BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-203G07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 75,235,904 - 75,388,096
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039814, LOC636847, 3110001D03Rik, LOC623529, LOC100039833
Downstream geneLOC100039884, LOC667845, Ptprd, LOC667858
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-203G07.bB6Ng01-203G07.g
ACCGA023621GA023622
length1,1991,180
definitionB6Ng01-203G07.b B6Ng01-203G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,386,895 - 75,388,096)(75,235,904 - 75,237,097)
sequence
gaattcttaaaggcttctttaaagctgtaggttagagacgacttaaattt
tcagacataggaaaaacatgttgactggattcaccagaagtaacggttta
gcacatttttaaaatcttgaaacatgtatactaacttttgttaaattttt
tgttactgttcagacacatgacttgctttctattcttctatggtgacttt
atgaatggatttgacatatgactgtattgccaacaagacttagcatacct
catttttaaaaagagcactgtgggacttattcatcaacttagtactccca
acccccttaaatcatagaaattctagagtgagtatttattagcttgttca
ttctgcacatcaattaccttaggccctatatgctgcaactccatcaaaag
cattaaatagctcccagtggcaaattcctggttatctttagctcatgctg
ttaagtaagtttccatagtctttataactccagctttcattgtatttttt
aaatgacttggtttcagctgttaaagctcacaaagttgacttaaagtgaa
aatacttgccagaatgtgagtataaaatttgactttccaggtgtaccaag
gccaggggtttggggcaggtctgctacatttgagagtttcctcacagctg
ttagcatggatttctgaccttattatgctccatctatatttttaatgaat
tgattgggccatgtaactcactgggattttacctcttacctagactgcct
cagtgttcatcatttggaatttttacttccagagaagcctcctgatgatt
atgagtttgatagtttctgaattgtgagacttaaggcgaatcccttctca
ttgccctgtgtcctccaccttcttcaggttctctcatccttgtctgttcc
tttctgaattcttaacgtgccatgtcgatgtttatgtttaacctgaacat
tgttatagaagacttgctcgttcttccactgattgccccttttagaagaa
agttagtgctttagaaaaggcaccaaagccacatgtggttagaggggcaa
gatgttttattttaatttcagcctaaaatttaggtgtcacatttattcta
taaatatcctgcatattgttgcattgtccagttgaaatctcctcctcgtt
ttagaaaatgagggagtacattcttgatctacttgcaaggtgcatgctt

gaattcagttccagttaattcaagcaagtttttggcacccttgaatcctc
atcgttctcaagtgtacagaaggagttctttaaataactcttgaaaatgg
caaagtggagcttcagatttcaaaacatttcagtgtgaagcagcccaaaa
gagcagcatcagaactgtcatcttcagcagcccatcaagtgctggatact
gcacagagtcagagtacagagaattaaacccgtgtccactgcccttttaa
tttgtggagtaagaaatttataaatttctgtaaatttctaaaatgaaatc
ctgaagatagtatcttctatatagaatgagataataaatgatgtctcaag
ataaccaatgatgtgaattaacatcaatgttgactacctaccggaaagta
acagtattagatttacatttaataatggagggtggaatatggctaaagac
ccatagtattctcacagtggacctatgttttgtttctagcacacccatga
gatgtctcacaactgccagtaactccagctccagcggatccgatgccttt
ttctgggttcctaaggtacctatactaaggtgtacataatttaaaaaaga
aaactgcatagttatgttcaataaggttttttatttacatttttgatcat
ttactccaatagtatgctaacaaattaaaagaaataaatatgaaaaatga
gctcagagatttaaatgttaattgcagaaactgttctgatcaagagaaat
attgattatacattgtccctggatgatctattcccagactatgtgagcat
tgtgatttcaaaatacactgggttaggtgggtagtctagaaaggttcaag
gttattctgtctatgaacgaagaactatacaggaaaaaagatagtaacaa
agaaaattgagagaatttatccagggatccatcccataatcagccttcaa
atgctgacaccattgcgttcactagcagattttgctgaaagaacccagat
atagctgtctctgtgagaactatgctgatgcctagcaaacacagaagtga
tgctcacaagtcagctattgatgatcacaggtctcatggagagctaaaga
attacccaagaaaaataagggtctgcagctcataagtgtgaacacatatt
gactaccagtaccccaaagctcgtggctct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_75386895_75388096
seq2: B6Ng01-203G07.b_44_1242 (reverse)

