BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-284A21
Chromosome4 (Build37)
Map Location 12,223,422 - 12,351,128
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDpy19l4, Rbm35a, LOC634834, 1110037F02Rik, LOC100039847, E130016E03Rik, LOC100039862, Gem, Cdh17, Ppm2c, Tmem67, C430048L16Rik, LOC230010, LOC623671, LOC100039958, Rbm12b, 6720467C03Rik, LOC545592
Downstream geneOTTMUSG00000004461
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-284A21.bB6Ng01-284A21.g
ACCGA082853GA082854
length6931,067
definitionB6Ng01-284A21.b B6Ng01-284A21.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,350,436 - 12,351,128)(12,223,422 - 12,224,493)
sequence
gaattcatagagtttgaatgagtctccccataaagccaggtcccaaagta
gagagccagcctagatcatagtgccttagggttgataggaacactgctgc
ccagaaatatgttacaaagcaatacaaacttttgtttgatgttcaaatta
ttgcttagatgagaaattcattattctgagagaactgctggtacaattga
tccattttccccgactttgcaagaatttcctgaagccaataataaaactt
gtgttttgttttttttgtgtgtgtgtgtgttagtcctttagtcacctgta
agttggagaagataaccagtcttattggcacagaccgtcggttctcagtt
tcttactgtgtcttgactcagctccactcaagctgtggtgtgtacatact
aagatcttattgtgtggtaataggaatgtggtacagttgcttgtctgctg
ctaatactctttatactcagagtttgaggtccctaaagtcaaccccaaat
cactggactcccccagaataaaagaacaaagataatgcagaggtgcaaag
tgaagattgtccaggtggtagatcaagaggaaactgaaggaaaagtcacc
aaagttcaaggtcaatcctgcctgtcattctccctctccctctccctctc
cccctccctcaccctctctctccctccattccctccttctccc
gaattcctgcctgtgcctaatggctcaaccatgaagtgctgtaaaaaggg
gtgggtaacacagatccaagggttaaacattatgaactgtctacagtggg
acagaatgctgatggaagagacagtgctgagatacaggtgtcaacagaat
gttcaaaccagtgacgccccttggacttgtgcaatgtaatagactctgca
tggccttaccgctaggtataaaaatcttggtgtttagagataaaaatcct
attccagctggaggctgtgacttttctctaggcagacactgctgccactg
caaggcaaaactccatttatctgggaactaaggtgccaatatcagtatga
acccagaagctgaaatggcattttaccaagtatgcaggctagggccccat
ggttctgaatgcttcctgacataggcagaagggcaagcttggtgccagca
tctggaacaggagcagggtttacagaatcgctttaagtagatttagggct
caaaactgagatagaagggaggcagggagccaaacaggtttcagagatca
ccttgtatttaggtgtcttgtgcctgggcttgactattctagaagctacc
agctagagttcccctatagtagtatatccatgaaccacagcaacaggtgg
ctttggtcattgctgaagttcaagaatgctcagggtgtctgagtgggtaa
gggataaggttggataaccatgctcagcctggaaagcagtgcttgacccg
tttattagctcacgggcatggacctactctgttgtaaacgcccagatgat
atttaaagctcttcctaactttcacctcagtccaacgtaaacatatagtg
ttttcgtcatgggtacatggcatgcatgatgcagttatggagaaagaaga
gctgattaataagtgttgctcatgggattcagtcagtaactctatgactc
atagacctttcatatctgggactacattttgggatgtaaaagaaagataa
tttcatccatgcccagatttagaaacattttagatcttctgaggctctgg
tgtttattagttatttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_12350436_12351128
seq2: B6Ng01-284A21.b_44_736 (reverse)

seq1  GGGAGAGGGAGGGAATGGAGGGAGGGAGAGGGAGAGGGAGGGGGAGAGGG  50
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAGGAGGGAATGGAGGGAGAGAGAGGGTGAGGGAGGGGGAGAGGG  50

seq1  AGAGGGAGAGGGAGAATGACAGGCAGGATTGACCTTGAACTTTGGTGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGAGAGGGAGAATGACAGGCAGGATTGACCTTGAACTTTGGTGACT  100

seq1  TTTCCTTCAGTTTCCTCTTGATCTACCACCTGGACAATCTTCACTTTGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTCAGTTTCCTCTTGATCTACCACCTGGACAATCTTCACTTTGCA  150

seq1  CCTCTGCATTATCTTTGTTCTTTTATTCTGGGGGAGTCCAGTGATTTGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCATTATCTTTGTTCTTTTATTCTGGGGGAGTCCAGTGATTTGGG  200

seq1  GTTGACTTTAGGGACCTCAAACTCTGAGTATAAAGAGTATTAGCAGCAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACTTTAGGGACCTCAAACTCTGAGTATAAAGAGTATTAGCAGCAGA  250

seq1  CAAGCAACTGTACCACATTCCTATTACCACACAATAAGATCTTAGTATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCAACTGTACCACATTCCTATTACCACACAATAAGATCTTAGTATGT  300

seq1  ACACACCACAGCTTGAGTGGAGCTGAGTCAAGACACAGTAAGAAACTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACCACAGCTTGAGTGGAGCTGAGTCAAGACACAGTAAGAAACTGAG  350

seq1  AACCGACGGTCTGTGCCAATAAGACTGGTTATCTTCTCCAACTTACAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGACGGTCTGTGCCAATAAGACTGGTTATCTTCTCCAACTTACAGGT  400

seq1  GACTAAAGGACTAACACACACACACACAAAAAAAACAAAACACAAGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAAAGGACTAACACACACACACACAAAAAAAACAAAACACAAGTTTT  450

seq1  ATTATTGGCTTCAGGAAATTCTTGCAAAGTCGGGGAAAATGGATCAATTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTGGCTTCAGGAAATTCTTGCAAAGTCGGGGAAAATGGATCAATTG  500

seq1  TACCAGCAGTTCTCTCAGAATAATGAATTTCTCATCTAAGCAATAATTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGCAGTTCTCTCAGAATAATGAATTTCTCATCTAAGCAATAATTTG  550

seq1  AACATCAAACAAAAGTTTGTATTGCTTTGTAACATATTTCTGGGCAGCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCAAACAAAAGTTTGTATTGCTTTGTAACATATTTCTGGGCAGCAG  600

seq1  TGTTCCTATCAACCCTAAGGCACTATGATCTAGGCTGGCTCTCTACTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTATCAACCCTAAGGCACTATGATCTAGGCTGGCTCTCTACTTTG  650

seq1  GGACCTGGCTTTATGGGGAGACTCATTCAAACTCTATGAATTC  693
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTGGCTTTATGGGGAGACTCATTCAAACTCTATGAATTC  693

seq1: chr4_12223422_12224493
seq2: B6Ng01-284A21.g_67_1133

seq1  GAATTCCTGCCTGTGCCTAATGGCTCAACCATGAAGTGCTGTAAAAAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCCTGTGCCTAATGGCTCAACCATGAAGTGCTGTAAAAAGGG  50

seq1  GTGGGTAACACAGATCCAAGGGTTAAACATTATGAACTGTCTACAGTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGTAACACAGATCCAAGGGTTAAACATTATGAACTGTCTACAGTGGG  100

seq1  ACAGAATGCTGATGGAAGAGACAGTGCTGAGATACAGGTGTCAACAGAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATGCTGATGGAAGAGACAGTGCTGAGATACAGGTGTCAACAGAAT  150

seq1  GTTCAAACCAGTGACGCCCCTTGGACTTGTGCAATGTAATAGACTCTGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAACCAGTGACGCCCCTTGGACTTGTGCAATGTAATAGACTCTGCA  200

seq1  TGGCCTTACCGCTAGGTATAAAAATCTTGGTGTTTAGAGATAAAAATCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTACCGCTAGGTATAAAAATCTTGGTGTTTAGAGATAAAAATCCT  250

