BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-210E14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 12,216,056 - 12,337,534
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpy19l4, Rbm35a, LOC634834, 1110037F02Rik, LOC100039847, E130016E03Rik, LOC100039862, Gem, Cdh17, Ppm2c, Tmem67, C430048L16Rik, LOC230010, LOC623671, LOC100039958, Rbm12b, 6720467C03Rik, LOC545592
Downstream geneOTTMUSG00000004461
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-210E14.bB6Ng01-210E14.g
ACCGA028665GA028666
length1,1601,148
definitionB6Ng01-210E14.b B6Ng01-210E14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,336,374 - 12,337,534)(12,216,056 - 12,217,194)
sequence
gaattctgtaaataataatgttcattatgcaacattgcaccatctaacat
aaagccccgagtctcaacattttctccaaatatgtgatttacatgttata
tatgttttgccttcatgtatgtgtttctacacacacacgcacacacacac
atacacacatatacatatacactcatatatatatgtatatatactgtgca
tgtctggtgtctataaaagttagaagaggacatgggattcactagattta
ggaatggctgagaactgctgtgcacttgcctgaactggcccaagtctttc
caaggtctttcatagaactttttgagattaaaatatagtttcagcatttc
tcccttccctttttccttccaaaccttctcatatactgcttaccattctc
cttcaatttacagcctctctttcagtaattgttatgcatccatgtatgta
tatgcatatagagccctaaatataccctgtttagtctacataatgtcact
tctgtgtatgttatgcttagccatctctccatatctcctacccccatata
tttcaaataatgattccactttagccttttttttttggatactttagaat
ctctagagacactttatgactcaaagatacataggacactaaataaaata
agtagaaaaaaatgttaaaagacagggtcgtggtatacatccagagaaat
agaataaaacagagtgaagcatatctgagcaaatattaacacaatccttt
ccccttccttctaccagtgtggttcaaatcatcatttaccttgtctcctt
agtgtgtgctgactattctccttccctatcttgttacagagaagccaaat
ttattgatagtgcacaaatgttcttttcaatgaacaatttcaatattctt
cccaaattatcagtgtctagtacaaccactggaaatgaatctgtcctgaa
cttccatgaggatcaccctcagtgactgggaatcagcagaccttcatcaa
cctgtcatcagctctggatcctccagaggggggtgctgctggtatacaca
tgtaaagttgatgtctcaaattatttatgaaacagatctacatgatgctg
tcatgattgtaaaaaaataatctcattctcttgagccatgggggagtcat
gctcagaaat
gaattctttataatttctttgagttcttggaatggagatcataggcaatt
cttgtcctttacttcttaaaatgttatgtctttttagccccactcataaa
aatacagtgaatttcacaaccccgtctccttcaatattaagtaagagtag
tgagaggaagcctagagaggcttggagtagtgggtggatcttatgtagga
ctcaggacaaggatgaaactttgatgccaactattgtagctggcttaggg
aagaagaaatatatactaggggtagcatgaaggaagacaggaggaatgaa
gaggctgttggaccagagcctttgggaatagaagagacatcagatagcac
tgagaagaaataaccaggaaggcatcaactaggaacccatgtgtgttcct
ggtattcctaagaacaatgatgacatcatcctggggccacctcttgtgag
tgattactgtggatagtgttctcttacctgtctcctgtattccgagagcc
tgattacatcttctcctctgtatcccatggtaaagcaggggtcctggcac
atggtaatcatgttcatatgtgtttgtacaaataataataagacaatacg
ataaagggaaatctatttggagatctttggtttttgttttagtttgtttg
tatcagattttatgagctatgcactttatcctattcactgactctcatag
cagacctattaaatgtagggtcatcatctacatttgcataaatgagaact
gagatttctgatttgctgagagttgtgtagattgtaattagaggtccctg
tattttgaccaaggcattgtgtatactagaactttattccaaatggatta
ataaatctaggaaaagatgagcagtctatctctgggattctccttccacc
ctttccttgtctacctagtcctagctcatatcacactgttctgatcttga
gagattctaatgcacagctggagcctgacatggtcattcttcctggtctt
tcctctgctgcctcctttattactctgcagcttaatgcctgtcctttatg
gactaaaaacattcagaaggaagagttcatgttgattttatttcttcctc
actgtggttcaacatagaacgcaggttcagacaatagtagaaggctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_12336374_12337534
seq2: B6Ng01-210E14.b_46_1205 (reverse)

seq1  ATTTCTGAGCATGACT-CCCCAT-GCTC-AGAGAATGGAGAATTATTTTT  47
      |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |  |||||
seq2  ATTTCTGAGCATGACTCCCCCATGGCTCAAGAGAAT-GAGATTATTTTTT  49

seq1  TACAATCATGACAGCATCATTGTAGATCTTGTTTCATAAATAATTTTGAG  97
      ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  TACAATCATGACAGCATCA-TGTAGATC-TGTTTCATAAATAA-TTTGAG  96

seq1  ACATCAAACTTTAACATGTGTATACCAGCAGCA-CCCCCTCTGGAGGATC  146
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ACATC-AACTTT-ACATGTGTATACCAGCAGCACCCCCCTCTGGAGGATC  144

seq1  CAGAGCTGATGACAGGTTGATGAAGGTCTGCTGATT-CCAGTCACTGAGG  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  CAGAGCTGATGACAGGTTGATGAAGGTCTGCTGATTCCCAGTCACTGAGG  194

seq1  GTGATCCTCATGGAAGTTCAGGACAGATTCATTTCCAGTGGTTGTACTAG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATCCTCATGGAAGTTCAGGACAGATTCATTTCCAGTGGTTGTACTAG  244

seq1  ACACTGATAATTTGGGAAGAATATTGAAATTGTTCATTGAAAAGAACATT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGATAATTTGGGAAGAATATTGAAATTGTTCATTGAAAAGAACATT  294

seq1  TGTGCACTATCAATAAATTTGGCTTCTCTGTAACAAGATAGGGAAGGAGA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACTATCAATAAATTTGGCTTCTCTGTAACAAGATAGGGAAGGAGA  344

seq1  ATAGTCAGCACACACTAAGGAGACAAGGTAAATGATGATTTGAACCACAC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCAGCACACACTAAGGAGACAAGGTAAATGATGATTTGAACCACAC  394

seq1  TGGTAGAAGGAAGGGGAAAGGATTGTGTTAATATTTGCTCAGATATGCTT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGAAGGAAGGGGAAAGGATTGTGTTAATATTTGCTCAGATATGCTT  444

seq1  CACTCTGTTTTATTCTATTTCTCTGGATGTATACCACGACCCTGTCTTTT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTGTTTTATTCTATTTCTCTGGATGTATACCACGACCCTGTCTTTT  494

seq1  AACATTTTTTTCTACTTATTTTATTTAGTGTCCTATGTATCTTTGAGTCA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTTTTTTCTACTTATTTTATTTAGTGTCCTATGTATCTTTGAGTCA  544

seq1  TAAAGTGTCTCTAGAGATTCTAAAGTATCCAAAAAAAAAAGGCTAAAGTG  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGTGTCTCTAGAGATTCTAAAGTATCCAAAAAAAAAAGGCTAAAGTG  594

seq1  GAATCATTATTTGAAATATATGGGGGTAGGAGATATGGAGAGATGGCTAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCATTATTTGAAATATATGGGGGTAGGAGATATGGAGAGATGGCTAA  644

seq1  GCATAACATACACAGAAGTGACATTATGTAGACTAAACAGGGTATATTTA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAACATACACAGAAGTGACATTATGTAGACTAAACAGGGTATATTTA  694

seq1  GGGCTCTATATGCATATACATACATGGATGCATAACAATTACTGAAAGAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTCTATATGCATATACATACATGGATGCATAACAATTACTGAAAGAG  744

seq1  AGGCTGTAAATTGAAGGAGAATGGTAAGCAGTATATGAGAAGGTTTGGAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGTAAATTGAAGGAGAATGGTAAGCAGTATATGAGAAGGTTTGGAA  794

seq1  GGAAAAAGGGAAGGGAGAAATGCTGAAACTATATTTTAATCTCAAAAAGT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAAGGGAAGGGAGAAATGCTGAAACTATATTTTAATCTCAAAAAGT  844

seq1  TCTATGAAAGACCTTGGAAAGACTTGGGCCAGTTCAGGCAAGTGCACAGC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGAAAGACCTTGGAAAGACTTGGGCCAGTTCAGGCAAGTGCACAGC  894

seq1  AGTTCTCAGCCATTCCTAAATCTAGTGAATCCCATGTCCTCTTCTAACTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTCAGCCATTCCTAAATCTAGTGAATCCCATGTCCTCTTCTAACTT  944

seq1  TTATAGACACCAGACATGCACAGTATATATACATATATATATGAGTGTAT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGACACCAGACATGCACAGTATATATACATATATATATGAGTGTAT  994

seq1  ATGTATATGTGTGTATGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTAGAAACACATAC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATATGTGTGTATGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTAGAAACACATAC  1044

seq1  ATGAAGGCAAAACATATATAACATGTAAATCACATATTTGGAGAAAATGT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGCAAAACATATATAACATGTAAATCACATATTTGGAGAAAATGT  1094

seq1  TGAGACTCGGGGCTTTATGTTAGATGGTGCAATGTTGCATAATGAACATT  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACTCGGGGCTTTATGTTAGATGGTGCAATGTTGCATAATGAACATT  1144

seq1  ATTATTTACAGAATTC  1161
      ||||||||||||||||
seq2  ATTATTTACAGAATTC  1160

seq1: chr4_12216056_12217194
seq2: B6Ng01-210E14.g_64_1211

seq1  GAATTCTTTATAATTTCTTTGAGTTCTTGGAATGGAGATCATAGGCAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATAATTTCTTTGAGTTCTTGGAATGGAGATCATAGGCAATT  50

