BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-321I07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 86,052,566 - 86,212,486
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamtsl1, 4930500O09Rik
Upstream geneA930009N24, LOC668052
Downstream geneRraga, 6230416J20Rik, LOC100040388, Adfp, EG624685, Dennd4c, Rps6, Asah3l, Slc24a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-321I07.bB6Ng01-321I07.g
ACCGA110600GA110601
length6251,092
definitionB6Ng01-321I07.b B6Ng01-321I07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,211,923 - 86,212,486)(86,052,566 - 86,053,666)
sequence
gaattcaattgtgacaggggactttgtcttgtttaacattcaagtcttaa
cttgccaaccaggatgtcagttatccatatacatgtctccttctttgaag
ttggacatcagttctcagggaggtcttgaacttaaactttacttgacctc
ctactcagaatggaagtcttattccaaaaagtttcaggtgtctctattat
gttgtggtccatcccaggggcagcgtataaaagcaaacactataaaagcg
tatttacaggtgcaggaaggaaggtgctgctggtagttggtttgggtcca
agcttattgtgggtaactacacaaagcagttctaactgacttacagaata
gaatagaatatgcaatcaacttgggcatgagagaatttcttagtaatagc
agtaacaacatatgagaaagtttccttataattttagtaaaatattagta
taaaacagcaggctaggtaacagttacctaggccttaacatttttaccta
ggccttaacattgagtgcatctttagatatgggtggtcagattctcccaa
gagttttctactaagaataaccctgatatacagtttattatatgtctgtc
tttcttttggtgggggaggggtgtg
gaattcctcctcagcagttgctccttcctgtgccctgccagtgaacccca
gtgcagcctctcaggatgcctgctatgaatattagccgttcttcatctct
gctgctgttctgtggctttggttcaatagaaatgaatcgaaatgggatgt
atgcagggctctaagcaaaagttccctttgtgtgtgtgtgtgtgtgcatg
tctttttttttttttcctttctttttttctttctttcttttgcaagggct
ctcataggtacacagagccaaacttaacttgagttcatgaaggcatgtta
gctctgggaagctgcaggcatgtgcttactccccatagcctaacctggat
agtttctagcttgcctccccattggctcgagtgagtatgcacacagctac
ttagctcaggagagatatgcacactgcctagggtcaatagcttttaccct
gatgctgctggttacatgttgggacagttgcacttcagcgatcctcccaa
ggtcctgaagtaatgattcatttccaattggacatgaaaccccagcctcc
ttccttatagagtgtgacttgggaatggcagtgtagacggaagagctctc
tgacttgagtggggtgaccccatgtgatccacatctggggactcacggac
aggcatctggtcagtgaactgagactcctccctgggccccacacagctgg
cagccaggcctccctggagccatcccgcccttccctcctgcaggctgggt
agcacctgccagcagtctgaaggtaaaggcaaccagggatttataaacct
agaaagttgaaacttttttaaaatgctgatgtgattttaagaggtgagct
ttatgccaagagcctactggcagagagggacccaggggaattctgtgtat
tatccacttgtgatagttaaatcccaaacaatttttactgtgaattaaaa
aatggagccgattttctgaccttgcattccctgtactctcccactcccct
tctgaggggaggtcgagcagtcctgactgctatgatgtcatcaccaccga
tgaaatctgtttcatagtcaagactgatggtgcctggtgtct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_86211923_86212486
seq2: B6Ng01-321I07.b_103_666 (reverse)

seq1  CACACCCCTCCCCCACCAAAAGAAAGACAGACATATAATAAACTGTATAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCCCTCCCCCACCAAAAGAAAGACAGACATATAATAAACTGTATAT  50

seq1  CAGGGTTATTCTTAGTAGAAAACTCTTGGGAGAATCTGACCACCCATATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTTATTCTTAGTAGAAAACTCTTGGGAGAATCTGACCACCCATATC  100

seq1  TAAAGATGCACTCAATGTTAAGGCCTAGGTAAAAATGTTAAGGCCTAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGATGCACTCAATGTTAAGGCCTAGGTAAAAATGTTAAGGCCTAGGT  150

seq1  AACTGTTACCTAGCCTGCTGTTTTATACTAATATTTTACTAAAATTATAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTTACCTAGCCTGCTGTTTTATACTAATATTTTACTAAAATTATAA  200

seq1  GGAAACTTTCTCATATGTTGTTACTGCTATTACTAAGAAATTCTCTCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAACTTTCTCATATGTTGTTACTGCTATTACTAAGAAATTCTCTCATG  250

seq1  CCCAAGTTGATTGCATATTCTATTCTATTCTGTAAGTCAGTTAGAACTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAGTTGATTGCATATTCTATTCTATTCTGTAAGTCAGTTAGAACTGC  300

seq1  TTTGTGTAGTTACCCACAATAAGCTTGGACCCAAACCAACTACCAGCAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTGTAGTTACCCACAATAAGCTTGGACCCAAACCAACTACCAGCAGC  350

seq1  ACCTTCCTTCCTGCACCTGTAAATACGCTTTTATAGTGTTTGCTTTTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCCTTCCTGCACCTGTAAATACGCTTTTATAGTGTTTGCTTTTATA  400

seq1  CGCTGCCCCTGGGATGGACCACAACATAATAGAGACACCTGAAACTTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGCCCCTGGGATGGACCACAACATAATAGAGACACCTGAAACTTTTT  450

seq1  GGAATAAGACTTCCATTCTGAGTAGGAGGTCAAGTAAAGTTTAAGTTCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATAAGACTTCCATTCTGAGTAGGAGGTCAAGTAAAGTTTAAGTTCAA  500

seq1  GACCTCCCTGAGAACTGATGTCCAACTTCAAAGAAGGAGACATGTATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCCCTGAGAACTGATGTCCAACTTCAAAGAAGGAGACATGTATATG  550

seq1  GATAACTGACATCC  564
      ||||||||||||||
seq2  GATAACTGACATCC  564

seq1: chr4_86052566_86053666
seq2: B6Ng01-321I07.g_67_1158

seq1  GAATTCCTCCTCAGCAGTTGCTCCTTCCTGTGCCCTGCCAGTGAACCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCTCAGCAGTTGCTCCTTCCTGTGCCCTGCCAGTGAACCCCA  50

seq1  GTGCAGCCTCTCAGGATGCCTGCTATGAATATTAGCCGTTCTTCATCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGCCTCTCAGGATGCCTGCTATGAATATTAGCCGTTCTTCATCTCT  100

seq1  GCTGCTGTTCTGTGGCTTTGGTTCAATAGAAATGAATCGAAATGGGATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGTTCTGTGGCTTTGGTTCAATAGAAATGAATCGAAATGGGATGT  150

seq1  ATGCAGGGCTCTAAGCAAAAGTTCCCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGGGCTCTAAGCAAAAGTTCCCTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATG  200

seq1  TCTTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTGCAAGGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTTTTTTTTTTCCTTTCTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTGCAAGGGCT  250

seq1  CTCATAGGTACACAGAGCCAAACTTAACTTGAGTTCATGAAGGCATGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAGGTACACAGAGCCAAACTTAACTTGAGTTCATGAAGGCATGTTA  300

seq1  GCTCTGGGAAGCTGCAGGCATGTGCTTACTCCCCATAGCCTAACCTGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGGGAAGCTGCAGGCATGTGCTTACTCCCCATAGCCTAACCTGGAT  350

seq1  AGTTTCTAGCTTGCCTCCCCATTGGCTCGAGTGAGTATGCACACAGCTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCTAGCTTGCCTCCCCATTGGCTCGAGTGAGTATGCACACAGCTAC  400

seq1  TTAGCTCAGGAGAGATATGCACACTGCCTAGGGTCAATAGCTTTTACCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTCAGGAGAGATATGCACACTGCCTAGGGTCAATAGCTTTTACCCT  450

seq1  GATGCTGCTGGTTACATGTTGGGACAGTTGCACTTCAGCGATCCTCCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGCTGGTTACATGTTGGGACAGTTGCACTTCAGCGATCCTCCCAA  500

seq1  GGTCCTGAAGTAATGATTCATTTCCAATTGGACATGAAACCCCAGCCTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTGAAGTAATGATTCATTTCCAATTGGACATGAAACCCCAGCCTCC  550

seq1  TTCCTTATAGAGTGTGACTTGGGAATGGCAGTGTAGACGGAAGAGCTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTATAGAGTGTGACTTGGGAATGGCAGTGTAGACGGAAGAGCTCTC  600

seq1  TGACTTGAGTGGGGTGACCCCATGTGATCCACATCTGGGGACTCACGGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTGAGTGGGGTGACCCCATGTGATCCACATCTGGGGACTCACGGAC  650

seq1  AGGCATCTGGTCAGTGAACTGAGACTCCTCCCTGGGCCCCACACAGCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATCTGGTCAGTGAACTGAGACTCCTCCCTGGGCCCCACACAGCTGG  700

seq1  CAGCCAGGCCTCCCTGGAGCCATCCCGCCCTTCCCTCCTGCAGGCTGGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGCCTCCCTGGAGCCATCCCGCCCTTCCCTCCTGCAGGCTGGGT  750

seq1  AGCACCTGCCAGCAGTCTGAAGGTAAAGGCAACCAGGGATTTATAAACCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCTGCCAGCAGTCTGAAGGTAAAGGCAACCAGGGATTTATAAACCT  800

seq1  AGAAAGTTGAAACTTTTTTAAAATGCTGATGTGATTTTAAGAGGTGAGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTTGAAACTTTTTTAAAATGCTGATGTGATTTTAAGAGGTGAGCT  850

seq1  TTATGCCAAGAGCCTACTGGCAGAGAGGGACCCAGGGGAATTCTGTGTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCCAAGAGCCTACTGGCAGAGAGGGACCCAGGGGAATTCTGTGTAT  900

seq1  TATCCACTTGTGATAAGTTAAATCCCAAACAATTTTTACTGTGAATTTAA  950
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TATCCACTTGTGAT-AGTTAAATCCCAAACAATTTTTACTGTGAA-TTAA  948

seq1  AAAATGGAGCCGATTTTCTTGACCTTGCATTCCCCTGTACTCTCCCACTC  1000
      |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  AAAATGGAGCCGATTTTC-TGACCTTGCATT-CCCTGTACTCTCCCACT-  995

seq1  CCCCTTCTGAGGGGAGGTCGAGGCAGCCCTGAACTGCTATGATGTTCATC  1050
      ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||
seq2  CCCCTTCTGAGGGGAGGTCGA-GCAGTCCTG-ACTGCTATGATG-TCATC  1042

seq1  ACCACCAATGAAATCCTGTTTTCATAGTCAAGACTGAGTGTGCCT-GTGT  1099
      |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||
seq2  ACCACCGATGAAAT-CTG-TTTCATAGTCAAGACTGATGGTGCCTGGTGT  1090

seq1  CT  1101
      ||
seq2  CT  1092