BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-185O07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 85,991,581 - 86,126,051
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamtsl1, 4930500O09Rik
Upstream geneSh3gl2, A930009N24, LOC668052
Downstream geneRraga, 6230416J20Rik, LOC100040388, Adfp, EG624685, Dennd4c, Rps6, Asah3l, Slc24a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185O07.bB6Ng01-185O07.g
ACCGA010882GA010883
length5931,124
definitionB6Ng01-185O07.b B6Ng01-185O07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,125,454 - 86,126,051)(85,991,581 - 85,992,702)
sequence
tctcccttccattgacagagctgttttctcaagtacctttaaggggaaaa
ctctgcttttcccttgtcctgtttggctaaatgggattcaggaagaagca
gttagtctttggaggaactggtcttatggagaaataagcagtagagactg
ttgcagtgggcaggaatgcccggctcagctgggtatagccggcatgatgg
gcaggtgccacctgggcctgtcacagatgtgcaatgatttgggaagggat
tactttggcgaacagtgttctgtcttttccgtcttactgttttgttcctc
tttcacataatgggggcactgacagtagatagcaaagaagtgaagacttt
gtgcctcgatgacattttttctcttctgggttttctgtaaggctgagtag
aggcgataaatattagtagaagaagtttctgagaacacagagaaaggtga
gtgtatctgagaaacgggtgctaaccgatgccagccccacatgaggggtt
ggatggaagatgggtaggaggttcagtacagaagacccttccttctcagt
gagccccgtggttgacatgtgttataggtaggggtggggaatt

gaattcacatgactcttagatgcacatgtcaacttgtcagacagtagttt
ccaaggtgtcctgaggatattgtgacagcctggttcattgtgctcctcat
tttcttcttcctttatacgtccagccctaccacagcagatcctgtgttag
atactagggatgatgggaaagaacactcatttcctattgatggaactcac
agtctatttaggaaaccaacgggctagatgcagtattggtcatactaaca
gaacaatatatccaactatttatatatgttaactcagtgggaataactgt
gatgactgaaacaggagtacatgcatttagagttctattccaataagaga
tatcagggagggctttgctgatcatgtcatctacaacagatccccctccc
caactgtcatctagccctttaattctagtatttgacttatgggagtctat
ggtgatttgatacatcatatattcacttattaattgatgatgatgtcaca
gcctttctataccactctaattctaatgatcagatggtaactgacaccaa
agagttactaatcataactctaaatagtaggaagaactgcacaggggaaa
gagagcgagaaggaagataaacacagaacagtgaacaaactatgataata
agtgtttgggcacaaaagtaaaataaatgtgatagagaaggccttagtga
ccactctgggaacacactcaaaggtgatgttctgtaagccaaaatccaaa
tgatgatgagtgctcaggatgtgttaccaagagaaagaggctttctggat
aaaaggaaagttatgcaaaaactcagagggaaaatgagtctgtcgtgttg
tagactcattcagctgcagtgggcaatggaatgagatcacgtgactacgt
cccagggaagctttggtgtctaaagatcagagaacctttagaggacgagt
tattcaagacagtaagtggtaccatctattcccaggttttacaaactccc
atgtactatgttgcagcatgccaattgtagcacagcatgaagtggagggc
tagagctggaggggttcattgcaaacagtctatttgaatgtcagttaagt
tcttgccttgaccagtcaaatggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_86125454_86126051
seq2: B6Ng01-185O07.b_41_638 (reverse)

seq1  ATTCCCCACCCCTACCTATAACACATGTCAACCACGGGGCTCACTGAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCCACCCCTACCTATAACACATGTCAACCACGGGGCTCACTGAGAA  50

seq1  GGAAGGGTCTTCTGTACTGAACCTCCTACCCATCTTCCATCCAACCCCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGGTCTTCTGTACTGAACCTCCTACCCATCTTCCATCCAACCCCTC  100

seq1  ATGTGGGGCTGGCATCGGTTAGCACCCGTTTCTCAGATACACTCACCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGGGCTGGCATCGGTTAGCACCCGTTTCTCAGATACACTCACCTTT  150

seq1  CTCTGTGTTCTCAGAAACTTCTTCTACTAATATTTATCGCCTCTACTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGTTCTCAGAAACTTCTTCTACTAATATTTATCGCCTCTACTCAG  200

seq1  CCTTACAGAAAACCCAGAAGAGAAAAAATGTCATCGAGGCACAAAGTCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAGAAAACCCAGAAGAGAAAAAATGTCATCGAGGCACAAAGTCTT  250

seq1  CACTTCTTTGCTATCTACTGTCAGTGCCCCCATTATGTGAAAGAGGAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTTTGCTATCTACTGTCAGTGCCCCCATTATGTGAAAGAGGAACA  300

seq1  AAACAGTAAGACGGAAAAGACAGAACACTGTTCGCCAAAGTAATCCCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGTAAGACGGAAAAGACAGAACACTGTTCGCCAAAGTAATCCCTTC  350

seq1  CCAAATCATTGCACATCTGTGACAGGCCCAGGTGGCACCTGCCCATCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATCATTGCACATCTGTGACAGGCCCAGGTGGCACCTGCCCATCATG  400

seq1  CCGGCTATACCCAGCTGAGCCGGGCATTCCTGCCCACTGCAACAGTCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCTATACCCAGCTGAGCCGGGCATTCCTGCCCACTGCAACAGTCTCT  450

seq1  ACTGCTTATTTCTCCATAAGACCAGTTCCTCCAAAGACTAACTGCTTCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTATTTCTCCATAAGACCAGTTCCTCCAAAGACTAACTGCTTCTT  500

