BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210B13
Chromosome4 (Build37)
Map Location 149,620,003 - 149,759,729
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEno1, LOC666880, LOC384091
Upstream geneKif1b, LOC100041794, Ube4b, Rbp7, LOC627985, Nmnat1, Lzic, Ctnnbip1, Clstn1, Pik3cd, D4Ertd429e, Slc25a33, Spsb1, H6pd, Gpr157, Slc2a5, LOC435818, Car6, LOC100041882
Downstream geneRere, Slc45a1, LOC677027, Errfi1, Park7, Tnfrsf9, Uts2, Per3, Vamp3, Camta1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210B13.bB6Ng01-210B13.g
ACCGA028528GA028529
length952385
definitionB6Ng01-210B13.b B6Ng01-210B13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,620,003 - 149,620,947)(149,759,340 - 149,759,729)
sequence
gaattcccctagctggtggggtctttggcaggaagcaggaggcaacttaa
cttgaggtggcccttgccgaggtttcccttctgggtccctgcctgcgttc
tatttaaagccagtcctcaggacagctgatctcagctcagctggtcactg
taattgtatcttggctagcacagctgccctggcactaaatttggtgggac
cattgaccacaagaaaggctgtgttaaacttgatatggctttggcactta
gtggccccagtgtccctcatcagtggctttgacttacagtaggaatagga
accccccaggcagggcctggagagatggctcagatggttaaagaggactg
actgctcttctgaaggtcctgatttcaaatcccagcaaccacatggtggc
tcttaaccatccctaatgaaatctgataccctcatctcgggtgtctgaag
acagctacagtgcttacgtatgattgatagattgatagatagattgatag
atagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagat
aaaatatttttttaaaaaaatgagccccaaggcggcaggacagagtgcag
tctgctctgggacagtctcggcagctgtcacagtggagcctgacttctgt
tacccaccttggcctcatctctccagcactggagctgctcaagactgcaa
ttcgcaaaggccggctacactgaccaggttgtcattggcatggatgtggg
ctgcctccgagttctacaggtctggcaagtatgacctgggacttcaagtc
tccggatgaccccagcaggtacatcactcccgaccagctggctgatctgt
acagtccttcgtccagaactactcaggtgggtatctgaggcagttctgtg
gctccctagggcagcttctgggccacgggggcttcaccaccagccccttc
tg
aagttatgtgattattatgttagactcctgctgggcaggggcaacctgga
agctggagggaggagaaccaagagctccttgtcactcttccttggtagac
agaggtttcaaagcaggctacgttaagtaagagccatctaaaacccagga
gcggaaaaaaaatggctgtggaaacataacctgggtaacaattagacaag
caggaaaccaacccacctttctcaggcacactcagtctccaagttctgac
ccacttaccaacctgtcacaaggaggaagaagcaggtggatggatccctg
tgagttcaaagcaagcctggtgttcctgcgtttcatgctagccaggctac
actgtaagacccagtctaatggggggggggggagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_149620003_149620947
seq2: B6Ng01-210B13.b_47_998

seq1  GAATTCCCCTAGCTGGTGGGGTCTTTGGCAGGAAGCAGGAGGCAACTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCCTAGCTGGTGGGGTCTTTGGCAGGAAGCAGGAGGCAACTTAA  50

seq1  CTTGAGGTGGCCCTTGCCGAGGTTTCCCTTCTGGGTCCCTGCCTGCGTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGGTGGCCCTTGCCGAGGTTTCCCTTCTGGGTCCCTGCCTGCGTTC  100

seq1  TATTTAAAGCCAGTCCTCAGGACAGCTGATCTCAGCTCAGCTGGTCACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAAGCCAGTCCTCAGGACAGCTGATCTCAGCTCAGCTGGTCACTG  150

seq1  TAATTGTATCTTGGCTAGCACAGCTGCCCTGGCACTAAATTTGGTGGGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTATCTTGGCTAGCACAGCTGCCCTGGCACTAAATTTGGTGGGAC  200

seq1  CATTGACCACAAGAAAGGCTGTGTTAAACTTGATATGGCTTTGGCACTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGACCACAAGAAAGGCTGTGTTAAACTTGATATGGCTTTGGCACTTA  250

seq1  GTGGCCCCAGTGTCCCTCATCAGTGGCTTTGACTTACAGTAGGAATAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCCCAGTGTCCCTCATCAGTGGCTTTGACTTACAGTAGGAATAGGA  300

seq1  ACCCCCCAGGCAGGGCCTGGAGAGATGGCTCAGATGGTTAAAGAGGACTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCCAGGCAGGGCCTGGAGAGATGGCTCAGATGGTTAAAGAGGACTG  350

seq1  ACTGCTCTTCTGAAGGTCCTGATTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTCTTCTGAAGGTCCTGATTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGC  400

seq1  TCTTAACCATCCCTAATGAAATCTGATACCCTCATCTCGGGTGTCTGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAACCATCCCTAATGAAATCTGATACCCTCATCTCGGGTGTCTGAAG  450

seq1  ACAGCTACAGTGCTTACGTATGATTGATAGATTGATAGATAGATTGATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTACAGTGCTTACGTATGATTGATAGATTGATAGATAGATTGATAG  500

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  550

seq1  AAAATATTTTTTTAAAAAAATGAGCCCCAAGGCGGCAGGACAGAGTGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATTTTTTTAAAAAAATGAGCCCCAAGGCGGCAGGACAGAGTGCAG  600

seq1  TCTGCTCTGGGACAGTCTCGGCAGCTGTCACAGTGGAGCCTGACTTCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTGGGACAGTCTCGGCAGCTGTCACAGTGGAGCCTGACTTCTGT  650

seq1  TACCCACCTTGGCCTCATCTCTCCAGCACTGGAGCTGCTCAAGACTGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCCACCTTGGCCTCATCTCTCCAGCACTGGAGCTGCTCAAGACTGCAA  700

seq1  -TCGCAAAGGCCGGCTACACTGACCAGGTTGTCATTGGCATGGATGT-GG  748
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TTCGCAAAGGCCGGCTACACTGACCAGGTTGTCATTGGCATGGATGTGGG  750

seq1  CTGCCTCCGAGTTCTACAGGTCTGGCAAGTATGACCT-GGACTTCAAGTC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CTGCCTCCGAGTTCTACAGGTCTGGCAAGTATGACCTGGGACTTCAAGTC  800

seq1  TCCGGATGACCCCAGCAGGTACATCACTCCCGACCAGCTGGCTGATCTGT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGGATGACCCCAGCAGGTACATCACTCCCGACCAGCTGGCTGATCTGT  850

seq1  ACAAGTCCTTCGTCCAGAACTACCCAGGTGGGTATCTGAGGCAG-TCTGT  896
      || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||
seq2  AC-AGTCCTTCGTCCAGAACTACTCAGGTGGGTATCTGAGGCAGTTCTGT  899

seq1  GGCTCCCTA-GGCAGCTTCTGGGCCAC-GGGGCTTCA-CACCAG-TCCTT  942
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||
seq2  GGCTCCCTAGGGCAGCTTCTGGGCCACGGGGGCTTCACCACCAGCCCCTT  949

seq1  CTG  945
      |||
seq2  CTG  952

seq1: chr4_149759340_149759729
seq2: B6Ng01-210B13.g_65_455 (reverse)

seq1  CCT-CCCCCCCCCCCATTAGACTGGGTCTTACAGTGTAGCCTGGCTAGCA  49
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCCCCCCCCCCATTAGACTGGGTCTTACAGTGTAGCCTGGCTAGCA  50

seq1  TGAAACGCAGGAACACCAGGCTTGCTTTGAACTCACAGGGATCCATCCAC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACGCAGGAACACCAGGCTTGCTTTGAACTCACAGGGATCCATCCAC  100

seq1  CTGCTTCTTCCTCCTTGTGACAGGTTGGTAAGTGGGTCAGAACTTGGAGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCTTCCTCCTTGTGACAGGTTGGTAAGTGGGTCAGAACTTGGAGA  150

seq1  CTGAGTGTGCCTGAGAAAGGTGGGTTGGTTTCCTGCTTGTCTAATTGTTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTGTGCCTGAGAAAGGTGGGTTGGTTTCCTGCTTGTCTAATTGTTA  200

seq1  CCCAGGTTATGTTTCCACAGCCATTTTTTTTCCGCTCCTGGGTTTTAGAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTTATGTTTCCACAGCCATTTTTTTTCCGCTCCTGGGTTTTAGAT  250

seq1  GGCTCTTACTTAACGTAGCCTGCTTTGAAACCTCTGTCTACCAAGGAAGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTTACTTAACGTAGCCTGCTTTGAAACCTCTGTCTACCAAGGAAGA  300

seq1  GTGACAAGGAGCTCTTGGTTCTCCTCCCTCCAGCTTCCAGGTTGCCCCTG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAAGGAGCTCTTGGTTCTCCTCCCTCCAGCTTCCAGGTTGCCCCTG  350

seq1  CCCAGCAGGAGTCTAACATAATAATCACATAACTTGAATTC  390
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCAGGAGTCTAACATAATAATCACATAACTTGAATTC  391