BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-184H23
Chromosome4 (Build37)
Map Location 147,185,766 - 147,329,707
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC277692, MGC67181, D4Wsu114e, Fv1, Mfn2, Plod1, 2510039O18Rik
Upstream geneLOC666474, LOC666482, LOC434514, LOC626288, LOC666498, LOC100043034, LOC666514, LOC100041561, LOC100041570, OTTMUSG00000010657, LOC384087, LOC666546, LOC666557, LOC545716, LOC666574, LOC666581, EG666588, LOC627701, OTTMUSG00000010671, LOC545718, OTTMUSG00000010673, 2610305D13Rik, LOC666618, LOC100043100, LOC666640, LOC194189, LOC666652, LOC100041677
Downstream geneNppb, Nppa, Clcn6, Mthfr, LOC433806, Agtrap, 2610109H07Rik, Mad2l2, Fbxo6, Fbxo44, Fbxo2, Ptchd2, Ubiad1, Frap1, Angptl7, Exosc10, LOC100043151, Srm, Masp2, Tardbp, Gm572, LOC100041733, LOC100041742, LOC100041755, Casz1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-184H23.bB6Ng01-184H23.g
ACCGA009857GA009858
length8531,065
definitionB6Ng01-184H23.b B6Ng01-184H23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,328,613 - 147,329,707)(147,185,766 - 147,186,665)
sequence
gaattccattttagacttgtccaagaaaaagtagaagtcattagctctca
ggaaattattctttggggctggagaaatagcttagtggttaggagcgctt
taggagggctggagtttggctccccagcacccgtgccaggtggctctcaa
ctgcctgcaactccggatccaggagatccaaaccactcttctggtttcca
tggatccacacacacattctccatggatacacacacacacacactccatg
gatacacacacacacactccatggatatacacatacacacacacacacac
tccatggatacacacacactccatggatacacacacacacacactccatg
gatatacacatacacacacacacacacacactccatggatacacacacac
acacactccatggatacacacacacacacactccatggatacacacacac
acactccatggatatacacatacacacacacacacacactccatggatat
acacacactccatggatccacacatacacactccatggatccacacacac
tccatggatacacacacacacactccatggatatacacatacacactcca
tggatacacacacactccatggatacacacacacacacacacacacacac
acactccatggatacacacacacacactccatggatacacacacacacac
actcccatggatacacacacacacacactccatggatacacacacacaca
cactccatggatacacacacacacactccatggatatacacatacacaca
cacacacacactccatggaatatacacacactccatgggatccacacata
cac
gaattctctacttcattttccctgtgtcttccaccctctgtgtgtctgtt
cagttagtttaaatctgtaacttcctgaaggctgcttgtatagctctccc
tttctgtctgccttttgtctccatgttggtgtctatctgtgtaatctgtt
gtctatttgtatctctctgactgaccttgagagagagctttggagtgctt
ctagaacatcaagggaaccatcacatggggaaagaatgggatagtgaaca
gtaatcttttataaaggattaggtaactggctccaagtggtcaagtggac
aacaaacatttataaatatgacttttatcaaaaaatacccataactgtat
atgcatttttgaactatgctttaagcctctgcatttcatgctttcatcaa
gtgacactcatgcagtttctgagcaggacttgaaaaagtacataaattgc
cattgtatctatgcatcaagttaggttttaaaagttgatatcaagagaag
tccaaggaaaataatgtgagtttttacattgttctttgaaaagtgtgcta
aaccctcagtaggatcacagctttaaaacttaaatttcttcaagttgcct
taattctggttgtgaggtccaggaaaattccccatttattagaagttaag
atgttttatataatacattgtcacagttatggttctgccaatgcatagga
aagcaccatggagcaagactccatggagttataatgggtgtagtcttagt
aagatgttcgcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatttaaagtaccagcttata
agtgtatgaatgtgtttcaaatgaagttctgaattctgaaagagatggaa
tttcagttgatcttgtcttttccactgtgttacatcaagaaagttgctag
ccaaggtgggttcaataaaatacccaaagaatgcagaccactgacaacaa
aggggttgcttttaacaaactgacaataagtcttcattgctaagacaggc
tgaacacaaaacactgtatatgaaaggtcactgggtgcgtgcagacatga
actcttatgtccagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_147328613_147329707
seq2: B6Ng01-184H23.b_48_873 (reverse)

seq1  TGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATC  50
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  CATGGAGTATGTGTGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTGGATCTGTGGAGT  100
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  GTGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGT  150
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  GTATCCATGGAGTGTGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTGGATCCATGGAG  200
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGGATCCATGGAGTGTGTA  250
                                                        
seq2  --------------------------------------------------  0

seq1  TGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTATA-TCCATGGAGTGTGTGTGTGTGT  299
                           |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ---------------------TGTATATTCCATGGAGTGTGTGTGTGTGT  29

seq1  GTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGT  79

seq1  GTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCAT-GGAGTGTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGGAGTGTG  129

seq1  TGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTG  179

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTATCCATGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTATCCATGG  229

seq1  AGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTG  279

seq1  TGTGTGGATCCATGGAGTGTGTATGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTATA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGATCCATGGAGTGTGTATGTGTGGATCCATGGAGTGTGTGTATA  329

seq1  TCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTG  379

seq1  TGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTG  429

seq1  TGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCAT  479

seq1  GGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTATCCATGGAGTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGTGTGTGTGTATCCATGGAGTG  529

seq1  TGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGTATGTGTATATCCATGGAGTGTGTGTGTGTGTATCCAT  579

seq1  GGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGAATGTGTGTGTGGATCCATGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGTGTGTGTGTGTGTATCCATGGAGAATGTGTGTGTGGATCCATGG  629

seq1  AAACCAGAAGAGTGGTTTGGATCTCCTGGATCCGGAGTTGCAGGCAGTTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAGAAGAGTGGTTTGGATCTCCTGGATCCGGAGTTGCAGGCAGTTG  679

seq1  AGAGCCACCTGGCACGGGTGCTGGGGAGCCAAACTCCAGCCCTCCTAAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCACCTGGCACGGGTGCTGGGGAGCCAAACTCCAGCCCTCCTAAAG  729

seq1  CGCTCCTAACCACTAAGCTATTTCTCCAGCCCCAAAGAATAATTTCCTGA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTCCTAACCACTAAGCTATTTCTCCAGCCCCAAAGAATAATTTCCTGA  779

seq1  GAGCTAATGACTTCTACTTTTTCTTGGACAAGTCTAAAATGGAATTC  1095
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTAATGACTTCTACTTTTTCTTGGACAAGTCTAAAATGGAATTC  826

seq1: chr4_147185766_147186665
seq2: B6Ng01-184H23.g_245_1133

seq1  TTGAGAGAGAGCTTTGGAGTGCTTCTAGAACATCAAGGGAACCATCACAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGAGAGCTTTGGAGTGCTTCTAGAACATCAAGGGAACCATCACAT  50

seq1  GGGGAAAGAATGGGATAGTGAACAGTAATCTTTTATAAAGGATTAGGTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAAGAATGGGATAGTGAACAGTAATCTTTTATAAAGGATTAGGTAA  100

seq1  CTGGCTCCAAGTGGTCAAGTGGACAACAAACATTTATAAATATGACTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCCAAGTGGTCAAGTGGACAACAAACATTTATAAATATGACTTTT  150

seq1  ATCAAAAAATACCCATAACTGTATATGCATTTTTGAACTATGCTTTAAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAAATACCCATAACTGTATATGCATTTTTGAACTATGCTTTAAGC  200

seq1  CTCTGCATTTCATGCTTTCATCAAGTGACACTCATGCAGTTTCTGAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCATTTCATGCTTTCATCAAGTGACACTCATGCAGTTTCTGAGCAG  250

seq1  GACTTGAAAAAGTACATAAATTGCCATTGTATCTATGCATCAAGTTAGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTGAAAAAGTACATAAATTGCCATTGTATCTATGCATCAAGTTAGGT  300

seq1  TTTAAAAGTTGATATCAAGAGAAGTCCAAGGAAAATAATGTGAGTTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAAAGTTGATATCAAGAGAAGTCCAAGGAAAATAATGTGAGTTTTTA  350

seq1  CATTGTTCTTTGAAAAGTGTGCTAAACCCTCAGTAGGATCACAGCTTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTCTTTGAAAAGTGTGCTAAACCCTCAGTAGGATCACAGCTTTAA  400

seq1  AACTTAAATTTCTTCAAGTTGCCTTAATTCTGGTTGTGAGGTCCAGGAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAAATTTCTTCAAGTTGCCTTAATTCTGGTTGTGAGGTCCAGGAAA  450

seq1  ATTCCCCATTTATTAGAAGTTAAGATGTTTTATATAATACATTGTCACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCCATTTATTAGAAGTTAAGATGTTTTATATAATACATTGTCACAG  500

seq1  TTATGGTTCTGCCAATGCATAGGAAAGCACCATGGAGCAAGACTCCATGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGTTCTGCCAATGCATAGGAAAGCACCATGGAGCAAGACTCCATGG  550

seq1  AGTTATAATGGGTGTAGTCTTAGTAAGATGTTCGCAAAAAAAAAAAAAAA  600
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
seq2  AGTTATAATGGGTGTAGTCTTAGTAAGATGTTCGC----AAAAAAAAAAA  596

seq1  AAAAAAAAATTTAAAGTACCAGCTTATAAGTGTATGAATGTGTTTCAAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAATTTAAAGTACCAGCTTATAAGTGTATGAATGTGTTTCAAAT  646

seq1  GAAGTTCTGAATTCTGAAAGAGATGGAATTTCAGTTGATCTTGTCTTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTCTGAATTCTGAAAGAGATGGAATTTCAGTTGATCTTGTCTTTTC  696

seq1  CACTGTGTTACATCAAGAAAGTTGCTAGCCAAAGTGGTTTCATAAAAATA  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||
seq2  CACTGTGTTACATCAAGAAAGTTGCTAGCCAAGGTGGGTTCAATAAAATA  746

seq1  CCCAAAGAATGCAGACCACTGACAACAAAAGGGGTTGCTTTTAACAAACT  800
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGAATGCAGACCACTGACAAC-AAAGGGGTTGCTTTTAACAAACT  795

seq1  GACAATAAGTCTTCATTGCTAAAGACAGGGCTG-ACACAAAACACTGTAT  849
      |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  GACAATAAGTCTTCATTGCT-AAGACA-GGCTGAACACAAAACACTGTAT  843

seq1  ATGAAAAGGTCAAACT-GGTGCGTGCAAGAACATTGACTCTTATGTTCCA  898
      ||| |||||||  ||| ||||||||||   ||||  ||||||||| ||||
seq2  ATG-AAAGGTC--ACTGGGTGCGTGCA--GACATGAACTCTTATG-TCCA  887

seq1  GT  900
      ||
seq2  GT  889