seq1  CCTGAATCCCATTTAGCCAAACAGGACAAGGGAAAAGCAGAGTTTTCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAATCCCATTTAGCCAAACAGGACAAGGGAAAAGCAGAGTTTTCCCC  550

seq1  TTAAAGGTACTTGAGAAAACAGCTCTGTCAATGGAAGGGAGAGAATTC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGTACTTGAGAAAACAGCTCTGTCAATGGAAGGGAGAGAATTC  598


seq1: chr4_85991581_85992702
seq2: B6Ng01-185O07.g_69_1192

seq1  GAATTCACATGACTCTTAGATGCACATGTCAACTTGTCAGACAGTAGTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATGACTCTTAGATGCACATGTCAACTTGTCAGACAGTAGTTT  50

seq1  CCAAGGTGTCCTGAGGATATTGTGACAGCCTGGTTCATTGTGCTCCTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTGTCCTGAGGATATTGTGACAGCCTGGTTCATTGTGCTCCTCAT  100

seq1  TTTCTTCTTCCTTTATACGTCCAGCCCTACCACAGCAGATCCTGTGTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTTCCTTTATACGTCCAGCCCTACCACAGCAGATCCTGTGTTAG  150

seq1  ATACTAGGGATGATGGGAAAGAACACTCATTTCCTATTGATGGAACTCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTAGGGATGATGGGAAAGAACACTCATTTCCTATTGATGGAACTCAC  200

seq1  AGTCTATTTAGGAAACCAACGGGCTAGATGCAGTATTGGTCATACTAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTATTTAGGAAACCAACGGGCTAGATGCAGTATTGGTCATACTAACA  250

seq1  GAACAATATATCCAACTATTTATATATGTTAACTCAGTGGGAATAACTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAATATATCCAACTATTTATATATGTTAACTCAGTGGGAATAACTGT  300

seq1  GATGACTGAAACAGGAGTACATGCATTTAGAGTTCTATTCCAATAAGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGACTGAAACAGGAGTACATGCATTTAGAGTTCTATTCCAATAAGAGA  350

seq1  TATCAGGGAGGGCTTTGCTGATCATGTCATCTACAACAGATCCCCCTCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGGGAGGGCTTTGCTGATCATGTCATCTACAACAGATCCCCCTCCC  400

seq1  CAACTGTCATCTAGCCCTTTAATTCTAGTATTTGACTTATGGGAGTCTAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGTCATCTAGCCCTTTAATTCTAGTATTTGACTTATGGGAGTCTAT  450

seq1  GGTGATTTGATACATCATATATTCACTTATTAATTGATGATGATGTCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTTGATACATCATATATTCACTTATTAATTGATGATGATGTCACA  500

seq1  GCCTTTCTATACCACTCTAATTCTAATGATCAGATGGTAACTGACACCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTCTATACCACTCTAATTCTAATGATCAGATGGTAACTGACACCAA  550

seq1  AGAGTTACTAATCATAACTCTAAATAGTAGGAAGAACTGCACAGGGGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTACTAATCATAACTCTAAATAGTAGGAAGAACTGCACAGGGGAAA  600

seq1  GAGAGCGAGAAGGAAGATAAACACAGAACAGTGAACAAACTATGATAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGCGAGAAGGAAGATAAACACAGAACAGTGAACAAACTATGATAATA  650

seq1  AGTGTTTGGGCACAAAAGTAAAATAAATGTGATAGAGAAGGCCTTAGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTGGGCACAAAAGTAAAATAAATGTGATAGAGAAGGCCTTAGTGA  700

seq1  CCACTCTGGGAACACACTCAAAGGTGATGTTCTGTAAGCCAAAATCCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTGGGAACACACTCAAAGGTGATGTTCTGTAAGCCAAAATCCAAA  750

seq1  TGATGATGAGTGCTCAGGATGTGTTACCAAGAGAAAGAGGCTTTCTGGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATGAGTGCTCAGGATGTGTTACCAAGAGAAAGAGGCTTTCTGGAT  800

seq1  AAAAGGAAAGTTATGCAAAAACTCAGAGGGAAAATGAGTCTGTCGTGTTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAAAGTTATGCAAAAACTCAGAGGGAAAATGAGTCTGTCGTGTTG  850

seq1  TAGACTCATTCAGCTGCAGTGGGCAATGGAATGAGATCACGTGACTACGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTCATTCAGCTGCAGTGGGCAATGGAATGAGATCACGTGACTACGT  900

seq1  CCCAGGGAAGCTTTGGTGTCTAAGGATCAGGAGAACCTTTAGAGGACGAG  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGGAAGCTTTGGTGTCTAAAGATCA-GAGAACCTTTAGAGGACGAG  949

seq1  TTA-TCAAGACAGTAAGTGGTACCATCTAATTCCCA-GTTTTACAAACTC  998
      ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  TTATTCAAGACAGTAAGTGGTACCATCT-ATTCCCAGGTTTTACAAACTC  998

seq1  CCATGTACTATGTTGCAGCATGGCAATTGTAGCACAGCATG-AGTGGAGG  1047
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCATGTACTATGTTGCAGCATGCCAATTGTAGCACAGCATGAAGTGGAGG  1048

seq1  GCTAGGAGCCTGGGAAGGGGTCCATTGC-AACAGTC-ATTTGAATGTCAG  1095
      |||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||
seq2  GCTA-GAG-CTGG--AGGGGTTCATTGCAAACAGTCTATTTGAATGTCAG  1094

seq1  -TAAGTCCCTGC--TGGGCAGTCAAATGGC  1122
       ||||| | |||  ||  ||||||||||||
seq2  TTAAGTTCTTGCCTTGACCAGTCAAATGGC  1124


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |