BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-221F14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 130,881,301 - 131,019,612
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGm853, Serinc2, Fabp3, Zcchc17, Wdr57, 2610200G18Rik, Pum1, LOC622577, Sdc3, Laptm5, Matn1, LOC622681, LOC100041575
Downstream geneGm831, EG664832, LOC100039799, Ptpru, Mecr, Sfrs4, EG664865, EG623230, Epb4.1, LOC666480, LOC100039835, Oprd1, LOC664894, Ythdf2, LOC664903, Gmeb1, Rnu11, Taf12, 9530096D07Rik, LOC100039864, Trspap1, Rcc1, Snhg3, Phactr4, Med18
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-221F14.bB6Ng01-221F14.g
ACCGA036666GA036667
length1,1191,132
definitionB6Ng01-221F14.b B6Ng01-221F14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(131,018,507 - 131,019,612)(130,881,301 - 130,882,408)
sequence
gaattctttggaatttccagtgtgtcacagccattgcctaagtggtcact
gggggaagtttctttttgtcccttggccttccctgggaggccccagtgag
attttgtatgaagcaagctcactgcatcctggccatcctgagtctgagtt
ggtgttgcatgaagaagttcactacttagaggcagatggccagcgttcaa
gagacaccaggcagatcatgtcctggttacatcacctcagagagagcctg
aaggcagatgtcctggccttggtaccctgaggcaagagcctaaagcattg
gccatctccaggacagaagaggctggctcacataaccagcccccacctgg
ctccaggagactctcagcatagtctgtagattcctgagacctgtgagcag
gaaaagactcaattcaaagtcacttggagaactttgaagggggaacaccc
ccgtaacttagcttttaaaaagttgacttgcttctcatttggggctaatg
tggcttctgtgtcattgacttcagcttaggacattcctcttcacagggtc
ccatccttttcccaggccctattgccaacagcaaagtaataatgtctgac
cttcttgtcctggcatctgccatagactctactttctattttccatacct
ggtaaggtgctacccttgttgtccccaccagctgctctcttgtttaagca
tgtatgtgccttacacacacaggtgtgtgcaccagcacattcatatctat
ggcaaaccacgcgcatacatgtatgcattccagccttatgtacatacatg
tgcatgtgttgtgtgcacatctatggcaaatacacgtacttgcagatgta
tatgctcaagcaccaacccttatgcacacacacacacacacacacacgtg
tgtgtgttcatacctatggcaaacatgtatacctgcagacaggcatcttc
aaggacactcactaactccacctcaccacaagttcctcccaatcctttct
cttggatcttccccagtggtggagagtcctactttccaatctttatgtcc
atatcatgagccttaaaggtagagtgggccctgagcttgataaatcctaa
tcatctctgaggaatgcca
gaattcacagaaaagccagacactgtagaatgcatctataatatccgttc
ccctgcagggagatgagaggcagagccaggagatgcctgaggaagtcacc
agcctgctgtacgtgtgctgtagcatgcgcgggtacacactgtgctgtgg
caggcgtgtgcatgtgcaggcacacacaatttgtatttaaagcatgccaa
cacttgcgttgtcaggtagaagacaatgagttcaggcttttccatacttc
ataggtggaatttttcaggatgtcatttgcctcgtgagccatatgtgaaa
ctgaatgtatacctgactggggagtctttcacagccatggtgggtgacag
gcagcccctcctccatacttctaacctttgcacccactgcttcacacagg
acagcaacacacccttaattccccattcaggtttcttagtgattgagcta
ctccgtgaggtttgcttttatcttccgctctgtttggactttgaaaccaa
gtctcactatgtagcttgagtgagcactacatgttaactccaggacaacc
aagttttactacaggacaactaagttaactctaggataactaagttaact
ccaggacaaccaagtcaactacaggaaaactaagttaataccaggacaac
tacgttaactacaagacatccaagttaactccaggacaactatgttaact
ccatataaaccaaattaactctaggacaaccaggttaactctaggacaac
taagtttaactgcagaacaaccaagttaactccaagacaatcatgcttac
tccagattaaccaagtttaactccaggacaaccattgtttaactccaaat
aaatcaagttaactctggaacaactaagttaacttgcaagacaatcacgt
taactcccaaacaaccatgtttaactccaggacaaccatgtttaactcag
gattatctaacctcattagacctaccttgccctctgcctccaagtgctgg
gaattcaggaaatggacctcttatgcctgaagtagaatgcttctagtata
cagcctaggcctgttggggacaatgtcctctcccaattagaataagggga
caactttcaactctcggtttcatccgagttac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_131018507_131019612
seq2: B6Ng01-221F14.b_46_1164 (reverse)

seq1  TGGC-TTCCTTCCAGAGATGATTAGAATTTAATTCAGCTCA-GGCCCACT  48
      |||| |||||  ||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||
seq2  TGGCATTCCT--CAGAGATGATTAGGATTT-ATCAAGCTCAGGGCCCACT  47

seq1  CT-CCTTT-AGCCTCATGATATGGACAT-AAGATTGG-AAGTGGGACTCT  94
      || ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||
seq2  CTACCTTTAAGGCTCATGATATGGACATAAAGATTGGAAAGTAGGACTCT  97

seq1  C--ACACT-GGGAAGATCCAAAGAGGAAGGA-TGGGA-GAACTTGT-GTG  138
      |   |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||
seq2  CCACCACTGGGGAAGATCC-AAGAGAAAGGATTGGGAGGAACTTGTGGTG  146

seq1  A-GTGGAG-TAGTGAGTGTCCTTGAAGATGCCTGTCTGCAGGTATACATG  186
      | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGAGTTAGTGAGTGTCCTTGAAGATGCCTGTCTGCAGGTATACATG  196

seq1  TTTGCCATAGGTATGAACACACACACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCATAGGTATGAACACACACACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC  246

seq1  ATAA-GGTTGGTGCTTGAGCATATACATCTGCAAGTACGTGTATTTGCCA  285
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGGTTGGTGCTTGAGCATATACATCTGCAAGTACGTGTATTTGCCA  296

seq1  TAGATGTGCACAC-ACACATGCACATGTATGTACATAAGGCTGGAATGCA  334
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGTGCACACAACACATGCACATGTATGTACATAAGGCTGGAATGCA  346

seq1  TACATGTATGCGCGTGGTTTGCCATAGATATGAATGTGCTGGTGCACACA  384
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTATGCGCGTGGTTTGCCATAGATATGAATGTGCTGGTGCACACA  396

seq1  CCTGTGTGTGTAAGGCACATACATGCTT-AACAAGAGAGCAGCTGGTGGG  433
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGTGTGTAAGGCACATACATGCTTAAACAAGAGAGCAGCTGGTGGG  446

seq1  GACAACAAGGGTAGCACCTTACCAGGTATGGAAAATAGAAAGTAGAGTCT  483
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACAAGGGTAGCACCTTACCAGGTATGGAAAATAGAAAGTAGAGTCT  496

seq1  ATGGCAGATGCCAGGACAAGAAGGTCAGACATTATTACTTTGCTGTTGGC  533
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGATGCCAGGACAAGAAGGTCAGACATTATTACTTTGCTGTTGGC  546

seq1  AATAGGGCCTGGGAAAAGGATGGGACCCTGTGAAGAGGAATGTCCTAAGC  583
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGGGCCTGGGAAAAGGATGGGACCCTGTGAAGAGGAATGTCCTAAGC  596

seq1  TGAAGTCAATGACACAGAAGCCACATTAGCCCCAAATGAGAAGCAAGTCA  633
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTCAATGACACAGAAGCCACATTAGCCCCAAATGAGAAGCAAGTCA  646

