BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-261D18
Chromosome4 (Build37)
Map Location 56,094,705 - 56,215,592
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfp462, LOC670211, Rad23b, LOC666953, LOC100041348, Klf4
Downstream geneActl7b, Actl7a, Ikbkap, BC026590, Ctnnal1, D730040F13Rik, 6430704M03Rik, Epb4.1l4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-261D18.bB6Ng01-261D18.g
ACCGA065955GA065956
length4191,143
definitionB6Ng01-261D18.b B6Ng01-261D18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(56,215,168 - 56,215,592)(56,094,705 - 56,095,857)
sequence
atgatctcagaatgttcaatcatgaataggatcattgcagaagtaggaac
agaaagattgtaaaagccataggcagtggataatatcaagaaaatagtgt
tttgcaggacagttgaagaaaactcacaaagattatgacagtatatgcaa
ggcctgcataagctcaacccagacaaagtatcagcatggagagaggaggt
gtggccaaaagcccttgcatagctgagaagccactggcaactgatagaga
gaatgagtttaagggtgtggcccgctggtaggtagatccctcttcactgg
ctgttcacacactcgagtgtattaacacaatttgaactcggcatttttaa
atggaagacacagatttaaaagggttcatcttccttagatgggagtgggt
ttgagaggagtaggtgagg

gaattcaagaatggttctttggattcaactcctggagagggccaaactgt
gatcaaaagatgctctctataaagagcatgcaggaacaccatcacttggc
catagttgtgtcagctttaaaagaaactccacccaaatggccaatggaga
gcctattagcatacgaatatgctggtctccaagctctctcttgtcacaag
tatctgttagagtccatgctggcatcctggctcttctcactctgctcttc
tctaaactttctcatgtactactttctcattctgccctggactctcccag
atgccagtgtttgcattctcctttatatgcacagtaaaatcctttctctc
aaccatgtcttaaggcagccgtgtcctcactttatataagtttggtgtgt
acaaaacatgtttgaataataaattggcatgagtaagattaagaatgtca
gcaattctttgaaccacctgagagaaggatggaaatttcagaaaatgagt
gtttccccactgggcaatttccttcttttcctagtgagtttctgctatga
gatgctgaacatcctgacagcaagaagtgttaatgttctaggcttcgggc
ctgacctaggattacaagactctatcgcatggctgtcttttctgggatga
catagttgcacttccattccaaggagaaatcacctacgatgtcacaccat
gtcctcagtaacttcccctgccgagaataccagcccttcctccatttcat
ggtgcatggaagtcatttgtttaccttaagcagagatcctaatcagagaa
ggaggagacagtgagccacatctcatcatccaatctgccactgcctctca
gaggcatccattattatgttataaccatgggacccagacacttggagcaa
acagacctgtgggttggctgtaaaatcctgttccaaacttcagtcgctat
ggacagagagggccaaacagatactcatttgttttaggactcagtgacat
gataaaacaaaggcaagcagagccagggagactttcatagagctccacag
ctcttgggagttgccacatgcctgagcagtggagaacatgagacagactc
tgacttctcactatgaccaacactggatgccgaattcctgtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_56215168_56215592
seq2: B6Ng01-261D18.b_45_469 (reverse)

seq1  CCTCACCTACTCCTCTCAAACCCACTCCCATCTAAGGAAGATGAACCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACCTACTCCTCTCAAACCCACTCCCATCTAAGGAAGATGAACCCTT  50

seq1  TTAAATCTGTGTCTTCCATTTAAAAATGCCGAGTTCAAATTGTGTTAATA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATCTGTGTCTTCCATTTAAAAATGCCGAGTTCAAATTGTGTTAATA  100

seq1  CACTCGAGTGTGTGAACAGCCAGTGAAGAGGGATCTACCTACCAGCGGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCGAGTGTGTGAACAGCCAGTGAAGAGGGATCTACCTACCAGCGGGC  150

seq1  CACACCCTTAAACTCATTCTCTCTATCAGTTGCCAGTGGCTTCTCAGCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCCTTAAACTCATTCTCTCTATCAGTTGCCAGTGGCTTCTCAGCTA  200

seq1  TGCAAGGGCTTTTGGCCACACCTCCTCTCTCCATGCTGATACTTTGTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGGGCTTTTGGCCACACCTCCTCTCTCCATGCTGATACTTTGTCTG  250

seq1  GGTTGAGCTTATGCAGGCCTTGCATATACTGTCATAATCTTTGTGAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAGCTTATGCAGGCCTTGCATATACTGTCATAATCTTTGTGAGTTT  300

seq1  TCTTCAACTGTCCTGCAAAACACTATTTTCTTGATATTATCCACTGCCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAACTGTCCTGCAAAACACTATTTTCTTGATATTATCCACTGCCTA  350

seq1  TGGCTTTTACAATCTTTCTGTTCCTACTTCTGCAATGATCCTATTCATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTTACAATCTTTCTGTTCCTACTTCTGCAATGATCCTATTCATGA  400

seq1  TTGAACATTCTGAGATCATGAATTC  425
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACATTCTGAGATCATGAATTC  425


seq1: chr4_56094705_56095857
seq2: B6Ng01-261D18.g_67_1209

seq1  GAATTCAAGAATGGTTCTTTGGATTCAACTCCTGGAGAGGGCCAAACTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGAATGGTTCTTTGGATTCAACTCCTGGAGAGGGCCAAACTGT  50

seq1  GATCAAAAGATGCTCTCTATAAAGAGCATGCAGGAACACCATCACTTGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAAAAGATGCTCTCTATAAAGAGCATGCAGGAACACCATCACTTGGC  100

seq1  CATAGTTGTGTCAGCTTTAAAAGAAACTCCACCCAAATGGCCAATGGAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTGTGTCAGCTTTAAAAGAAACTCCACCCAAATGGCCAATGGAGA  150

seq1  GCCTATTAGCATACGAATATGCTGGTCTCCAAGCTCTCTCTTGTCACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATTAGCATACGAATATGCTGGTCTCCAAGCTCTCTCTTGTCACAAG  200

seq1  TATCTGTTAGAGTCCATGCTGGCATCCTGGCTCTTCTCACTCTGCTCTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGTTAGAGTCCATGCTGGCATCCTGGCTCTTCTCACTCTGCTCTTC  250

seq1  TCTAAACTTTCTCATGTACTACTTTCTCATTCTGCCCTGGACTCTCCCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAACTTTCTCATGTACTACTTTCTCATTCTGCCCTGGACTCTCCCAG  300

seq1  ATGCCAGTGTTTGCATTCTCCTTTATATGCACAGTAAAATCCTTTCTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCAGTGTTTGCATTCTCCTTTATATGCACAGTAAAATCCTTTCTCTC  350

seq1  AACCATGTCTTAAGGCAGCCGTGTCCTCACTTTATATAAGTTTGGTGTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATGTCTTAAGGCAGCCGTGTCCTCACTTTATATAAGTTTGGTGTGT  400

seq1  ACAAAACATGTTTGAATAATAAATTGGCATGAGTAAGATTAAGAATGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACATGTTTGAATAATAAATTGGCATGAGTAAGATTAAGAATGTCA  450

seq1  GCAATTCTTTGAACCACCTGAGAGAAGGATGGAAATTTCAGAAAATGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTCTTTGAACCACCTGAGAGAAGGATGGAAATTTCAGAAAATGAGT  500

seq1  GTTTCCCCACTGGGCAATTTCCTTCTTTTCCTAGTGAGTTTCTGCTATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCCCACTGGGCAATTTCCTTCTTTTCCTAGTGAGTTTCTGCTATGA  550

seq1  GATGCTGAACATCCTGACAGCAAGAAGTGTTAATGTTCTAGGCTTCGGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGAACATCCTGACAGCAAGAAGTGTTAATGTTCTAGGCTTCGGGC  600

seq1  CTGACCTAGGATTACAAGACTCTATCGCATGGCTGTCTTTTCTGGGATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACCTAGGATTACAAGACTCTATCGCATGGCTGTCTTTTCTGGGATGA  650

seq1  CATAGTTGCACTTCCATTCCAAGGAGAAATCACCTACGATGTCACACCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTTGCACTTCCATTCCAAGGAGAAATCACCTACGATGTCACACCAT  700

seq1  GTCCTCAGTAACTTCCCCTGCCGAGAATACCAGCCCTTCCTCCATTTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCAGTAACTTCCCCTGCCGAGAATACCAGCCCTTCCTCCATTTCAT  750

seq1  GGTGCATGGAAGTCATTTGTTTACCTTAAGCAGAGATCCTAATCAGAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCATGGAAGTCATTTGTTTACCTTAAGCAGAGATCCTAATCAGAGAA  800

seq1  GGAGGAGACAGTGAGCCACATCTCATCATCCAATCTGCCACTGCCTCTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGACAGTGAGCCACATCTCATCATCCAATCTGCCACTGCCTCTCA  850

seq1  GAGGCATCCATTATTATGTTATAACCATGGGACCCAGACACTTGGAGCAA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAGGCATCCATTATTATGTTATAACCATGGGACCCAGACACTTGGAGC-A  899

seq1  AACAGACCTGTGGGTTGGCTGTAAAATCCTGTTCCAAACTTCAGTCGCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGACCTGTGGGTTGGCTGTAAAATCCTGTTCCAAACTTCAGTCGCTA  949

seq1  TGGACAGAGAAGGGGCCAAACAAGATACTCATTTG-TTTAAGACCCAGTG  999
      ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||
seq2  TGGACAGAGA--GGGCCAAAC-AGATACTCATTTGTTTTAGGACTCAGTG  996

seq1  ACATGATAAAACAAAGGCAAGCAGAGGCAGGGAGAC-TTCATAGAGCTCA  1048
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| 
seq2  ACATGATAAAACAAAGGCAAGCAGAGCCAGGGAGACTTTCATAGAGCTCC  1046

seq1  CAAGCTCTTGGGAGTTTGCCACATGCCTGGAGCCAGTGGAGAAACATGAA  1098
        |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |
seq2  ACAGCTCTTGGGAG-TTGCCACATGCCT-GAG-CAGTGGAG-AACATG-A  1091

seq1  GACAGACTCTGAGCCTTCTCACTTATGA-CAACACTGGATGCAGATTCCC  1147
      ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||| || |  |
seq2  GACAGACTCTGA--CTTCTCAC-TATGACCAACACTGGATGCCGAAT-TC  1137

seq1  CTGTGA  1153
      ||||||
seq2  CTGTGA  1143


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |