BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-234G15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 37,040,594 - 37,164,801
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC545600
Upstream geneLOC100042132
Downstream geneLOC621458, LOC277771
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-234G15.bB6Ng01-234G15.g
ACCGA046186GA046187
length5841,110
definitionB6Ng01-234G15.b B6Ng01-234G15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,164,265 - 37,164,801)(37,040,594 - 37,041,717)
sequence
agtctggtgattcctaagaaaattggacatagtgctacccgaggacccat
ctatatcactcctaggcatatacccaaaagatgttccaatatataacaag
gacacatgctccactatgttcatagcagccttatttataatagccagaac
ctggaaagaaaccagatatccttcaacagaggaatggatacagaatatgt
cataaatttacacaatgggtaactattcagctattaaaaatgaggacatc
atggattttgcacaactcttttttaaattaaaataattttccatataata
tatatctatcatgatttcccctctctccctcatctattattgtgagtgtg
tcatttttctctctaagtctattgatatgatttattacattcatacactt
atggtgaaacattcctgagtgtccagaataagtgtatttaatcatggtgg
atggttttggtatgtgcttattaattcagtttgcaagtgttttattaaga
gatatttttcaaaaattttcttattattatgatgtcattaccttttgggg
ggtatgtttggatttttgttgttgttattggttg

gaattccaggtggctacaatacctaacaagcatttacctgggatctgtag
atacacattccaggcttccagcataagcatgggaggtaccattcagccat
cttccaagttccacttgaaaatggccttgttaaaacttaaagactgtaaa
gtattgtgaacaggtaagaatgtccattaacattttctgattatgtttat
atatataatgcagatccaaccaaccagactgaaaagaatcaagagaaggt
ttagaagtgggtattgacatgaatttgttcccacaattaaacttgataga
acattgtatgttattccagaaatatgctattagatgtctagtaactggtt
gtctaaaaaaagagaaagcctgtcctaaacttggtgaattcattggtgca
gttttctttaataacttagaggtggtccttctagttcaagatcagcaaat
tttagtatctctaaaaagaaaaactgaggcaaaacaaagcttattaaaaa
tatttaaatctactattgtacaaactagaatgtaactgacaatggttaat
gtgcatagcttacttaaaactgttaatagttctgatatcgaattgatgga
cacatttagaaactgtattttaattaaaaaaaaaacccacgcacttattc
tgtatttcctatagatagtgttagtgaagagaattggatctgaataaatt
atatttaattatacttcaattttatttcaattttccttttatttcaattt
ttcctttcttttctccctacctcctttccttgtgttttttgtctgtatct
ttgggtcctggtgtgtaattctccgttttgcttgctcatgtggaagaaaa
tggagataagagattaatggccagtgtcttcttgtattgatttatacttc
attctttaaaacagggtttctttatgaacctggatccttgggacttaatg
atctctaaccttcagccttggattacaagacatacattatagacacatag
gcatgagcactttatgtgggttcttggtactgattcagttcttctgcata
gagcagagcttacttagacatctctctgaccattccttctttatattcgg
ttccttttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_37164265_37164801
seq2: B6Ng01-234G15.b_95_631 (reverse)

seq1  CAACCAATAACAACAACAAAAATCCAAACATACCCCCCAAAAGGTAATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCAATAACAACAACAAAAATCCAAACATACCCCCCAAAAGGTAATGA  50

seq1  CATCATAATAATAAGAAAATTTTTGAAAAATATCTCTTAATAAAACACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATAATAATAAGAAAATTTTTGAAAAATATCTCTTAATAAAACACTT  100

seq1  GCAAACTGAATTAATAAGCACATACCAAAACCATCCACCATGATTAAATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACTGAATTAATAAGCACATACCAAAACCATCCACCATGATTAAATA  150

seq1  CACTTATTCTGGACACTCAGGAATGTTTCACCATAAGTGTATGAATGTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTATTCTGGACACTCAGGAATGTTTCACCATAAGTGTATGAATGTAA  200

seq1  TAAATCATATCAATAGACTTAGAGAGAAAAATGACACACTCACAATAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATCATATCAATAGACTTAGAGAGAAAAATGACACACTCACAATAATA  250

seq1  GATGAGGGAGAGAGGGGAAATCATGATAGATATATATTATATGGAAAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGGGAGAGAGGGGAAATCATGATAGATATATATTATATGGAAAATT  300

seq1  ATTTTAATTTAAAAAAGAGTTGTGCAAAATCCATGATGTCCTCATTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAATTTAAAAAAGAGTTGTGCAAAATCCATGATGTCCTCATTTTTA  350

seq1  ATAGCTGAATAGTTACCCATTGTGTAAATTTATGACATATTCTGTATCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTGAATAGTTACCCATTGTGTAAATTTATGACATATTCTGTATCCA  400

seq1  TTCCTCTGTTGAAGGATATCTGGTTTCTTTCCAGGTTCTGGCTATTATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGTTGAAGGATATCTGGTTTCTTTCCAGGTTCTGGCTATTATAA  450

seq1  ATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTGTTATATATTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGCTGCTATGAACATAGTGGAGCATGTGTCCTTGTTATATATTGGA  500

seq1  ACATCTTTTGGGTATATGCCTAGGAGTGATATAGATG  537
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTTGGGTATATGCCTAGGAGTGATATAGATG  537


seq1: chr4_37040594_37041717
seq2: B6Ng01-234G15.g_66_1175

seq1  GAATTCCAGGTGGCTACAATACCTAACAAGCATTTACCTGGGATCTGTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTGGCTACAATACCTAACAAGCATTTACCTGGGATCTGTAG  50

seq1  ATACACATTCCAGGCTTCCAGCATAAGCATGGGAGGTACCATTCAGCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACATTCCAGGCTTCCAGCATAAGCATGGGAGGTACCATTCAGCCAT  100

seq1  CTTCCAAGTTCCACTTGAAAATGGCCTTGTTAAAACTTAAAGACTGTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAAGTTCCACTTGAAAATGGCCTTGTTAAAACTTAAAGACTGTAAA  150

seq1  GTATTGTGAACAGGTAAGAATGTCCATTAACATTTTCTGATTATGTTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGTGAACAGGTAAGAATGTCCATTAACATTTTCTGATTATGTTTAT  200

seq1  ATATATAATGCAGATCCAACCAACCAGACTGAAAAGAATCAAGAGAAGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATAATGCAGATCCAACCAACCAGACTGAAAAGAATCAAGAGAAGGT  250

seq1  TTAGAAGTGGGTATTGACATGAATTTGTTCCCACAATTAAACTTGATAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAGTGGGTATTGACATGAATTTGTTCCCACAATTAAACTTGATAGA  300

seq1  ACATTGTATGTTATTCCAGAAATATGCTATTAGATGTCTAGTAACTGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTATGTTATTCCAGAAATATGCTATTAGATGTCTAGTAACTGGTT  350

seq1  GTCTAAAAAAAGAGAAAGCCTGTCCTAAACTTGGTGAATTCATTGGTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAAAAAAGAGAAAGCCTGTCCTAAACTTGGTGAATTCATTGGTGCA  400

seq1  GTTTTCTTTAATAACTTAGAGGTGGTCCTTCTAGTTCAAGATCAGCAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTTTAATAACTTAGAGGTGGTCCTTCTAGTTCAAGATCAGCAAAT  450

seq1  TTTAGTATCTCTAAAAAGAAAAACTGAGGCAAAACAAAGCTTATTAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGTATCTCTAAAAAGAAAAACTGAGGCAAAACAAAGCTTATTAAAAA  500

seq1  TATTTAAATCTACTATTGTACAAACTAGAATGTAACTGACAATGGTTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAAATCTACTATTGTACAAACTAGAATGTAACTGACAATGGTTAAT  550

seq1  GTGCATAGCTTACTTAAAACTGTTAATAGTTCTGATATCGAATTGATGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATAGCTTACTTAAAACTGTTAATAGTTCTGATATCGAATTGATGGA  600

seq1  CACATTTAGAAACTGTATTTTAATTAAAAAAAAAACCCACGCACTTATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTAGAAACTGTATTTTAATTAAAAAAAAAACCCACGCACTTATTC  650

seq1  TGTATTTCCTATAGATAGTGTTAGTGAAGAGAATTGGATCTGAATAAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTCCTATAGATAGTGTTAGTGAAGAGAATTGGATCTGAATAAATT  700

seq1  ATATTTAATTATACTTCAATTTTATTTCAATTTTCCTTTTATTTCAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTAATTATACTTCAATTTTATTTCAATTTTCCTTTTATTTCAATTT  750

seq1  TTCCTTTCTTTTCTCCCTACCTCCTTTCCTTGTGTTTTTTGTCTGTATCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTCTTTTCTCCCTACCTCCTTTCCTTGTGTTTTTTGTCTGTATCT  800

seq1  TTGGGTCCTGGTGTGTAATTCTCCGTTTTGCTTGCTCATGTGGAAGAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTCCTGGTGTGTAATTCTCCGTTTTGCTTGCTCATGTGGAAGAAAA  850

seq1  TGGAGATAAGAGATTAATGGCCAGTGTCTTCTTGTATTGATTTATACTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATAAGAGATTAATGGCCAGTGTCTTCTTGTATTGATTTATACTTC  900

seq1  ATTCTTTAAAACAGGGTTTCTTTATGAACCTGGATCCTTGGGACTTAATG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTAAAACAGGGTTTCTTTATGAACCTGGATCCTTGGGACTTAATG  950

seq1  ATCTCTAACCTTCAGCCTTGGAATTAC-AGACATACATTATAGACACATA  999
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTAACCTTCAGCCTTGG-ATTACAAGACATACATTATAGACACATA  999

seq1  AGGCCATGAGCAACTTTTAATGTGGGTTCTTGGTACCTGAATTCAGGTTC  1049
        | ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||
seq2  --GGCATGAGC-ACTTT--ATGTGGGTTCTTGGTA-CTG-ATTCA-GTTC  1041

seq1  TTCTGCATAGAAAGCAAGAGCTTTACCTAAGACATCTCTCTGACCATTCC  1099
      ||||||||||  ||| |||||||   || |||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCATAG--AGC-AGAGCTT--ACTTAGACATCTCTCTGACCATTCC  1086

seq1  CTCCTTTTATATTCTGTT-CTTTTAT  1124
       ||  ||||||||| ||| |||||||
seq2  TTC--TTTATATTCGGTTCCTTTTAT  1110


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |