BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-179D10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 150,429,528 - 150,576,263
singlet/doubletdoublet
Overlap geneVamp3, Camta1
Upstream geneGpr157, Slc2a5, LOC435818, Car6, LOC100041882, Eno1, LOC666880, LOC384091, Rere, Slc45a1, LOC677027, Errfi1, Park7, Tnfrsf9, Uts2, Per3
Downstream geneLOC100041960, Dnajc11, Thap3, Phf13, Klhl21, Zbtb48, Tas1r1, Nol9, EG666980, Plekhg5, Tnfrsf25, Espn, LOC100043284, Hes2, Acot7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-179D10.bB6Ng01-179D10.g
ACCGA005998GA005999
length1,1631,016
definitionB6Ng01-179D10.b B6Ng01-179D10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,429,528 - 150,430,690)(150,575,259 - 150,576,263)
sequence
gaattctagggagagctggggctacagcagttccacctgctatgggtcct
tcaacaaatatcagagaaagcaaagacctgcctctattagggaactagta
aacctggctataagacacacaacaatttggaaacaaaacaaaacccaaat
cagaaagacttgttcctggcttgaataatccaattaccctatcttacaag
tggctctggggacaagctttcagatatgttttaggtttgtaattggtagt
agaaaaattagtatgaaaccaggaagagtctcctttgtgcttagaagatg
gcttctagaacattcaggcaaagcatcatatacataaaataaaaataaac
ctaaacaaaaagaatatggaaatacttgtctgagtttctcgcagaatctg
tactattgccctttaaatacacgtttaaaaagatgacttctgatatagtc
aaaatttatgcccacacactgctgatgccttttttctctaatgttttaaa
aaaataattacatgcttgtgtctgtgtgtacaggtgcatgcatgtgccct
tggaggcagttacaagcagtttcgtgatacaaatgagagtgcttggaacc
caggtggatcctctgctagaacaagtaagtgttcttttaactcccgagac
atctttctagctccaacgactctttttctaaataaaattctagagaattc
ccatgtttgtttaaaagtcacatttaaaattttagagtggtacctcatct
acttgattttgtgtctgctggagtcttcgattactgccagtggcagcact
tgaccccgaaaggcacacctgtagacctgaaaggtataaagtcacaagta
tgagtacactgtaattcccagtgcacttgataagctaatatataatccca
atgctccaaccatgacatggaggtggacacatgagagtcttggaagcctg
agggccagctcactgatacatgcagcactgaacaagagatagtgtctcaa
taagtggaaagccaggactgaccatgtgaggttgtttctctgctctcaag
tgttcctttgcttctcaagtataccatggctgtttggtgtgtataactgt
tattgtgggacggcagtcttaactcttacacctgcagttattcttaaagt
tcccaaggtaaaa
gaattcattagctcttgacaagggtgtggtctgtgtggaaggacaatgga
cacctggaatataaatggtgtgtctaagccacgcagagtataagtagcag
agtcggaattgctctgcctttcatctgaaaccctttacgcccgtaccacc
cagcaggccttcggaggtaccttcctgctaccccacactgggctggtgac
ttctaaccagggtctgagtacaatgagaggtggctcagcaagagccctag
ccactgtcagaatgaaacaagcgaggggtcacgagctcctggtgcacacg
tgcgtggaggtgggtgatgtgggacaggtcctcgctcattcaatcacaga
ggcctacataccagagcgtacacaggacgcagctccagaccgctgaaatc
ctgtcctgagatcccagccctcagggcaggccatctagtgggaaggatgc
tggtgtacacatagacaagaaaggccaccagctttgaggtctgtgctctc
caaaggggtgtcatctggactgtgaccgagtcacatggaaaccaccggta
tgaaccttgggaagaatgttccagagggagcagccagttccaagctcctg
aggctgtaaagcaggagaaagcaagcaaacaggggactggagccgatgag
ccaggcaagcacaggaaagcactcgaagggaagcctgagggagctcccac
cccaaggaagggcagaatgcctcagtcttatttggatactctaagcacag
cagtgatgtgatctgataaatgtgcttttaaagttctctcttgctgtaag
ggacaaggtggcagctagtaggtccctacagcgactcagcaggaggacat
atcaggagcagaggaaaagggggctgagggctaagtggttaggtttaccc
agacttgccttaggggtcaggcaggctcgttttaaaaaagagaagggatc
cagccctgaccagtggtggtcttgtacttgggataactaggggcttggtc
aaggcttttgtacacc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_150429528_150430690
seq2: B6Ng01-179D10.b_47_1209

seq1  GAATTCTAGGGAGAGCTGGGGCTACAGCAGTTCCACCTGCTATGGGTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGGAGAGCTGGGGCTACAGCAGTTCCACCTGCTATGGGTCCT  50

seq1  TCAACAAATATCAGAGAAAGCAAAGACCTGCCTCTATTAGGGAACTAGTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAAATATCAGAGAAAGCAAAGACCTGCCTCTATTAGGGAACTAGTA  100

seq1  AACCTGGCTATAAGACACACAACAATTTGGAAACAAAACAAAACCCAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTGGCTATAAGACACACAACAATTTGGAAACAAAACAAAACCCAAAT  150

seq1  CAGAAAGACTTGTTCCTGGCTTGAATAATCCAATTACCCTATCTTACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGACTTGTTCCTGGCTTGAATAATCCAATTACCCTATCTTACAAG  200

seq1  TGGCTCTGGGGACAAGCTTTCAGATATGTTTTAGGTTTGTAATTGGTAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCTGGGGACAAGCTTTCAGATATGTTTTAGGTTTGTAATTGGTAGT  250

seq1  AGAAAAATTAGTATGAAACCAGGAAGAGTCTCCTTTGTGCTTAGAAGATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATTAGTATGAAACCAGGAAGAGTCTCCTTTGTGCTTAGAAGATG  300

seq1  GCTTCTAGAACATTCAGGCAAAGCATCATATACATAAAATAAAAATAAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTAGAACATTCAGGCAAAGCATCATATACATAAAATAAAAATAAAC  350

seq1  CTAAACAAAAAGAATATGGAAATACTTGTCTGAGTTTCTCGCAGAATCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAAAAAGAATATGGAAATACTTGTCTGAGTTTCTCGCAGAATCTG  400

seq1  TACTATTGCCCTTTAAATACACGTTTAAAAAGATGACTTCTGATATAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTATTGCCCTTTAAATACACGTTTAAAAAGATGACTTCTGATATAGTC  450

seq1  AAAATTTATGCCCACACACTGCTGATGCCTTTTTTCTCTAATGTTTTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTATGCCCACACACTGCTGATGCCTTTTTTCTCTAATGTTTTAAA  500

seq1  AAAATAATTACATGCTTGTGTCTGTGTGTACAGGTGCATGCATGTGCCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAATTACATGCTTGTGTCTGTGTGTACAGGTGCATGCATGTGCCCT  550

seq1  TGGAGGCAGTTACAAGCAGTTTCGTGATACAAATGAGAGTGCTTGGAACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGCAGTTACAAGCAGTTTCGTGATACAAATGAGAGTGCTTGGAACC  600

seq1  CAGGTGGATCCTCTGCTAGAACAAGTAAGTGTTCTTTTAACTCCCGAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGGATCCTCTGCTAGAACAAGTAAGTGTTCTTTTAACTCCCGAGAC  650

seq1  ATCTTTCTAGCTCCAACGACTCTTTTTCTAAATAAAATTCTAGAGAATTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTTCTAGCTCCAACGACTCTTTTTCTAAATAAAATTCTAGAGAATTC  700

seq1  CCATGTTTGTTTAAAAGTCACATTTAAAATTTTAGAGTGGTACCTCATCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGTTTGTTTAAAAGTCACATTTAAAATTTTAGAGTGGTACCTCATCT  750

seq1  ACTTGATTTTGTGTCTGCTGGAGTCTTCGATTACTGCCAGTGGCAGCACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATTTTGTGTCTGCTGGAGTCTTCGATTACTGCCAGTGGCAGCACT  800

seq1  TGACCCCG-AAGGCACACCTGTAGACCTGAAAGGTATAAAGTCACAAGTA  849
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCCGAAAGGCACACCTGTAGACCTGAAAGGTATAAAGTCACAAGTA  850

seq1  TGAGTACACTGTAATTCCCAGTGCACTTGATAAGCTAATATATAATCCCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTACACTGTAATTCCCAGTGCACTTGATAAGCTAATATATAATCCCA  900

seq1  ATGCTCCAACCATGACATGGGAGGTGGACACATGAGAGTCTTGGAAGCCT  949
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCCAACCATGACAT-GGAGGTGGACACATGAGAGTCTTGGAAGCCT  949

seq1  GAGGGCCAGCTCACCTGATACATGCAGCACTGAACAAGAGATAGTGTCTC  999
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GAGGGCCAGCTCA-CTGATACATGCAGCACTGAACAAGAGATAGTGTCT-  997

seq1  CAATAAGGTGGAAAGCCAGGACTGA-CATGTGAGGTTG-TTCTCTGCTCT  1047
      |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  CAATAA-GTGGAAAGCCAGGACTGACCATGTGAGGTTGTTTCTCTGCTCT  1046

seq1  CAAGTG-TCCTTTGC-TCTCAAGTATACCATGGCCTGTTT-GTGTGTATA  1094
      |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| 
seq2  CAAGTGTTCCTTTGCTTCTCAAGTATACCATGG-CTGTTTGGTGTGTAT-  1094

seq1  AACTGTTATGGTGGGAC-GCAGTCTTAACTCCTTACA-CTGCAGTTATTT  1142
      ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||
seq2  AACTGTTATTGTGGGACGGCAGTCTTAACT-CTTACACCTGCAGTTA-TT  1142

seq1  CTTAAAAGTCCCAAGGTAAAA  1163
      ||||||  |||||||||||||
seq2  CTTAAAGTTCCCAAGGTAAAA  1163

seq1: chr4_150575259_150576263
seq2: B6Ng01-179D10.g_69_1084 (reverse)

