BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-189M23
Chromosome4 (Build37)
Map Location 73,720,029 - 73,820,318
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFrmd3
Upstream geneOTTMUSG00000001246, LOC100039726, LOC667722, LOC623115, OTTMUSG00000000281, OTTMUSG00000000280, OTTMUSG00000000282, OTTMUSG00000000283, Gm428, Rasef, LOC667768, LOC545637, LOC623272, OTTMUSG00000014862, OTTMUSG00000004010, 2310002L09Rik
Downstream geneLOC100039774, Jmjd2c, LOC100040258, LOC100039814, LOC636847
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-189M23.bB6Ng01-189M23.g
ACCGA013732GA013733
length1,144882
definitionB6Ng01-189M23.b B6Ng01-189M23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,819,191 - 73,820,318)(73,720,029 - 73,720,900)
sequence
gaattctgtccttacagaggtaagagatggccaaaaggtctttcttctta
actctgttcccttaaatgagcaccccactttggaaactatatgaggatga
gcatctacatccagactctaggacactgatagacagacagggaaagctac
catagctcgatactaaatatggcgaatgtccagcatcttcctcaacacct
agatgtgagccaaaaacctgaagggctttttcttcagctagcaggattct
tccttttccagatgatgagtccaggctgctcagatatattcaaggcaggt
cctgaacatgtttaacagaagctgtgggcccattagctgtccagtgttta
agtgaccaatctaaactgggaagggggacctgacctataccaccataaac
gtgtattcttgacactattgacctaccagttttcctttctttgtttatgc
agataaacccataataaatggaaataagatccatctcaggctgctaaaac
cacttataaccctctgccttccatgtaaaaaagtgatttttggattactc
tctcatctgtaatgtatggtctctacataccgaccccatgtgtggtgtgt
gtgtgctttttaaattatcacaaatattgttatctgttgttgcttgctgt
gtctgagattcctcttgccttttacttctttaattggcttaggaaatgaa
tcagattaagacctcctagatggaaacaaggacattatcaaacacaggag
aaacatgtgtacctcagatgatccaactaaactgactagttcattttgtc
ctcatgtccatccatttatactcatagatcagtgtgttgctcaatcctca
tcatagaagtttctccttgaggtagacgataattactatgactcacaact
ggacaatgaaacggagtgagggacttttggagcacccagtcctaaatagg
atgtctttatcaacaactccccttgagactcagggatctattatggaaaa
aaagttagaaagaatgttaagaggtagaaaatgaatgacctccaaggaaa
cacttatcctcccaggcacaccagggacctcattacaccagatgaactcc
acagaatttattgagaagtaagcataggaccctgtgtgtggttt
ctatgtggacccagagaagcaaagggtaagaacacatcttgatcttcaac
ctatgggcttaagagaaggcctggaatgctgggtactatgggatcctttc
cagaaaccttatggtgcctttattctaacagattgttgacctgagaaata
aagcaactggtgggtgtttaactggaaggagtgggaacacgaaaaagtct
ttctcggaatgctgggctcacatgaagaaaagtgggaattgccccatgct
ctttgaatttagatttctcagagtagttgcatagaatccaattataaaga
aacacaaccaccatattaagaacctactggcagaggtaggggataaactt
ggtagaagttgggtgtttttatggtgtgatgaaaatatttagagtctggc
atagatgaggcttattcaacacaatcaattgtaaatattttgtggatcaa
tatcaagtaatatgaaatgtacttttaaaatattagagtctctttacttt
ttaaatcaatttgtacattacaagtgttgttttgcagtcacttgctactg
tattataggagaaggttaactactggatagaaaatattgcaggaaatagt
aaacaacccacaaaacattggttcatttcatgttatttggaagaaacttt
ttgggaagatggtgaatctctcttttggaagcaggcaagagaagattgga
tggtttcctatcagcaatacatgagttttatggggggtcactcagaaacc
acaaagtgctttcccgttcacacccagcagcattgcccaaatagcaagct
tagctgtcatgaactggttatggaatgacaatagcaacccaaagacaatg
aaacggagcgtgtgttggatggtaatgcgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_73819191_73820318
seq2: B6Ng01-189M23.b_45_1188 (reverse)

seq1  AAACCACACA---GGTCCTATGCTTAC-TCTC-ATAATTTCTGT-GAGTT  44
      ||||||||||   |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||
seq2  AAACCACACACAGGGTCCTATGCTTACTTCTCAATAAATTCTGTGGAGTT  50

seq1  CATCT-GTGT-ATGAG--TCCTGTTGTGCCT-GGAGGAT-AGTGTTTCCT  88
      ||||| |||| |||||   |||| ||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  CATCTGGTGTAATGAGGTCCCTGGTGTGCCTGGGAGGATAAGTGTTTCCT  100

