BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-168L12
Chromosome4 (Build37)
Map Location 119,423,757 - 119,612,726
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHivep3
Upstream geneOlfr1338, Olfr1524-ps1, Olfr1337, Olfr219-ps1, GA_x5J8B7W3BSW-40181-41086, Olfr1335, Olfr1333, GA_x5J8B7TQTH0-2-774, Olfr1332-ps1, Olfr1331, Olfr1330, Olfr1329, Olfr1519, Lao1, LOC666703, OTTMUSG00000008833, Slc2a1, Zfp691, Ermap, Ccdc23, 4930538K18Rik, AU022252, Lepre1, Cldn19, Ybx1, Ppih, 1700041C02Rik, Ldha-ps2, LOC100041471, Ppcs, Zmynd12, BC057371, LOC666766, LOC384052, AA415398, Foxj3, Guca2a, Guca2b
Downstream geneEdn2, Foxo6, Scmh1, Slfnl1, Ctps, EG667063, Cited4, Kcnq4, Nfyc, Rims3, LOC626489, 3110037I16Rik, Zfp69
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-168L12.bB6Ng01-168L12.g
ACCDH959883DH959884
length1,1391,095
definitionDH959883|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168L12, 5' end.DH959884|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-168L12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,611,575 - 119,612,726)(119,423,757 - 119,424,850)
sequence
gaattccacgggtcggacacagtgggacatgtgaaggtgaaaccaaggca
ctggtaggtcgaagcatgaactcatacactgtggttctaggtttgacact
ttctgctcagcagccatctgcaggaccaagaatagaagcacagcaggtag
gcccttgagctggctcagcaggtggaagctgctgccaggccgaatgacat
gaatccaatcacctggacccgtggagagacaatgaggagtcactcccaca
agttgtcctctgaatgtccttcacatgcatgctgtggaacacacgcacac
acacacctttacatacacacacatgtgtgtgtgtacacatataaataaat
aaataaatgtaattaaaaaaaaaagaaatatggcaggtggagcttccaca
gcctaaggatgctaaatgtttatttgcataagtcattaacatacggagat
tctttagaaatagaaaataaactatttcttgccaataaaaccaagcgctc
agttcgtaggatgattaaatgacaacccaggatcaaatctctcctctgag
acgttatgggagaagaaaccgctagagagtaagtacaccaagtcaaactc
cctccatggtggctccaaacactgttgctcctgcagcagaaccactgatt
tcagagactaggtgaagctcatagttcccagaagcactgagtggtttgaa
tacatgcacttacatcatggaaatctccatagtctgtataaagatctgcc
atggagcaagctaaaacacactgctactgacatccaaccaccatccatgg
cagcatcttaccccaaagatgcacggatacccagcccatgcccgcggcag
tggacagctccttgaaccagatgtcatgtggacacagttctgggcttcaa
tgcagatgataattgactcatagaattactcagtgcaaaggagagatcca
caaaggtttgggcctctgtggttggagagtaaataataagagcctgattg
tcacatgtggacagaagaaaggaagaggctgtaagctgtaaagtgggtct
gtctgtgctctacacataacacaaacaacacaacacacatccctaggtaa
aatccatttggctaaggcaagagactttcttgtcacgga
gaattctaatgattttgagcgagtttcaggaatgacctggaaacaacagc
ttcgtcagtgtctcgggatgtcattgacgttggtgtcacaataatacaag
cccgtggaaatgtaaggataagatagcattactggaccttgaatggagga
aaccctttctgcatggctgtcctggggctttggcagagctgagggtgtgg
aggtttttagctaactctgcccattggtgcttgagttgctctccatccct
ttagactgtggtgaccttggagcagctcctagttcttacatccccttcac
tcttctttcttttgtcctcctgctggagccattattacattcagtcactc
ccttgctctgttcccatccctggactctcccctcctttgctcttggcccc
tgcctgtaatgtgtgcattcacatccaggcagccccattgttaactctgt
gcagtgtctttttctttccacctcacagactgtctcccagctgaggagaa
gaaggtatctactcttcaggaaatgctgttcttgggtgggagaggactgg
cttcccagaagtgccaaaatgaagatccttctccattgaaaataaacaaa
acccctttatctactggcttcctgcttcctcccctgaaagccacccttct
cagacatgtggcaccatgccaggggacatggaatcatagtatgagctgag
catgtcttcccgtacagtgctggaagctcggggaaagctgtttagtatgt
atgtctaatcaaagcatgtctttctcatgtagtatgtgttcctcatctga
cctattgccacatgtggcttgaggaatgtgatggctgtccatgtaaaatt
catgtgacatttaaagattagtcaaccatgcagtcatggcttgtttcttg
gtcattgctttaaaattcaccatgccttgtccttccctctgctgttgaga
tgcctttcaggggagaacgcatttccctttaagtggaaggctgctactgg
gatggctgatttaatgaatttggacaaggttttgaaattttcttttgagg
aatgggggaggtggtccaggggcttgagcatgctagtgagctttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_119611575_119612726
seq2: B6Ng01-168L12.b_47_1185 (reverse)