seq1  GGTGTAC-ACAGCCTTG--CCAGCCCCTAGTTAT-CCAAGTCCAAGGCCA  46
      ||||||| | |||||||  | ||||||||||||| |||||| |||| |||
seq2  GGTGTACAAAAGCCTTGACCAAGCCCCTAGTTATCCCAAGTACAAGACCA  50

seq1  CCACTGGTCA-GGCTGGATCCC-TCTC-TTTCTAAAACGAGCCTGCCTG-  92
      |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| 
seq2  CCACTGGTCAGGGCTGGATCCCTTCTCTTTTTTAAAACGAGCCTGCCTGA  100

seq1  CCCCTAA-GCAAGTCT-GGTAAACCTTACCACTTAGCCCTCAGCCCCCTT  140
      ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTAAGGCAAGTCTGGGTAAACCTAACCACTTAGCCCTCAGCCCCCTT  150

seq1  TTCCTCTGCTCCTGCTATGTCCTCCTGCTGAGTCGCTGTA-GGACCTACT  189
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TTCCTCTGCTCCTGATATGTCCTCCTGCTGAGTCGCTGTAGGGACCTACT  200

seq1  AGCTGCCACCTTGTCCCTTACAGCAAGAGAGAACTTTAAAAGCACATTTA  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCACCTTGTCCCTTACAGCAAGAGAGAACTTTAAAAGCACATTTA  250

seq1  TCAGATCACATCACTGCTGTGCTTAGAGTATCCAAATAAGACTGAGGCAT  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATCACATCACTGCTGTGCTTAGAGTATCCAAATAAGACTGAGGCAT  300

seq1  TCTGCCCTTCCTTGGGGTGGGAGCTCCCTCAGGCTTCCCTTCGAGTGCTT  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCCTTCCTTGGGGTGGGAGCTCCCTCAGGCTTCCCTTCGAGTGCTT  350

seq1  TCCTGTGCTTGCCTGGCTCATCGGCTCCAGTCCCCTGTTTGCTTGCTTTC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTGCTTGCCTGGCTCATCGGCTCCAGTCCCCTGTTTGCTTGCTTTC  400

seq1  TCCTGCTTTACAGCCTCAGGAGCTTGGAACTGGCTGCTCCCTCTGGAACA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTTTACAGCCTCAGGAGCTTGGAACTGGCTGCTCCCTCTGGAACA  450

seq1  TTCTTCCCAAGGTTCATACCGGTGGTTTCCATGTGACTCGGTCACAGTCC  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCCAAGGTTCATACCGGTGGTTTCCATGTGACTCGGTCACAGTCC  500

seq1  AGATGACACCCCTTTGGAGAGCACAGACCTCAAAGCTGGTGGCCTTTCTT  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGACACCCCTTTGGAGAGCACAGACCTCAAAGCTGGTGGCCTTTCTT  550

seq1  GTCTATGTGTACACCAGCATCCTTCCCACTAGATGGCCTGCCCTGAGGGC  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGTGTACACCAGCATCCTTCCCACTAGATGGCCTGCCCTGAGGGC  600

seq1  TGGGATCTCAGGACAGGATTTCAGCGGTCTGGAGCTGCGTCCTGTGTACG  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATCTCAGGACAGGATTTCAGCGGTCTGGAGCTGCGTCCTGTGTACG  650

seq1  CTCTGGTATGTAGGCCTCTGTGATTGAATGAGCGAGGACCTGTCCCACAT  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGTATGTAGGCCTCTGTGATTGAATGAGCGAGGACCTGTCCCACAT  700

seq1  CACCCACCTCCACGCACGTGTGCACCAGGAGCTCGTGACCCCTCGCTTGT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACCTCCACGCACGTGTGCACCAGGAGCTCGTGACCCCTCGCTTGT  750

seq1  TTCATTCTGACAGTGGCTAGGGCTCTTGCTGAGCCACCTCTCATTGTACT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTCTGACAGTGGCTAGGGCTCTTGCTGAGCCACCTCTCATTGTACT  800

seq1  CAGACCCTGGTTAGAAGTCACCAGCCCAGTGTGGGGTAGCAGGAAGGTAC  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCCTGGTTAGAAGTCACCAGCCCAGTGTGGGGTAGCAGGAAGGTAC  850

seq1  CTCCGAAGGCCTGCTGGGTGGTACGGGCGTAAAGGGTTTCAGATGAAAGG  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCGAAGGCCTGCTGGGTGGTACGGGCGTAAAGGGTTTCAGATGAAAGG  900

seq1  CAGAGCAATTCCGACTCTGCTACTTATACTCTGCGTGGCTTAGACACACC  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCAATTCCGACTCTGCTACTTATACTCTGCGTGGCTTAGACACACC  950

seq1  ATTTATATTCCAGGTGTCCATTGTCCTTCCACACAGACCACACCCTTGTC  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATATTCCAGGTGTCCATTGTCCTTCCACACAGACCACACCCTTGTC  1000

seq1  AAGAGCTAATGAATTC  1005
      ||||||||||||||||
seq2  AAGAGCTAATGAATTC  1016