seq1  TGGA-GTCATTCA-TTTCTACCTCTT-ACAATCTTTCTAACTTTTTTTCC  135
      |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGTCATTCATTTTCTACCTCTTAACATTCTTTCTAACTTTTTTTCC  150

seq1  AT-ATAGATCCCTGAGTCTCAAGGGGAGTTGTTTGATAAAGACATCCTAT  184
      || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATAATAGATCCCTGAGTCTCAAGGGGAGTTG-TTGATAAAGACATCCTAT  199

seq1  TTAGGACTGGGTGCTCC-AAAGTCCCTCACTCCGTTTCATTGTCCAGTTG  233
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGACTGGGTGCTCCAAAAGTCCCTCACTCCGTTTCATTGTCCAGTTG  249

seq1  TGAGTCATAGTAATTATCGTCTACCTCAAGGAGAAACTTCTATGATGAGG  283
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCATAGTAATTATCGTCTACCTCAAGGAGAAACTTCTATGATGAGG  299

seq1  ATTGAGCAACACACTGATCTATGAGTATAAATGGATGGACATGAGGACAA  333
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGCAACACACTGATCTATGAGTATAAATGGATGGACATGAGGACAA  349

seq1  AATGAACTAGTCAGTTTAGTTGGATCATCTGAGGTACACATGTTTCTCCT  383
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACTAGTCAGTTTAGTTGGATCATCTGAGGTACACATGTTTCTCCT  399

seq1  GTGTTTGATAATGTCCTTGTTTCCATCTAGGAGGTCTTAATCTGATTCAT  433
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGATAATGTCCTTGTTTCCATCTAGGAGGTCTTAATCTGATTCAT  449

seq1  TTCCTAAGCCAATTAAAGAAGTAAAAGGCAAGAGGAATCTCAGACACAGC  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAAGCCAATTAAAGAAGTAAAAGGCAAGAGGAATCTCAGACACAGC  499

seq1  AAGCAACAACAGATAACAATATTTGTGATAATTTAAAAAGCACACACACA  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAACAACAGATAACAATATTTGTGATAATTTAAAAAGCACACACACA  549

seq1  CCACACATGGGGTCGGTATGTAGAGACCATACATTACAGATGAGAGAGTA  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACATGGGGTCGGTATGTAGAGACCATACATTACAGATGAGAGAGTA  599

seq1  ATCCAAAAATCACTTTTTTACATGGAAGGCAGAGGGTTATAAGTGGTTTT  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAAAATCACTTTTTTACATGGAAGGCAGAGGGTTATAAGTGGTTTT  649

seq1  AGCAGCCTGAGATGGATCTTATTTCCATTTATTATGGGTTTATCTGCATA  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCTGAGATGGATCTTATTTCCATTTATTATGGGTTTATCTGCATA  699

seq1  AACAAAGAAAGGAAAACTGGTAGGTCAATAGTGTCAAGAATACACGTTTA  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGAAAGGAAAACTGGTAGGTCAATAGTGTCAAGAATACACGTTTA  749

seq1  TGGTGGTATAGGTCAGGTCCCCCTTCCCAGTTTAGATTGGTCACTTAAAC  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTATAGGTCAGGTCCCCCTTCCCAGTTTAGATTGGTCACTTAAAC  799

seq1  ACTGGACAGCTAATGGGCCCACAGCTTCTGTTAAACATGTTCAGGACCTG  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGACAGCTAATGGGCCCACAGCTTCTGTTAAACATGTTCAGGACCTG  849

seq1  CCTTGAATATATCTGAGCAGCCTGGACTCATCATCTGGAAAAGGAAGAAT  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAATATATCTGAGCAGCCTGGACTCATCATCTGGAAAAGGAAGAAT  899

seq1  CCTGCTAGCTGAAGAAAAAGCCCTTCAGGTTTTTGGCTCACATCTAGGTG  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTAGCTGAAGAAAAAGCCCTTCAGGTTTTTGGCTCACATCTAGGTG  949

seq1  TTGAGGAAGATGCTGGACATTCGCCATATTTAGTATCGAGCTATGGTAGC  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGAAGATGCTGGACATTCGCCATATTTAGTATCGAGCTATGGTAGC  999

seq1  TTTCCCTGTCTGTCTATCAGTGTCCTAGAGTCTGGATGTAGATGCTCATC  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTGTCTGTCTATCAGTGTCCTAGAGTCTGGATGTAGATGCTCATC  1049

