BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-326G07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 62,941,546 - 63,078,260
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCol27a1, Orm1, Orm-ps, Orm3, Orm2, Akna, Whrn
Upstream geneSlc31a2, Fkbp15, Slc31a1, Cdc26, Prpf4, Rnf183, Wdr31, Bspry, Hdhd3, Alad, Pole3, 4933430I17Rik, Rgs3, Zfp618, Ambp, Kif12
Downstream geneAtp6v1g1, 6330416G13Rik, LOC670833, 1700018C11Rik, LOC667451, Tnfsf15, Tnfsf8, Rpl17-ps, Tnc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-326G07.bB6Ng01-326G07.g
ACCGA114213GA114214
length1,1911,094
definitionB6Ng01-326G07.b B6Ng01-326G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,077,047 - 63,078,260)(62,941,546 - 62,942,635)
sequence
gaattctcacagcttggcacagccccacactgctcctccctgcacagtcg
tctctgtgacaaccctgcgtctgcatcactctctgggattagaacaaggg
caggcagctgtgggaggattcatccctcacccaagcttgcacagtgttac
taccccaaacaccaggggccacagtgcacattcttaagcaagagacccca
gctcagggtccagtggccacacacaaaatgaagcagctttgctgactggg
gaacaggatccgtgtgtccaccactcagctcacagcagggtagtcacaaa
aaaggtggcagacctttcatgcttttctttttttctgggagctgagccgg
cccattaacctctattttcatatttatgccagtgcctgggggggtctggg
cagaagtcctgggagtagtgaccatcaggccaagccctgttggcaggtca
ggatgtcaagagatggggaaggttgcagggactatgccttgccctccagc
tcctgtatcccttcatccttccctccatctttgcatggtcaattgtcaca
gccattcacctccccccccccagctccatcacctcccccacgttgccctc
catgacagctgttgtctcctcatgtgtccccagcagcctccacactctct
cagctctcagacagtgggcagaccctgagcgaggacagtggcgtggatgc
cggggagacggaggccagcacctcaggccgaggcagacagacagcatccg
ctaagaacaagaatggcaaggagcagccccggacggagaggaccgcggag
ggtgccaacaaacctgtgagtcgggactgcacacagggccctggcggagg
atggacgggcctgagaatcagagacacttggcatgcgacccataggatgc
gttgcgggaagggctcatcccgaagggtccctgtgctaggaatcgtagag
cctcactttgccctgctcctgggtgcagcactggtggctgctctctactc
tagtgtagcatggtagcgcagcagtctgaggggtcataatttgagcttca
ctgccctcctctgaaaaaatcaaagccaccctctcccactgcagccgctg
ctgaagccacgtcacccttgtcctgtgagaaatgcagccaccttggcatc
gccatgaagggcgtgcaacacgcagcctctggccagaatcg
tctgataggaggagccatgctacaggacattagcacttacctctgcacaa
ccaatgtggcgagtcatggctcaaaggatgaatgtggctcacgggtaagg
cttttcaggcagggcagctgactcagggctcagtgtccccagaacgtggg
actctgtcctctgacacggatgaccatgtgtgacagcctaatgtgtttct
atatctctgttctcccacctctctctcaacaagtctcaagcaggaaagct
gtctttgaacttgatatgtgactaaagatgacctataactctttactgtc
ctgtctctgcctcctcctcacaatgctaagattaaagacaccaaggatca
ccacactcagtgcattctgcattttctcagccactctgaaaagtcaggct
tggggcctgcagagaaaggggatcaagtagctgacctaccccaggtcaca
caagagtagtggtaggggtgaacaccagtggggtgggggcttgttctgag
cacctgccaaccagaggcccaggtgacctggctttctgctttcccatagg
gtttcccaggagacattggccctccaggggacaatggccctgaaggcatg
aaggtgagttctctcccacctaaggtccttggctgaagaagccccagggc
ccaaggtggctgcaccatctggtgtcctgtcaacctgatgtggaggtact
acctctgagaccatttctgttctctttcccagggtaagcctggagcccga
ggcctgcctggacctcctgggcagctggggcctgaggtaagatagccctg
tcccctcctgtccctctttgtcttctctagcctatcccagcacctagctg
gctctgtccagggtaccaaagccatgattgagggcaggaccacttgagat
tcatccaccagagaatctatctgttctcttacaaccctgcctgtgactct
tctctgacctggtggggcaagcgacttttcctttccacacatagcaccag
tatcagttcttcaaatgagagatagaaaatgttggaccccttttcattaa
ggtggagatccaggtaaggaaatgactgcagcccgtgttagcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_63077047_63078260
seq2: B6Ng01-326G07.b_47_1237 (reverse)

