BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285P10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 62,487,701 - 62,642,208
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp618
Upstream geneMup5, LOC435785, LOC667295, LOC100039305, LOC546832, OTTMUSG00000007485, Mup3, LOC100039345, OTTMUSG00000000231, Zfp37, Slc31a2, Fkbp15, Slc31a1, Cdc26, Prpf4, Rnf183, Wdr31, Bspry, Hdhd3, Alad, Pole3, 4933430I17Rik, Rgs3
Downstream geneAmbp, Kif12, Col27a1, Orm1, Orm-ps, Orm3, Orm2, Akna, Whrn, Atp6v1g1, 6330416G13Rik, LOC670833, 1700018C11Rik, LOC667451, Tnfsf15, Tnfsf8, Rpl17-ps, Tnc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285P10.bB6Ng01-285P10.g
ACCGA084279GA084280
length1,0611,001
definitionB6Ng01-285P10.b B6Ng01-285P10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(62,641,145 - 62,642,208)(62,487,701 - 62,488,696)
sequence
gaattccatcccctggagccacacgggggaaggagagaatggatttccac
aagttgtcctctgacaaccacacatacacctctcccccacctgtgtacac
atagtaagtaaataaagggttaaaaaacaaaccgcttccaggaacctccc
aggagaagcaccttgttggggaggggcctggtaagttcaagtcctccctg
cccagtgtacatctttacagcccagcaatgggcttttcagggtagggacc
aggaacatctcctacaaaagaacagtgacatgtacagaggtttgtctcac
tgtgtggattatgatgaggaaaaatgagaggggaccaaaatctagtagac
actgaatttgggtatacacaaatggtggaaatacaggccagttaaaaaaa
tgtttatattcacagatgaaagatatcttgagttttaaaagcaaaaaagc
aagccagctacagaacagcatgcaaaatataatcccatttgtgtaaaact
gtaatcataaatacttaaatatgtagaaatgacttgaataacgttcatca
aaatgtgaacagtggttatctcaggattcaggtgatttttttttaaagaa
taatcttcctacttttcaagactgcgtgagtgtttttataatgaatgtgt
tatttttatagtcagaaaaaaataaacctatttccacttaggaaaaacaa
gagtggggaaacaactctggaaagacatttcacacttaagagaccaaact
gcagcctgtcttctctgtggagggagccagagaccgtgtggtcaagaagc
cccaggtttgagtctgaccctgatgcaaatcagtttgactcagcaagtca
attagccacttccttggttagttcctcgtgtgaaaacagagatggctttt
ctctgccacagaatctctttgaggataaagagagtaatcctggggaagtt
ctcagtaatcctggtttcttctcctttgaatcattgatgagtgcccctca
tggctcatactaggcatcagtatatattgaacaggatggatggattggaa
tgggtggatgg
gaattcattttcatagagcccagtaatagattgcccactggtaactcaga
ctgtagaaagcacacctctcaagggacaatgggaatatttactccaagtc
acggagggcaggaataaagtcagtgtagtctttggtattgactggaccag
tatgcaacagctggatggcttttatggttctgtggctttagagctggggt
cacatcacacatcctgactccaggtcagtactatcattaactggacatta
tcctatcatgtcagacccaacctcagattcctagtcaacacgacccagca
caccaagctctccagttcagccagctaagtgaaagctcacctaagaaaca
gaagtgctttctctaaaatacagggatagattatggattgaaaaccatga
gcactaagaaacaatacttatgcccaagtgtgtgtgtgtgggggggaggc
ataactgtgatcccaacaccctggtgggtgacaagatggaggccagcctg
ggctacagagagagaccttgtctcaaaactacacaacaaaatgataattg
gaagtaaggatttctgtctggggtggcagctgttcaagaggctgctgctg
tctcctcctccctggtggtgtccaggaacatggaaagtgagtctgcactg
gtatatggtatgtttgacagttcagacccatagctgtatccgaccatgca
ctttaacagttagggatggtgagtgaggctcaggaagaggacggagaaag
cacactgactgcttaactcaatgctcaacacctgaatggtcctgcctggg
gccaggaagtttgggtcattttcttctgctaaccaggttcctgggtcatg
aggtgtcattgggcattacgtccctttgcttttttgactcaaaccctgtt
taatattttgttcagcattccatcttgcaccttttgagtcagagggactc
acttatgggttcttggggtgaatatatccccaatacctacctgtagttgg
c
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_62641145_62642208
seq2: B6Ng01-285P10.b_46_1106 (reverse)

seq1  CCATCCACCCAT--CCATCCATCCATCCTGTTCAATATATACTGAATGCC  48
      ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCATCCACCCATTCCAATCCATCCATCCTGTTCAATATATACTG-ATGCC  49

seq1  TAGTATGAGCCATGAGGGGCACTCATCAATGAATTCAAAGGGAGAAGAAA  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  TAGTATGAGCCATGAGGGGCACTCATCAATG-ATTCAAA-GGAGAAGAAA  97

seq1  CCAGGATTAACTGAGAACTTCCCCAGGATTACTCTCTTTATCCTCAAAGA  148
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGATT-ACTGAGAACTTCCCCAGGATTACTCTCTTTATCCTCAAAGA  146

seq1  GATTCTGTGGCAGAGAAAAGCCATCTCTGTTTTCACACGAGGAACTAACC  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGTGGCAGAGAAAAGCCATCTCTGTTTTCACACGAGGAACTAACC  196

seq1  AAGGAAGTGGCTAATTGACTTGCCTGAGTCAAACTGATTTGCATCAGGGT  248
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGTGGCTAATTGACTTG-CTGAGTCAAACTGATTTGCATCAGGGT  245

seq1  CAGACTCAAACCTGGGGCTTCTTGACCACACGGTCTCTGGCTCCCTCCAC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTCAAACCTGGGGCTTCTTGACCACACGGTCTCTGGCTCCCTCCAC  295

seq1  AGAGAAGACAGGCTGCAGTTTGGTCTCTTAAGTGTGAAATGTCTTTCCAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGACAGGCTGCAGTTTGGTCTCTTAAGTGTGAAATGTCTTTCCAG  345

seq1  AGTTGTTTCCCCACTCTTGTTTTTCCTAAGTGGAAATAGGTTTATTTTTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGTTTCCCCACTCTTGTTTTTCCTAAGTGGAAATAGGTTTATTTTTT  395

seq1  TCTGACTATAAAAATAACACATTCATTATAAAAACACTCACGCAGTCTTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACTATAAAAATAACACATTCATTATAAAAACACTCACGCAGTCTTG  445

seq1  AAAAGTAGGAAGATTATTCTTTAAAAAAAAATCACCTGAATCCTGAGATA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTAGGAAGATTATTCTTTAAAAAAAAATCACCTGAATCCTGAGATA  495

seq1  ACCACTGTTCACATTTTGATGAACGTTATTCAAGTCATTTCTACATATTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTGTTCACATTTTGATGAACGTTATTCAAGTCATTTCTACATATTT  545

seq1  AAGTATTTATGATTACAGTTTTACACAAATGGGATTATATTTTGCATGCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATTTATGATTACAGTTTTACACAAATGGGATTATATTTTGCATGCT  595

seq1  GTTCTGTAGCTGGCTTGCTTTTTTGCTTTTAAAACTCAAGATATCTTTCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGTAGCTGGCTTGCTTTTTTGCTTTTAAAACTCAAGATATCTTTCA  645

seq1  TCTGTGAATATAAACATTTTTTTAACTGGCCTGTATTTCCACCATTTGTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGAATATAAACATTTTTTTAACTGGCCTGTATTTCCACCATTTGTG  695

seq1  TATACCCAAATTCAGTGTCTACTAGATTTTGGTCCCCTCTCATTTTTCCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCCAAATTCAGTGTCTACTAGATTTTGGTCCCCTCTCATTTTTCCT  745

seq1  CATCATAATCCACACAGTGAGACAAACCTCTGTACATGTCACTGTTCTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATAATCCACACAGTGAGACAAACCTCTGTACATGTCACTGTTCTTT  795

seq1  TGTAGGAGATGTTCCTGGTCCCTACCCTGAAAAGCCCATTGCTGGGCTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGAGATGTTCCTGGTCCCTACCCTGAAAAGCCCATTGCTGGGCTGT  845

seq1  AAAGATGTACACTGGGCAGGGAGGACTTGAACTTACCAGGCCCCTCCCCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGATGTACACTGGGCAGGGAGGACTTGAACTTACCAGGCCCCTCCCCA  895

seq1  ACAAGGTGCTTCTCCTGGGAGGTTCCTGGAAGCGGTTTGTTTTTTAACCC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTGCTTCTCCTGGGAGGTTCCTGGAAGCGGTTTGTTTTTTAACCC  945

seq1  TTTATTTACTTACTATGTGTACACAGGTGGGGGAGAGGTGTATGTGTGGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTACTTACTATGTGTACACAGGTGGGGGAGAGGTGTATGTGTGGT  995

seq1  TGTCAGAGGACAACTTGTGGAAATCCATTCTCTCCTTCCCCCGTGTGGCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGAGGACAACTTGTGGAAATCCATTCTCTCCTTCCCCCGTGTGGCT  1045

seq1  CCAGGGGATGGAATTC  1064
      ||||||||||||||||
seq2  CCAGGGGATGGAATTC  1061

seq1: chr4_62487701_62488696
seq2: B6Ng01-285P10.g_65_1065

seq1  GAATTCATTTTCATAGAGCCCAGTAATAGATTGCCCACTGGTAACTCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTTCATAGAGCCCAGTAATAGATTGCCCACTGGTAACTCAGA  50

seq1  CTGTAGAAAGCACACCTCTCAAGGGACAATGGGAATATTTACTCCAAGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGAAAGCACACCTCTCAAGGGACAATGGGAATATTTACTCCAAGTC  100

seq1  ACGGAGGGCAGGAATAAAGTCAGTGTAGTCTTTGGTATTGACTGGACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGAGGGCAGGAATAAAGTCAGTGTAGTCTTTGGTATTGACTGGACCAG  150

seq1  TATGCAACAGCTGGATGGCTTTTATGGTTCTGTGGCTTTAGAGCTGGGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAACAGCTGGATGGCTTTTATGGTTCTGTGGCTTTAGAGCTGGGGT  200

seq1  CACATCACACATCCTGACTCCAGGTCAGTACTATCATTAACTGGACATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATCACACATCCTGACTCCAGGTCAGTACTATCATTAACTGGACATTA  250

seq1  TCCTATCATGTCAGACCCAACCTCAGATTCCTAGTCAACACGACCCAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATCATGTCAGACCCAACCTCAGATTCCTAGTCAACACGACCCAGCA  300

seq1  CACCAAGCTCTCCAGTTCAGCCAGCTAAGTGAAAGCTCACCTAAGAAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAGCTCTCCAGTTCAGCCAGCTAAGTGAAAGCTCACCTAAGAAACA  350

seq1  GAAGTGCTTTCTCTAAAATACAGGGATAGATTATGGATTGAAAACCATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGCTTTCTCTAAAATACAGGGATAGATTATGGATTGAAAACCATGA  400

seq1  GCACTAAGAAACAATACTTATGCCCAAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTAAGAAACAATACTTATGCCCAAGTGTGTGTGTGTGGGGGGGAGGC  450

seq1  ATAACTGTGATCCCAACACCCTGGTGGGTGACAAGATGGAGGCCAGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTGTGATCCCAACACCCTGGTGGGTGACAAGATGGAGGCCAGCCTG  500

seq1  GGCTACAGAGAGAGACCTTGTCTCAAAACTACACAACAAAATGATAATTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACAGAGAGAGACCTTGTCTCAAAACTACACAACAAAATGATAATTG  550

seq1  GAAGTAAGGATTTCTGTCTGGGGTGGCAGCTGTTCAAGAGGCTGCTGCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAAGGATTTCTGTCTGGGGTGGCAGCTGTTCAAGAGGCTGCTGCTG  600

seq1  TCTCCTCCTCCCTGGTGGTGTCCAGGAACATGGAAAGTGAGTCTGCACTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTCCTCCCTGGTGGTGTCCAGGAACATGGAAAGTGAGTCTGCACTG  650

seq1  GTATATGGTATGTTTGACAGTTCAGACCCATAGCTGTATCCGACCATGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGGTATGTTTGACAGTTCAGACCCATAGCTGTATCCGACCATGCA  700

seq1  CTTTAACAGTTAGGGATGGTGAGTGAGGCTCAGGAAGAGGACGGAGAAGG  750
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTTTAACAGTTAGGGATGGTGAGTGAGGCTCAGGAAGAGGACGGAGAAAG  750

seq1  CACACTGACTGCTTAACTCAATGCTCAACACCTGAATGGTCCTGCCTGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTGACTGCTTAACTCAATGCTCAACACCTGAATGGTCCTGCCTGGG  800

seq1  GCCAGGAAGTTT-GGTCATTTTCTTCTGCTAACCAGGTTCCTGGTTCATG  849
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCCAGGAAGTTTGGGTCATTTTCTTCTGCTAACCAGGTTCCTGGGTCATG  850

seq1  AGGTGTCATT-GGCATTACGT-CCTTTGCTTTTTTGACTCAAACCCTGTT  897
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCATTGGGCATTACGTCCCTTTGCTTTTTTGACTCAAACCCTGTT  900

seq1  TAATATTTTTGTTCAGCATTCCATCTTGCAGCTTTTGAGTCAGAGGGACT  947
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TAATA-TTTTGTTCAGCATTCCATCTTGCACCTTTTGAGTCAGAGGGACT  949

seq1  CAC-TATGGG-TCTTGGGGTGAATATATACTCAATACCTACCTGT-GTTG  994
      ||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||
seq2  CACTTATGGGTTCTTGGGGTGAATATATCCCCAATACCTACCTGTAGTTG  999

seq1  GC  996
      ||
seq2  GC  1001