BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-274A03
Chromosome4 (Build37)
Map Location 62,639,447 - 62,763,951
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp618
Upstream geneLOC546832, OTTMUSG00000007485, Mup3, LOC100039345, OTTMUSG00000000231, Zfp37, Slc31a2, Fkbp15, Slc31a1, Cdc26, Prpf4, Rnf183, Wdr31, Bspry, Hdhd3, Alad, Pole3, 4933430I17Rik, Rgs3
Downstream geneAmbp, Kif12, Col27a1, Orm1, Orm-ps, Orm3, Orm2, Akna, Whrn, Atp6v1g1, 6330416G13Rik, LOC670833, 1700018C11Rik, LOC667451, Tnfsf15, Tnfsf8, Rpl17-ps, Tnc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-274A03.bB6Ng01-274A03.g
ACCGA075426GA075427
length1,137809
definitionB6Ng01-274A03.b B6Ng01-274A03.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,762,807 - 62,763,951)(62,639,447 - 62,640,252)
sequence
gaattcttagaacagtgccggacatatcctagtctctggtctcaaaagct
ccagccctggtgctaagaagaccccagctggatccccaagccaacctttc
catcagcctttctgtaagccttgcccactgctggggtcacaaccatggtc
ccttatctccagggtagccccacccaccagagctgaggtcctacttctta
gtcctcactaggtttaaatttgtttgtttattgttatgtgtgtctgaggt
atatgtgggtgcatatgtgctgcagagtacaggtagaggtcagagaacaa
ctttatgtggttctctctttccaccttttcatgcgttctggggatcaagc
tcaggtatcaggcacgaggtaatgaggcaagcattttatccctgagccat
cttgctggtccatcatagactcttaccattatatttctctaggttctgtc
taaatcctcctttaaagatgtctaatgtaaaatggttcatctggggacag
ttataaaatattgataaacacaagctcaacgatttttaaaggagcaagtg
ccatcttctacaatccctataccaaggggaacatcatctcacaggacatc
aacagctgccccgccctgccccacacccctccaccctcccctctggtgtt
tctctgctgctaccatttgtctggctcctatggccttgaattagccatcc
ctgatcgatatcctctttgtaacctagtgtattcaatcgacaatactttg
tggacatcttgcccaatcaataagtattgatctccaggactgcctttatt
ggatacatggctcccatgggacttgggaatttgctgagccagttgccctc
caccaagggacattcagttgttgcaagtcactccctcccttattaaaaag
cgctggcatccacacccttgcagggcttctgcacatctggtacgtgatct
aaaaacagtcactgcttagagcctgcccatgacttcctaggctaggtggg
caggatgccttctggaaggctctgctaactcggcaccaccacccaaccat
acctgcactattaccacctcctctattttgcattttcttgaactgggagg
ggaggaaccagtacactacacgtcatttacttttctt
gaattccaggccctgtctgagctgcaagctcctgttctgttccatggcct
gggaaggtgcagtgatacacgcgcagtgggtagagttcttggctgggctg
gacttaagcctaagtcctgtagaccccgctactctgccgttcaccttcgc
tgtgatggattggggaaactgctccctattctgttcagcacaggctcagg
accccctggcttttattccccacatctttaacaagcctcagcaggccagc
ggggtgtgttctgtgtgcacaaagcctttaatacggcgtttgaaaacagt
tgcaggtttgctctaattaattacatttgacatacttggaaccagggcct
cccggttgcagaatgcaaatttctacccagacagatgtaaggtatgttcg
cagccaagagctctggtgtgtcccagccaggcctgccaatgttgctcacg
ctcctcgggggacagtggcagacagtgagaagtggagtcaagattcaacc
ctggggatgtcgggagcccacaggcagttggaattaggtctccagtctcg
ggtaatccttttcccttctttgagcctcagtttctcaggctgtacaattt
gagctttggctgggtgtagtcggaagctatgtgctgttcacttgttcagg
ggaaggaaggcaattagagaagtgggtaaatggctggagtctagaaatac
aaattggtgaggggagggagggttgaatagtgagagaatcaggaggcctt
agaacaaatggatcttgagaataggatagggtggcttgtttattttgctg
ccccttgcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_62762807_62763951
seq2: B6Ng01-274A03.b_46_1182 (reverse)

seq1  AAGAAAAGGAAAATAAACGTGTAGTGTAATTGGTTCCT-CCCTCCCAGGT  49
      |||||||| |||    ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |
seq2  AAGAAAAGTAAA--TGACGTGTAGTGT-ACTGGTTCCTCCCCTCCCAGTT  47

seq1  CA--GAGATGCAAAATAGA-GAGGTGGTAATAGTGCAGGGTATGGTTGGG  96
      ||   | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAAGAAAATGCAAAATAGAGGAGGTGGTAATAGTGCA-GGTATGGTTGGG  96

seq1  TGGTGGTGCCGAGGTTAGCAGAAGCCTCCAGAAGGGCATCCTTGCCCACC  146
      |||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||
seq2  TGGTGGTGCCGA-GTTAGCAGAGCCTTCCAGAA-GGCATCC-TGCCCACC  143

seq1  TAGCCCTAGGAAGTCATGGGCAGGCTCCTAAGCAGTGACTGTTTTTTAGA  196
      ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||
seq2  TAG-CCTAGGAAGTCATGGGCAGGCT-CTAAGCAGTGACTG-TTTTTAGA  190

seq1  TCACGTACCAGATGTGCAGAAGCCCCTGCAAGGGTGTGGATGCCAGCGCT  246
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGTACCAGATGTGCAGAAG-CCCTGCAAGGGTGTGGATGCCAGCGCT  239

seq1  TTTTAATAAGGGAGGGAGTGACTTGCAACAACCTGAATGTCCCTTGGTGG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATAAGGGAGGGAGTGACTTGCAACAA-CTGAATGTCCCTTGGTGG  288

seq1  AGGGCAACTGGCTCAGCAAATTCCCAAGTCCCATGGGAGCCATGTATCCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAACTGGCTCAGCAAATTCCCAAGTCCCATGGGAGCCATGTATCCA  338

seq1  ATAAAGGCAGTCCTGGAGATCAATACTTATTGATTGGGCAAGATGTCCAC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGGCAGTCCTGGAGATCAATACTTATTGATTGGGCAAGATGTCCAC  388

seq1  AAAGTATTGTCGATTGAATACACTAGGTTACAAAGAGGATATCGATCAGG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTATTGTCGATTGAATACACTAGGTTACAAAGAGGATATCGATCAGG  438

seq1  GATGGCTAATTCAAGGCCATAGGAGCCAGACAAATGGTAGCAGCAGAGAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTAATTCAAGGCCATAGGAGCCAGACAAATGGTAGCAGCAGAGAA  488

seq1  ACACCAGAGGGGAGGGTGGAGGGGTGTGGGGCAGGGCGGGGCAGCTGTTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAGAGGGGAGGGTGGAGGGGTGTGGGGCAGGGCGGGGCAGCTGTTG  538

seq1  ATGTCCTGTGAGATGATGTTCCCCTTGGTATAGGGATTGTAGAAGATGGC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCTGTGAGATGATGTTCCCCTTGGTATAGGGATTGTAGAAGATGGC  588

seq1  ACTTGCTCCTTTAAAAATCGTTGAGCTTGTGTTTATCAATATTTTATAAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCTCCTTTAAAAATCGTTGAGCTTGTGTTTATCAATATTTTATAAC  638

seq1  TGTCCCCAGATGAACCATTTTACATTAGACATCTTTAAAGGAGGATTTAG  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCCAGATGAACCATTTTACATTAGACATCTTTAAAGGAGGATTTAG  688

seq1  ACAGAACCTAGAGAAATATAATGGTAAGAGTCTATGATGGACCAGCAAGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAACCTAGAGAAATATAATGGTAAGAGTCTATGATGGACCAGCAAGA  738

seq1  TGGCTCAGGGATAAAATGCTTGCCTCATTACCTCGTGCCTGATACCTGAG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCAGGGATAAAATGCTTGCCTCATTACCTCGTGCCTGATACCTGAG  788

seq1  CTTGATCCCCAGAACGCATGAAAAGGTGGAAAGAGAGAACCACATAAAGT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATCCCCAGAACGCATGAAAAGGTGGAAAGAGAGAACCACATAAAGT  838

seq1  TGTTCTCTGACCTCTACCTGTACTCTGCAGCACATATGCACCCACATATA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCTGACCTCTACCTGTACTCTGCAGCACATATGCACCCACATATA  888

seq1  CCTCAGACACACATAACAATAAACAAACAAATTTAAACCTAGTGAGGACT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAGACACACATAACAATAAACAAACAAATTTAAACCTAGTGAGGACT  938

seq1  AAGAAGTAGGACCTCAGCTCTGGTGGGTGGGGCTACCCTGGAGATAAGGG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGTAGGACCTCAGCTCTGGTGGGTGGGGCTACCCTGGAGATAAGGG  988

seq1  ACCATGGTTGTGACCCCAGCAGTGGGCAAGGCTTACAGAAAGGCTGATGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGGTTGTGACCCCAGCAGTGGGCAAGGCTTACAGAAAGGCTGATGG  1038