seq1  CGATCCTGGGCAGAGGCTGGCGTGTGTTGGCACCGCCCTCAATGGCGATG  50
      |||| |||| |||||||| |||||   | ||| ||||||  |||||||||
seq2  CGATTCTGGCCAGAGGCT-GCGTG---TTGCA-CGCCCTTCATGGCGATG  45

seq1  CCCAGTGTGGCTGCACTTTTCCTCACACGGACCAGGGTGGACGTTGGCTC  100
      || || |||||||||   || |||||| |||| ||||| |||| ||||| 
seq2  CCAAG-GTGGCTGCA---TTTCTCACA-GGACAAGGGT-GACG-TGGCTT  88

seq1  CAGCAGGCCGGGCTGCAGGTGGGAGAAGGGTGGCCTTGATGTTTCTCAGA  150
      ||||||    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||
seq2  CAGCAG---CGGCTGCA-GTGGGAG-AGGGTGGCTTTGAT-TTTTTCAGA  132

seq1  GGAGGGCAGTTGAAGCCTCAAA-TATGACCCCTCAGACTGCCTGCGCTAC  199
      ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GGAGGGCAG-TGAAG-CTCAAATTATGACCCCTCAGACTG-CTGCGCTAC  179

seq1  CATGCTACACTAGAGTAGAGAGCAGCCACCAGTGCTTGCCACCCAGGAGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
seq2  CATGCTACACTAGAGTAGAGAGCAGCCACCAGTGCT--GCACCCAGGAGC  227

seq1  AGGGCAAAGTGAGGCTCTACGATTCCTAGCACAGGGACCCTTCCGGATGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AGGGCAAAGTGAGGCTCTACGATTCCTAGCACAGGGACCCTTCGGGATGA  277

seq1  GCCCTTCCCGCAACGCATCCTATGGGTCGCATGCCAAGTGTCTCCTGATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GCCCTTCCCGCAACGCATCCTATGGGTCGCATGCCAAGTGTCT-CTGATT  326

seq1  CTCAGGCCCGTCCATCCTCCGCCAGGGCCCTGTGTGCAGTCCCGACTCAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGCCCGTCCATCCTCCGCCAGGGCCCTGTGTGCAGTCCCGACTCAC  376

seq1  AGGTTTGTTGGCACCCTCCGCGGTCCTCTCCGTCCGGGGCTGCTCCTTGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTGTTGGCACCCTCCGCGGTCCTCTCCGTCCGGGGCTGCTCCTTGC  426

seq1  CATTCTTGTTCTTAGCGGATGCTGTCTGTCTGCCTCGGCCTGAGGTGCTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTGTTCTTAGCGGATGCTGTCTGTCTGCCTCGGCCTGAGGTGCTG  476

seq1  GCCTCCGTCTCCCCGGCATCCACGCCACTGTCCTCGCTCAGGGTCTGCCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCGTCTCCCCGGCATCCACGCCACTGTCCTCGCTCAGGGTCTGCCC  526

seq1  ACTGTCTGAGAGCTGAGAGAGTGTGGAGGCTGCTGGGGACACATGAGGAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCTGAGAGCTGAGAGAGTGTGGAGGCTGCTGGGGACACATGAGGAG  576

seq1  ACAACAGCTGTCATGGAGGGCAACGTGGGGGAGGTGATGGAGCTGGGGGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAGCTGTCATGGAGGGCAACGTGGGGGAGGTGATGGAGCTGGGGGG  626

seq1  GGGGAGGTGAATGGCTGTGACAATTGACCATGCAAAGATGGAGGGAAGGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGGTGAATGGCTGTGACAATTGACCATGCAAAGATGGAGGGAAGGA  676

seq1  TGAAGGGATACAGGAGCTGGAGGGCAAGGCATAGTCCCTGCAACCTTCCC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGGATACAGGAGCTGGAGGGCAAGGCATAGTCCCTGCAACCTTCCC  726

seq1  CATCTCTTGACATCCTGACCTGCCAACAGGGCTTGGCCTGATGGTCACTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCTTGACATCCTGACCTGCCAACAGGGCTTGGCCTGATGGTCACTA  776

seq1  CTCCCAGGACTTCTGCCCAGACCCCCCCAGGCACTGGCATAAATATGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCAGGACTTCTGCCCAGACCCCCCCAGGCACTGGCATAAATATGAAA  826

seq1  ATAGAGGTTAATGGGCCGGCTCAGCTCCCAGAAAAAAAGAAAAGCATGAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGTTAATGGGCCGGCTCAGCTCCCAGAAAAAAAGAAAAGCATGAA  876

seq1  AGGTCTGCCACCTTTTTTGTGACTACCCTGCTGTGAGCTGAGTGGTGGAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGCCACCTTTTTTGTGACTACCCTGCTGTGAGCTGAGTGGTGGAC  926

seq1  ACACGGATCCTGTTCCCCAGTCAGCAAAGCTGCTTCATTTTGTGTGTGGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGGATCCTGTTCCCCAGTCAGCAAAGCTGCTTCATTTTGTGTGTGGC  976

seq1  CACTGGACCCTGAGCTGGGGTCTCTTGCTTAAGAATGTGCACTGTGGCCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGACCCTGAGCTGGGGTCTCTTGCTTAAGAATGTGCACTGTGGCCC  1026

seq1  CTGGTGTTTGGGGTAGTAACACTGTGCAAGCTTGGGTGAGGGATGAATCC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGTTTGGGGTAGTAACACTGTGCAAGCTTGGGTGAGGGATGAATCC  1076

seq1  TCCCACAGCTGCCTGCCCTTGTTCTAATCCCAGAGAGTGATGCAGACGCA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACAGCTGCCTGCCCTTGTTCTAATCCCAGAGAGTGATGCAGACGCA  1126

seq1  GGGTTGTCACAGAGACGACTGTGCAGGGAGGAGCAGTGTGGGGCTGTGCC  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTGTCACAGAGACGACTGTGCAGGGAGGAGCAGTGTGGGGCTGTGCC  1176

seq1  AAGCTGTGAGAATTC  1214
      |||||||||||||||
seq2  AAGCTGTGAGAATTC  1191

seq1: chr4_62941546_62942635
seq2: B6Ng01-326G07.g_77_1170

seq1  TCTGATAGGAGGAGCCATGCTACAGGACATTAGCACTTACCTCTGCACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGATAGGAGGAGCCATGCTACAGGACATTAGCACTTACCTCTGCACAA  50

seq1  CCAATGTGGCGAGTCATGGCTCAAAGGATGAATGTGGCTCACGGGTAAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGTGGCGAGTCATGGCTCAAAGGATGAATGTGGCTCACGGGTAAGG  100

seq1  CTTTTCAGGCAGGGCAGCTGACTCAGGGCTCAGTGTCCCCAGAACGTGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCAGGCAGGGCAGCTGACTCAGGGCTCAGTGTCCCCAGAACGTGGG  150

seq1  ACTCTGTCCTCTGACACGGATGACCATGTGTGACAGCCTAATGTGTTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGTCCTCTGACACGGATGACCATGTGTGACAGCCTAATGTGTTTCT  200

seq1  ATATCTCTGTTCTCCCACCTCTCTCTCAACAAGTCTCAAGCAGGAAAGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCTCTGTTCTCCCACCTCTCTCTCAACAAGTCTCAAGCAGGAAAGCT  250