seq1  TCCGTGACAAGAAGGTCTTCTTGCCTTAGCCAAAATGGGATTTTA-CTAG  49
      ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||
seq2  TCCGTGACAAGAAAGTC-TCTTGCCTTAGCCAAA--TGGATTTTACCTAG  47

seq1  GGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGAGCACAGA  99
      || |||||||       ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||
seq2  GGATGTGTGT-------TGTGT-TGTTTGTGT-TATGTGTAGAGCACAGA  88

seq1  CAGGACCCAC-TTACAGCTTACAGCCTCTTTCCTTTCTTCTGTCCACATG  148
      || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CA-GACCCACTTTACAGCTTACAGCCTC-TTCCTTTCTTCTGTCCACATG  136

seq1  TGACAATCAGGCTCTTATTATTTACTCTTCCAACCACAAGAGGCCCAAAC  198
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  TGACAATCAGGCTCTTATTATTTACTC-TCCAACCAC-AGAGGCCCAAAC  184

seq1  CTTTGTGGATCTCTCCTTTGCACTGAGT-ATTCTATGAGTCAATTATCAT  247
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTGGATCTCTCCTTTGCACTGAGTAATTCTATGAGTCAATTATCAT  234

seq1  CTGCATTGAAGCCCAGAACTGTGTCCACATGACATCTGGTTCAAGGAGCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATTGAAGCCCAGAACTGTGTCCACATGACATCTGGTTCAAGGAGCT  284

seq1  GTCCACTGCCGCGGGCATGGGCTGGGTATCCGTGCATCTTTGGGGTAAGA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACTGCCGCGGGCATGGGCTGGGTATCCGTGCATCTTTGGGGTAAGA  334

seq1  TGCTGCCATGGATGGTGGTTGGATGTCAGTAGCAGTGTGTTTTAGCTTGC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCATGGATGGTGGTTGGATGTCAGTAGCAGTGTGTTTTAGCTTGC  384

seq1  TCCATGGCAGATCTTTATACAGACTATGGAGATTTCCATGATGTAAGTGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGCAGATCTTTATACAGACTATGGAGATTTCCATGATGTAAGTGC  434

seq1  ATGTATTCAAACCACTCAGTGCTTCTGGGAACTATGAGCTTCACCTAGTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATTCAAACCACTCAGTGCTTCTGGGAACTATGAGCTTCACCTAGTC  484

seq1  TCTGAAATCAGTGGTTCTGCTGCAGGAGCAACAGTGTTTGGAGCCACCAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAATCAGTGGTTCTGCTGCAGGAGCAACAGTGTTTGGAGCCACCAT  534

seq1  GGAGGGAGTTTGACTTGGTGTACTTACTCTCTAGCGGTTTCTTCTCCCAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGAGTTTGACTTGGTGTACTTACTCTCTAGCGGTTTCTTCTCCCAT  584

