BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-254K08
Chromosome4 (Build37)
Map Location 37,793,378 - 37,941,562
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC277771
Upstream geneLOC100042132, LOC545600, LOC621458
Downstream geneLOC100039448, LOC665520, LOC100039487
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-254K08.bB6Ng01-254K08.g
ACCGA061060GA061061
length1,0231,124
definitionB6Ng01-254K08.b B6Ng01-254K08.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,940,542 - 37,941,562)(37,793,378 - 37,794,508)
sequence
gaattcattgcatgtgataaatatttagtttttttaaaaaagcacagtat
attcaggtaatttatatgaatatatatgcatgtaatagttatatatatat
atacatatacatatatatacatttattattttatatgtatatagaaaaga
tctattatatgtctgcctatgaaatctcaaaacagtatctctaatatttt
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aataaataatgcccattatccctaactttatgttagtaaatttgtaaaaa
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gtattttgatgctttgtcacagggagttagcatcttccagaaggattaga
tgatgagaaatgtagccttttggagtagtgaggcatgaagaggtttgtca
ctagggtgcttgaagttcaaaggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_37940542_37941562
seq2: B6Ng01-254K08.b_48_1070 (reverse)

seq1  ACAATA-CATACATAGATAGATATAGATATAGTTATA-GATATAGATAGA  48
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATTACATTAAAGACAAATAAAAATCATTAAAAGTAAATAAGGACAAGTAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATGAAAAAACTAGAGTAAGAACCAATAAACTAATTTAACTGTTATGAAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TCTGAAATATTCCTATACTTGTTTTGAAAATACATGAATGAATTATTAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AATGTATATATATGTATATGTATATATATATATAACTATTACATGCATAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATATATATGTATATGTATATATATATATAACTATTACATGCATAT  950

seq1  ATATTCATATAAATTACCTGAATATACTGTGCTTTTTTAAAAAAACTAAA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCATATAAATTACCTGAATATACTGTGCTTTTTTAAAAAAACTAAA  1000

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      |||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATCACATGCAATGAATTC  1023


seq1: chr4_37793378_37794508
seq2: B6Ng01-254K08.g_68_1191

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTATAGCTCCCAAGAATTATAAAATTGCCACAAACTCAAACAATTTA  250

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GCTTTGCTTGTACCTTCAACAGCTATCTCTGTAGGGTATGAGTTAGTGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGCTTGTACCTTCAACAGCTATCTCTGTAGGGTATGAGTTAGTGTC  350

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AGATTTTATACTGATGACATCAGACAACAGACATTATATAATTTTCCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTTTATACTGATGACATCAGACAACAGACATTATATAATTTTCCCCA  450

seq1  ATCATAACCTTATTTACAGAAAGATTTACTCTACTGAAGATCTGAAAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAACCTTATTTACAGAAAGATTTACTCTACTGAAGATCTGAAAAGA  500

seq1  CTATTTCTTTTGACAGATTTAATCCATTATGTTGACAATTGACCATGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATGTCATCCTGACTTTAAGTGGTCCTTTAAAGTGAAGAGGCGAAGTAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCATCCTGACTTTAAGTGGTCCTTTAAAGTGAAGAGGCGAAGTAATG  600

seq1  GACCAGACAAATTGATTCTACTTGAGTTCGTGTTTGTTATATTTTTGTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGACAAATTGATTCTACTTGAGTTCGTGTTTGTTATATTTTTGTAA  650

seq1  TATGTCTTTGAATGAGAAAAGTAAAATTTGTTCGGAGTAATTTAATTCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCTTTGAATGAGAAAAGTAAAATTTGTTCGGAGTAATTTAATTCAG  700

seq1  AGTCTATCCACTCATAGTGGCAAATAGAACAAAGTACATTTCTCTATTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTATCCACTCATAGTGGCAAATAGAACAAAGTACATTTCTCTATTCC  750

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATTTTGCTTTGCAATACAATAAAAGAGCTACTTTTGCAACCTGTCAT  800

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTTATATGTTAGCCTGTAAAACATGAGCTTCAGTACTGCAGTTCA  850

seq1  AATAAATAATGCCCATTATCCCTAACTTTATGTTAGTAAATTTGTAAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAATGCCCATTATCCCTAACTTTATGTTAGTAAATTTGTAAAAA  900

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GCCACTGCACTGTTGCTAATATTTTCAAAATAACGTTTGATGATTTTTTT  950

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
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seq1  GTATTTGAATGCTTTGTCACAAGGGAG-TAGCATTCTTCCAGAA-GATTA  1046
      ||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||
seq2  GTATTTTGATGCTTTGTCAC-AGGGAGTTAGCA-TCTTCCAGAAGGATTA  1048

seq1  GAAGGATGAAGAAATGTAGCCTTTTGGAGTAAGTGAGGCATTGGAAGAAG  1096
      | | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |
seq2  G-ATGATG-AGAAATGTAGCCTTTTGGAGT-AGTGAGGCAT--GAAGAGG  1093

seq1  TTTGTCACTAGGGTGGGCTTTGAGGTTTCAAAGGC  1131
      |||||||||||||||    |||| | |||||||||
seq2  TTTGTCACTAGGGTG---CTTGAAG-TTCAAAGGC  1124


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