seq1  GTCTTTGAACTTGATATGTGACTAAAGATGACCTATAACTCTTTACTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTGAACTTGATATGTGACTAAAGATGACCTATAACTCTTTACTGTC  300

seq1  CTGTCTCTGCCTCCTCCTCACAATGCTAAGATTAAAGACACCAAGGATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCTCTGCCTCCTCCTCACAATGCTAAGATTAAAGACACCAAGGATCA  350

seq1  CCACACTCAGTGCATTCTGCATTTTCTCAGCCACTCTGAAAAGTCAGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACACTCAGTGCATTCTGCATTTTCTCAGCCACTCTGAAAAGTCAGGCT  400

seq1  TGGGGCCTGCAGAGAAAGGGGATCAAGTAGCTGACCTACCCCAGGTCACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCCTGCAGAGAAAGGGGATCAAGTAGCTGACCTACCCCAGGTCACA  450

seq1  CAAGAGTAGTGGTAGGGGTGAACACCAGTGGGGTGGGGGCTTGTTCTGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTAGTGGTAGGGGTGAACACCAGTGGGGTGGGGGCTTGTTCTGAG  500

seq1  CACCTGCCAACCAGAGGCCCAGGTGACCTGGCTTTCTGCTTTCCCATAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTGCCAACCAGAGGCCCAGGTGACCTGGCTTTCTGCTTTCCCATAGG  550

seq1  GTTTCCCAGGAGACATTGGCCCTCCAGGGGACAATGGCCCTGAAGGCATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCCCAGGAGACATTGGCCCTCCAGGGGACAATGGCCCTGAAGGCATG  600

seq1  AAGGTGAGTTCTCTCCCACCTAAGGTCCTTGGCTGAAGAAGCCCCAGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGAGTTCTCTCCCACCTAAGGTCCTTGGCTGAAGAAGCCCCAGGGC  650

seq1  CCAAGGTGGCTGCACCATCTGGTGTCCTGTCAACCTGATGTGGAGGTACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGTGGCTGCACCATCTGGTGTCCTGTCAACCTGATGTGGAGGTACT  700

seq1  ACCTCTGAGACCATTTCTGTTCTCTTTCCCAGGGTAAGCCTGGAGCCCGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGAGACCATTTCTGTTCTCTTTCCCAGGGTAAGCCTGGAGCCCGA  750

seq1  GGCCTGCCTGGACCTCCTGGGCAGCTGGGGCCTGAGGTAAGATAGCCCTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGCCTGGACCTCCTGGGCAGCTGGGGCCTGAGGTAAGATAGCCCTG  800

seq1  TCCCCTCCTGTCCCTCTTTGTCTTCTCTAGCCTATCCCAGCACCTAGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCTGTCCCTCTTTGTCTTCTCTAGCCTATCCCAGCACCTAGCTG  850

seq1  GCTCTGTCCAGGGTACCAAAGCCATGATTGAGGGCAGGACCACTTGAGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGTCCAGGGTACCAAAGCCATGATTGAGGGCAGGACCACTTGAGAT  900

seq1  TCAT-CACCAGAGAATCTATCTGTTCTCTTACAACCCTGCCTGTGACTCT  949
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCACCAGAGAATCTATCTGTTCTCTTACAACCCTGCCTGTGACTCT  950

seq1  TCTCTGACCTGGTGGGGCAAGCGACTTT--CCTTCCACACATAGCA-CAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||
seq2  TCTCTGACCTGGTGGGGCAAGCGACTTTTCCTTTCCACACATAGCACCAG  1000

seq1  TATCAG-TCTCAAAATGAGAGGATAGGAAATGTTGGACCCC-TTTCAT--  1042
      |||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  
seq2  TATCAGTTCTTCAAATGAGA-GATAGAAAATGTTGGACCCCTTTTCATTA  1049

seq1  AAGTGGAGATCCAGGGAAGGAAATGACTGCCAGGCCCCGTGTTAGCAG  1090
      | ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||
seq2  AGGTGGAGATCCAGGTAAGGAAATGACTG-CAG--CCCGTGTTAGCAG  1094