BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-268J11
Chromosome4 (Build37)
Map Location 147,663,557 - 147,762,430
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC666581, EG666588, LOC627701, OTTMUSG00000010671, LOC545718, OTTMUSG00000010673, 2610305D13Rik, LOC666618, LOC100043100, LOC666640, LOC194189, LOC666652, LOC100041677, LOC277692, MGC67181, D4Wsu114e, Fv1, Mfn2, Plod1, 2510039O18Rik, Nppb, Nppa, Clcn6, Mthfr, LOC433806, Agtrap, 2610109H07Rik, Mad2l2, Fbxo6, Fbxo44, Fbxo2, Ptchd2
Downstream geneUbiad1, Frap1, Angptl7, Exosc10, LOC100043151, Srm, Masp2, Tardbp, Gm572, LOC100041733, LOC100041742, LOC100041755, Casz1, Pex14, LOC670864, Dffa, Cort, Apitd1, LOC666774, Pgd, Kif1b, LOC100041794, Ube4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-268J11.bB6Ng01-268J11.g
ACCGA071409GA071410
length467963
definitionB6Ng01-268J11.b B6Ng01-268J11.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,663,557 - 147,664,027)(147,761,473 - 147,762,430)
sequence
atgccatcctgaagacattagggttatgaaatgctcctggcaggaaggat
ccaagaaaggggagagagagagagagagagagagagagagagagagagag
agagagagagagagagagagagtatgaatagatagatagatagatagata
gatagatagatagatagatagatagatagatagatagatactaagaccta
gaatggcgggtgtgtatattactgccacaggagcagaagcccaaagtggt
actctagataaaacagccccgaagtgccttgcaaatgtccagctccaccc
aacatatcccaggggaaggcagagaaagaggagccacgggggagggtggg
aggaaggagaaccagggtaatatttgtttctaagggagcagtgggagaca
caaagtgttcccaagcccagctgagagcataggctgcttttttgggtgaa
tggctcaattcttctca
gaattcacttctctctgtcttccccttcacttggggtgatcgaggcagta
cagtgacacccagtcacgggtagctgtgacaaacgcatgaggtgatgtct
acaggagccttttgggaggtaaggcccagcacggattgctatgaattcat
tggcagcttttatataacagttgaagtgtttttcacagggacacatagtt
cctgagatgcaccccaccctctgagccctccttcctggcttacagataca
ccttccaaattctgcccctgccctagaaacagagaccccgctggagccta
ctaaggtgggctggggtgggggatgcctcctggtgggccaactgaggagg
aggggagccccctccctgcagcctcctctgagctggagacactggggcac
gaggctttctttcatttgtccagcccctgcttactaaatggcagcttggg
caggcagtgtgctgagtctgggtgctgggtctgggtctgggtgctgggtc
tgggactggggtctgggactgggcctgggactgggcctgggcctgggact
gggactgggtctgggtctgggtgctgggtctgggacttgggtctgggact
gggactgggactgggactgggactgggactgggactgggactgggtctgg
tgctgggtgctgggtgctgggtctgggtctgggactgggcctgggactgg
gactgggtctgggtctgggtgctgggtctgggactggggtctgggactgg
gactgggactggggtctgggactgggactgggactgggactgggactggg
actgggtcttgtgctgggttgctgggtgcttgggtctgggtctgggactg
ggacttgggactgggactgggtctgggactggaactgggtctgggtctgg
gtgctggttctggactggggtctgggactgtgactgacactgacactggg
agtgggactggtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_147663557_147664027
seq2: B6Ng01-268J11.b_46_518

seq1  GAATTCATGCCATCCTGAAGACATTAGGGTTATGAAATGCTCCTGGCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGCCATCCTGAAGACATTAGGGTTATGAAATGCTCCTGGCAGG  50

seq1  AAGGATCCAAGAAAGGG--GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  98
      |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATCCAAGAAAGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  100

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATGAATAGATAGATAGATAGA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTATGAATAGATAGATAGATAGA  150

seq1  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACTAA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACTAA  200

seq1  GACCTAGAATGGCGGGTGTGTATATTACTGCCACAGGAGCAGAAGCCCAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTAGAATGGCGGGTGTGTATATTACTGCCACAGGAGCAGAAGCCCAA  250

seq1  AGTGGTACTCTAGATAAAACAGCCCCGAAGTGCCTTGCAAATGTCCAGCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTACTCTAGATAAAACAGCCCCGAAGTGCCTTGCAAATGTCCAGCT  300

seq1  CCACCCAACATATCCCAGGGGAAGGCAGAGAAAGAGGAGCCACGGGGGAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCAACATATCCCAGGGGAAGGCAGAGAAAGAGGAGCCACGGGGGAG  350

seq1  GGTGGGAGGAAGGAGAACCAGGGTAATATTTGTTTCTAAGGGAGCAGTGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGAGGAAGGAGAACCAGGGTAATATTTGTTTCTAAGGGAGCAGTGG  400

seq1  GAGACACAAAGTGTTCCCAAGCCCAGCTGAGAGCAGAGGCTGCTTTTCTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | 
seq2  GAGACACAAAGTGTTCCCAAGCCCAGCTGAGAGCATAGGCTGCTTTTTTG  450

seq1  GGTGAATGGCTCAGTTCTTCTCA  471
      ||||||||||||| |||||||||
seq2  GGTGAATGGCTCAATTCTTCTCA  473

seq1: chr4_147761473_147762430
seq2: B6Ng01-268J11.g_67_1026 (reverse)

seq1  CAGTCCCACTCCCAGTGTCAGTGTCAGTCCCAGTCCCAGACCCCAGTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  CAGTCCCACTCCCAGTGTCAGTGTCAGTCACAGTCCCAGACCCCAGT-CC  49

seq1  AGACCCAGCACCCAGACCCAGACCCAGTCCCAGTCCCAGACCCAGTCCCA  100
      ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCAGCACCCAGACCCAGACCCAGTTCCAGTCCCAGACCCAGTCCCA  99

seq1  GTCCC-AGTCCCAGTCCCAGACCCAGACCC-AGCACCCAGC-ACCCAGCA  147
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  GTCCCAAGTCCCAGTCCCAGACCCAGACCCAAGCACCCAGCAACCCAGCA  149

seq1  CCAGACCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCC  197
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCC  199

seq1  CAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCCCAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCCCAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACC  249

seq1  CAGACCCAGTCCCAGTCCCAGGCCCAGTCCCAGACCCAGACCCAGCACCC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCCAGTCCCAGTCCCAGGCCCAGTCCCAGACCCAGACCCAGCACCC  299

seq1  AGCACCCAGCACCAGACCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCCAGCACCAGACCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCAGTCCCA  349

seq1  GTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCCAAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACCCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGTCCCAGTCCCAGACCCAAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACCCA  399

seq1  GACCCAGTCCCAGTCCCAAGCCCAGGCCCAGTCCCAGGCCCAGTCCCAGA  447
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCAGTCCCAGTCCCAGGCCCAGGCCCAGTCCCAGGCCCAGTCCCAGA  449

seq1  CCCCAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACCCAGACCCAGCACCCAGACTCAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTCCCAGACCCAGCACCCAGACCCAGACCCAGCACCCAGACTCAG  499

seq1  CACACTGCCTGCCCAAGCTGCCATTTAGTAAGCAGGGGCTGGACAAATGA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGCCTGCCCAAGCTGCCATTTAGTAAGCAGGGGCTGGACAAATGA  549

seq1  AAGAAAGCCTCGTGCCCCAGTGTCTCCAGCTCAGAGGAGGCTGCAGGGAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGCCTCGTGCCCCAGTGTCTCCAGCTCAGAGGAGGCTGCAGGGAG  599

seq1  GGGGCTCCCCTCCTCCTCAGTTGGCCCACCAGGAGGCATCCCCCACCCCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTCCCCTCCTCCTCAGTTGGCCCACCAGGAGGCATCCCCCACCCCA  649

seq1  GCCCACCTTAGTAGGCTCCAGCGGGGTCTCTGTTTCTAGGGCAGGGGCAG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACCTTAGTAGGCTCCAGCGGGGTCTCTGTTTCTAGGGCAGGGGCAG  699

seq1  AATTTGGAAGGTGTATCTGTAAGCCAGGAAGGAGGGCTCAGAGGGTGGGG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGGAAGGTGTATCTGTAAGCCAGGAAGGAGGGCTCAGAGGGTGGGG  749

seq1  TGCATCTCAGGAACTATGTGTCCCTGTGAAAAACACTTCAACTGTTATAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCTCAGGAACTATGTGTCCCTGTGAAAAACACTTCAACTGTTATAT  799

seq1  AAAAGCTGCCAATGAATTCATAGCAATCCGTGCTGGGCCTTACCTCCCAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCTGCCAATGAATTCATAGCAATCCGTGCTGGGCCTTACCTCCCAA  849

seq1  AAGGCTCCTGTAGACATCACCTCATGCGTTTGTCACAGCTACCCGTGACT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCTCCTGTAGACATCACCTCATGCGTTTGTCACAGCTACCCGTGACT  899

seq1  GGGTGTCACTGTACTGCCTCGATCACCCCAAGTGAAGGGGAAGACAGAGA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTCACTGTACTGCCTCGATCACCCCAAGTGAAGGGGAAGACAGAGA  949

seq1  GAAGTGAATTC  958
      |||||||||||
seq2  GAAGTGAATTC  960