BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170L14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 147,663,563 - 147,807,069
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666581, EG666588, LOC627701, OTTMUSG00000010671, LOC545718, OTTMUSG00000010673, 2610305D13Rik, LOC666618, LOC100043100, LOC666640, LOC194189, LOC666652, LOC100041677, LOC277692, MGC67181, D4Wsu114e, Fv1, Mfn2, Plod1, 2510039O18Rik, Nppb, Nppa, Clcn6, Mthfr, LOC433806, Agtrap, 2610109H07Rik, Mad2l2, Fbxo6, Fbxo44, Fbxo2, Ptchd2
Downstream geneUbiad1, Frap1, Angptl7, Exosc10, LOC100043151, Srm, Masp2, Tardbp, Gm572, LOC100041733, LOC100041742, LOC100041755, Casz1, Pex14, LOC670864, Dffa, Cort, Apitd1, LOC666774, Pgd, Kif1b, LOC100041794, Ube4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170L14.bB6Ng01-170L14.g
ACCDH961363DH961364
length1,092287
definitionDH961363|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170L14, 5' end.DH961364|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,805,976 - 147,807,069)(147,663,563 - 147,663,847)
sequence
gaattcaccctgaaccttgaagggttcagaatgctcccaccgacaggcac
catgggcccgtgggggatgctggttcctgccccctattttctactcagtc
aactgttcttttctgtggtctccctgttcacctctgctgctcaaacctgc
cctccttccatacgtttgctgaaccctcacacagggccccacctagaaga
ccttggaagctcggggctggcctgctgtggaggggaacgaaccatgaacc
caccatatgccatcttacttcctgtgttaataaccaaccacactcacact
ggaacctagccctaacctcagactaagacagtaatgaccttggtgaaggt
tgccatgctacaggagatacacaggaaagagattacagttcagaacaagg
aggcagaagccctggccattcttcacgggctggacttgaacttggacacc
ttgtttgccttggagagactctgtgtggagacagaggacttaggtttcag
aagtacctttgacagcatatgaaatgtagaatgaatggagatatagttag
aagccagcaacatttctaagtgtgtgcacccacacatatgcgtgtgtgtg
tgtgtgtgttacatgggtaacagctgtagcagacattttataggttctca
atgtgggaaccatattttgaaggtgatattaacaaaccggatcttgcccc
agatgcatttggaagaaagatgaaggcacacaagaccacactggcctgga
aaggagtcccaagagagttgtcttggggaagaaggactgggccaggcatg
tggtattcaaagagcaaaaccaggacgtgcagataggagttgcatgaccc
gatgtaacagctcttgtgttaagaaacctctgtagctgtgagtggaaaca
gagttggagtgttcggagcatcaacatggggggtgagtttgtcgtaacta
aagagaaagctgggttccttggcagacgctgaagcaaagattccacacca
cagagaggttgatggaaacactgggcagcctggagtctttcttcacctgg
tgaattggctggttctgataaagagttgcttctatggacctg
atgccatcctgaagacattagggttatgaaatgctcctggcaggaaggat
ccaagaaaggggagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagagagtatgaatagatagatagatagatagata
gatagatagatagatagatagatagatagatagatagatactaagaccta
gaatggcgggtgtgtatattactgccacaggagcagaagcccaaagtggt
actctagattaaacagcccctaagtgccttgctaatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_147805976_147807069
seq2: B6Ng01-170L14.b_43_1134 (reverse)

seq1  CAGGTCCATAG-AGCAACTCTTTATCAGAACCAGCCAAATCACAGGGTGA  49
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||
seq2  CAGGTCCATAGAAGCAACTCTTTATCAGAACCAGCCAATTCACCAGGTGA  50

seq1  --GAAGACTCCAGGGCTGCCCAGTTGTCTCCGTCAACCTCTCTGTGGTGT  97
         ||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGACTCCA-GGCTGCCCAG-TGTTTCCATCAACCTCTCTGTGGTGT  98

seq1  -GACTCTTTGCTTCAGCGTTCTTGCCAAGGAA-CCAGCTTTTCTCTTTAG  145
       || |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||
seq2  GGAATCTTTGCTTCAGCGT--CTGCCAAGGAACCCAGC-TTTCTCTTTAG  145

seq1  TTACGACAAACTCACCCCCCATGTTGATGCTCCGAACACTCCAACTTCTG  195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTACGACAAACTCACCCCCCATGTTGATGCTCCGAACACTCCAAC-TCTG  194

seq1  TTTCCACTCACAGCTACAGAGGTTTCTTTAACACAAGAGCTGTTACATCG  245
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCACTCACAGCTACAGAGGTTTC-TTAACACAAGAGCTGTTACATCG  243

seq1  GGTCATGCAACTCCTATCTGCACGTCCTGGTTTTGCTCTTTGAATACCAC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATGCAACTCCTATCTGCACGTCCTGGTTTTGCTCTTTGAATACCAC  293

seq1  ATGCCTGGCCCAGTCCTTCTTCCCCAAGACAACTCTCTTGGGTCTCCTTT  345
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ATGCCTGGCCCAGTCCTTCTTCCCCAAGACAACTCTCTTGGGACTCCTTT  343

seq1  CCAGGCCAGTGTGGTCTTGTGTGCCTTCATCTTTCTTCCAAATGCATCTG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCCAGTGTGGTCTTGTGTGCCTTCATCTTTCTTCCAAATGCATCTG  393

seq1  GGGCAAGATCCGGTTTGTTAATATCACCTTCAAAATATGGTTCCCACATT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAGATCCGGTTTGTTAATATCACCTTCAAAATATGGTTCCCACATT  443

seq1  GAGAACCTATAAAATGTCTGCTACAGCTGTTACCCATGTAACACACACAC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACCTATAAAATGTCTGCTACAGCTGTTACCCATGTAACACACACAC  493

seq1  ACACACACGCATATGTGTGGGTGCACACACTTAGAAATGTTGCTGGCTTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACGCATATGTGTGGGTGCACACACTTAGAAATGTTGCTGGCTTC  543

seq1  TAACTATATCTCCATTCATTCTACATTTCATATGCTGTCAAAGGTACTTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTATATCTCCATTCATTCTACATTTCATATGCTGTCAAAGGTACTTC  593

seq1  TGAAACCTAAGTCCTCTGTCTCCACACAGAGTCTCTCCAAGGCAAACAAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACCTAAGTCCTCTGTCTCCACACAGAGTCTCTCCAAGGCAAACAAG  643

seq1  GTGTCCAAGTTCAAGTCCAGCCCGTGAAGAATGGCCAGGGCTTCTGCCTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCAAGTTCAAGTCCAGCCCGTGAAGAATGGCCAGGGCTTCTGCCTC  693

seq1  CTTGTTCTGAACTGTAATCTCTTTCCTGTGTATCTCCTGTAGCATGGCAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTCTGAACTGTAATCTCTTTCCTGTGTATCTCCTGTAGCATGGCAA  743

seq1  CCTTCACCAAGGTCATTACTGTCTTAGTCTGAGGTTAGGGCTAGGTTCCA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACCAAGGTCATTACTGTCTTAGTCTGAGGTTAGGGCTAGGTTCCA  793

seq1  GTGTGAGTGTGGTTGGTTATTAACACAGGAAGTAAGATGGCATATGGTGG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGTGTGGTTGGTTATTAACACAGGAAGTAAGATGGCATATGGTGG  843

seq1  GTTCATGGTTCGTTCCCCTCCACAGCAGGCCAGCCCCGAGCTTCCAAGGT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATGGTTCGTTCCCCTCCACAGCAGGCCAGCCCCGAGCTTCCAAGGT  893

seq1  CTTCTAGGTGGGGCCCTGTGTGAGGGTTCAGCAAACGTATGGAAGGAGGG  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGGTGGGGCCCTGTGTGAGGGTTCAGCAAACGTATGGAAGGAGGG  943

seq1  CAGGTTTGAGCAGCAGAGGTGAACAGGGAGACCACAGAAAAGAACAGTTG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTTGAGCAGCAGAGGTGAACAGGGAGACCACAGAAAAGAACAGTTG  993

seq1  ACTGAGTAGAAAATAGGGGGCAGGAACCAGCATCCCCCACGGGCCCATGG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGTAGAAAATAGGGGGCAGGAACCAGCATCCCCCACGGGCCCATGG  1043

seq1  TGCCTGTCGGTGGGAGCATTCTGAACCCTTCAAGGTTCAGGGTGAATTC  1094
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTCGGTGGGAGCATTCTGAACCCTTCAAGGTTCAGGGTGAATTC  1092

seq1: chr4_147663563_147663847
seq2: B6Ng01-170L14.g_76_362

seq1  ATGCCATCCTGAAGACATTAGGGTTATGAAATGCTCCTGGCAGGAAGGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCATCCTGAAGACATTAGGGTTATGAAATGCTCCTGGCAGGAAGGAT  50

seq1  CCAAGAAAGGG--GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  98
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  100

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATGAATAGATAGATAGATAGATAGATA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATGAATAGATAGATAGATAGATAGATA  150

seq1  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACTAAGACCTA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACTAAGACCTA  200

seq1  GAATGGCGGGTGTGTATATTACTGCCACAGGAGCAGAAGCCCAAAGTGGT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGCGGGTGTGTATATTACTGCCACAGGAGCAGAAGCCCAAAGTGGT  250

seq1  ACTCTAGATAAAACAGCCCCGAAGTGCCTTGCAAATG  285
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||
seq2  ACTCTAGATTAAACAGCCCCTAAGTGCCTTGCTAATG  287