BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-232C18
Chromosome4 (Build37)
Map Location 57,806,595 - 57,999,939
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAkap2, D630039A03Rik, Txn1, Txndc8
Upstream geneIkbkap, BC026590, Ctnnal1, D730040F13Rik, 6430704M03Rik, Epb4.1l4b, Ptpn3, LOC100041460, 1700042G15Rik, LOC100041342, LOC619973, LOC667049, Palm2, LOC100041513
Downstream geneSvep1, Musk, Edg2, LOC675306, LOC433711, Olfr267, AI314180, LOC100041581, Ltb4dh
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-232C18.bB6Ng01-232C18.g
ACCGA044575GA044576
length1,131908
definitionB6Ng01-232C18.b B6Ng01-232C18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(57,998,821 - 57,999,939)(57,806,595 - 57,807,500)
sequence
gaattcctgttgcccccacacacacacacaaatacatagacaagaatgtt
cccagcagcatcagtccccacagcccaagttatgttacattcacccaaag
gaatactggaacacttacagactactggtcaacctaccatgagtatagta
ctgagcaaaggaagtcagacataaatcagagtcattcgaattctacttgt
aaagttcacaaatatgcaaagacaattcatggtgacgaacacagaactga
cgttgcttttgagcatagatgggggtaacgatgtgaaagggtggtcatgg
tgtcgaggtgtgattatacaatatgattctctcataataatactctaagc
tttttactttgaacttacttttgaaattctatctcatgtgataacagtgg
gtgacagtcccctgcggtaaattcaatgtatctctagaaagatgtcagat
gccacatggttcttattgctcctggctattcttgctatctgtagagtggg
aatctcataaccccataataatgcaagtcatctcgagagagagctgtgcc
ctatttcttgcaccccataacttgtaccatcccactatgagacacagctt
ttcccggtaagagaattctttctagaggggcccccccaacctctcttttt
gagttctccctgacctttgaagtaggaagtagactgacataagcagagac
aacatgatccactgagcatgcctccaaagagatgagagaaatatcttcta
atagagctgtgggagtccagaggatcacctaaaattaattacatggcagt
gattatgagagtagacaccatctcttgtttgtggatgctcttttacctca
gatggtctcactcttacctccaaatgtatctggcttcccatgtagcaaaa
gaaaagataagtactttaggaagacttgggacataaaatccaaaagaagg
taagttggggagtccactgttcttgtatagtaattgcttgcctcccatgg
gaaaaactgagactgaagtagaatccaaaaccttcccacaagcttgcatt
tcctgattgtgaaacctcccttcatggcccgagagccacccttcagacca
ttaggaagaacagggttctaggtacctaggc
gaattcactctctataccaggggctggtctcaaactctgagaccatctgc
ctctgcctcctgagtgctggaattaaaggcatccgcctccctgtaggcct
tggctgccattttcaagtgttttgggtctctgttactctgtgttgacaat
ttcaactcagcatcctgtttgtgagactcattatcaggtacagagacacc
gtggtgacttttgtttatccaacagttgatagtgaaagcacacagagcct
gactttcttatccttgggaaaatagaggagggaggagaaaccggcaggca
cccagtctttgagtctctaactgaagagttggctcctggcagagcagggg
gagtggatgccccgctcagtctcctttgagtgacagtgatcgagggcagt
tctctcagttaaggacttcatatgtggattattttaatcccagatagcaa
aaggccctctgcgttctagtaacgataacactaatggctactttcctgtg
ctggcagattagacacggttgcatgctcagcacgtgaactctaccctctc
cactgctataccctcggcttgaaaaactacagataaagtaatgaagataa
ttttttattaaagagttcccccaaggtgttctaggatgtagacttggggt
gcaagcagcctttagaacggtggttctcaacctccccaatgctgtgacct
tttagtacagttcctcatgttgcgaggacccccccaaccataaaattatt
ttcactgccacttcataaatgtcattttactactgctaacgaatcgtaat
gtaaatattttctgagacagaggttttgccaaaggggtcacaacctatag
cttgagaacgggctgctccctagaacattcttcactctgttcctgtttgt
ctgttggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_57998821_57999939
seq2: B6Ng01-232C18.b_46_1176 (reverse)

seq1  GCCTAGGTTACCCTAG-ACCTTGTTCTTCCTAATGGTCTGGAGGGTGGCT  49
      ||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCCTAGGT--ACCTAGAACCCTGTTCTTCCTAATGGTCTGAAGGGTGGCT  48

seq1  CT-GGGGCATGAAGGGA-GTTTCACAATCAGG-AATGCAAGC-TGTGGG-  94
      || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| 
seq2  CTCGGGCCATGAAGGGAGGTTTCACAATCAGGAAATGCAAGCTTGTGGGA  98

seq1  AGGTTTTGGATTCTACTTCAGTCTCAGTTTTTCCCATGGGA-GCAAGC-A  142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  AGGTTTTGGATTCTACTTCAGTCTCAGTTTTTCCCATGGGAGGCAAGCAA  148

seq1  TTACTATACAAGAACAGTGG-CTCCC--ACTTAACCTTCTTTTGGATTTT  189
      |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||
seq2  TTACTATACAAGAACAGTGGACTCCCCAACTT-ACCTTCTTTTGGATTTT  197

seq1  ATGT-CCAAGTCTTCCT-AAGTCTTTATCTTTTCTTTTGCTACATGGG-A  236
      |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |
seq2  ATGTCCCAAGTCTTCCTAAAGTACTTATCTTTTCTTTTGCTACATGGGAA  247

seq1  GCCAGATACATTTGGAGGTAAGAGTGAGACCATCTGAGGT-AAAGAGCAT  285
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GCCAGATACATTTGGAGGTAAGAGTGAGACCATCTGAGGTAAAAGAGCAT  297

seq1  CCACAAACAAGAGATGGTGTCTACTCTCATAATCACTGCCATGTAATTAA  335
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAACAAGAGATGGTGTCTACTCTCATAATCACTGCCATGTAATTAA  347

seq1  TTTTAGGTGATCCTCTGGACTCCCACAGCTCTATTAGAAGATATTTCTCT  385
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGTGATCCTCTGGACTCCCACAGCTCTATTAGAAGATATTTCTCT  397

seq1  CATCTCTTTGGAGGCATGCTCAGTGGATCATGTTGTCTCTGCTTATGTCA  435
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTTTGGAGGCATGCTCAGTGGATCATGTTGTCTCTGCTTATGTCA  447

seq1  GTCTACTTCCTACTTCAAAGGTCAGGGAGAACTCAAAAAGAGAGGTTGGG  485
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACTTCCTACTTCAAAGGTCAGGGAGAACTCAAAAAGAGAGGTTGGG  497

seq1  GGGGCCCCTCTAGAAAGAATTCTCTTACCGGGAAAAGCTGTGTCTCATAG  535
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCCCTCTAGAAAGAATTCTCTTACCGGGAAAAGCTGTGTCTCATAG  547

seq1  TGGGATGGTACAAGTTATGGGGTGCAAGAAATAGGGCACAGCTCTCTCTC  585
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGGTACAAGTTATGGGGTGCAAGAAATAGGGCACAGCTCTCTCTC  597

seq1  GAGATGACTTGCATTATTATGGGGTTATGAGATTCCCACTCTACAGATAG  635
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGACTTGCATTATTATGGGGTTATGAGATTCCCACTCTACAGATAG  647

seq1  CAAGAATAGCCAGGAGCAATAAGAACCATGTGGCATCTGACATCTTTCTA  685
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATAGCCAGGAGCAATAAGAACCATGTGGCATCTGACATCTTTCTA  697

seq1  GAGATACATTGAATTTACCGCAGGGGACTGTCACCCACTGTTATCACATG  735
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATACATTGAATTTACCGCAGGGGACTGTCACCCACTGTTATCACATG  747

seq1  AGATAGAATTTCAAAAGTAAGTTCAAAGTAAAAAGCTTAGAGTATTATTA  785
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGAATTTCAAAAGTAAGTTCAAAGTAAAAAGCTTAGAGTATTATTA  797

seq1  TGAGAGAATCATATTGTATAATCACACCTCGACACCATGACCACCCTTTC  835
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGAATCATATTGTATAATCACACCTCGACACCATGACCACCCTTTC  847

seq1  ACATCGTTACCCCCATCTATGCTCAAAAGCAACGTCAGTTCTGTGTTCGT  885
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCGTTACCCCCATCTATGCTCAAAAGCAACGTCAGTTCTGTGTTCGT  897

seq1  CACCATGAATTGTCTTTGCATATTTGTGAACTTTACAAGTAGAATTCGAA  935
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGAATTGTCTTTGCATATTTGTGAACTTTACAAGTAGAATTCGAA  947

seq1  TGACTCTGATTTATGTCTGACTTCCTTTGCTCAGTACTATACTCATGGTA  985
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCTGATTTATGTCTGACTTCCTTTGCTCAGTACTATACTCATGGTA  997

seq1  GGTTGACCAGTAGTCTGTAAGTGTTCCAGTATTCCTTTGGGTGAATGTAA  1035
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGACCAGTAGTCTGTAAGTGTTCCAGTATTCCTTTGGGTGAATGTAA  1047

seq1  CATAACTTGGGCTGTGGGGACTGATGCTGCTGGGAACATTCTTGTCTATG  1085
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTTGGGCTGTGGGGACTGATGCTGCTGGGAACATTCTTGTCTATG  1097

seq1  TATTTGTGTGTGTGTGTGGGGGCAACAGGAATTC  1119
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGTGTGTGTGTGTGGGGGCAACAGGAATTC  1131

seq1: chr4_57806595_57807500
seq2: B6Ng01-232C18.g_69_976

seq1  GAATTCACTCTCTATACCAGGGGCTGGTCTCAAACTCTGAGACCATCTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTCTATACCAGGGGCTGGTCTCAAACTCTGAGACCATCTGC  50

seq1  CTCTGCCTCCTGAGTGCTGGAATTAAAGGCATCCGCCTCCCTGTAGGCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCCTCCTGAGTGCTGGAATTAAAGGCATCCGCCTCCCTGTAGGCCT  100

seq1  TGGCTGCCATTTTCAAGTGTTTTGGGTCTCTGTTACTCTGTGTTGACAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGCCATTTTCAAGTGTTTTGGGTCTCTGTTACTCTGTGTTGACAAT  150

seq1  TTCAACTCAGCATCCTGTTTGTGAGACTCATTATCAGGTACAGAGACACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTCAGCATCCTGTTTGTGAGACTCATTATCAGGTACAGAGACACC  200

seq1  GTGGTGACTTTTGTTTATCCAACAGTTGATAGTGAAAGCACACAGAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGACTTTTGTTTATCCAACAGTTGATAGTGAAAGCACACAGAGCCT  250

seq1  GACTTTCTTATCCTTGGGAAAATAGAGGAGGGAGGAGAAACCGGCAGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTTCTTATCCTTGGGAAAATAGAGGAGGGAGGAGAAACCGGCAGGCA  300

seq1  CCCAGTCTTTGAGTCTCTAACTGAAGAGTTGGCTCCTGGCAGAGCAGGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTCTTTGAGTCTCTAACTGAAGAGTTGGCTCCTGGCAGAGCAGGGG  350

seq1  GAGTGGATGCCCCGCTCAGTCTCCTTTGAGTGACAGTGATCGAGGGCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGATGCCCCGCTCAGTCTCCTTTGAGTGACAGTGATCGAGGGCAGT  400

seq1  TCTCTCAGTTAAGGACTTCATATGTGGATTATTTTAATCCCAGATAGCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCAGTTAAGGACTTCATATGTGGATTATTTTAATCCCAGATAGCAA  450

seq1  AAGGCCCTCTGCGTTCTAGTAACGATAACACTAATGGCTACTTTCCTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCCTCTGCGTTCTAGTAACGATAACACTAATGGCTACTTTCCTGTG  500

seq1  CTGGCAGATTAGACACGGTTGCATGCTCAGCACGTGAACTCTACCCTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCAGATTAGACACGGTTGCATGCTCAGCACGTGAACTCTACCCTCTC  550

seq1  CACTGCTATACCCTCGGCTTGAAAAACTACAGATAAAGTAATGAAGATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGCTATACCCTCGGCTTGAAAAACTACAGATAAAGTAATGAAGATAA  600

seq1  TTTTTTATTAAAGAGTTCCCCCAAGGTGTTCTAGGATGTAGACTTGGGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTATTAAAGAGTTCCCCCAAGGTGTTCTAGGATGTAGACTTGGGGT  650

seq1  GCAAGCAGCCTTTAGAACGGTGGTTCTCAACCTCCCCAATGCTGTGACCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCAGCCTTTAGAACGGTGGTTCTCAACCTCCCCAATGCTGTGACCT  700

seq1  TTTAGTACAGTTCCTCATGTTGCGAGGACCCCCCCAACCATAAAATTATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTACAGTTCCTCATGTTGCGAGGACCCCCCCAACCATAAAATTATT  750

seq1  TTCACTGCCACTTCATAAATGTCATTTTACTACTGCTAACGAATCGTAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTGCCACTTCATAAATGTCATTTTACTACTGCTAACGAATCGTAAT  800

seq1  GTAAATATTTTCTGAGACAGAGG-TTTGCCAAAGGGGTCACAACCTATAG  849
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATATTTTCTGAGACAGAGGTTTTGCCAAAGGGGTCACAACCTATAG  850

seq1  CTTGAGAAC-GGCTGCTCCCTAGAACATTCTTCACTCTGTTCCTGTTTGT  898
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGAACGGGCTGCTCCCTAGAACATTCTTCACTCTGTTCCTGTTTGT  900

seq1  CTGTTGGG  906
      ||||||||
seq2  CTGTTGGG  908