BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-248N24
Chromosome4 (Build37)
Map Location 149,098,542 - 149,238,794
singlet/doubletdoublet
Overlap geneD4Ertd429e, Slc25a33
Upstream geneLOC100041742, LOC100041755, Casz1, Pex14, LOC670864, Dffa, Cort, Apitd1, LOC666774, Pgd, Kif1b, LOC100041794, Ube4b, Rbp7, LOC627985, Nmnat1, Lzic, Ctnnbip1, Clstn1, Pik3cd
Downstream geneSpsb1, H6pd, Gpr157, Slc2a5, LOC435818, Car6, LOC100041882, Eno1, LOC666880, LOC384091, Rere, Slc45a1, LOC677027, Errfi1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-248N24.bB6Ng01-248N24.g
ACCGA056839GA056840
length1,1441,126
definitionB6Ng01-248N24.b B6Ng01-248N24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(149,237,644 - 149,238,794)(149,098,542 - 149,099,658)
sequence
gaattctgtttacataactagtcaggtcaggttcaccaaggtactgggct
ttcagccctgggtgaaggaccacgatgattggctgatttccagggctggc
agaaggggaggccacatccagctacagcaaggaagactctgctcctccca
catccaagggaggtgtattcacccttctgccatccatgagtcctccaaaa
ccttcaggcagcaagcgtgtgagtggccagacctcacaggactgtctgga
agtattgacgggacagtcatgttgctgctgtgttccccgtctgtacctat
gcctggcagaattacatgtctgttctaatttgtctctgctgctgtgataa
aacactgaccaaaagcaaacagtggaggaaacggtttgtctcaccttaca
cttccaggtcactgggaggcatcagcacaggaacggaaggcaggacaact
tgctgtcccctaccacggtgcctctgatgaggtcactcactcacagccaa
ggaaatacagcaggaaccatggaagatgctgcttgctagctgggtcactc
acaggctcaggcttcatatacatatagcccatgaccgcctgcctagggaa
tggtgcttcccactgttggctgggccctcctgcatcaattaataatgaca
gtcccccacaaggcaagcccacaggtcaatcctcatggaggcttttcttc
cagatgtctctagatcatgttaagtggacagagctcacaaggacatcatg
gtggtgaaagctgactccaacctacgcatcccaaatcttttcatttatct
attgttgacataaaatactgctttggaggaaataagacgacttacttatg
agctaaatatgagtgaccaaggccggagaatgcaaacttagtcatcccgc
atgggtgtcagctaggtcagcatagagaagcagcgagagcttggatatca
aaagcaaaggaagtagcgggacttcggataggcaccacagaggtgggaag
tccgacctttcgggctagcttgcttttcttgataagctggagctgacagc
tcaagtcatcagagagatgtactctcagttgactgaattgcctttcatgg
agactgggttgtagcactctgtaggactttcttattgctgattg
gaattccaaaggtggggaagcttggcaggggctgggctctgctctgctct
gctctgccctgggcagttcctgaggcagtctcttctgtaagggcgcaatg
cttcttcagtgagaggtccccaaatatctgcatgctcaatccccacccgc
gagtctccttcctgttcctgtgaagaaggccagcaggccgacgcgcacta
atccaaccccgagggaggctcaagccttccccctcaccgcgccatccaga
gtggagctgctcaggcagcagctcacccacaggacagaggagcagctggg
cccgtaagcactcctcctcatcgccagatccccatcctgctcccaacccc
aaatgcagtaccccaaaccaacccacctcccttgtggaacagaagccctt
ctgaagaacatgaaagaaaaaaagacgcggtacctggtgccaaccggaat
gagcaggacccaggaggcatttattgaaaacacagcattcaaaacatggc
agctatggccagtggtggttacagttgttagggtcgctggacaatcacaa
tctactacatgacacgggcttgcactgggcgcagacagagggcacggcgg
gcgggatggacaggctgcctggggatggagggtggcctgctccagggcaa
gggttactggagtctgctctgctcgggccagcgtgggccccagacgcaga
cgtgagcagtctccctccctcctttctcagggacaccacctctatgtacc
tgggatgatcccactctgaacggggacggcccagtggttgtcccagtcaa
tgagccacaacccaagggtgcctgagtttcctcagcttctgccagcgacc
ccagaacacgctttctccaactaacaaacgtttaaagggaccattaattg
ttaaaaagtagcagaacgccttaaaaggccaagcaattccgggacccaat
catgctgtctactccccacaacaggcaggtgaatgctcagccagggattc
tggcctgctcagagcctggcctctgtgttaattcataagtacttaaacca
caccaatgcaccacgtacgtcatcgtcacacactcggcttcttatcttat
gcaatgcagaaattacacaatattgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_149237644_149238794
seq2: B6Ng01-248N24.b_50_1193 (reverse)