seq1  ATTCCAGCTGGAGGCTGTGACTTTTCTCTAGGCAGACACTGCTGCCACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAGCTGGAGGCTGTGACTTTTCTCTAGGCAGACACTGCTGCCACTG  300

seq1  CAAGGCAAAACTCCATTTATCTGGGAACTAAGGTGCCAATATCAGTATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGCAAAACTCCATTTATCTGGGAACTAAGGTGCCAATATCAGTATGA  350

seq1  ACCCAGAAGCTGAAATGGCATTTTACCAAGTATGCAGGCTAGGGCCCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGAAGCTGAAATGGCATTTTACCAAGTATGCAGGCTAGGGCCCCAT  400

seq1  GGTTCTGAATGCTTCCTGACATAGGCAGAAGGGCAAGCTTGGTGCCAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTGAATGCTTCCTGACATAGGCAGAAGGGCAAGCTTGGTGCCAGCA  450

seq1  TCTGGAACAGGAGCAGGGTTTACAGAATCGCTTTAAGTAGATTTAGGGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAACAGGAGCAGGGTTTACAGAATCGCTTTAAGTAGATTTAGGGCT  500

seq1  CAAAACTGAGATAGAAGGGAGGCAGGGAGCCAAACAGGTTTCAGAGATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACTGAGATAGAAGGGAGGCAGGGAGCCAAACAGGTTTCAGAGATCA  550

seq1  CCTTGTATTTAGGTGTCTTGTGCCTGGGCTTGACTATTCTAGAAGCTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTATTTAGGTGTCTTGTGCCTGGGCTTGACTATTCTAGAAGCTACC  600

seq1  AGCTAGAGTTCCCCTATAGTAGTATATCCATGAACCACAGCAACAGGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAGTTCCCCTATAGTAGTATATCCATGAACCACAGCAACAGGTGG  650

seq1  CTTTGGTCATTGCTGAAGTTCAAGAATGCTCAGGGTGTCTGAGTGGGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGTCATTGCTGAAGTTCAAGAATGCTCAGGGTGTCTGAGTGGGTAA  700

seq1  GGGATAAGGTTGGATAACCATGCTCAGCCTGGAAAGCAGTGCTTGACCCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATAAGGTTGGATAACCATGCTCAGCCTGGAAAGCAGTGCTTGACCCG  750

seq1  TTTATTAGCTCACGGGCATGGACCTACTCTGTTGTAAACGCCCAGATGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTAGCTCACGGGCATGGACCTACTCTGTTGTAAACGCCCAGATGAT  800

seq1  ATTTAAAGCTCTTCCTAACTTTCACCTCAGTCCAACGTAAACATATAGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAGCTCTTCCTAACTTTCACCTCAGTCCAACGTAAACATATAGTG  850

seq1  TTTTCGTCATGGGTACATGGCATGCATGATGCAGTTATGGAGAAAGAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCGTCATGGGTACATGGCATGCATGATGCAGTTATGGAGAAAGAAGA  900

seq1  GCTGATTAATAAGTGTTGCTCATGGGATTCAGTCAGTAACTCTATGACTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGATTAATAAGTGTTGCTCATGGGATTCAGTCAGTAACTCTATGACTC  950

seq1  ATAGACCTTCCATATCTGGGACTACATTTTGGGAATGT-AAAGAAAGATA  999
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| 
seq2  ATAGACCTTTCATATCTGGGACTACATTTTGGG-ATGTAAAAGAAAGAT-  998

seq1  AATTTCAATTCCATGCCAAGATTTAGAAACATTTTAGATCTTCTGAAGCT  1049
      |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AATTTCA--TCCATGCCCAGATTTAGAAACATTTTAGATCTTCTGAGGCT  1046

seq1  CTGTGTTTTAATAATTTTATTTT  1072
      |||   |||| ||   |||||||
seq2  CTGGTGTTTATTA--GTTATTTT  1067