seq1  AAAGGTTGGCTTGGGGATCCAGCTGGGGTCTTCTTAGCACCAGGGCTGGA  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTTGGCTTGGGGATCCAGCTGGGGTCTTCTTAGCACCAGGGCTGGA  1088

seq1  GCTTTTGAGACCAGAGACTAGGATATGTCCGGCACTGTTCTAAGAATTC  1145
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTGAGACCAGAGACTAGGATATGTCCGGCACTGTTCTAAGAATTC  1137

seq1: chr4_62639447_62640252
seq2: B6Ng01-274A03.g_63_871

seq1  GAATTCCAGGCCCTGTCTGAGCTGCAAGCTCCTGTTCTGTTCCATGGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCCCTGTCTGAGCTGCAAGCTCCTGTTCTGTTCCATGGCCT  50

seq1  GGGAAGGTGCAGTGATACACGCGCAGTGGGTAGAGTTCTTGGCTGGGCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGGTGCAGTGATACACGCGCAGTGGGTAGAGTTCTTGGCTGGGCTG  100

seq1  GACTTAAGCCTAAGTCCTGTAGACCCCGCTACTCTGCCGTTCACCTTCGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTAAGCCTAAGTCCTGTAGACCCCGCTACTCTGCCGTTCACCTTCGC  150

seq1  TGTGATGGATTGGGGAAACTGCTCCCTATTCTGTTCAGCACAGGCTCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGGATTGGGGAAACTGCTCCCTATTCTGTTCAGCACAGGCTCAGG  200

seq1  ACCCCCTGGCTTTTATTCCCCACATCTTTAACAAGCCTCAGCAGGCCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCTGGCTTTTATTCCCCACATCTTTAACAAGCCTCAGCAGGCCAGC  250

seq1  GGGGTGTGTTCTGTGTGCACAAAGCCTTTAATACGGCGTTTGAAAACAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGTGTTCTGTGTGCACAAAGCCTTTAATACGGCGTTTGAAAACAGT  300

seq1  TGCAGGTTTGCTCTAATTAATTACATTTGACATACTTGGAACCAGGGCCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGGTTTGCTCTAATTAATTACATTTGACATACTTGGAACCAGGGCCT  350

seq1  CCCGGTTGCAGAATGCAAATTTCTACCCAGACAGATGTAAGGTATGTTCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGTTGCAGAATGCAAATTTCTACCCAGACAGATGTAAGGTATGTTCG  400

seq1  CAGCCAAGAGCTCTGGTGTGTCCCAGCCAGGCCTGCCAATGTTGCTCACG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAAGAGCTCTGGTGTGTCCCAGCCAGGCCTGCCAATGTTGCTCACG  450

seq1  CTCCTCGGGGGACAGTGGCAGACAGTGAGAAGTGGAGTCAAGATTCAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCGGGGGACAGTGGCAGACAGTGAGAAGTGGAGTCAAGATTCAACC  500

seq1  CTGGGGATGTCGGGAGCCCACAGGCAGTTGGAATTAGGTCTCCAGTCTCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGATGTCGGGAGCCCACAGGCAGTTGGAATTAGGTCTCCAGTCTCG  550

seq1  GGTAATCCTTTTCCCTTCTTTGAGCCTCAGTTTCTCAGGCTGTACAATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATCCTTTTCCCTTCTTTGAGCCTCAGTTTCTCAGGCTGTACAATTT  600

seq1  GAGCTTTGGCTGGGTGTAGTCGGAAGCTATGTGCTGTTCACTTGTTCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTTGGCTGGGTGTAGTCGGAAGCTATGTGCTGTTCACTTGTTCAGG  650

seq1  GGAAGGAAGGCAATTAGAGAAGTGGGTAAATGGCTGGAGTCTAGAAATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGAAGGCAATTAGAGAAGTGGGTAAATGGCTGGAGTCTAGAAATAC  700

seq1  AAATTGGTGAGGGGAGGGAGGGTTGAATAGTGAGAGAATCAGGAGGCCAT  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAATTGGTGAGGGGAGGGAGGGTTGAATAGTGAGAGAATCAGGAGGCCTT  750

seq1  AGAACAAATGGATC-TGAG-AGAGGATAGGG-GGCTTGGCACAGTTGCTG  797
      |||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||      ||||||
seq2  AGAACAAATGGATCTTGAGAATAGGATAGGGTGGCTTGTTTATTTTGCTG  800

seq1  CCCCTTGCC  806
      |||||||||
seq2  CCCCTTGCC  809