BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-256G16
Chromosome4 (Build37)
Map Location 136,726,702 - 136,849,446
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWnt4
Upstream geneE2f2, Ddefl1, Tcea3, Zfp46, Hnrpr, Htr1d, LOC100042540, Luzp1, Aof2, LOC667080, LOC433770, 4930549C01Rik, BC029684, Ephb2, C1qb, C1qc, C1qa, Epha8, Zbtb40
Downstream geneCdc42, LOC665533, LOC242711, Ela3, 1700013G24Rik, Hspg2, Ldlrad2, Usp48, Rap1gap, Akp2, Ece1, LOC100040558, Eif4g3, Hp1bp3, Kif17
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-256G16.bB6Ng01-256G16.g
ACCGA062381GA062382
length1,1361,078
definitionB6Ng01-256G16.b B6Ng01-256G16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(136,726,702 - 136,727,837)(136,848,380 - 136,849,446)
sequence
gaattctgctttaaaggttttcagagtgcaccagttcagtgggcagccca
tcccccaaggaaggatctagaccttactgaaccctggctgctcccccgga
aggtgtcagaaggctctttctcacaggaacaaagacctagccacaggagt
cagtgcctacttctctgtccggtgtctcgaggtcagattagtacataaca
ccatctgaatttaaggtaggcagaatgtattaaacaggagtgtcttatat
cagtggtgttaggaactctccaatgtacactcacactctcaggtgatgtg
gagtagaggctcttaatcatacttgacagatggggaaactaaggctcaga
aaagtcatgctgtcagcagtatcagaaacaggggtgtagctccgcaatgc
tccccgcagcggatagatgaattctcttcctcttttagggacttagactt
gggtaaaggggaatccttccgtttgatgcaggaaaaaaaaaaactcagaa
tgagccaggatgaagcaggattggaagtttattaaaagtagaaagtgctg
gcacacctttgatcatagcactgaggcagccaggtctccatgagttcaag
gccagccttgtctactatatagaaaaaccttgtctcaaatgaacaaacaa
acaaacaaacaaatagaaaggtgtctagggaaagaacaaaacacgctctg
gagcagtagttctcaacctgtgggtcaagactcctttgggagtcaaatga
ccctttcacaaagtccacctaagaccaccggaaaacacagatatttacat
tatgaatcataacagtagcaaaatttacagttatgaaatagcaatgaaat
aattttatggttggaggtcactacacataaggaactgtattaaagggtct
cagcatcaggagggttgagagccactgagctagaacacagatacggcctt
ctgaaaggacagtcacagttgattaagacatttttaacagattttttaag
cgtgagaattggggagaaccgagacttaggaaagactatgacatacctga
ggggttggaaagatggctcaagcgctgaagtggtgttgtacttgcttctg
cagagccactgagttgatgccaggaccatgtcaggc
tcttttctcactgactctgggctctagccactcagcttcagtagtgtggc
cctggtggcttccctgggacccaggctggagccttgttctctggaagagg
gcccaatgggacctgatttccccagaggctgtttaatggcagaaggacat
tatggtgggactgggagtaccatggtggggtgtcttggggaggtgataga
tactttaccccgcaggagggaggcagaactcacaagtgcccaacatgcag
ctttcttccctttccacccctccagcctcctttctcacacttgtaacccc
cttcttctggttttcttcccagagtaccccaaggcttggctgcacaggtc
tgagtcctatgtgtcctgtaggtttgcctgcagtgctgtcttttctaagg
ggctaagagatgcccagagctgggagttcgaggaagtgaccccataggtg
gaccccctgaggaccacaatgcacagggcgtctttctgtgggttgatctc
ttccggactcacacagtctcaagttgctctcctgagaacacaagtcttgc
ctgggctcttcagtagcaaatggcaaaatggggacgggaggggagcctgt
ctgactcaaggcccaggagcacgtcatggggacatctctccagatggtgg
gagggaagccaatccagcggaaaggagctggaactgggagagaactggcc
gaagttgagctgggttggcgaggaggccctgggcgtggtgacctttgggc
accaggtgggtgtcccgatagaggccaggggaatgggcatggctccatca
ttgccctggtgcattctccaggaacccagcaggtgggccctgggtttgtc
cccactttctaggaaggacactgagttatagagagggcacagtccttgcc
caactttctcaccgctggcaggacaggatctggtcatcaccgcaccttga
ctcccttcagacgtctcagttgataggttgggaatggacataaattcaag
gctgctgtaaggatgatctgcgcttaagaatagcaccaggataggtccaa
cactgccttctttcacttggtctacagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_136726702_136727837
seq2: B6Ng01-256G16.b_50_1185