seq1  ACTTTTTAAAAGCTAAGTTACGGGGGTGTTCCCCCTTCAAAGTTCTCCAA  683
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTAAAAGCTAAGTTACGGGGGTGTTCCCCCTTCAAAGTTCTCCAA  696

seq1  GTGACTTTGAATTGAGTCTTTTCCTGCTCACAGGTCTCAGGAATCTACAG  733
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTTGAATTGAGTCTTTTCCTGCTCACAGGTCTCAGGAATCTACAG  746

seq1  ACTATGCTGAGAGTCTCCTGGAGCCAGGTGGGGGCTGGTTATGTGAGCCA  783
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGCTGAGAGTCTCCTGGAGCCAGGTGGGGGCTGGTTATGTGAGCCA  796

seq1  GCCTCTTCTGTCCTGGAGATGGCCAATGCTTTAGGCTCTTGCCTCAGGGT  833
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTTCTGTCCTGGAGATGGCCAATGCTTTAGGCTCTTGCCTCAGGGT  846

seq1  ACCAAGGCCAGGACATCTGCCTTCAGGCTCTCTCTGAGGTGATGTAACCA  883
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAAGGCCAGGACATCTGCCTTCAGGCTCTCTCTGAGGTGATGTAACCA  896

seq1  GGACATGATCTGCCTGGTGTCTCTTGAACGCTGGCCATCTGCCTCTAAGT  933
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACATGATCTGCCTGGTGTCTCTTGAACGCTGGCCATCTGCCTCTAAGT  946

seq1  AGTGAACTTCTTCATGCAACACCAACTCAGACTCAGGATGGCCAGGATGC  983
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAACTTCTTCATGCAACACCAACTCAGACTCAGGATGGCCAGGATGC  996

seq1  AGTGAGCTTGCTTCATACAAAATCTCACTGGGGCCTCCCAGGGAAGGCCA  1033
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGCTTGCTTCATACAAAATCTCACTGGGGCCTCCCAGGGAAGGCCA  1046

seq1  AGGGACAAAAAGAAACTTCCCCCAGTGACCACTTAGGCAATGGCTGTGAC  1083
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACAAAAAGAAACTTCCCCCAGTGACCACTTAGGCAATGGCTGTGAC  1096

seq1  ACACTGGAAATTCCAAAGAATTC  1106
      |||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGGAAATTCCAAAGAATTC  1119

seq1: chr4_130881301_130882408
seq2: B6Ng01-221F14.g_68_1199

seq1  GAATTCACAGAAAAGCCAGACACTGTAGAATGCATCTATAATATCCGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGAAAAGCCAGACACTGTAGAATGCATCTATAATATCCGTTC  50

seq1  CCCTGCAGGGAGATGAGAGGCAGAGCCAGGAGATGCCTGAGGAAGTCACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCAGGGAGATGAGAGGCAGAGCCAGGAGATGCCTGAGGAAGTCACC  100

seq1  AGCCTGCTGTACGTGTGCTGTAGCATGCGCGGGTACACACTGTGCTGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGCTGTACGTGTGCTGTAGCATGCGCGGGTACACACTGTGCTGTGG  150

seq1  CAGGCGTGTGCATGTGCAGGCACACACAATTTGTATTTAAAGCATGCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCGTGTGCATGTGCAGGCACACACAATTTGTATTTAAAGCATGCCAA  200

seq1  CACTTGCGTTGTCAGGTAGAAGACAATGAGTTCAGGCTTTTCCATACTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGCGTTGTCAGGTAGAAGACAATGAGTTCAGGCTTTTCCATACTTC  250

seq1  ATAGGTGGAATTTTTCAGGATGTCATTTGCCTCGTGAGCCATATGTGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTGGAATTTTTCAGGATGTCATTTGCCTCGTGAGCCATATGTGAAA  300

seq1  CTGAATGTATACCTGACTGGGGAGTCTTTCACAGCCATGGTGGGTGACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATGTATACCTGACTGGGGAGTCTTTCACAGCCATGGTGGGTGACAG  350