seq1  CTTGTCCTTTACTTCTTAAAATGTTATGTCTTTTTAGCCCCACTCATAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCCTTTACTTCTTAAAATGTTATGTCTTTTTAGCCCCACTCATAAA  100

seq1  AATACAGTGAATTTCACAACCCCGTCTCCTTCAATATTAAGTAAGAGTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGTGAATTTCACAACCCCGTCTCCTTCAATATTAAGTAAGAGTAG  150

seq1  TGAGAGGAAGCCTAGAGAGGCTTGGAGTAGTGGGTGGATCTTATGTAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGAAGCCTAGAGAGGCTTGGAGTAGTGGGTGGATCTTATGTAGGA  200

seq1  CTCAGGACAAGGATGAAACTTTGATGCCAACTATTGTAGCTGGCTTAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGACAAGGATGAAACTTTGATGCCAACTATTGTAGCTGGCTTAGGG  250

seq1  AAGAAGAAATATATACTAGGGGTAGCATGAAGGAAGACAGGAGGAATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAAATATATACTAGGGGTAGCATGAAGGAAGACAGGAGGAATGAA  300

seq1  GAGGCTGTTGGACCAGAGCCTTTGGGAATAGAAGAGACATCAGATAGCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTGTTGGACCAGAGCCTTTGGGAATAGAAGAGACATCAGATAGCAC  350

seq1  TGAGAAGAAATAACCAGGAAGGCATCAACTAGGAACCCATGTGTGTTCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAGAAATAACCAGGAAGGCATCAACTAGGAACCCATGTGTGTTCCT  400

seq1  GGTATTCCTAAGAACAATGATGACATCATCCTGGGGCCACCTCTTGTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTCCTAAGAACAATGATGACATCATCCTGGGGCCACCTCTTGTGAG  450

seq1  TGATTACTGTGGATAGTGTTCTCTTACCTGTCTCCTGTATTCCGAGAGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTACTGTGGATAGTGTTCTCTTACCTGTCTCCTGTATTCCGAGAGCC  500

seq1  TGATTACATCTTCTCCTCTGTATCCCATGGTAAAGCAGGGGTCCTGGCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTACATCTTCTCCTCTGTATCCCATGGTAAAGCAGGGGTCCTGGCAC  550

seq1  ATGGTAATCATGTTCATATGTGTTTGTACAAATAATAATAAGACAATACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAATCATGTTCATATGTGTTTGTACAAATAATAATAAGACAATACG  600

seq1  ATAAAGGGAAATCTATTTGGAGATCTTTGGTTTTTGTTTTAGTTTGTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGGGAAATCTATTTGGAGATCTTTGGTTTTTGTTTTAGTTTGTTTG  650

seq1  TATCAGATTTTATGAGCTATGCACTTTATCCTATTCACTGACTCTCATAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGATTTTATGAGCTATGCACTTTATCCTATTCACTGACTCTCATAG  700

seq1  CAGACCTATTAAATGTAGGGTCATCATCTACATTTGCATAAATGAGAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTATTAAATGTAGGGTCATCATCTACATTTGCATAAATGAGAACT  750

seq1  GAGATTTCTGATTTGCTGAGAGTTGTGTAGATTGTAATTAGAGGTCCCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTTCTGATTTGCTGAGAGTTGTGTAGATTGTAATTAGAGGTCCCTG  800

seq1  TATTTTGACCAAGGCATTGTGTATACTAGAACTTTATTCCAAATGGATTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGACCAAGGCATTGTGTATACTAGAACTTTATTCCAAATGGATTA  850

seq1  ATAAATCTAGGAAAAGATGAGCAGTCTATCTCT-GGATTCTCCTTCCACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  ATAAATCTAGGAAAAGATGAGCAGTCTATCTCTGGGATTCTCCTTCCACC  900

seq1  C-TTCCTTGTCTACCTAGTCCTAGCTCATATCACACTGTTCTGATCTTGA  948
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTTGTCTACCTAGTCCTAGCTCATATCACACTGTTCTGATCTTGA  950

seq1  GAGA-TCT-ATGCACAGCT-GAGCCTGACATGGTCATTC-TCCTGGTCCT  994
      |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  
seq2  GAGATTCTAATGCACAGCTGGAGCCTGACATGGTCATTCTTCCTGGTC--  998

seq1  TTCCCTCTGCTGCCTCCTTTATTACTCTGCAGCTTAATGCCTGTCCTTTA  1044
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTCTGCTGCCTCCTTTATTACTCTGCAGCTTAATGCCTGTCCTTTA  1048

seq1  TGGACTAAAAACA-TCAGAAGGAAAGAGTTCATGTTGATTT--ATTCT--  1089
      ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||  
seq2  TGGACTAAAAACATTCAGAAGG-AAGAGTTCATGTTGATTTTATTTCTTC  1097

seq1  CTCACTGTGG-TCCACATAGAACGCA-GTCCAGACAATAAGTAGAAGGCT  1137
      |||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||
seq2  CTCACTGTGGTTCAACATAGAACGCAGGTTCAGACAAT-AGTAGAAGGCT  1146

seq1  CC  1139
      ||
seq2  CC  1148