BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-301G22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 131,684,768 - 131,832,450
singlet/doubletdoublet
Overlap geneOprd1, LOC664894, Ythdf2, LOC664903, Gmeb1, Rnu11, Taf12
Upstream geneGm831, EG664832, LOC100039799, Ptpru, Mecr, Sfrs4, EG664865, EG623230, Epb4.1, LOC666480, LOC100039835
Downstream gene9530096D07Rik, LOC100039864, Trspap1, Rcc1, Snhg3, Phactr4, Med18, Sesn2, Atpif1, Dnajc8, Ptafr, Eya3, Xkr8, Smpdl3b, Rpa2, BC013712, LOC100039917, Ppp1r8, Stx12, OTTMUSG00000010099, BC008163, Fgr, Ahdc1, LOC100041932, Wasf2, Gpr3, Cd164l2, Fcnc-ps, Map3k6, Sytl1, D4Ertd196e
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-301G22.bB6Ng01-301G22.g
ACCGA095745GA095746
length1,059930
definitionB6Ng01-301G22.b B6Ng01-301G22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(131,684,768 - 131,685,821)(131,831,521 - 131,832,450)
sequence
gaattcactctgtagagcaggctggccttgaactcagagatccacctgcc
tcagctgggattaaaggtgggcagcaccacggtccagacacttgtggacg
ggcttacatgctggggacacacaagtcattctccactgaaccagcaaagc
cacaggaacatcactatcccctttttacaggtggagaaggctgaggggtg
gagaggtgaagctgactagcaggccttaagttaggtctccagttcctggg
attctaaaattcaagttcaatccctttgttttacaaatgaaggctctgag
gctgtgctatagcagtgaccccagaggctgggtgcacagagagggaacag
agatgagtcaacaaagcctgcaccagcagcccaggggtccagctggagct
ccctttatttgcagacaaagggtgattgctctcccaaaggacaaaacaag
cctggtcgggcaaggaggacgacagcaaactgtgtccctgcccaccactt
aagagggatggcacttggccagaaattaattagctgtctcagtttggcag
aacccggagaaggaaagtggttaattataatgaagcccagagagcttgct
tatcaaggggaagattatggccaggcctcggaagcaaaaggcccccccga
gttgaacgtgagtggagagacctgccaggctatagttagcagcaaccagg
ctaaaggcctagcttccattggaaacccaaagcacactcaaagagttctc
ccttccctcatcctgaccctgcttaaggatggctggagtgtggggtgaac
tgtatccagatagtgtggaagaatctggggctggagatctgatggctcac
ttaggaaagtgttttctgtgtgagcatggggacctgagttcagtccccag
gagtcacagaaacaagacaggtgttggtgggctgaggaggcagacagaca
tttgctggggacatgctggctgggtacacagcttccagtgagagatccta
tctcaaaaaaccaggtggttgggttctagaaggcacgacacccttgaagg
ctgaatact
gaattcagatgtcaaatactatggaagtatcttaaaagttacagtccttg
acttgaaaaggagttaagaagctggttttggtgatgtagccttgaatcac
cagcgctctgaagtcagaggcaggtgcatctctgagtttgaggccagcct
ggtctacacagcaatttccaggctagggggagctaagtagtttggggagg
aggggtgtgctttcattcagtggaaggatttataaatattacttatattt
cattcacatgcatactacacatggcaggaaatccacttagaaaagctcaa
gaaagctttggaggcacatttgcagataagctactcagtactttatgaca
aaccccttaacctctctggacagacaacaggactaaccatacttaactgt
ggggctgtgataaggaaggggtggaatacttaaaagtgtttaagttgttc
atggtggaggtgcacacctttaaaccgaacgctccgaggcagaggcaggt
ggacttgactttgaagccagcctggtctacacagtgagttccaggacagc
cagggctacacagaaaaccctgtcttgaaaacaaacaaacaaacaaacaa
acaaaccaaaagaaaacagaacaaaaagcccaaagtgcttaagttgtgca
cgattcatctgagtaggtttcagtcctgggtctttatgaagggaaatgac
agggtccaagtcactcttctaaagcaatccctagaaaatgttctaggcca
catttacttgtgaatttctcaacatcttatttgaaaaataaaatttataa
ataaataaataaataaaagactttcacttaaaagtttgttcctcccttgt
taacatttatgccaatgccatacataataggtacttaaaaatattaaaat
ccgtagaaaaaaaatcccttctgagtttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_131684768_131685821
seq2: B6Ng01-301G22.b_44_1102

seq1  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGAGCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAGATCCACCTGCC  50

