BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-258L07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 35,923,564 - 35,924,693
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneMobkl2b, Ifnk, 3110043O21Rik, LOC620559, LOC621227, Lingo2
Downstream geneLOC100042132
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-258L07.bB6Ng01-258L07.g
ACCGA064076GA064077
length1,1401,192
definitionB6Ng01-258L07.b B6Ng01-258L07.g
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcacagaaaaacttcaaacatttgtccacaaatagtagtgtctgtt
actttggttctatcatcatttgtagaaataaattatccaggtttataaga
aaccatgaaattatctgttctgataattatggtgataaattatatacatt
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ttgagtattttatatccagctacttcactgaagctgtttatcagtttagg
agtcctctgctgagttttaggatcactttattgacattatccatcactca
caagggtatttttacttcttctttccaatgtgtagatacgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_35923564_35924693
seq2: B6Ng01-258L07.b_46_1185

seq1  GAATTCACAGAAAAACTTCAAACATTTGTCCACAAATAGTAGTGTCTGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATACACATATATTATATGTAGGTGGCTCTATAAATTGTAAAATCA  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACATACACACATATGTATGTATATACACACACACA  800

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACACACACACAAATACACACACACACACACACACACACACACACACA  850

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTGTTTTTCAACCTGTGTGCTGTCACAGGTCACATATCATAAATTCT  950

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      |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATCAGATATTTATTTTTATGATTTTATAACAGTAACAAAATTATAA  1000

seq1  -TTAAGAAGTAGCAACAATATCATTTCAT-GGTACAGGTCACCATTTAAG  1045
       |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  TTTAAGAAGTAGCAACAATATCATTTCATGGGTACAGGTCACCATTTAGG  1050

seq1  AGTAATGGTGTTAAAGATTTTCAGTATT-AGGATGATT-GAGAATCACTG  1093
      ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||
seq2  AGTAATGGTGTTAAGAATTTTCAGTATTAAGGATGATTGGAGATCCACTG  1100

seq1  CTTAAGCTAAAG--TATGCATATTGG-TCCTGAACCATGT  1130
      ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||
seq2  CTTAAGCTAAAGGTTATGCATATTGGTTCCTGAACCATGT  1140


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