BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-313E17
Chromosome4 (Build37)
Map Location 16,594,716 - 16,719,295
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040095, LOC633695, Calb1, Decr1, Nbn, Osgin2, Ripk2, LOC667150, LOC383994
Downstream geneLOC100040154, LOC667212, LOC100040173
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-313E17.bB6Ng01-313E17.g
ACCGA104548GA104549
length1,0781,107
definitionB6Ng01-313E17.b B6Ng01-313E17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(16,594,716 - 16,595,782)(16,718,175 - 16,719,295)
sequence
gaattcacctctctctctctctctctctctctctctctatatatatatat
atatatatatatatatatatatatatatatatcatatgtaacatatatac
atatatgtatatattatatgcatatatatgttgcgtatattatatataat
caccatctcatgtaagcagaggcagtaagtttaaggcagtaactatattt
atggtagcaaactatgcatgagggaaatatacattctacaaaaatttgtg
taaattgtgtatcaaagtaattatttatatgtgtgatggccatgaattgt
caaaatatacttgaggtaatgggaaatttgcttatctgattattttggct
atgaaggaaaatcagtccaccatatcttaagctttttactttatgatgag
atcctcttaatttactagctttagaggctgaaatttggttgtgtatgtgg
aagattcaggtttgaattctgttctgatttagatataaagggtttttcta
aaggctcttgtggtaaaggcttggttaccagtctatggagacctcacaaa
ggtgactaatcactgatagatacactattttatggcgatataaggagtgg
attaaagaggtgtggcctggaaaagtaggtcactagagttattcattgga
ggatatctctccctagtctgtctattcatttcatatcttggctgtcacag
agagagcagctatgccctaccacatcctcttcattaagttcctctttcct
caccatagtccagaaaaaactgagctcagttaccatgcatggaggtttcc
taaaccatgattgtagtcaacccatctttaaatggcttataacagatact
tgtcacagctttcaagaagcccatctaacacaagctatttgatacaacag
atctaatcatacttgacattccatgggagaaaaggattttttatacccag
atgttttaatatgtattcatcccctttgtcgtgtaagtttcctccatgcc
acagtggctggtgtaaatgtgaagaggaagaacttgggaggacttaagtt
cctcttccaccgtatggggtcctatctg
gaattctatgattcttttgaaacctcagagagaacccctaattacacacc
acatcaaacaaggcgttctcaacaccaactcttcccaaaaaaactccagc
agctagggaccaagtattcatatatatgagattataaggactgttcttat
tcaaaccattgtgaaaggaaactgtttttttttttttttttaactgtctt
ttctcacactgagtatcttgactggtattatggttggtattatattcatg
tacagttaccagtagcacagcgataacaagtcttgggaatattttttttt
ctgcactctaacattctttcaccaacattcaagagcaaaacttaataatg
tctaaaggatttgtgtttttcaatctcgtatggtttcattttctccattg
tttttcccaatccattctatagactgatattttgtatttatcctaatttt
accttatcctgtttatactaggaaaaataattgtatcacttaactaagtg
catatactctggctatccaatgctattacataggaaattttgttgttatt
tttctctctgctttgcactataattctaaatgtgtaatttatacactagt
gattacacatttttattttatcccttaactttgtttattctattaatttg
catactattggtctcctttgtgcctgacttgaattactgagtaaatttaa
acagaaaatgaaatatctgtatatggaacttctagtgaaaagctttcagt
gttcttcatatatacatggacatggcaaaggaattatgaaagtgattgaa
aactacaattctaatcatagcttcatgattctggaaaggtttgacattgt
tcaataataaataaacgtttttctatcactgcttcaaggacctgtggaaa
ccccagtcattgtagttaacaatcatagaaacaagatatatatccaaacc
taaccccattacatatcattttacacgtttagtatttaggacaataaatg
aaaatattcatttcagatgtttaagacccagaaaagagactgattatata
gacgactacgttttccgatgatttctcagaatccatgatgatccaagtag
cccaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_16594716_16595782
seq2: B6Ng01-313E17.b_45_1122

seq1  GAATTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATAT  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GAATTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATAT  50

seq1  ATATATATATATATATATATATATATATATATCATATGTAACATATATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATATATCATATGTAACATATATAC  100

seq1  ATATATGTATATATTATATGCATATATATGTTGCGTATATTATATATAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTATATATTATATGCATATATATGTTGCGTATATTATATATAAT  150

seq1  CACCATCTCATGTAAGCAGAGGCAGTAAGTTTAAGGCAGTAACTATATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATCTCATGTAAGCAGAGGCAGTAAGTTTAAGGCAGTAACTATATTT  200