seq1  GAATTCTGCTTTAAAGGTTTTCAGAGTGCACCAGTTCAGTGGGCAGCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTTTAAAGGTTTTCAGAGTGCACCAGTTCAGTGGGCAGCCCA  50

seq1  TCCCCCAAGGAAGGATCTAGACCTTACTGAACCCTGGCTGCTCCCCCGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCAAGGAAGGATCTAGACCTTACTGAACCCTGGCTGCTCCCCCGGA  100

seq1  AGGTGTCAGAAGGCTCTTTCTCACAGGAACAAAGACCTAGCCACAGGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCAGAAGGCTCTTTCTCACAGGAACAAAGACCTAGCCACAGGAGT  150

seq1  CAGTGCCTACTTCTCTGTCCGGTGTCTCGAGGTCAGATTAGTACATAACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGCCTACTTCTCTGTCCGGTGTCTCGAGGTCAGATTAGTACATAACA  200

seq1  CCATCTGAATTTAAGGTAGGCAGAATGTATTAAACAGGAGTGTCTTATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTGAATTTAAGGTAGGCAGAATGTATTAAACAGGAGTGTCTTATAT  250

seq1  CAGTGGTGTTAGGAACTCTCCAATGTACACTCACACTCTCAGGTGATGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGTGTTAGGAACTCTCCAATGTACACTCACACTCTCAGGTGATGTG  300

seq1  GAGTAGAGGCTCTTAATCATACTTGACAGATGGGGAAACTAAGGCTCAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGAGGCTCTTAATCATACTTGACAGATGGGGAAACTAAGGCTCAGA  350

seq1  AAAGTCATGCTGTCAGCAGTATCAGAAACAGGGGTGTAGCTCCGCAATGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCATGCTGTCAGCAGTATCAGAAACAGGGGTGTAGCTCCGCAATGC  400

seq1  TCCCCGCAGCGGATAGATGAATTCTCTTCCTCTTTTAGGGACTTAGACTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCGCAGCGGATAGATGAATTCTCTTCCTCTTTTAGGGACTTAGACTT  450

seq1  GGGTAAAGGGGAATCCTTCCGTTTGATGCAGGAAAAAAAAAAACTCAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTAAAGGGGAATCCTTCCGTTTGATGCAGGAAAAAAAAAAACTCAGAA  500

seq1  TGAGCCAGGATGAAGCAGGATTGGAAGTTTATTAAAAGTAGAAAGTGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCAGGATGAAGCAGGATTGGAAGTTTATTAAAAGTAGAAAGTGCTG  550

seq1  GCACACCTTTGATCATAGCACTGAGGCAGCCAGGTCTCCATGAGTTCAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACCTTTGATCATAGCACTGAGGCAGCCAGGTCTCCATGAGTTCAAG  600

seq1  GCCAGCCTTGTCTACTATATAGAAAAACCTTGTCTCAAATGAACAAACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCCTTGTCTACTATATAGAAAAACCTTGTCTCAAATGAACAAACAA  650

seq1  ACAAACAAACAAATAGAAAGGTGTCTAGGGAAAGAACAAAACACGCTCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACAAACAAATAGAAAGGTGTCTAGGGAAAGAACAAAACACGCTCTG  700