seq1  AAGCATGCAACATTTTACAAAGTAGATCATG-ATGTACTTCCTCATTTTT  49
      ||||||||| |   || | |||||||||| | ||||||| ||||||||| 
seq2  AAGCATGCACC---TTGC-AAGTAGATCAAGAATGTACTCCCTCATTTTC  46

seq1  TCCTAAAAACGAGGA-GAAATCAAAACT-GACAATTGCAACAATATTGCA  97
      |    |||||||||| || ||   |||| ||||| |||||||||| ||||
seq2  T----AAAACGAGGAGGAGATTTCAACTGGACAA-TGCAACAATA-TGCA  90

seq1  AGATA-TTATAG-ATACATGTGACACCTTAAAATTTAGGCTGAATTTAAA  145
       |||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||
seq2  GGATATTTATAGAATAAATGTGACACC-TAAATTTTAGGCTGAAATTAAA  139

seq1  --TAAACATCCTTGCCCCTCTAA-CACATGT-GCTTTGGTGCCTTTTTCT  191
         |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  ATAAAACAT-CTTGCCCCTCTAACCACATGTGGCTTTGGTGCC-TTTTCT  187

seq1  AAAGCACTAACTTTC-TCTAAAAGGGGCAATCAGTGGAAGAACGAGCAAG  240
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCACTAACTTTCTTCTAAAAGGGGCAATCAGTGGAAGAACGAGCAAG  237

seq1  TCTTCTATAACAATGTTCAGGTTAAACATAAACATCGACATGGCACGTTA  290
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTATAACAATGTTCAGGTTAAACATAAACATCGACATGGCACGTTA  287

seq1  AGAATTCAGAAAGGAACAGACAAGGATGAGAGAACCTGAAGAAGGTGGAG  340
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTCAGAAAGGAACAGACAAGGATGAGAGAACCTGAAGAAGGTGGAG  337

seq1  GACACAGGGCAATGAGAAGGGATTCGCCTTAAGTCTCACAATTCAGAAAC  390
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAGGGCAATGAGAAGGGATTCGCCTTAAGTCTCACAATTCAGAAAC  387

seq1  TATCAAACTCATAATCATCAGGAGGCTTCTCTGGAAGTAAAAATTCCAAA  440
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAACTCATAATCATCAGGAGGCTTCTCTGGAAGTAAAAATTCCAAA  437

seq1  TGATGAACACTGAGGCAGTCTAGGTAAGAGGTAAAATCCCAGTGAGTTAC  490
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAACACTGAGGCAGTCTAGGTAAGAGGTAAAATCCCAGTGAGTTAC  487

seq1  ATGGCCCAATCAATTCATTAAAAATATAGATGGAGCATAATAAGGTCAGA  540
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCCAATCAATTCATTAAAAATATAGATGGAGCATAATAAGGTCAGA  537

seq1  AATCCATGCTAACAGCTGTGAGGAAACTCTCAAATGTAGCAGACCTGCCC  590
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATGCTAACAGCTGTGAGGAAACTCTCAAATGTAGCAGACCTGCCC  587

seq1  CAAACCCCTGGCCTTGGTACACCTGGAAAGTCAAATTTTATACTCACATT  640
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACCCCTGGCCTTGGTACACCTGGAAAGTCAAATTTTATACTCACATT  637

seq1  CTGGCAAGTATTTTCACTTTAAGTCAACTTTGTGAGCTTTAACAGCTGAA  690
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAAGTATTTTCACTTTAAGTCAACTTTGTGAGCTTTAACAGCTGAA  687