seq1  ATGGTAGCAAACTATGCATGAGGGAAATATACATTCTACAAAAATTTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGCAAACTATGCATGAGGGAAATATACATTCTACAAAAATTTGTG  250

seq1  TAAATTGTGTATCAAAGTAATTATTTATATGTGTGATGGCCATGAATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTGTGTATCAAAGTAATTATTTATATGTGTGATGGCCATGAATTGT  300

seq1  CAAAATATACTTGAGGTAATGGGAAATTTGCTTATCTGATTATTTTGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATATACTTGAGGTAATGGGAAATTTGCTTATCTGATTATTTTGGCT  350

seq1  ATGAAGGAAAATCAGTCCACCATATCTTAAGCTTTTTACTTTATGATGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGGAAAATCAGTCCACCATATCTTAAGCTTTTTACTTTATGATGAG  400

seq1  TGTCCTCTTAATTTACTAGCTTTAGAGGCTGAAATTTGGTTGTGTATGTG  450
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -ATCCTCTTAATTTACTAGCTTTAGAGGCTGAAATTTGGTTGTGTATGTG  449

seq1  GAAGATTCAGGTTTGAATTCTGTTCTGATTTAGATATAAAGGGTTTTTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTCAGGTTTGAATTCTGTTCTGATTTAGATATAAAGGGTTTTTCT  499

seq1  AAAGGCTCTTGTGGTAAAGGCTTGGTTACCAGTCTATGGAGACCTCACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCTCTTGTGGTAAAGGCTTGGTTACCAGTCTATGGAGACCTCACAA  549

seq1  AGGTGACTAATCACTGATAGATACACTATTTTATGGCGATATAAGGAGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACTAATCACTGATAGATACACTATTTTATGGCGATATAAGGAGTG  599

seq1  GATTAAAGAGGTGTGGCCTGGAAAAGTAGGTCACTAGAGTTATTCATTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAAGAGGTGTGGCCTGGAAAAGTAGGTCACTAGAGTTATTCATTGG  649

seq1  AGGATATCTCTCCCTAGTCTGTCTATTCATTTCATATCTTGGCTGTCACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATATCTCTCCCTAGTCTGTCTATTCATTTCATATCTTGGCTGTCACA  699

seq1  GAGAGAGCAGCTATGCCCTACCACATCCTCTTCATTAAGTTCCTCTTTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGCAGCTATGCCCTACCACATCCTCTTCATTAAGTTCCTCTTTCC  749

seq1  TCACCATAGTCCAGAAAAAACTGAGCTCAGTTACCATGCATGGAGGTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCATAGTCCAGAAAAAACTGAGCTCAGTTACCATGCATGGAGGTTTC  799

seq1  CTAAACCATGATTGTAGTCAACCCATCTTTAAATGGCTTATAACAGATAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACCATGATTGTAGTCAACCCATCTTTAAATGGCTTATAACAGATAC  849

seq1  TTGTCACAGCTTTCAAGAAGCCCATCTAACACAAGCTATTTGATACAACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCACAGCTTTCAAGAAGCCCATCTAACACAAGCTATTTGATACAACA  899

seq1  GATCTAATCATACTTGACATTCCATGGGAGAAAAGGATTTTTTATACTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GATCTAATCATACTTGACATTCCATGGGAGAAAAGGATTTTTTATACCCA  949

seq1  GATGTTTT-ATATGTATTCATCTCCTTTGT-GTGTAAGTTT-CTCCATGC  997
      |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  GATGTTTTAATATGTATTCATCCCCTTTGTCGTGTAAGTTTCCTCCATGC  999

seq1  CACAGT-GCT-GTGTAAATGTG-AGAGG-AGAACTTGGGA-GACTT-AGT  1041
      |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||
seq2  CACAGTGGCTGGTGTAAATGTGAAGAGGAAGAACTTGGGAGGACTTAAGT  1049

seq1  T-CTCTTCCACCGTATGGG--TCTATCTG  1067
      | |||||||||||||||||   |||||||
seq2  TCCTCTTCCACCGTATGGGGTCCTATCTG  1078

seq1: chr4_16718175_16719295
seq2: B6Ng01-313E17.g_64_1170 (reverse)

seq1  TTTTTGGCTACTATGATCATCATGAATTTCTGAGAAATCATCTGAAAAAC  50
      |||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||
seq2  TTTTGGGCTACTTGGATCATCATGGA-TTCTGAGAAATCATC-GGAAAAC  48

seq1  GTTAGTCCTTCCTATATAATCAGTCTCTTTTCTTGGGGTCTTTAAAACAT  100
      | ||||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||
seq2  G-TAGTCGT--CTATATAATCAGTCTCTTTTCT--GGGTCTT--AAACAT  91

seq1  CTGAAATTGAATATTTTCATTTTATTGTCCTAAATACTTAAAACGTGTAA  150
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||
seq2  CTGAAA-TGAATATTTTCA-TTTATTGTCCTAAATACT--AAACGTGTAA  137

seq1  AATGATATGTAATTGGGGTTAGGTTTGGATATATATCTTGTTTCTATGAT  200
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATATGTAA-TGGGGTTAGGTTTGGATATATATCTTGTTTCTATGAT  186

seq1  TGTTAACTACAATGACTGGTGTTTCCACAGGTCCTTGAAGCAGTGATAGA  250
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAACTACAATGACTGGGGTTTCCACAGGTCCTTGAAGCAGTGATAGA  236

seq1  AAAACGTTTATTTATTATTGAACAATGTCAAACCTTTCCAGAATCATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACGTTTATTTATTATTGAACAATGTCAAACCTTTCCAGAATCATGAA  286

seq1  GCTATGATTAGAATTGTAGTTTTCAATCACTTTCATAATTCCTTTGCCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGATTAGAATTGTAGTTTTCAATCACTTTCATAATTCCTTTGCCAT  336

seq1  GTCCATGTATATATGAAGAACACTGAAAGCTTTTCACTAGAAGTTCCATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATGTATATATGAAGAACACTGAAAGCTTTTCACTAGAAGTTCCATA  386

seq1  TACAGATATTTCATTTTCTGTTTAAATTTACTCAGTAATTCAAGTCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGATATTTCATTTTCTGTTTAAATTTACTCAGTAATTCAAGTCAGGC  436

seq1  ACAAAGGAGACCAATAGTATGCAAATTAATAGAATAAACAAAGTTAAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGGAGACCAATAGTATGCAAATTAATAGAATAAACAAAGTTAAGGG  486

seq1  ATAAAATAAAAATGTGTAATCACTAGTGTATAAATTACACATTTAGAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATAAAAATGTGTAATCACTAGTGTATAAATTACACATTTAGAATT  536

seq1  ATAGTGCAAAGCAGAGAGAAAAATAACAACAAAATTTCCTATGTAATAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGCAAAGCAGAGAGAAAAATAACAACAAAATTTCCTATGTAATAGC  586

seq1  ATTGGATAGCCAGAGTATATGCACTTAGTTAAGTGATACAATTATTTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGATAGCCAGAGTATATGCACTTAGTTAAGTGATACAATTATTTTTC  636

seq1  CTAGTATAAACAGGATAAGGTAAAATTAGGATAAATACAAAATATCAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTATAAACAGGATAAGGTAAAATTAGGATAAATACAAAATATCAGTC  686

seq1  TATAGAATGGATTGGGAAAAACAATGGAGAAAATGAAACCATACGAGATT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGAATGGATTGGGAAAAACAATGGAGAAAATGAAACCATACGAGATT  736

seq1  GAAAAACACAAATCCTTTAGACATTATTAAGTTTTGCTCTTGAATGTTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAACACAAATCCTTTAGACATTATTAAGTTTTGCTCTTGAATGTTGG  786

seq1  TGAAAGAATGTTAGAGTGCAGAAAAAAAAATATTCCCAAGACTTGTTATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGAATGTTAGAGTGCAGAAAAAAAAATATTCCCAAGACTTGTTATC  836

seq1  GCTGTGCTACTGGTAACTGTACATGAATATAATACCAACCATAATACCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGCTACTGGTAACTGTACATGAATATAATACCAACCATAATACCAG  886

seq1  TCAAGATACTCAGTGTGAGAAAAGACAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGATACTCAGTGTGAGAAAAGACAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAACAG  936

seq1  TTTCCTTTCACAATGGTTTGAATAAGAACAGTCCTTATAATCTCATATAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTTCACAATGGTTTGAATAAGAACAGTCCTTATAATCTCATATAT  986

seq1  ATGAATACTTGGTCCCTAGCTGCTGGAGTTTTTTTGGGAAGAGTTGGTGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATACTTGGTCCCTAGCTGCTGGAGTTTTTTTGGGAAGAGTTGGTGT  1036

seq1  TGAGAACGCCTTGTTTGATGTGGTGTGTAATTAGGGGTTCTCTCTGAGGT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAACGCCTTGTTTGATGTGGTGTGTAATTAGGGGTTCTCTCTGAGGT  1086

seq1  TTCAAAAGAATCATAGAATTC  1121
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAAGAATCATAGAATTC  1107