BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-171I02
Chromosome4 (Build37)
Map Location 59,723,618 - 59,841,235
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE130308A19Rik, 1110054O05Rik, Snx30
Upstream geneOlfr267, AI314180, LOC100041581, Ltb4dh, 2010203O07Rik, Gng10, AI481877, LOC433712, Ugcg, LOC100041535, LOC634731, LOC666719, Rod1, Hsdl2, LOC100041592
Downstream geneSlc46a2, LOC100041656, Mup4, LOC620807, LOC100041658, LOC620846, Mup2, LOC620882, LOC100041687, LOC667221, LOC100038948, LOC620997, Mup1, LOC620942, LOC100039008, LOC100039028, LOC620982, LOC100039054, LOC100039063, LOC667234
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-171I02.bB6Ng01-171I02.g
ACCGA000370GA000371
length682924
definitionB6Ng01-171I02.b B6Ng01-171I02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,840,554 - 59,841,235)(59,723,618 - 59,724,539)
sequence
gaattctaaggcaggcaatctcaaatttggatggccataaaattttctta
agcgactttaagggcctgtgagatgactcagcaggtaaaggcgccaggca
ccaagcctgagtacctgagttcaatccccaggttccacatggtggaagaa
gaaaaccaagtcctacaagctgtctcaggcaccacagcatgtgggcccat
accattacacatgcacacacacatgtacacacacatatgtacacacacac
acataaacacacatatcttggaaaaaaactagaaaaaaaatcaaaggtct
aaatctaatttcttttcatttttcagtgctggggattgaacacaagccct
catacatgctacaagccctcatacatgctaagccctcatacatgctaagc
cctcatacatgctaagcatgcacttctacactgagtgacatcctgattcc
gagtcttagggcctctgtgtcaccaggctggcttcaaactcatggtcctt
ctgcttcagcctccccagggattacaggtttgtaccaccatgggatccaa
acttctcaagattcaggcagcactactacctaagagctcctcagagggtc
tgagtgcccaaagaaatctctaaaggttctaaaacagtgtgctcattgga
gaggagagacgaggagggagggagggagggag
gaattcctaagccctgagaaaactaatttttactctgggaaatgatttac
tattgaatctctcaatgtttcttttagggatcatgttaaaagcactggaa
aaacatgtatgggttgattgaaaatgcctgtgtaagatactctgtgctgt
atagttaaatcagtaaagaaggaactgtagaaggactagcggggtgaggg
tacagctgccgcttcattagtgaatctgtgggaaatgtaaatgttgactc
tgtaatgaattgatgtgccttcagccccgcctccagtcaaagaaagtaag
agtgaaaagcaagattgtttctgggaattgtacatgctacgctgtatttc
aaagtctgctggcagcagcgcactatatagtttatgtattacaccagtgg
cagatattcagacacattagaaggtactcttgattcagtgcctggcagtg
taataaaaagggggtgatggtaggggtgttctatggtctctaataagcaa
tatctcaacgggccctgtcagattctatgaaaagtccacaagatgatgta
ttatgttaattaccgtcctgtggctttcatgctgttaagcctacaaatgc
agctacatttcgaagttgatttaagaatatatttcagccagggatgaaag
cactccttattgtgattaatgtcatacaatatttattctcttgttctcct
tttgcctttgctttggaatgcttaatttctttccatgaagtaggaattaa
ccttgagatttaagctttttctagtttattttttaaaactatcagatgat
cccccttttggcttctagtgtcttattttgttaattttaaaaggccagca
ttttcagagagaatttcacggttgtactgatgtgtaattctatactggag
ctcgtcagtcgccatactgttgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_59840554_59841235
seq2: B6Ng01-171I02.b_44_725 (reverse)

seq1  CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTCGTCTCTCCTCTCCAATGAGCACACTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCCCTCCCTCCCTCCTCGTCTCTCCTCTCCAATGAGCACACTGTT  50

seq1  TTAGAACCTTTAGAGATTTCTTTGGGCACTCAGACCCTCTGAGGAGCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAACCTTTAGAGATTTCTTTGGGCACTCAGACCCTCTGAGGAGCTCT  100

seq1  TAGGTAGTAGTGCTGCCTGAATCTTGAGAAGTTTGGATCCCATGGTGGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTAGTAGTGCTGCCTGAATCTTGAGAAGTTTGGATCCCATGGTGGTA  150

seq1  CAAACCTGTAATCCCTGGGGAGGCTGAAGCAGAAGGACCATGAGTTTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCTGTAATCCCTGGGGAGGCTGAAGCAGAAGGACCATGAGTTTGAA  200

seq1  GCCAGCCTGGTGACACAGAGGCCCTAAGACTCGGAATCAGGATGTCACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCTGGTGACACAGAGGCCCTAAGACTCGGAATCAGGATGTCACTC  250

seq1  AGTGTAGAAGTGCATGCTTAGCATGTATGAGGGCTTAGCATGTATGAGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAGAAGTGCATGCTTAGCATGTATGAGGGCTTAGCATGTATGAGGG  300

seq1  CTTAGCATGTATGAGGGCTTGTAGCATGTATGAGGGCTTGTGTTCAATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCATGTATGAGGGCTTGTAGCATGTATGAGGGCTTGTGTTCAATCC  350

seq1  CCAGCACTGAAAAATGAAAAGAAATTAGATTTAGACCTTTGATTTTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACTGAAAAATGAAAAGAAATTAGATTTAGACCTTTGATTTTTTTT  400

seq1  CTAGTTTTTTTCCAAGATATGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTACATATGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTTTTTTTCCAAGATATGTGTGTTTATGTGTGTGTGTGTACATATGT  450

seq1  GTGTGTACATGTGTGTGTGCATGTGTAATGGTATGGGCCCACATGCTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTACATGTGTGTGTGCATGTGTAATGGTATGGGCCCACATGCTGTG  500

seq1  GTGCCTGAGACAGCTTGTAGGACTTGGTTTTCTTCTTCCACCATGTGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGAGACAGCTTGTAGGACTTGGTTTTCTTCTTCCACCATGTGGAA  550

seq1  CCTGGGGATTGAACTCAGGTACTCAGGCTTGGTGCCTGGCGCCTTTACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGATTGAACTCAGGTACTCAGGCTTGGTGCCTGGCGCCTTTACCT  600

seq1  GCTGAGTCATCTCACAGGCCCTTAAAGTCGCTTAAGAAAATTTTATGGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGTCATCTCACAGGCCCTTAAAGTCGCTTAAGAAAATTTTATGGCC  650

seq1  ATCCAAATTTGAGATTGCCTGCCTTAGAATTC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAATTTGAGATTGCCTGCCTTAGAATTC  682

seq1: chr4_59723618_59724539
seq2: B6Ng01-171I02.g_62_985

seq1  GAATTCCTAAGCCCTGAGAAAACTAATTTTTACTCTGGGAAATGATTTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAAGCCCTGAGAAAACTAATTTTTACTCTGGGAAATGATTTAC  50

seq1  TATTGAATCTCTCAATGTTTCTTTTAGGGATCATGTTAAAAGCACTGGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAATCTCTCAATGTTTCTTTTAGGGATCATGTTAAAAGCACTGGAA  100

seq1  AAACATGTATGGGTTGATTGAAAATGCCTGTGTAAGATACTCTGTGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGTATGGGTTGATTGAAAATGCCTGTGTAAGATACTCTGTGCTGT  150

seq1  ATAGTTAAATCAGTAAAGAAGGAACTGTAGAAGGACTAGCGGGGTGAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTAAATCAGTAAAGAAGGAACTGTAGAAGGACTAGCGGGGTGAGGG  200

seq1  TACAGCTGCCGCTTCATTAGTGAATCTGTGGGAAATGTAAATGTTGACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGCTGCCGCTTCATTAGTGAATCTGTGGGAAATGTAAATGTTGACTC  250

seq1  TGTAATGAATTGATGTGCCTTCAGCCCCGCCTCCAGTCAAAGAAAGTAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATGAATTGATGTGCCTTCAGCCCCGCCTCCAGTCAAAGAAAGTAAG  300

seq1  AGTGAAAAGCAAGATTGTTTCTGGGAATTGTACATGCTACGCTGTATTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAAGCAAGATTGTTTCTGGGAATTGTACATGCTACGCTGTATTTC  350

seq1  AAAGTCTGCTGGCAGCAGCGCACTATATAGTTTATGTATTACACCAGTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCTGCTGGCAGCAGCGCACTATATAGTTTATGTATTACACCAGTGG  400

seq1  CAGATATTCAGACACATTAGAAGGTACTCTTGATTCAGTGCCTGGCAGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATATTCAGACACATTAGAAGGTACTCTTGATTCAGTGCCTGGCAGTG  450

seq1  TAATAAAAAGGGGGTGATGGTAGGGGTGTTCTATGGTCTCTAATAAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAAAAGGGGGTGATGGTAGGGGTGTTCTATGGTCTCTAATAAGCAA  500

seq1  TATCTCAACGGGCCCTGTCAGATTCTATGAAAAGTCCACAAGATGATGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCAACGGGCCCTGTCAGATTCTATGAAAAGTCCACAAGATGATGTA  550

seq1  TTATGTTAATTACCGTCCTGTGGCTTTCATGCTGTTAAGCCTACAAATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTTAATTACCGTCCTGTGGCTTTCATGCTGTTAAGCCTACAAATGC  600

seq1  AGCTACATTTCGAAGTTGATTTAAGAATATATTTCAGCCA-GGATGAAAG  649
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGCTACATTTCGAAGTTGATTTAAGAATATATTTCAGCCAGGGATGAAAG  650

seq1  CACTCCTTATTGTGATTAATGTCATACAATATTTATTCTCTTGTTCTCCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTTATTGTGATTAATGTCATACAATATTTATTCTCTTGTTCTCCT  700

seq1  TTTGCCTTTGCTTTGGAATGCTTAATTTCTTTCCATGAAGTAGGAATTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTTTGCTTTGGAATGCTTAATTTCTTTCCATGAAGTAGGAATTAA  750

seq1  CCTTGAGATTTAAGCTTTTTCTAGTTTA-TTTTTAAAACTATCAGATGAT  798
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGATTTAAGCTTTTTCTAGTTTATTTTTTAAAACTATCAGATGAT  800

seq1  CCCCCTTTTGGCTTCTAGTGTCTTATTTTGTTAATTTT-AAAGGCCAGCA  847
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCCCCTTTTGGCTTCTAGTGTCTTATTTTGTTAATTTTAAAAGGCCAGCA  850

seq1  TTTTCAAGAGAGAATTTCACGGTTGTACTGATGTGTAATTCTATACT-GA  896
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTTTC-AGAGAGAATTTCACGGTTGTACTGATGTGTAATTCTATACTGGA  899

seq1  GCTCGTTCAGTCGCCATACTGTTGCT  922
      ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GCTCG-TCAGTCGCCATACTGTTGCT  924