seq1  CAATCAGCAATTAAGAAAATGTCCTACAGAGTTGCCTACAACCCAGTCT-  49
      |||||||||| |||||||  ||||||||||||   |||||||||||||| 
seq2  CAATCAGCAA-TAAGAAA--GTCCTACAGAGT--GCTACAACCCAGTCTC  45

seq1  CATGGAAG--CATTCTGTCAACTGAGAGTCCCTCCTCTCTGATGACTTGA  97
      |||| |||   |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||
seq2  CATGAAAGGCAATTCAGTCAACTGAGAGTACAT-CTCTCTGATGACTTGA  94

seq1  GCTTGTCAGCT-CAGCTTATC-AGAAAAGCAAAGCTAGCCCGGAAGGTCG  145
      || |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  GC-TGTCAGCTCCAGCTTATCAAGAAAAGC-AAGCTAGCCCGAAAGGTCG  142

seq1  GACTTCCCACCTTCTGTGGTTGCCTATCCGAAGTCCCGCCTACTTCCTTT  195
      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GACTTCCCACC-TCTGTGG-TGCCTATCCGAAGTCCCG-CTACTTCCTTT  189

seq1  GCTTTTGATTATCCAAGCTCTCGCTGCTTCTCTATGCTGACCTAGCTGAC  245
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGA-TATCCAAGCTCTCGCTGCTTCTCTATGCTGACCTAGCTGAC  238

seq1  ACCCATGCGGGATGACTAAGTTTGCATTCTCCGGCCTTGGTCACTCATAT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCATGCGGGATGACTAAGTTTGCATTCTCCGGCCTTGGTCACTCATAT  288

seq1  TTAGCTCATAAGTAAGTCGTCTTATTTCCTCCAAAGCAGTATTTTATGTC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTCATAAGTAAGTCGTCTTATTTCCTCCAAAGCAGTATTTTATGTC  338

seq1  AACAATAGATAAATGAAAAGATTTGGGATGCGTAGGTTGGAGTCAGCTTT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATAGATAAATGAAAAGATTTGGGATGCGTAGGTTGGAGTCAGCTTT  388

seq1  CACCACCATGATGTCCTTGTGAGCTCTGTCCACTTAACATGATCTAGAGA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACCATGATGTCCTTGTGAGCTCTGTCCACTTAACATGATCTAGAGA  438

seq1  CATCTGGAAGAAAAGCCTCCATGAGGATTGACCTGTGGGCTTGCCTTGTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGAAGAAAAGCCTCCATGAGGATTGACCTGTGGGCTTGCCTTGTG  488

seq1  GGGGACTGTCATTATTAATTGATGCAGGAGGGCCCAGCCAACAGTGGGAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACTGTCATTATTAATTGATGCAGGAGGGCCCAGCCAACAGTGGGAA  538

seq1  GCACCATTCCCTAGGCAGGCGGTCATGGGCTATATGTATATGAAGCCTGA  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATTCCCTAGGCAGGCGGTCATGGGCTATATGTATATGAAGCCTGA  588

seq1  GCCTGTGAGTGACCCAGCTAGCAAGCAGCATCTTCCATGGTTCCTGCTGT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGAGTGACCCAGCTAGCAAGCAGCATCTTCCATGGTTCCTGCTGT  638