seq1  TCAGCTGGGATTAAAGGTGGGCAGCACCACGGTCCAGACACTTGTGGACG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTGGGATTAAAGGTGGGCAGCACCACGGTCCAGACACTTGTGGACG  100

seq1  GGCTTACATGCTGGGGACACACAAGTCATTCTCCACTGAACCAGCAAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTACATGCTGGGGACACACAAGTCATTCTCCACTGAACCAGCAAAGC  150

seq1  CACAGGAACATCACTATCCCCTTTTTACAGGTGGAGAAGGCTGAGGGGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGAACATCACTATCCCCTTTTTACAGGTGGAGAAGGCTGAGGGGTG  200

seq1  GAGAGGTGAAGCTGACTAGCAGGCCTTAAGTTAGGTCTCCAGTTCCTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTGAAGCTGACTAGCAGGCCTTAAGTTAGGTCTCCAGTTCCTGGG  250

seq1  ATTCTAAAATTCAAGTTCAATCCCTTTGTTTTACAAATGAAGGCTCTGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTAAAATTCAAGTTCAATCCCTTTGTTTTACAAATGAAGGCTCTGAG  300

seq1  GCTGTGCTATAGCAGTGACCCCAGAGGCTGGGTGCACAGAGAGGGAACAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGCTATAGCAGTGACCCCAGAGGCTGGGTGCACAGAGAGGGAACAG  350

seq1  AGATGAGTCAACAAAGCCTGCACCAGCAGCCCAGGGGTCCAGCTGGAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGAGTCAACAAAGCCTGCACCAGCAGCCCAGGGGTCCAGCTGGAGCT  400

seq1  CCCTTTATTTGCAGACAAAGGGTGATTGCTCTCCCAAAGGACAAAACAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTATTTGCAGACAAAGGGTGATTGCTCTCCCAAAGGACAAAACAAG  450

seq1  CCTGGTCGGGCAAGGAGGACGACAGCAAACTGTGTCCCTGCCCACCACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTCGGGCAAGGAGGACGACAGCAAACTGTGTCCCTGCCCACCACTT  500

seq1  AAGAGGGATGGCACTTGGCCAGAAATTAATTAGCTGTCTCAGTTTGGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGGGATGGCACTTGGCCAGAAATTAATTAGCTGTCTCAGTTTGGCAG  550

seq1  AACCCGGAGAAGGAAAGTGGTTAATTATAATGAAGCCCAGAGAGCTTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCGGAGAAGGAAAGTGGTTAATTATAATGAAGCCCAGAGAGCTTGCT  600

seq1  TATCAAGGGGAAGATTATGGCCAGGCCTCGGAAGCAAAAGGCCCCCCCGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAGGGGAAGATTATGGCCAGGCCTCGGAAGCAAAAGGCCCCCCCGA  650

seq1  GTTGAACGTGAGTGGAGAGACCTGCCAGGCTATAGTTAGCAGCAACCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAACGTGAGTGGAGAGACCTGCCAGGCTATAGTTAGCAGCAACCAGG  700

seq1  CTAAAGGCCTAGCTTCCATTGGAAACCCAAAGCACACTCAAAGAGTTCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGCCTAGCTTCCATTGGAAACCCAAAGCACACTCAAAGAGTTCTC  750

seq1  CCTTCCCTCATCCTGACCCTGCTTAAGGATGGCTGGAGTGTGGGGTGAAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCTCATCCTGACCCTGCTTAAGGATGGCTGGAGTGTGGGGTGAAC  800

seq1  TGTATCCAGATAGTGTGGAAGAATCTGGGGCTGGAGATCTGATGGCTCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCCAGATAGTGTGGAAGAATCTGGGGCTGGAGATCTGATGGCTCAC  850

seq1  TTAGGAAAGTGTTTTCTGTGTGAGCATGGGGACCTGAGTTCAGTCCCCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGAAAGTGTTTTCTGTGTGAGCATGGGGACCTGAGTTCAGTCCCCAG  900

seq1  GAGTCACAGAAACAAGACAGGTG-TGGTGGGCTGAGGAGGCAAGACAGAC  949
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAGTCACAGAAACAAGACAGGTGTTGGTGGGCTGAGGAGGC-AGACAGAC  949

seq1  ATTTGCT-GGGACATGCTGGCTGGGTACACAGCTTCCAGTGAGAGATCCT  998
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTGGGGACATGCTGGCTGGGTACACAGCTTCCAGTGAGAGATCCT  999