seq1  AACGTCTCAGAGGAGAGATTTGATCCTGGGTTGTCATTTAATCATCCTAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTCTCAGAGGAGAGATTTGATCCTGGGTTGTCATTTAATCATCCTAC  634

seq1  GAACTGAGCGCTTGGTTTTATTGGCAAGAAATAGTTTATTTTCTATTTCT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGAGCGCTTGGTTTTATTGGCAAGAAATAGTTTATTTTCTATTTCT  684

seq1  AAAGAATCTCCGTATGTTAATGACTTATGCAAATAAACATTTAGCATCCT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAATCTCCGTATGTTAATGACTTATGCAAATAAACATTTAGCATCCT  734

seq1  TAGGCTGTGGAAGCTCCACCTGCCATATTTCTTTTTTTTTTAATTACATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTGTGGAAGCTCCACCTGCCATATTTCTTTTTTTTTTAATTACATT  784

seq1  TATTTATTTATTTATATGTGTACACACACACATGTGTGTGTATGTAAAGG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTTATTTATATGTGTACACACACACATGTGTGTGTATGTAAAGG  834

seq1  TGTGTGTGTGCGTGTGTTCCACAGCATGCATGTGAAGGACATTCAGAGGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGCGTGTGTTCCACAGCATGCATGTGAAGGACATTCAGAGGA  884

seq1  CAACTTGTGGGAGTGACTCCTCATTGTCTCTCCACGGGTCCAGGTGATTG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGTGGGAGTGACTCCTCATTGTCTCTCCACGGGTCCAGGTGATTG  934

seq1  GATTCATGTCATTCGGCCTGGCAGCAGCTTCCACCTGCTGAGCCAGCTCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCATGTCATTCGGCCTGGCAGCAGCTTCCACCTGCTGAGCCAGCTCA  984

seq1  AGGGCCTACCTGCTGTGCTTCTATTCTTGGTCCTGCAGATGGCTGCTGAG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCTACCTGCTGTGCTTCTATTCTTGGTCCTGCAGATGGCTGCTGAG  1034

seq1  CAGAAAGTGTCAAACCTAGAACCACAGTGTATGAGTTCATGCTTCGACCT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGTGTCAAACCTAGAACCACAGTGTATGAGTTCATGCTTCGACCT  1084

seq1  ACCAGTGCCTTGGTTTCACCTTCACATGTCCCACTGTGTCCGACCCGTGG  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGTGCCTTGGTTTCACCTTCACATGTCCCACTGTGTCCGACCCGTGG  1134

seq1  AATTC  1152
      |||||
seq2  AATTC  1139

seq1: chr4_119423757_119424850
seq2: B6Ng01-168L12.g_68_1162

seq1  GAATTCTAATGATTTTGAGCGAGTTTCAGGAATGACCTGGAAACAACAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAATGATTTTGAGCGAGTTTCAGGAATGACCTGGAAACAACAGC  50

seq1  TTCGTCAGTGTCTCGGGATGTCATTGACGTTGGTGTCACAATAATACAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTCAGTGTCTCGGGATGTCATTGACGTTGGTGTCACAATAATACAAG  100

seq1  CCCGTGGAAATGTAAGGATAAGATAGCATTACTGGACCTTGAATGGAGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTGGAAATGTAAGGATAAGATAGCATTACTGGACCTTGAATGGAGGA  150

seq1  AACCCTTTCTGCATGGCTGTCCTGGGGCTTTGGCAGAGCTGAGGGTGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCTTTCTGCATGGCTGTCCTGGGGCTTTGGCAGAGCTGAGGGTGTGG  200

seq1  AGGTTTTTAGCTAACTCTGCCCATTGGTGCTTGAGTTGCTCTCCATCCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTTTAGCTAACTCTGCCCATTGGTGCTTGAGTTGCTCTCCATCCCT  250

seq1  TTAGACTGTGGTGACCTTGGAGCAGCTCCTAGTTCTTACATCCCCTTCAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACTGTGGTGACCTTGGAGCAGCTCCTAGTTCTTACATCCCCTTCAC  300

seq1  TCTTCTTTCTTTTGTCCTCCTGCTGGAGCCATTATTACATTCAGTCACTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTTCTTTTGTCCTCCTGCTGGAGCCATTATTACATTCAGTCACTC  350

seq1  CCTTGCTCTGTTCCCATCCCTGGACTCTCCCCTCCTTTGCTCTTGGCCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCTCTGTTCCCATCCCTGGACTCTCCCCTCCTTTGCTCTTGGCCCC  400

seq1  TGCCTGTAATGTGTGCATTCACATCCAGGCAGCCCCATTGTTAACTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTAATGTGTGCATTCACATCCAGGCAGCCCCATTGTTAACTCTGT  450

seq1  GCAGTGTCTTTTTCTTTCCACCTCACAGACTGTCTCCCAGCTGAGGAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTGTCTTTTTCTTTCCACCTCACAGACTGTCTCCCAGCTGAGGAGAA  500

seq1  GAAGGTATCTACTCTTCAGGAAATGCTGTTCTTGGGTGGGAGAGGACTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGTATCTACTCTTCAGGAAATGCTGTTCTTGGGTGGGAGAGGACTGG  550

seq1  CTTCCCAGAAGTGCCAAAATGAAGATCCTTCTCCATTGAAAATAAACAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCAGAAGTGCCAAAATGAAGATCCTTCTCCATTGAAAATAAACAAA  600

seq1  ACCCCTTTATCTACTGGCTTCCTGCTTCCTCCCCTGAAAGCCACCCTTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTTTATCTACTGGCTTCCTGCTTCCTCCCCTGAAAGCCACCCTTCT  650

seq1  CAGACATGTGGCACCATGCCAGGGGACATGGAATCATAGTATGAGCTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACATGTGGCACCATGCCAGGGGACATGGAATCATAGTATGAGCTGAG  700

seq1  CATGTCTTCCCGTACAGTGCTGGAAGCTCGGGGAAAGCTGTTTAGTATGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCTTCCCGTACAGTGCTGGAAGCTCGGGGAAAGCTGTTTAGTATGT  750

seq1  ATGTCTAATCAAAGCATGTCTTTCTCATGTAGTATGTGTTCCTCATCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTAATCAAAGCATGTCTTTCTCATGTAGTATGTGTTCCTCATCTGA  800

seq1  CCTATTGCCACATGTGGCTTGAGGAATGTGATGGCTGTCCATGTAAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATTGCCACATGTGGCTTGAGGAATGTGATGGCTGTCCATGTAAAATT  850

seq1  CATGTGACATTTAAAGATTAGTCAACCATGCAGTCATGGCTTGTTTC-TG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CATGTGACATTTAAAGATTAGTCAACCATGCAGTCATGGCTTGTTTCTTG  900

seq1  GTCATTGCTTTAAAATTCACCATGCCTTGTCC-TCCCTCTGCTGTTGAGA  948
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GTCATTGCTTTAAAATTCACCATGCCTTGTCCTTCCCTCTGCTGTTGAGA  950

seq1  TGCCTTTCAGGGGAGAACGCA-TTCCCTTTAAGTGGAAGGCTGCTACTGG  997
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTTTCAGGGGAGAACGCATTTCCCTTTAAGTGGAAGGCTGCTACTGG  1000

seq1  GATGGCTGATTTAATGAATTTGGACATAGTTTTGAAATTTTCTTTTTTGA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||
seq2  GATGGCTGATTTAATGAATTTGGACAAGGTTTTGAAATTTTC--TTTTGA  1048

seq1  GGTATGGGGGAGTGAGTCCAGGGTCTTGA-CATGCTAGTTGAGCTTTC  1094
      || |||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||||
seq2  GGAATGGGGGAGGTGGTCCAGGGGCTTGAGCATGCTAG-TGAGCTTTC  1095