seq1  ACCAAGTCATTTAAAAAATACAATGAAAGCTGGAGTTATAAAGACTATGG  740
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGTCATTTAAAAAATACAATGAAAGCTGGAGTTATAAAGACTATGG  737

seq1  AAACTTACTTAACAGCATGAGCTAAAGATAACCAGGAATTTGCCACTGGG  790
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTACTTAACAGCATGAGCTAAAGATAACCAGGAATTTGCCACTGGG  787

seq1  AGCTATTTAATGCTTTTGATGGAGTTGCAGCATATAGGGCCTAAGGTAAT  840
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTTAATGCTTTTGATGGAGTTGCAGCATATAGGGCCTAAGGTAAT  837

seq1  TGATGTGCAGAATGAACAAGCTAATAAATACTCACTCTAGAATTTCTATG  890
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGCAGAATGAACAAGCTAATAAATACTCACTCTAGAATTTCTATG  887

seq1  ATTTAAGGGGGTTGGGAGTACTAAGTTGATGAATAAGTCCCACAGTGCTC  940
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGGGGTTGGGAGTACTAAGTTGATGAATAAGTCCCACAGTGCTC  937

seq1  TTTTTAAAAATGAGGTATGCTAAGTCTTGTTGGCAATACAGTCATATGTC  990
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAATGAGGTATGCTAAGTCTTGTTGGCAATACAGTCATATGTC  987

seq1  AAATCCATTCATAAAGTCACCATAGAAGAATAGAAAGCAAGTCATGTGTC  1040
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCATTCATAAAGTCACCATAGAAGAATAGAAAGCAAGTCATGTGTC  1037

seq1  TGAACAGTAACAAAAAATTTAACAAAAGTTAGTATACATGTTTCAAGATT  1090
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAGTAACAAAAAATTTAACAAAAGTTAGTATACATGTTTCAAGATT  1087

seq1  TTAAAAATGTGCTAAACCGTTACTTCTGGTGAATCCAGTCAACATGTTTT  1140
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAATGTGCTAAACCGTTACTTCTGGTGAATCCAGTCAACATGTTTT  1137

seq1  TCCTATGTCTGAAAATTTAAGTCGTCTCTAACCTACAGCTTTAAAGAAGC  1190
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGTCTGAAAATTTAAGTCGTCTCTAACCTACAGCTTTAAAGAAGC  1187

seq1  CTTTAAGAATTC  1202
      ||||||||||||
seq2  CTTTAAGAATTC  1199


seq1: chr4_75235904_75237097
seq2: B6Ng01-203G07.g_63_1242

seq1  GAATTCAGTTCCAGTTAATTCAAGCAAGTTTTTGGCACCCTTGAATCCTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTCCAGTTAATTCAAGCAAGTTTTTGGCACCCTTGAATCCTC  50

seq1  ATCGTTCTCAAGTGTACAGAAGGAGTTCTTTAAATAACTCTTGAAAATGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTTCTCAAGTGTACAGAAGGAGTTCTTTAAATAACTCTTGAAAATGG  100

seq1  CAAAGTGGAGCTTCAGATTTCAAAACATTTCAGTGTGAAGCAGCCCAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTGGAGCTTCAGATTTCAAAACATTTCAGTGTGAAGCAGCCCAAAA  150

seq1  GAGCAGCATCAGAACTGTCATCTTCAGCAGCCCATCAAGTGCTGGATACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCATCAGAACTGTCATCTTCAGCAGCCCATCAAGTGCTGGATACT  200

seq1  GCACAGAGTCAGAGTACAGAGAATTAAACCCGTGTCCACTGCCCTTTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGAGTCAGAGTACAGAGAATTAAACCCGTGTCCACTGCCCTTTTAA  250

seq1  TTTGTGGAGTAAGAAATTTATAAATTTCTGTAAATTTCTAAAATGAAATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGGAGTAAGAAATTTATAAATTTCTGTAAATTTCTAAAATGAAATC  300

seq1  CTGAAGATAGTATCTTCTATATAGAATGAGATAATAAATGATGTCTCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGATAGTATCTTCTATATAGAATGAGATAATAAATGATGTCTCAAG  350

seq1  ATAACCAATGATGTGAATTAACATCAATGTTGACTACCTACCGGAAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCAATGATGTGAATTAACATCAATGTTGACTACCTACCGGAAAGTA  400

seq1  ACAGTATTAGATTTACATTTAATAATGGAGGGTGGAATATGGCTAAAGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTATTAGATTTACATTTAATAATGGAGGGTGGAATATGGCTAAAGAC  450

seq1  CCATAGTATTCTCACAGTGGACCTATGTTTTGTTTCTAGCACACCCATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGTATTCTCACAGTGGACCTATGTTTTGTTTCTAGCACACCCATGA  500

seq1  GATGTCTCACAACTGCCAGTAACTCCAGCTCCAGCGGATCCGATGCCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCTCACAACTGCCAGTAACTCCAGCTCCAGCGGATCCGATGCCTTT  550

seq1  TTCTGGGTTCCTAAGGTACCTATACTAAGGTGTACATAATTTAAAAAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGTTCCTAAGGTACCTATACTAAGGTGTACATAATTTAAAAAAGA  600

seq1  AAACTGCATAGTTATGTTCAATAAGGTTTTTTATTTACATTTTTGATCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGCATAGTTATGTTCAATAAGGTTTTTTATTTACATTTTTGATCAT  650

seq1  TTACTCCAATAGTATGCTAACAAATTAAAAGAAATAAATATGAAAAATGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCCAATAGTATGCTAACAAATTAAAAGAAATAAATATGAAAAATGA  700

seq1  GCTCAGAGATTTAAATGTTAATTGCAGAAACTGTTCTGATCAAGAGAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGAGATTTAAATGTTAATTGCAGAAACTGTTCTGATCAAGAGAAAT  750

seq1  ATTGATTATACATTGTCCCTGGATGATCTATTCCCAGACTATGTGAGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTATACATTGTCCCTGGATGATCTATTCCCAGACTATGTGAGCAT  800

seq1  TGTGATTTCAAAATACACTGGGTTAGGTGGGTAGTCTAGAAAGGTTCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATTTCAAAATACACTGGGTTAGGTGGGTAGTCTAGAAAGGTTCAAG  850

seq1  GTTATTCTGTCTATGAACGAAGAACTATACAGGAAAAAAGATAGTAACAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTCTGTCTATGAACGAAGAACTATACAGGAAAAAAGATAGTAACAA  900

seq1  AGAAAATTGAGAGAATTTATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCCTCCAA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AGAAAATTGAGAGAATTTATCCAGGGATCCATCCCATAATCAGCCTTCAA  950

seq1  ATGCTGACACCATTGCGTTCACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGAACCCAGA  1000
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGACACCATTGCGTTCACTAGC-AGATTTTGCTGAAAGAACCCAGA  999

seq1  TATAGCTGTCTCTTGTGAG-ACTATGCTGATGCCTAGCAAACACAGAAGT  1049
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCTGTCTC-TGTGAGAACTATGCTGATGCCTAGCAAACACAGAAGT  1048

seq1  GGATGCTCAC-AGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCTCAATGGAGG  1098
       ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | |   ||||| |
seq2  -GATGCTCACAAGTCAGCTATT-GAT-GATCACAGGTCTC---ATGGA-G  1091

seq1  AGCTAGAGAATATACCCAAGAAAATAAAGGGGTCTGCAGCTCTATAGGTG  1148
      ||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |||
seq2  AGCTAAAGAAT-TACCCAAGAAAA-ATAAGGGTCTGCAGCTC-ATAAGTG  1138

seq1  -GAACAACAATATGAACTACCCAGTACCCCCCAGAGCTCGTGGCTCT  1194
       |||||   ||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||
seq2  TGAACA--CATATTGACTA-CCAGTA--CCCCAAAGCTCGTGGCTCT  1180


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |