAATGAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAATGCAAGGAGAATAGCAAATAAGAAAGGACTAACCAGAATGAC  991

seq1  ACCATACAGAATCCAGGTGACATCATGAAAAGCCTCATGAGTGGGAGATG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATACAGAATCCAGGTGACATCATGAAAAGCCTCATGAGTGGGAGATG  1041

seq1  AGGAGTCACATAGAGACATCTGGCTTGGGAATTC  1084
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTCACATAGAGACATCTGGCTTGGGAATTC  1075

seq1: chr4_56416061_56417131
seq2: B6Ng01-168F04.g_65_1128

seq1  GAATTCAATGAACTTCCCCAGCAGAAAAACCACAATGATTAGAAATAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGAACTTCCCCAGCAGAAAAACCACAATGATTAGAAATAAGT  50

seq1  TCAGAGAAATTAAGGAAAATGAGCTCCTAATCGAAAACATGAAAATCTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAAATTAAGGAAAATGAGCTCCTAATCGAAAACATGAAAATCTAA  100

seq1  GTCAAATGAGTAAGGTAATACAAGATGTGAAAGAGGAATTCAACAAAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAATGAGTAAGGTAATACAAGATGTGAAAGAGGAATTCAACAAAGGG  150

seq1  ACACAAATAAAAGGCTGATTGAAAGTGCTTGAAATGAAAGATGTATAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAATAAAAGGCTGATTGAAAGTGCTTGAAATGAAAGATGTATAGGT  200

seq1  CAATCAAAAACTTCCATGAAAAGACTCAGCAATAGAATAAAACAAAGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCAAAAACTTCCATGAAAAGACTCAGCAATAGAATAAAACAAAGAAA  250

seq1  TGGCAGACTATATGAGTTTGAAAACAACGTGGAAGTAATGCAGCAATCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAGACTATATGAGTTTGAAAACAACGTGGAAGTAATGCAGCAATCAA  300

seq1  ACAAAGATGAAGATAAAATAGTAAGGTATTGATATGAGCTGTAATATACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGATGAAGATAAAATAGTAAGGTATTGATATGAGCTGTAATATACC  350

seq1  CAGGGCACCCCCCTAAAATATAAAAGCTATGGATAATAGGCAAAGAAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCACCCCCCTAAAATATAAAAGCTATGGATAATAGGCAAAGAAAGA  400

seq1  GACTAACCTAATCATAAAGGCATAGAAAACATTACTTAAAAGAATGATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAACCTAATCATAAAGGCATAGAAAACATTACTTAAAAGAATGATAA  450

seq1  GGAAAAAATTCCCGGAGTTACAAACAGAGATGTCAACCCAAACACCTAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAATTCCCGGAGTTACAAACAGAGATGTCAACCCAAACACCTAGA  500

seq1  ATACCAAAAAACAGGACCAGAAAAGAACAACCAATTGTCATATATAGAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAAAAAACAGGACCAGAAAAGAACAACCAATTGTCATATATAGAAC  550

seq1  AGGAAAAGAATATTGACAACAGTCCTTCCGGTCTGCACCAGCTCAGGGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAAGAATATTGACAACAGTCCTTCCGGTCTGCACCAGCTCAGGGCC  600

seq1  ACCTTGGGCTCGAACTCAGCTGACAGTCCCATGGTCCCCAGAGGACTCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGGGCTCGAACTCAGCTGACAGTCCCATGGTCCCCAGAGGACTCTC  650

seq1  CATGCCCCACCCCAGTGCCTTAGCACACCCAGGATCTTAGGATCACTGAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCCCACCCCAGTGCCTTAGCACACCCAGGATCTTAGGATCACTGAT  700

seq1  GAGTGGAACACAACATCTGTTCCAACACAACTGGGAGTGCATGCGGACAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGAACACAACATCTGTTCCAACACAACTGGGAGTGCATGCGGACAG  750

seq1  CAGGAGCAAGGACACAGGAGTCCAGTCTTACTAATGGCTTGGGTTCCTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGCAAGGACACAGGAGTCCAGTCTTACTAATGGCTTGGGTTCCTTC  800

seq1  TGGTCGGTCAGCATGGCTCTACCTTGATTTTGAACTCAGTGGACAGCCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCGGTCAGCATGGCTCTACCTTGATTTTGAACTCAGTGGACAGCCTC  850

seq1  ATGGTCCCCAGAGGAGGTACCACTTCCAGGCTCTCTAACACACCCAGGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCCCCAGAGGAGGTACCACTTCCAGGCTCTCTAACACACCCAGGAT  900

seq1  CTTAGGATCTGGGGATCCCAGGAGCTTGGTCACACCAGAATCTCAGGGTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTTAGGATCTGGGGATCCCAGGAGCTTGGTCACACCAGAATCTCA-GGTC  949

seq1  TCAGAGGAAGTTTGACTACCAAGAACTCTGACACACCCAGAAT-CTCAGC  999
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCAGAGGAAGTTTGACTTCCAAGAACTCTGACACACCCAGAATCCTCAGC  999

seq1  ATCACAGGATCTCAGGGAAAGCTGGACTCTGAGGAGTTCTGACTCAACCA  1049
      |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  
seq2  ATCACA-GATCTCAGGGAAAGCT-GACTCTGAGGAGTTCTGACTCATC--  1045

seq1  GGATTATAAGAAGGACAAATTC  1071
       |||||| |||  |||||||||
seq2  AGATTAT-AGA--GACAAATTC  1064