seq1  GAGCAGTAGTTCTCAACCTGTGGGTCAAGACTCCTTTGGGAGTCAAATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTAGTTCTCAACCTGTGGGTCAAGACTCCTTTGGGAGTCAAATGA  750

seq1  CCCTTTCACAAAGTCCACCTAAGACCACCGGAAAACACAGATATTTACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTCACAAAGTCCACCTAAGACCACCGGAAAACACAGATATTTACAT  800

seq1  TATGAATCATAACAGTAGCAAAATTTACAGTTATGAAATAGCAATGAAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAATCATAACAGTAGCAAAATTTACAGTTATGAAATAGCAATGAAAT  850

seq1  AATTTTATGGTTGGAGGTCACTACACATAAGGAACTGTATTAAAGGGTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTATGGTTGGAGGTCACTACACATAAGGAACTGTATTAAAGGGTCT  900

seq1  CAGCATCAGGAGGGTTGAGAGCCACTGAGCTAGAACACAGATACGGCCTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCAGGAGGGTTGAGAGCCACTGAGCTAGAACACAGATACGGCCTT  950

seq1  CTGAAAGGACAGTCACAGTTGATTAAGACATTTTTAACAGA-TTTTTAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTGAAAGGACAGTCACAGTTGATTAAGACATTTTTAACAGATTTTTTAAG  1000

seq1  CGTGAGAATTGGGAGAAACCGAGACTTAGGGAAAGACTATGACATAACCT  1049
      |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||
seq2  CGTGAGAATTGGGGAGAACCGAGACTTA-GGAAAGACTATGACAT-ACCT  1048

seq1  GAGGGGTTGGAAAGATGGCTC-AGCGCTGAAGT-GTG-TGTAC-TGCTCC  1095
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |
seq2  GAGGGGTTGGAAAGATGGCTCAAGCGCTGAAGTGGTGTTGTACTTGCTTC  1098

seq1  TGCAGAGCACCTGAGTTTGATGCCCAGGACCCATGTCAGGC  1136
      ||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||
seq2  TGCAGAGCCACTGAG-TTGATG-CCAGGA-CCATGTCAGGC  1136

seq1: chr4_136848380_136849446
seq2: B6Ng01-256G16.g_79_1156 (reverse)

seq1  ACTGTAG--CCAGTG-AAGAAGGGAGTGTTGG-CCTATCCT-GTGCTAT-  44
      |||||||  | |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| 
seq2  ACTGTAGACCAAGTGAAAGAAGGCAGTGTTGGACCTATCCTGGTGCTATT  50

seq1  -CTAAGCCCAGATCATCCTTACAGCAGCTTTGAATTTATGT-CATTCCCA  92
        ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  CTTAAGCGCAGATCATCCTTACAGCAGCCTTGAATTTATGTCCATTCCCA  100

seq1  ACTTA-CAACTGAGACGTCTG-AGGGAGCCAAGG-GCGGTGATGACCCAG  139
      || || ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||
seq2  ACCTATCAACTGAGACGTCTGAAGGGAGTCAAGGTGCGGTGATGA-CCAG  149

seq1  ATCCTGTCCCTGCCAGCGGTGAG-AAGTTGGGCAAGGACTGTGCCCTCTC  188
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGT-CCTGCCAGCGGTGAGAAAGTTGGGCAAGGACTGTGCCCTCTC  198

seq1  TATAACTCAGTGTCCTTCCTAGAAAGTGGGGACAAACCCAGGGCCCACCT  238
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACTCAGTGTCCTTCCTAGAAAGTGGGGACAAACCCAGGGCCCACCT  248

seq1  GCTGGGTTCCTGGAGAATGCA-CAGGGCAATGATGGAGCCATGCCCATTC  287
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTTCCTGGAGAATGCACCAGGGCAATGATGGAGCCATGCCCATTC  298

