BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271K06
Chromosome4 (Build37)
Map Location 131,684,768 - 131,854,191
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOprd1, LOC664894, Ythdf2, LOC664903, Gmeb1, Rnu11, Taf12
Upstream geneGm831, EG664832, LOC100039799, Ptpru, Mecr, Sfrs4, EG664865, EG623230, Epb4.1, LOC666480, LOC100039835
Downstream gene9530096D07Rik, LOC100039864, Trspap1, Rcc1, Snhg3, Phactr4, Med18, Sesn2, Atpif1, Dnajc8, Ptafr, Eya3, Xkr8, Smpdl3b, Rpa2, BC013712, LOC100039917, Ppp1r8, Stx12, OTTMUSG00000010099, BC008163, Fgr, Ahdc1, LOC100041932, Wasf2, Gpr3, Cd164l2, Fcnc-ps, Map3k6, Sytl1, D4Ertd196e, LOC100041990, LOC100042018, Wdtc1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271K06.bB6Ng01-271K06.g
ACCGA073668GA073669
length7151,055
definitionB6Ng01-271K06.b B6Ng01-271K06.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(131,853,477 - 131,854,191)(131,684,768 - 131,685,823)
sequence
gaattcttcctcagaaggctccctcaagggtttatctttggtccaaataa
ctacagcaatatcccagatagccctttctgtctgtttctaactacaccct
gcacccagcaatgcttttttttttttttggtcactagaggcatacctgcc
ttcacccaaaacttcctggcctctgactatctgcacagacccctgctcta
catgtcaatcttttttttttttttttttttttttgaaacagggtttctct
gtatagccctggctgtcctggagctcactttgtaaaccaggctggcctcg
aactcaaaaatccgcttgcctctgcctcccgagtgctgggattaaagggg
tgcgccatcacacccggctcatgtcaatctttttatttggttggctggtt
tttgaaacagggtctctctacatagccctaaatatcctggaacttaccat
gtagaccaggttagccttgaactcacagaaagaaaagggatgtgccaata
caaccagccaacatgccagtctttttaaaaaatacatttcttttcctgtg
aggtaggttttctctgtgtaacagccctagctaacctgaactcactttgt
agaccaggttggccttaaacttacctgcttcaaccaccccagtgctggga
ttaaaggcatgtaccaccacactggctttttaatttatcaatctctctat
caatctatctatcta
gaattcactctgtagagcaggctggccttgaactcagagatccacctgcc
tcagctgggattaaaggtgggcagcaccacggtccagacacttgtggacg
ggcttacatgctggggacacacaagtcattctccactgaaccagcaaagc
cacaggaacatcactatcccctttttacaggtggagaaggctgaggggtg
gagaggtgaagctgactagcaggccttaagttaggtctccagttcctggg
attctaaaattcaagttcaatccctttgttttacaaatgaaggctctgag
gctgtgctatagcagtgaccccagaggctgggtgcacagagagggaacag
agatgagtcaacaaagcctgcaccagcagcccaggggtccagctggagct
ccctttatttgcagacaaagggtgattgctctcccaaaggacaaaacaag
cctggtcgggcaaggaggacgacagcaaactgtgtccctgcccaccactt
aagagggatggcacttggccagaaattaattagctgtctcagtttggcag
aacccggagaaggaaagtggttaattataatgaagcccagagagcttgct
tatcaaggggaagattatggccaggcctcggaagcaaaaggcccccccga
gttgaacgtgagtggagagacctgccaggctatagttagcagcaaccagg
ctaaaggcctagcttccattggaaacccaaagcacactcaaagagttctc
ccttccctcatcctgaccctgcttaaggatggctggagtgtggggtgaac
tgtatccagatagtgtggaagaatctggggctggagatctgatggctcac
ttaggaaagtgttttctgtgtgagcatggggacctgagttcagtccccag
gagtcacagaaacaagacaggtgtggtggggctgaggaggcaagacagac
atttgctgggacatgctggctgggtacacagcttccagtgaggagatcct
atctcaaaaaacaaggtgttggctctagagcacgaccaccttgagctgat
actag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_131853477_131854191
seq2: B6Ng01-271K06.b_44_758 (reverse)