seq1  ATTTCCTTGGCTGTGAGTGAGTGACCTCATCAGAGGCACCGTGGTAGGGG  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTTGGCTGTGAGTGAGTGACCTCATCAGAGGCACCGTGGTAGGGG  688

seq1  ACAGCAAGTTGTCCTGCCTTCCGTTCCTGTGCTGATGCCTCCCAGTGACC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCAAGTTGTCCTGCCTTCCGTTCCTGTGCTGATGCCTCCCAGTGACC  738

seq1  TGGAAGTGTAAGGTGAGACAAACCGTTTCCTCCACTGTTTGCTTTTGGTC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTGTAAGGTGAGACAAACCGTTTCCTCCACTGTTTGCTTTTGGTC  788

seq1  AGTGTTTTATCACAGCAGCAGAGACAAATTAGAACAGACATGTAATTCTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTTATCACAGCAGCAGAGACAAATTAGAACAGACATGTAATTCTG  838

seq1  CCAGGCATAGGTACAGACGGGGAACACAGCAGCAACATGACTGTCCCGTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCATAGGTACAGACGGGGAACACAGCAGCAACATGACTGTCCCGTC  888

seq1  AATACTTCCAGACAGTCCTGTGAGGTCTGGCCACTCACACGCTTGCTGCC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTTCCAGACAGTCCTGTGAGGTCTGGCCACTCACACGCTTGCTGCC  938

seq1  TGAAGGTTTTGGAGGACTCATGGATGGCAGAAGGGTGAATACACCTCCCT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTTTTGGAGGACTCATGGATGGCAGAAGGGTGAATACACCTCCCT  988

seq1  TGGATGTGGGAGGAGCAGAGTCTTCCTTGCTGTAGCTGGATGTGGCCTCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTGGGAGGAGCAGAGTCTTCCTTGCTGTAGCTGGATGTGGCCTCC  1038

seq1  CCTTCTGCCAGCCCTGGAAATCAGCCAATCATCGTGGTCCTTCACCCAGG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTGCCAGCCCTGGAAATCAGCCAATCATCGTGGTCCTTCACCCAGG  1088

seq1  GCTGAAAGCCCAGTACCTTGGTGAACCTGACCTGACTAGTTATGTAAACA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAAGCCCAGTACCTTGGTGAACCTGACCTGACTAGTTATGTAAACA  1138

seq1  GAATTC  1151
      ||||||
seq2  GAATTC  1144

seq1: chr4_149098542_149099658
seq2: B6Ng01-248N24.g_66_1191

seq1  GAATTCCAAAGGTGGGGAAGCTTGGCAGGGGCTGGGCTCTGCTCTGCTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAGGTGGGGAAGCTTGGCAGGGGCTGGGCTCTGCTCTGCTCT  50

seq1  GCTCTGCCCTGGGCAGTTCCTGAGGCAGTCTCTTCTGTAAGGGCGCAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCCCTGGGCAGTTCCTGAGGCAGTCTCTTCTGTAAGGGCGCAATG  100

seq1  CTTCTTCAGTGAGAGGTCCCCAAATATCTGCATGCTCAATCCCCACCCGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCAGTGAGAGGTCCCCAAATATCTGCATGCTCAATCCCCACCCGC  150

seq1  GAGTCTCCTTCCTGTTCCTGTGAAGAAGGCCAGCAGGCCGACGCGCACTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTCCTTCCTGTTCCTGTGAAGAAGGCCAGCAGGCCGACGCGCACTA  200

seq1  ATCCAACCCCGAGGGAGGCTCAAGCCTTCCCCCTCACCGCGCCATCCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAACCCCGAGGGAGGCTCAAGCCTTCCCCCTCACCGCGCCATCCAGA  250

seq1  GTGGAGCTGCTCAGGCAGCAGCTCACCCACAGGACAGAGGAGCAGCTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGCTGCTCAGGCAGCAGCTCACCCACAGGACAGAGGAGCAGCTGGG  300

seq1  CCCGTAAGCACTCCTCCTCATCGCCAGATCCCCATCCTGCTCCCAACCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTAAGCACTCCTCCTCATCGCCAGATCCCCATCCTGCTCCCAACCCC  350

seq1  AAATGCAGTACCCCAAACCAACCCACCTCCCTTGTGGAACAGAAGCCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCAGTACCCCAAACCAACCCACCTCCCTTGTGGAACAGAAGCCCTT  400

seq1  CTGAAGAACATGAAAGAAAAAAAGACGCGGTACCTGGTGCCAACCGGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGAACATGAAAGAAAAAAAGACGCGGTACCTGGTGCCAACCGGAAT  450

seq1  GAGCAGGACCCAGGAGGCATTTATTGAAAACACAGCATTCAAAACATGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGGACCCAGGAGGCATTTATTGAAAACACAGCATTCAAAACATGGC  500

seq1  AGCTATGGCCAGTGGTGGTTACAGTTGTTAGGGTCGCTGGACAATCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGGCCAGTGGTGGTTACAGTTGTTAGGGTCGCTGGACAATCACAA  550

seq1  TCTACTACATGACACGGGCTTGCACTGGGCGCAGACAGAGGGCACGGCGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTACATGACACGGGCTTGCACTGGGCGCAGACAGAGGGCACGGCGG  600

seq1  GCGGGATGGACAGGCTGCCTGGGGATGGAGGGTGGCCTGCTCCAGGGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGGATGGACAGGCTGCCTGGGGATGGAGGGTGGCCTGCTCCAGGGCAA  650

seq1  GGGTTACTGGAGTCTGCTCTGCTCGGGCCAGCGTGGGCCCCAGACGCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTACTGGAGTCTGCTCTGCTCGGGCCAGCGTGGGCCCCAGACGCAGA  700

seq1  CGTGAGCAGTCTCCCTCCCTCCTTTCTCAGGGACACCACCTCTATGTACC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGAGCAGTCTCCCTCCCTCCTTTCTCAGGGACACCACCTCTATGTACC  750

seq1  TGGGATGATCCCACTCTGAACGGGGACGGCCCAGTGGTTGTCCCAGTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATGATCCCACTCTGAACGGGGACGGCCCAGTGGTTGTCCCAGTCAA  800

seq1  TGAGCCACAACCCAAGGGTGCCTGAGTTTCCTCAGCTTCTGCCAGCGACC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCACAACCCAAGGGTGCCTGAGTTTCCTCAGCTTCTGCCAGCGACC  850

seq1  CCAGAACACGCTTTCTCCAACTAACAAAACGTTAAA-GGACCATTAA-TG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||
seq2  CCAGAACACGCTTTCTCCAACTAACAAACGTTTAAAGGGACCATTAATTG  900

seq1  TTAAAAAGTAGCAGGAACGCTTTAAAAGGCC-AGCAATCCC--GACCC-A  944
      ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| |
seq2  TTAAAAAGTAGCA-GAACGCCTTAAAAGGCCAAGCAATTCCGGGACCCAA  949

seq1  TCATGCTGTCTACTCCCACCAACAGGCAGGGTGACAGGCTCAG-CAGGGA  993
      |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||
seq2  TCATGCTGTCTACTCCCCACAACAGGCA-GGTGA-ATGCTCAGCCAGGGA  997

seq1  TTCTGG-CTGCTCAGAG-CTGG-CTCTGTGT---ATCATAAATAATTTAA  1037
      |||||| |||||||||| |||| ||||||||    |||||| || || ||
seq2  TTCTGGCCTGCTCAGAGCCTGGCCTCTGTGTTAATTCATAAGTACTTAAA  1047

seq1  ACACACACATGCACACACGCACG-CA-CG-CACACAC-CGGCTTC-TATC  1082
       |||||  |||||| |||| ||| || || ||||||| ||||||| ||||
seq2  CCACACCAATGCAC-CACGTACGTCATCGTCACACACTCGGCTTCTTATC  1096

seq1  TAATGCCAAAAATGCAGAAATTAACACCATATTGT  1117
      | ||||    |||||||||||| |||| |||||||
seq2  TTATGC----AATGCAGAAATT-ACACAATATTGT  1126