seq1: chr4_6567161_6568345
seq2: B6Ng01-174F07.b_50_1228 (reverse)
seq1 TTTCTTTTTA-TTGAACTGAAGAG-CTTGTGTGAGTA-GCTGAAATCTTA 47
|||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2 TTTCTTTTTATTTGAAC-GAAGAGCCTTGTGTGAGTAGGCTGAAATCT-- 47
seq1 AAATCCTGAGACTGTGTAATCTTGAG-ACTGTTCTGCTTTGGGCCTCAGG 96
|||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || | |
seq2 AAATCCTGAGACTG-GTAATC-TGAGAACTGTTCTGCTTTGGGACTTAAG 95
seq1 ATTTTTTCCCTTTCTGTAAAGTGGGTTAATAAAAATACCTCTCACATAGG 146
|||| || ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |
seq2 GATTTTACC--TTCTGTAAAGTGGGTAATAAAAAATACTCTTCACATAAG 143
seq1 CTTATGACACTCACTCAAATGTTGTTAATTATAAGACA-GCTAAGACAAA 195
| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||
seq2 C-TATGACACTCACTCAAATGTTG-TAATTATAAGACAGGCTAAGAC-AA 190
seq1 GTTCAGTGCTCAGGAAGCAATAAGCGAGCTAGTAACTATTATTGTTGAAT 245
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||
seq2 GTTCAGTGCTCAGGAAGCAATAAGCGAGCTAGTACCTATTATTG-TGAAT 239
seq1 TCATCTTCAGAGCTCGCACTGTATACCTACCCACTTAGGCC-TTACTGTA 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2 TCATCTTCAGAGCTCGCACTGTATACCTACCCACTTAGGCCTTTACTGTA 289
seq1 CTGAGGCTGAGCAACGTTCTTTGCATAGTGAAACTGTTTGGGGGGAGTAG 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGAGGCTGAGCAACGTTCTTTGCATAGTGAAACTGTTTGGGGGGAGTAG 339
seq1 CACCGTCTGGGTCAGGTGGAATAGCCCAAGTCTATCTCAACAGTCCATTA 394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACCGTCTGGGTCAGGTGGAATAGCCCAAGTCTATCTCAACAGTCCATTA 389
seq1 ATGGAGCCTCTGGCCAACTTTCATCTCTGTGCTTCACTTCTTCAGTGTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2 ATGGAGCCTCTGGCCAACTTTCATCTCTGTGCTTCACTTCTTCAGTG-TT 438
seq1 GAAGTCTGCATAATGATATTTAACATGGAGTTGTCATAGGGGCCTAATGA 494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAAGTCTGCATAATGATATTTAACATGGAGTTGTCATAGGGGCCTAATGA 488
seq1 GGTCTGATTTGTAAATTGCCTAGTTAAGTGTCTGATGCATGGTGCGATTG 544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGTCTGATTTGTAAATTGCCTAGTTAAGTGTCTGATGCATGGTGCGATTG 538
seq1 CCCAAATGATGATGATAATGATGCAGAGGCGTGTAATGATGATGCTAAAA 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCAAATGATGATGATAATGATGCAGAGGCGTGTAATGATGATGCTAAAA 588
seq1 TGATAACTCTCACAATTCTTAGAATTCTGCCTAGTTACTCTGCTACACAA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGATAACTCTCACAATTCTTAGAATTCTGCCTAGTTACTCTGCTACACAA 638
seq1 TTCTATAAGTGTCCTTTTGGATACTTTAGTACCATTAGAAGCATAGTTTC 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTATAAGTGTCCTTTTGGATACTTTAGTACCATTAGAAGCATAGTTTC 688
seq1 CTTAATTGGTATTATATTATGTTTAATTAATCTCCTTTTCATCATTTACT 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTAATTGGTATTATATTATGTTTAATTAATCTCCTTTTCATCATTTACT 738
seq1 GTAAGTGGTTGATGTCTTTAAGTTCCAGACCATATAAATTTGCTTCACTT 794
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAAGTGGTTGATGTCTTTAAGTTCCAGACCATATAAATTTGCTTCACTT 788
seq1 TTGAAGTGATTAAGATGCTTTTTCATACATGTTTACTACAACTCATTTCA 844
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTGAAGTGATTAAGATGCTTTTTCATACATGTTTACTACAACTCATTTCA 838
seq1 CCAGTGCCTTCTAGAGCAGTCAAGGGTTTCCAAAATGTTCTATTATATAC 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGTGCCTTCTAGAGCAGTCAAGGGTTTCCAAAATGTTCTATTATATAC 888
seq1 AGGTCATTAAATAAATGAACTAAATTGATGCTTTGCATGCGTATCCTACT 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTCATTAAATAAATGAACTAAATTGATGCTTTGCATGCGTATCCTACT 938
seq1 GTTTCCTTAAGATAAGCTGCTTGTACAAGGAAATCCTCAAAGATCTTTAT 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTCCTTAAGATAAGCTGCTTGTACAAGGAAATCCTCAAAGATCTTTAT 988
seq1 GCATGCCTAGCTGGTTATTCTTTTTACTGCTAGATTGTCAGTATCTGTGC 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCATGCCTAGCTGGTTATTCTTTTTACTGCTAGATTGTCAGTATCTGTGC 1038
seq1 CCCCTAAGTTTGTATGTTGATAACAGTCACCACTGTGCCAGAGTTAAGAG 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCCTAAGTTTGTATGTTGATAACAGTCACCACTGTGCCAGAGTTAAGAG 1088
seq1 ATAGGGCCTTTGAGGCTGGTTACATTACGAACGAAGGCAGAACCTTTGTA 1144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATAGGGCCTTTGAGGCTGGTTACATTACGAACGAAGGCAGAACCTTTGTA 1138
seq1 AATGGGATTGATGCTCTTACAGCATTTGTCTAAGAGAATTC 1185
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATGGGATTGATGCTCTTACAGCATTTGTCTAAGAGAATTC 1179
| seq1: chr11_45514859_45515053
seq2: B6Ng01-174F07.g_137_319
seq1 ATAAAATATTATTTTTTAAAGAGCCGTATTCTGAGCCGGGC-GTGTTGGC 49
||||||| ||||||||| | | |||||| ||| ||||
seq2 ATAAAAT----TTTTTTAAAAA----------AACCCGGGCGGTGGTGGC 36
seq1 GCACGCCTTTAATCCCGGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGA 99
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2 GCACGCCTTTAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCAGATTTCTGA 86
seq1 GTTCGAGGCCAGCCTGCTCTACAAAGTGAGCTCCAGGACAGCCAGGGCTA 149
||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2 GTTCGAGACCAGCCTAGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTA 136
seq1 TACAGAGAAACCCTGTCTCG-AAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAA 195
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||
seq2 TACAGAGAAACCCTGTCTTGAAAAAAACAAAAACCAAAAAAAAAAAA 183
|