seq1  TAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAAAATAAAAAGCCAGTGTGGT  50
      ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGATAGATAGATTGATAGAGAGATTGATAAATTAAAAAGCCAGTGTGGT  50

seq1  GGTACATGCCTTTAATCCCAGCACTGGGGTGGTTGAAGCAGGTAAGTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACATGCCTTTAATCCCAGCACTGGGGTGGTTGAAGCAGGTAAGTTTA  100

seq1  AGGCCAACCTGGTCTACAAAGTGAGTTCAGGTTAGCTAGGGCTGTTACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCAACCTGGTCTACAAAGTGAGTTCAGGTTAGCTAGGGCTGTTACAC  150

seq1  AGAGAAAACCTACCTCACAGGAAAAGAAATGTATTTTTTAAAAAGACTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAAACCTACCTCACAGGAAAAGAAATGTATTTTTTAAAAAGACTGG  200

seq1  CATGTTGGCTGGTTGTATTGGCACATGCCTTTTCTTTCTGTGAGTTCAAG  250
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTGGCTGGTTGTATTGGCACATCCCTTTTCTTTCTGTGAGTTCAAG  250

seq1  GCTAACCTGGTCTACATGGTAAGTTCCAGGATATCTAGGGCTATGTAGAG  300
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCTAACCTGGTCTACATGGTAAGTTCCAGGATATTTAGGGCTATGTAGAG  300

seq1  AGACCCTGTCTCAAAAACCAGCCAACCAAATAAAAAGATTGACATGAGCC  350
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTGTTTCAAAAACCAGCCAACCAAATAAAAAGATTGACATGAGCC  350

seq1  GGGTGTGATGGCGCACGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAA  400
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGTGATGGCGCACCCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAA  400

seq1  GCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGCTCCAGGA  450
      |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCGGATTTTTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTTTACAAAGTGAGCTCCAGGA  450

seq1  CAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  500
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA  500

seq1  AAAAAGATTGACATGTAGAGCAGGGGTCTGTGCAGATAGTCAGAGGCCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGATTGACATGTAGAGCAGGGGTCTGTGCAGATAGTCAGAGGCCAG  550

seq1  GAAGTTTTGGGTGAAGGCAGGTATGCCTCTAGTGACCAAAAAAAAAAAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTTGGGTGAAGGCAGGTATGCCTCTAGTGACCAAAAAAAAAAAAA  600

seq1  AGCATTGCTGGGTGCAGGGTGTAGTTAGAAACAGACAGAAAGGGCTATCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTGCTGGGTGCAGGGTGTAGTTAGAAACAGACAGAAAGGGCTATCT  650

seq1  GGGATATTGCTGTAGTTATTTGGACCAAAGATAAACCCTTGAGGGAGCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATATTGCTGTAGTTATTTGGACCAAAGATAAACCCTTGAGGGAGCCT  700

seq1  TCTGAGGAAGAATTC  715
      |||||||||||||||
seq2  TCTGAGGAAGAATTC  715

seq1: chr4_131684768_131685823
seq2: B6Ng01-271K06.g_64_1118

seq1  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCC  50

seq1  TCAGCTGGGATTAAAGGTGGGCAGCACCACGGTCCAGACACTTGTGGACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTGGGATTAAAGGTGGGCAGCACCACGGTCCAGACACTTGTGGACG  100

seq1  GGCTTACATGCTGGGGACACACAAGTCATTCTCCACTGAACCAGCAAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTACATGCTGGGGACACACAAGTCATTCTCCACTGAACCAGCAAAGC  150

seq1  CACAGGAACATCACTATCCCCTTTTTACAGGTGGAGAAGGCTGAGGGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGAACATCACTATCCCCTTTTTACAGGTGGAGAAGGCTGAGGGGTG  200

seq1  GAGAGGTGAAGCTGACTAGCAGGCCTTAAGTTAGGTCTCCAGTTCCTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTGAAGCTGACTAGCAGGCCTTAAGTTAGGTCTCCAGTTCCTGGG  250

seq1  ATTCTAAAATTCAAGTTCAATCCCTTTGTTTTACAAATGAAGGCTCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAAAATTCAAGTTCAATCCCTTTGTTTTACAAATGAAGGCTCTGAG  300

seq1  GCTGTGCTATAGCAGTGACCCCAGAGGCTGGGTGCACAGAGAGGGAACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGCTATAGCAGTGACCCCAGAGGCTGGGTGCACAGAGAGGGAACAG  350

seq1  AGATGAGTCAACAAAGCCTGCACCAGCAGCCCAGGGGTCCAGCTGGAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGTCAACAAAGCCTGCACCAGCAGCCCAGGGGTCCAGCTGGAGCT  400

seq1  CCCTTTATTTGCAGACAAAGGGTGATTGCTCTCCCAAAGGACAAAACAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTATTTGCAGACAAAGGGTGATTGCTCTCCCAAAGGACAAAACAAG  450

seq1  CCTGGTCGGGCAAGGAGGACGACAGCAAACTGTGTCCCTGCCCACCACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCGGGCAAGGAGGACGACAGCAAACTGTGTCCCTGCCCACCACTT  500

seq1  AAGAGGGATGGCACTTGGCCAGAAATTAATTAGCTGTCTCAGTTTGGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGATGGCACTTGGCCAGAAATTAATTAGCTGTCTCAGTTTGGCAG  550

seq1  AACCCGGAGAAGGAAAGTGGTTAATTATAATGAAGCCCAGAGAGCTTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCGGAGAAGGAAAGTGGTTAATTATAATGAAGCCCAGAGAGCTTGCT  600

seq1  TATCAAGGGGAAGATTATGGCCAGGCCTCGGAAGCAAAAGGCCCCCCCGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAGGGGAAGATTATGGCCAGGCCTCGGAAGCAAAAGGCCCCCCCGA  650

seq1  GTTGAACGTGAGTGGAGAGACCTGCCAGGCTATAGTTAGCAGCAACCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAACGTGAGTGGAGAGACCTGCCAGGCTATAGTTAGCAGCAACCAGG  700

seq1  CTAAAGGCCTAGCTTCCATTGGAAACCCAAAGCACACTCAAAGAGTTCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGCCTAGCTTCCATTGGAAACCCAAAGCACACTCAAAGAGTTCTC  750

seq1  CCTTCCCTCATCCTGACCCTGCTTAAGGATGGCTGGAGTGTGGGGTGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCTCATCCTGACCCTGCTTAAGGATGGCTGGAGTGTGGGGTGAAC  800

seq1  TGTATCCAGATAGTGTGGAAGAATCTGGGGCTGGAGATCTGATGGCTCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCCAGATAGTGTGGAAGAATCTGGGGCTGGAGATCTGATGGCTCAC  850

seq1  TTAGGAAAGTGTTTTCTGTGTGAGCATGGGGACCTGAGTTCAGTCCCCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAAGTGTTTTCTGTGTGAGCATGGGGACCTGAGTTCAGTCCCCAG  900

seq1  GAGTCACAGAAACAAGACAGGTGTGGT-GGGCTGAGGAGGCAAGACAGAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCACAGAAACAAGACAGGTGTGGTGGGGCTGAGGAGGCAAGACAGAC  950

seq1  ATTTGCTGGGACATGCTGGCTGGGTACACAGCTTCCAGTGA-GAGATCCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATTTGCTGGGACATGCTGGCTGGGTACACAGCTTCCAGTGAGGAGATCCT  1000

seq1  ATCTCAAAAAAACAAGGTGGTTGGTTCTAGAGGCACGA-CACCCTGAGGC  1047
      ||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||| ||
seq2  ATCTC-AAAAAACAAGGT-GTTGGCTCTAGA-GCACGACCACCTTGA-GC  1046

seq1  TGATACTAG  1056
      |||||||||
seq2  TGATACTAG  1055