seq1  CTCATATAGTTTCCAAAGTGGGGTGCTCATTTAAGGGAACAGAGTTAAGA  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATATAGTTTCCAAAGTGGGGTGCTCATTTAAGGGAACAGAGTTAAGA  1099

seq1  AGAAAGACCTTTTGGCCATCTCTTACCTCTGTAAGGACAGAATTC  1128
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGACCTTTTGGCCATCTCTTACCTCTGTAAGGACAGAATTC  1144

seq1: chr4_73720029_73720900
seq2: B6Ng01-189M23.g_70_951

seq1  CTATGTGGACCCAGAGAAGCAAAGGGTAAGAACACATCTTGATCTTCAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTGGACCCAGAGAAGCAAAGGGTAAGAACACATCTTGATCTTCAAC  50

seq1  CTATGGGCTTAAGAGAAGGCCTGGAATGCTGGGTACTATGGGATCCTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGGCTTAAGAGAAGGCCTGGAATGCTGGGTACTATGGGATCCTTTC  100

seq1  CAGAAACCTTATGGTGCCTTTATTCTAACAGATTGTTGACCTGAGAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAACCTTATGGTGCCTTTATTCTAACAGATTGTTGACCTGAGAAATA  150

seq1  AAGCAACTGGTGGGTGTTTAACTGGAAGGAGTGGGAACACGAAAAAGTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAACTGGTGGGTGTTTAACTGGAAGGAGTGGGAACACGAAAAAGTCT  200

seq1  TTCTCGGAATGCTGGGCTCACATGAAGAAAAGTGGGAATTGCCCCATGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCGGAATGCTGGGCTCACATGAAGAAAAGTGGGAATTGCCCCATGCT  250

seq1  CTTTGAATTTAGATTTCTCAGAGTAGTTGCATAGAATCCAATTATAAAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAATTTAGATTTCTCAGAGTAGTTGCATAGAATCCAATTATAAAGA  300

seq1  AACACAACCACCATATTAAGAACCTACTGGCAGAGGTAGGGGATAAACTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAACCACCATATTAAGAACCTACTGGCAGAGGTAGGGGATAAACTT  350

seq1  GGTAGAAGTTGGGTGTTTTTATGGTGTGATGAAAATATTTAGAGTCTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAAGTTGGGTGTTTTTATGGTGTGATGAAAATATTTAGAGTCTGGC  400

seq1  ATAGATGAGGCTTATTCAACACAATCAATTGTAAATATTTTGTGGATCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATGAGGCTTATTCAACACAATCAATTGTAAATATTTTGTGGATCAA  450

seq1  TATCAAGTAATATGAAATGTACTTTTAAAATATTAGAGTCTCTTTACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAGTAATATGAAATGTACTTTTAAAATATTAGAGTCTCTTTACTTT  500

seq1  TTAAATCAATTTGTACATTACAAGTGTTGTTTTGCAGTCACTTGCTACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCAATTTGTACATTACAAGTGTTGTTTTGCAGTCACTTGCTACTG  550

seq1  TATTATAGGAGAAGGTTAACTACTGGATAGAAAATATTGCAGGAAATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAGGAGAAGGTTAACTACTGGATAGAAAATATTGCAGGAAATAGT  600

seq1  AAACAACCCACAAAACATTGGTTCATTTCATGTTATTTGGAAGAAAC-TT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AAACAACCCACAAAACATTGGTTCATTTCATGTTATTTGGAAGAAACTTT  650

seq1  TTGGGAAGATGGTGAATCTCTC-TTTGGAAGCAGGCAAGAGAAGATTGGA  698
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGAAGATGGTGAATCTCTCTTTTGGAAGCAGGCAAGAGAAGATTGGA  700

seq1  TGG-TTCCTATCAGCAATACATGAG-TTTAT-GGGGGTCAC-CAGAAACC  744
      ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||
seq2  TGGTTTCCTATCAGCAATACATGAGTTTTATGGGGGGTCACTCAGAAACC  750

seq1  ACAAAGTGCTT--CCGTTCACACCCAGCAGCATTGCCCAAATAGCAAGCT  792
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGTGCTTTCCCGTTCACACCCAGCAGCATTGCCCAAATAGCAAGCT  800

seq1  TAGCTGTCATGAACTGGTTATGG-ATGACAAATAGCAA-CCAAAGACAAT  840
      ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||
seq2  TAGCTGTCATGAACTGGTTATGGAATGAC-AATAGCAACCCAAAGACAAT  849

seq1  GAAACGGAGCGTGGGTTGGATGGT-ATGCGTGT  872
      ||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  GAAACGGAGCGTGTGTTGGATGGTAATGCGTGT  882