seq1  ATCTCAAAAAAACAAGGTGGTT-GGTTCTAG-AGGCACGACACCCT--GA  1044
      ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||   |
seq2  ATCTC-AAAAAACCAGGTGGTTGGGTTCTAGAAGGCACGACACCCTTGAA  1048

seq1  GGCTG-ATACT  1054
      ||||| |||||
seq2  GGCTGAATACT  1059

seq1: chr4_131831521_131832450
seq2: B6Ng01-301G22.g_67_996 (reverse)

seq1  TCAAACTCAGAAGGGATTTTTTTCTAACGGATTTTAATATTTT--AGTAC  48
      |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||
seq2  TCAAACTCAGAAGGGATTTTTTTTCTACGGATTTTAATATTTTTAAGTAC  50

seq1  CTATTATGTATGGCATTGGCATAAATGTT-ACAAGGGAGGAAACAAACTT  97
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  CTATTATGTATGGCATTGGCATAAATGTTAACAAGGGAGG-AACAAACTT  99

seq1  TTAAGTGAAAAGTCTTTTATTTATTTTATTTATTTATAAATTTTATTTTT  147
      ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTG-AAAGTCTTTTATTTA-TTTATTTATTTATAAATTTTATTTTT  147

seq1  C-AATAAGATGTTGAGAAATTCACAAGTAAATGTGGCCTAGAACATTTTC  196
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAGATGTTGAGAAATTCACAAGTAAATGTGGCCTAGAACATTTTC  197

seq1  TAGGGATTGCTTTTAGAAGAGTGACTTGGACCCTGTCATTTCCCTTCATA  246
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGATTGC-TTTAGAAGAGTGACTTGGACCCTGTCATTTCCCTTCATA  246

seq1  AAGACCCAGGACTGAAACCTACTCAGATGAATCGTGCACAACTTAAGCAC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCCAGGACTGAAACCTACTCAGATGAATCGTGCACAACTTAAGCAC  296

seq1  TTTGGGCTTTTTGTTCTGTTTTCTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGCTTTTTGTTCTGTTTTCTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGT  346

seq1  TTGTTTTCAAGACAGGGTTTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTCAAGACAGGGTTTTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCA  396

seq1  CTGTGTAGACCAGGCTGGCTTCAAAGTCAAGTCCACCTGCCTCTGCCTCG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTAGACCAGGCTGGCTTCAAAGTCAAGTCCACCTGCCTCTGCCTCG  446

seq1  GAGCGTTCGGTTTAAAGGTGTGCACCTCCACCATGAACAACTTAAACACT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCGTTCGGTTTAAAGGTGTGCACCTCCACCATGAACAACTTAAACACT  496

seq1  TTTAAGTATTCCACCCCTTCCTTATCACAGCCCCACAGTTAAGTATGGTT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTATTCCACCCCTTCCTTATCACAGCCCCACAGTTAAGTATGGTT  546

seq1  AGTCCTGTTGTCTGTCCAGAGAGGTTAAGGGGTTTGTCATAAAGTACTGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGTTGTCTGTCCAGAGAGGTTAAGGGGTTTGTCATAAAGTACTGA  596

seq1  GTAGCTTATCTGCAAATGTGCCTCCAAAGCTTTCTTGAGCTTTTCTAAGT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTTATCTGCAAATGTGCCTCCAAAGCTTTCTTGAGCTTTTCTAAGT  646

seq1  GGATTTCCTGCCATGTGTAGTATGCATGTGAATGAAATATAAGTAATATT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTCCTGCCATGTGTAGTATGCATGTGAATGAAATATAAGTAATATT  696

seq1  TATAAATCCTTCCACTGAATGAAAGCACACCCCTCCTCCCCAAACTACTT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAATCCTTCCACTGAATGAAAGCACACCCCTCCTCCCCAAACTACTT  746

seq1  AGCTCCCCCTAGCCTGGAAATTGCTGTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCCCCTAGCCTGGAAATTGCTGTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACT  796

seq1  CAGAGATGCACCTGCCTCTGACTTCAGAGCGCTGGTGATTCAAGGCTACA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATGCACCTGCCTCTGACTTCAGAGCGCTGGTGATTCAAGGCTACA  846

seq1  TCACCAAAACCAGCTTCTTAACTCCTTTTCAAGTCAAGGACTGTAACTTT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCAAAACCAGCTTCTTAACTCCTTTTCAAGTCAAGGACTGTAACTTT  896

seq1  TAAGATACTTCCATAGTATTTGACATCTGAATTC  930
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATACTTCCATAGTATTTGACATCTGAATTC  930