seq1  GCAGCCCCTCCTCCATACTTCTAACCTTTGCACCCACTGCTTCACACAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCCCTCCTCCATACTTCTAACCTTTGCACCCACTGCTTCACACAGG  400

seq1  ACAGCAACACACCCTTAATTCCCCATTCAGGTTTCTTAGTGATTGAGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAACACACCCTTAATTCCCCATTCAGGTTTCTTAGTGATTGAGCTA  450

seq1  CTCCGTGAGGTTTGCTTTTATCTTCCGCTCTGTTTGGACTTTGAAACCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCGTGAGGTTTGCTTTTATCTTCCGCTCTGTTTGGACTTTGAAACCAA  500

seq1  GTCTCACTATGTAGCTTGAGTGAGCACTACATGTTAACTCCAGGACAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCACTATGTAGCTTGAGTGAGCACTACATGTTAACTCCAGGACAACC  550

seq1  AAG-TTTACTACAGGACAACTAAGTTAACTCTAGGATAACTAAGTTAACT  599
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTACTACAGGACAACTAAGTTAACTCTAGGATAACTAAGTTAACT  600

seq1  CCAGGACAACCAAGTCAACTACAGGAAAACTAAGTTAATACCAGGACAAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAACCAAGTCAACTACAGGAAAACTAAGTTAATACCAGGACAAC  650

seq1  TACGTTAACTACAAGACATCCAAGTTAACTCCAGGACAACTATGTTAACT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACGTTAACTACAAGACATCCAAGTTAACTCCAGGACAACTATGTTAACT  700

seq1  CCATATAAACCAAATTAACTCTAGGACAACCAGGTTAACTCTAGGACAAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATAAACCAAATTAACTCTAGGACAACCAGGTTAACTCTAGGACAAC  750

seq1  TAAG-TTAACTGCAGAACAACCAAGTTAACTCCAAGACAATCATGCTTAC  798
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTTTAACTGCAGAACAACCAAGTTAACTCCAAGACAATCATGCTTAC  800

seq1  TCCAGATTAACCAAG-TTAACTCCAGGACAACCAT--GTTAACTCCAAAT  845
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||
seq2  TCCAGATTAACCAAGTTTAACTCCAGGACAACCATTGTTTAACTCCAAAT  850

seq1  AAATCAAGTTAACTCTGGAACAACTAAGTTAAC-TGCAAGACAATCACGT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AAATCAAGTTAACTCTGGAACAACTAAGTTAACTTGCAAGACAATCACGT  900

seq1  TAACTCCCAAACAACCATG-TTAACTCCAGGACAACCATG-TTAACTCAG  942
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAACTCCCAAACAACCATGTTTAACTCCAGGACAACCATGTTTAACTCAG  950

seq1  GATTATCTAACCCACTAAGACCTACCT--GCCTCTGCCTCCCAAGTGCTG  990
      ||||||||||||   | ||||||||||   ||||||||| ||||||||||
seq2  GATTATCTAACCTCATTAGACCTACCTTGCCCTCTGCCT-CCAAGTGCTG  999

seq1  GGATTACAGG-AATGGACCTC-TATGCCTGAAGTAG-ATGCTTCTAG-AT  1036
      ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||
seq2  GGAATTCAGGAAATGGACCTCTTATGCCTGAAGTAGAATGCTTCTAGTAT  1049

seq1  ACAGCCTAGGCCTGGTGGGG-CAATGTC--CTCCCCATCAGA--CAGGGG  1081
      |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| || |||   |||||
seq2  ACAGCCTAGGCCTGTTGGGGACAATGTCCTCTCCCAATTAGAATAAGGGG  1099

seq1  AC-ACTTTCA---CTCTGTTTCATC--AGTTAC  1108
      || |||||||   ||| ||||||||  ||||||
seq2  ACAACTTTCAACTCTCGGTTTCATCCGAGTTAC  1132