seq1  CCCTGGCCTCTATCGGGACACCCACCTGGTGCCCAAAGGTCACCACGCCC  337
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGCCTCTATCGGGACACCCACCTGGTGCCCAAAGGTCACCACGCCC  348

seq1  AGGGCCTCCTCGCCAACCCAGCTCAACTTCGGCCAGTTCTCTCCCAGTTC  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCCTCCTCGCCAACCCAGCTCAACTTCGGCCAGTTCTCTCCCAGTTC  398

seq1  CAGCTCCTTTCCGCTGGATTGGCTTCCCTCCCACCATCTGGAGAGATGTC  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCCTTTCCGCTGGATTGGCTTCCCTCCCACCATCTGGAGAGATGTC  448

seq1  CCCATGACGTGCTCCTGGGCCTTGAGTCAGACAGGCTCCCCTCCCGTCCC  487
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGACGTGCTCCTGGGCCTTGAGTCAGACAGGCTCCCCTCCCGTCCC  498

seq1  CATTTTGCCATTTGCTACTGAAGAGCCCAGGCAAGACTTGTGTTCTCAGG  537
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTGCCATTTGCTACTGAAGAGCCCAGGCAAGACTTGTGTTCTCAGG  548

seq1  AGAGCAACTTGAGACTGTGTGAGTCCGGAAGAGATCAACCCACAGAAAGA  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAACTTGAGACTGTGTGAGTCCGGAAGAGATCAACCCACAGAAAGA  598

seq1  CGCCCTGTGCATTGTGGTCCTCAGGGGGTCCACCTATGGGGTCACTTCCT  637
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCCTGTGCATTGTGGTCCTCAGGGGGTCCACCTATGGGGTCACTTCCT  648

seq1  CGAACTCCCAGCTCTGGGCATCTCTTAGCCCCTTAGAAAAGACAGCACTG  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACTCCCAGCTCTGGGCATCTCTTAGCCCCTTAGAAAAGACAGCACTG  698

seq1  CAGGCAAACCTACAGGACACATAGGACTCAGACCTGTGCAGCCAAGCCTT  737
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAAACCTACAGGACACATAGGACTCAGACCTGTGCAGCCAAGCCTT  748

seq1  GGGGTACTCTGGGAAGAAAACCAGAAGAAGGGGGTTACAAGTGTGAGAAA  787
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTACTCTGGGAAGAAAACCAGAAGAAGGGGGTTACAAGTGTGAGAAA  798

seq1  GGAGGCTGGAGGGGTGGAAAGGGAAGAAAGCTGCATGTTGGGCACTTGTG  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTGGAGGGGTGGAAAGGGAAGAAAGCTGCATGTTGGGCACTTGTG  848

seq1  AGTTCTGCCTCCCTCCTGCGGGGTAAAGTATCTATCACCTCCCCAAGACA  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTGCCTCCCTCCTGCGGGGTAAAGTATCTATCACCTCCCCAAGACA  898

seq1  CCCCACCATGGTACTCCCAGTCCCACCATAATGTCCTTCTGCCATTAAAC  937
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACCATGGTACTCCCAGTCCCACCATAATGTCCTTCTGCCATTAAAC  948

seq1  AGCCTCTGGGGAAATCAGGTCCCATTGGGCCCTCTTCCAGAGAACAAGGC  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTGGGGAAATCAGGTCCCATTGGGCCCTCTTCCAGAGAACAAGGC  998

seq1  TCCAGCCTGGGTCCCAGGGAAGCCACCAGGGCCACACTACTGAAGCTGAG  1037
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCTGGGTCCCAGGGAAGCCACCAGGGCCACACTACTGAAGCTGAG  1048

seq1  TGGCTAGAGCCCAGAGTCAGTGAGAAAAGA  1067
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTAGAGCCCAGAGTCAGTGAGAAAAGA  1078