BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-286P22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 21,854,465 - 22,014,200
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6230409E13Rik
Upstream genePrdm13, Ccnc, 2610029I01Rik, Usp45, 4930528A17Rik, 5730406M06Rik, Coq3
Downstream geneLOC100040379, Fbxl4, Pou3f2, LOC664911, 1700025O08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-286P22.bB6Ng01-286P22.g
ACCGA085043GA085044
length1,1441,105
definitionB6Ng01-286P22.b B6Ng01-286P22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,013,048 - 22,014,200)(21,854,465 - 21,855,580)
sequence
gaattccagatgcttaaacccgtagtttggtgaagaggctacaaaacttc
cccaagaaggacggagtcgggatttatgaggctatgtgcccaggagcatg
caggatgagaataggggcaggggattcctattctcccttactccttactc
ctgccagtctcaaggtgatattttggtctcaatatgagatttcccgaatt
ttgaatgattctcatcctcactcttgctccaggaccattctcccggtcac
attttcccctcaaggtatcagcctagggcctcttaagtggcaagacttgc
ttctttccttcctttttcagaccccaggaagtaaacattctattcggagc
caatattaaaatcctttcagcttgtgagttccataactgggtttgtaatc
tattcatgatgcatagtcttaatcatccacaattaacacagtaacccacc
acaccacgaccactatcccactgacatcaccaatagctccaccatgcctt
ccaaggaagaacacgtaccttgtacttccaacctatttcccctgtacaga
gacaacctgagtccccaggtcagagtcaggccatttccatcaattccagt
tggtttgtttggttggttgctttattttgtttttgcctcttgttttaacc
taaattttcccatattattccatcaattatggctccattcatctcccttc
aaaactgatgcaggattcaccctgatgttaccatgcagtggcttctgcct
ttctccaaagcagagaaatcagatgggtgtgaagaggggattgaaaccaa
gttgctgcgtttaattctaagatccctatgggaacccctgctaactgcct
gatgcacacaattcctttcttccattattctttcattataaagcatggga
atgcctaaatacatattttttcctggattccctgcaggtagagaggcatg
tgacacaaaactgttccaataagttcagcagaatcctttgatggagatca
tcttgggaaagattttagtttctgataaaagagaccaaatgtgactgatt
ttatccatcccccatctttctgtttgaggtgaagcacaccaaactgaagg
cattcattttgggtaagctgccttccatgttccgtggctgagcc
gaattcacttgagtttctgggaacatatgacttgattccacttggtattt
tctggaagggctcactcacttcttgactatctttcccacacctgtctaac
tcacctcctaccgtgtttggcctttctggttacctggctatgcattgctt
gcttgttttgctcctgtagatgtgaccccagttttgtcctttgtactagc
aaactaatacactgctaaattaaaagatgcccctgtccttctaacgaagc
attttcaactcccctccctcatctgagcctattagtcccctattttcctt
ctcagtactaagctagtctcataggagatgctctctgagagctgcttaga
gatttataaaacactcaagtccaatagattaaaaaaagcacatagataaa
gtcacttcatggtgacagactttcttctagatataatgctcattgctgga
tctggtagtgcaggtctgtaatcccagttccttgaaggctgagctggaaa
gggggaaagttcaaggacagcctgagcaacttaggctttcttaaaataaa
aaataaaagccaggggtacagctcagtggtagagtgcttgcctatcacat
acaaaaccattggtttagtacctggcattaaaagaaaaatcacctctccc
aggcaagtagggcagtattagatttgttctttacaaattgttttagttat
agttactgttgctgtgatgaaacaccatgaccaaagcaacttggggagtg
taacggctggttttgtgtgtcaacttgacacaagctggagttatcacaga
gaaaggagtctcccttgaggaaatgcttccataagatccagctgtaaggc
attttctcattactgatcaaagggaggatccattgtgggtggttccatac
ctggggctggcaatcctaggttctatagaaactgagcttataagggaagc
tgagcagccagggaagcagccagtaagtaacatcctcatggcctctgcat
cagctctgcttcatgacctacttgagtcagttctgacttcccttggtgat
gaacaacaagtatggaagtgtaagctgaaataatccttcctccaacttgg
cttct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_22013048_22014200
seq2: B6Ng01-286P22.b_46_1189 (reverse)

seq1  GGCTCAGCCACCGGAACAGGGAAAGGCCAGCTTTCCCCAAAATG-ATGGC  49
      |||||||||| ||||||| ||||  | |||| || ||||||||| ||| |
seq2  GGCTCAGCCA-CGGAACATGGAA--GGCAGC-TTACCCAAAATGAATGCC  46

seq1  TTCAGTTTTGGGTGTTGCTTTCACCTTCAAAACAGAAAGATGGGGGATGG  99
      ||||||||  |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||| |
seq2  TTCAGTTT--GGTG-TGC-TTCACCT--CAAACAGAAAGATGGGGGAT-G  89

seq1  GATAAAATCAGTCACA-TTGGTCTCTTTTATCAGGAAACTAAAATCTTTC  148
      |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GATAAAATCAGTCACATTTGGTCTCTTTTATCA-GAAACTAAAATCTTTC  138

seq1  CC-AGATGATCTCCATTCAAAGGATTTCTGCTGAACTTATT-GAACAGTT  196
      || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  CCAAGATGATCTCCA-TCAAAGGA-TTCTGCTGAACTTATTGGAACAGTT  186

seq1  TTGTGTCACATGCCTCTCTACCTGCAGGGAATCCAGGGAAAAATATGTAT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTGTGTCACATGCCTCTCTACCTGCAGGGAATCCAGGAAAAAATATGTAT  236

seq1  TTAGGCATT-CCATGCTTTATAATGAAAGAATAATGGAAGAAAGGAATTG  295
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGCATTCCCATGCTTTATAATGAAAGAATAATGGAAGAAAGGAATTG  286

seq1  TGTGCATCAGGCAGTTAGCAGGGGTTCCCATAGGGATCTTAGAATTAAAC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATCAGGCAGTTAGCAGGGGTTCCCATAGGGATCTTAGAATTAAAC  336

seq1  GCAGCAACTTGGTTTCAATCCCCTCTTCACACCCATCTGATTTCTCTGCT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCAACTTGGTTTCAATCCCCTCTTCACACCCATCTGATTTCTCTGCT  386

seq1  TTGGAGAAAGGCAGAAGCCACTGCATGGTAACATCAGGGTGAATCCTGCA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAGAAAGGCAGAAGCCACTGCATGGTAACATCAGGGTGAATCCTGCA  436

seq1  TCAGTTTTGAAGGGAGATGAATGGAGCCATAATTGATGGAATAATATGGG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTTTGAAGGGAGATGAATGGAGCCATAATTGATGGAATAATATGGG  486

seq1  AAAATTTAGGTTAAAACAAGAGGCAAAAACAAAATAAAGCAACCAACCAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTAGGTTAAAACAAGAGGCAAAAACAAAATAAAGCAACCAACCAA  536

seq1  ACAAACCAACTGGAATTGATGGAAATGGCCTGACTCTGACCTGGGGACTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACCAACTGGAATTGATGGAAATGGCCTGACTCTGACCTGGGGACTC  586

seq1  AGGTTGTCTCTGTACAGGGGAAATAGGTTGGAAGTACAAGGTACGTGTTC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGTCTCTGTACAGGGGAAATAGGTTGGAAGTACAAGGTACGTGTTC  636

seq1  TTCCTTGGAAGGCATGGTGGAGCTATTGGTGATGTCAGTGGGATAGTGGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTGGAAGGCATGGTGGAGCTATTGGTGATGTCAGTGGGATAGTGGT  686

seq1  CGTGGTGTGGTGGGTTACTGTGTTAATTGTGGATGATTAAGACTATGCAT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTGTGGTGGGTTACTGTGTTAATTGTGGATGATTAAGACTATGCAT  736

seq1  CATGAATAGATTACAAACCCAGTTATGGAACTCACAAGCTGAAAGGATTT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATAGATTACAAACCCAGTTATGGAACTCACAAGCTGAAAGGATTT  786

seq1  TAATATTGGCTCCGAATAGAATGTTTACTTCCTGGGGTCTGAAAAAGGAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTGGCTCCGAATAGAATGTTTACTTCCTGGGGTCTGAAAAAGGAA  836

seq1  GGAAAGAAGCAAGTCTTGCCACTTAAGAGGCCCTAGGCTGATACCTTGAG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGAAGCAAGTCTTGCCACTTAAGAGGCCCTAGGCTGATACCTTGAG  886

seq1  GGGAAAATGTGACCGGGAGAATGGTCCTGGAGCAAGAGTGAGGATGAGAA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAATGTGACCGGGAGAATGGTCCTGGAGCAAGAGTGAGGATGAGAA  936

seq1  TCATTCAAAATTCGGGAAATCTCATATTGAGACCAAAATATCACCTTGAG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCAAAATTCGGGAAATCTCATATTGAGACCAAAATATCACCTTGAG  986

seq1  ACTGGCAGGAGTAAGGAGTAAGGGAGAATAGGAATCCCCTGCCCCTATTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCAGGAGTAAGGAGTAAGGGAGAATAGGAATCCCCTGCCCCTATTC  1036

seq1  TCATCCTGCATGCTCCTGGGCACATAGCCTCATAAATCCCGACTCCGTCC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCTGCATGCTCCTGGGCACATAGCCTCATAAATCCCGACTCCGTCC  1086

seq1  TTCTTGGGGAAGTTTTGTAGCCTCTTCACCAAACTACGGGTTTAAGCATC  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGGGAAGTTTTGTAGCCTCTTCACCAAACTACGGGTTTAAGCATC  1136

seq1  TGGAATTC  1153
      ||||||||
seq2  TGGAATTC  1144

seq1: chr4_21854465_21855580
seq2: B6Ng01-286P22.g_67_1171

seq1  GAATTCACTTGAGTTTCTGGGAACATATGACTTGATTCCACTTGGTATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTGAGTTTCTGGGAACATATGACTTGATTCCACTTGGTATTT  50

seq1  TCTGGAAGGGCTCACTCACTTCTTGACTATCTTTCCCACACCTGTCTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAGGGCTCACTCACTTCTTGACTATCTTTCCCACACCTGTCTAAC  100

seq1  TCACCTCCTACCGTGTTTGGCCTTTCTGGTTACCTGGCTATGCATTGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTCCTACCGTGTTTGGCCTTTCTGGTTACCTGGCTATGCATTGCTT  150

seq1  GCTTGTTTTGCTCCTGTAGATGTGACCCCAGTTTTGTCCTTTGTACTAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTTTGCTCCTGTAGATGTGACCCCAGTTTTGTCCTTTGTACTAGC  200

seq1  AAACTAATACACTGCTAAATTAAAAGATGCCCCTGTCCTTCTAACGAAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAATACACTGCTAAATTAAAAGATGCCCCTGTCCTTCTAACGAAGC  250

seq1  ATTTTCAACTCCCCTCCCTCATCTGAGCCTATTAGTCCCCTATTTTCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCAACTCCCCTCCCTCATCTGAGCCTATTAGTCCCCTATTTTCCTT  300

seq1  CTCAGTACTAAGCTAGTCTCATAGGAGATGCTCTCTGAGAGCTGCTTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTACTAAGCTAGTCTCATAGGAGATGCTCTCTGAGAGCTGCTTAGA  350

seq1  GATTTATAAAACACTCAAGTCCAATAGATTAAAAAAAGCACATAGATAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATAAAACACTCAAGTCCAATAGATTAAAAAAAGCACATAGATAAA  400

seq1  GTCACTTCATGGTGACAGACTTTCTTCTAGATATAATGCTCATTGCTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTTCATGGTGACAGACTTTCTTCTAGATATAATGCTCATTGCTGGA  450

seq1  TCTGGTAGTGCAGGTCTGTAATCCCAGTTCCTTGAAGGCTGAGCTGGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTAGTGCAGGTCTGTAATCCCAGTTCCTTGAAGGCTGAGCTGGAAA  500

seq1  GGGGGAAAGTTCAAGGACAGCCTGAGCAACTTAGGCTTTCTTAAAATAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGAAAGTTCAAGGACAGCCTGAGCAACTTAGGCTTTCTTAAAATAAA  550

seq1  AAATAAAAGCCAGGGGTACAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTATCACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAAGCCAGGGGTACAGCTCAGTGGTAGAGTGCTTGCCTATCACAT  600

seq1  ACAAAACCATTGGTTTAGTACCTGGCATTAAAAGAAAAATCACCTCTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACCATTGGTTTAGTACCTGGCATTAAAAGAAAAATCACCTCTCCC  650

seq1  AGGCAAGTAGGGCAGTATTAGATTTGTTCTTTACAAATTGTTTTAGTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAGTAGGGCAGTATTAGATTTGTTCTTTACAAATTGTTTTAGTTAT  700

seq1  AGTTACTGTTGCTGTGATGAAACACCATGACCAAAGCAACTTGGGGAGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTGTTGCTGTGATGAAACACCATGACCAAAGCAACTTGGGGAGTG  750

seq1  TAACGGCTGGTTTTGTGTGTCAACTTGACACAAGCTGGAGTTATCACAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACGGCTGGTTTTGTGTGTCAACTTGACACAAGCTGGAGTTATCACAGA  800

seq1  GAAAGGAGTCTCCCTTGAGGAAATGCTTCCATAAGATCCAGCTGTAAGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGAGTCTCCCTTGAGGAAATGCTTCCATAAGATCCAGCTGTAAGGC  850

seq1  ATTTTCTCATTACTGATCAAAGGGGAGGATCCATTGTGGGTGGTTCCATA  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTCATTACTGATCAAA-GGGAGGATCCATTGTGGGTGGTTCCATA  899

seq1  CCT-GGGCTGGCAATCCTAGGTTCTATAAGAAAACTGAGCTTATAAGGGG  949
      ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||
seq2  CCTGGGGCTGGCAATCCTAGGTTCTATA--GAAACTGAGCTTATAA-GGG  946

seq1  AAGCTGAGCAAGCCAGGGAAAGCAAGCCAGTAAGTAACATCCCTCCATGG  999
      ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||
seq2  AAGCTGAGC-AGCCAGGG-AAGC-AGCCAGTAAGTAACATCC--TCATGG  991

seq1  CCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCATGACCTACTTGAGTTCCAGTCCTGACT  1049
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||
seq2  CCTCTGCATCAGCT-CTGCTTCATGACCTACTTGAGT--CAGTTCTGACT  1038

seq1  T-CCTTGGTGATGAACAAC-AGTATGGAAGTGTAAGCTGAATAAATCCTT  1097
      | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |
seq2  TCCCTTGGTGATGAACAACAAGTATGGAAGTGTAAGCTGAAATAATCC-T  1087

seq1  TCCTCCCCAACTT-GCTTCT  1116
      ||||  ||||||| ||||||
seq2  TCCT--CCAACTTGGCTTCT  1105