BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-332C24
Chromosome4 (Build37)4 (Build37)
Map Location 147,166,056 - 147,166,696146,713,012 - 146,713,858
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneOTTMUSG00000010694, LOC666474, LOC666482, LOC434514, LOC626288, LOC666498, LOC100043034, LOC666514, LOC100041561, LOC100041570, OTTMUSG00000010657, LOC384087, LOC666546, LOC666557, LOC545716, LOC666574, LOC666581, EG666588, LOC627701, OTTMUSG00000010671, LOC545718, OTTMUSG00000010673, 2610305D13Rik, LOC666618, LOC100043100, LOC666640, LOC194189, LOC666652, LOC100041677
Downstream geneLOC277692, MGC67181, D4Wsu114e, Fv1, Mfn2, Plod1, 2510039O18Rik, Nppb, Nppa, Clcn6, Mthfr, LOC433806, Agtrap, 2610109H07Rik, Mad2l2, Fbxo6, Fbxo44, Fbxo2, Ptchd2, Ubiad1, Frap1, Angptl7, Exosc10, LOC100043151, Srm, Masp2, Tardbp, Gm572, LOC100041733, LOC100041742
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-332C24.bB6Ng01-332C24.g
ACCGA118362GA118363
length1,042851
definitionB6Ng01-332C24.b B6Ng01-332C24.g
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(147,166,056 - 147,166,696)(146,713,012 - 146,713,858)
sequence
gaattcttctttccttaggcaaaccttatactaatgccaaaaggataaca
ttgtgtaaaaggcaaagaagagaaacactagaaagtcatcatacaaagtt
ggtgtacatctacaccccaaacaggtaaacagaagaaaatatatggccaa
agtcttccagtgaaaaacagacagcatattcaacaaatggtgctggatca
agtgtcagtccacatgtagaagaatgccaattgattcactcctaccgcct
tgtacaatgctcaagtcaacgtgggtcaagaacctccacataaaaccaga
tacattgaatctaatacaagagaaagggggaaaaaagccttcaacacatc
tgcaaagggtaaattttcctgaatagaacagaaatggctcaagttcaaag
gtcaactatgggctggtgagatggctcagtgggtaagagcacccgacttc
tcttcagaaggtctgcagttcaaatcccagcaaccacatggtggctcaca
atcatccgtaatgagatctgactccctcttctggagtgtctgaagacagc
tatagtgtacttacatataaataaataaatctttaaaaaaaaaaaggtca
actatggacaaatgggatctcataaaattgaaaaacttctgtaaggcaaa
aaaaaaaaaaacaaacaaaaaaaaaaacactgtcaataggacaaaacagc
aattcacggaatggtaaaagatcgtaaccattcctctgtctgacagaggg
ctaatgtccactatatagaaagaactcaagaagttagactctagagaacc
aaataaccctattaaaaatagggtatgcagccattgaaggagttacagag
acaaagtttggagctgagactgaaggaagggccatccagagactgcccta
ccggggatccatcccataaacaacccccaaacccagacactatttcaact
gtcaacaagattttgctggcaggaccctgatatgcctgtctctctgaagc
tatgcagtttctggcaaataaactggattttcaacagagtga
gaattcaatctggtcctccacaagggcagcagagtgtttttaattactga
gctatctccccaagcctctaaatcacttcttaaaatgcaggaatgtatat
aaactcactggcaacatatcctcagcaacctcagtaaaactgtgatatag
ctctaaatgtcacacaggaggagcaatgaaaagtacttacaaaaaaaaaa
aaaagactggagcgggacacttagagctagcttcaaagcacaaggccctc
tcctggcctctgcaggtacctgtacttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtatttgtggcatgtacacgtttgtatgcatatacataagtgtgtgg
tatgtttgtgtgcatttacatgtgtatgtgcagtgtgtacagtgtatgtt
tgcatgtgtattagcagtgtggtgtgcatgtgtgcatgtatgtttctgtg
tgtaggtatattatgtgcagcatgtgtgtgtatgcgtatatgcgtgtatg
tgtccctgtgtatataacaaaggtaaccaaaaaatcttttttaaaaatta
gttaggctggagatatggctcagtgggtgggagcactgacagttctgcaa
gaggttctgagttcaagttcagcaaccgaatgatggttcacaaccatttg
tattaggatctgatatcctcttatggtgtatctgaagagagtgacagtgc
acacagatacataaaataaataaatcttttaaaaagctgagtcaaataaa
tcctatctcaaaaataaaaagttgttttggcttgtattggtaaagaaact
gacaaatcctgacctgcctgaaggtttgaatcctcagaacctaccttaaa
a
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_147166056_147166696
seq2: B6Ng01-332C24.b_48_688

seq1  GAATTCTTCTTTCCTTAGGCAAACCTTATACTAATGCCAAAAGGATAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTTCCTTAGGCAAACCTTATACTAATGCCAAAAGGATAACA  50

seq1  TTGTGTAAAAGGCAAAGAAGAGAAACACTAGAAAGTCATCATACAAAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTAAAAGGCAAAGAAGAGAAACACTAGAAAGTCATCATACAAAGTT  100

seq1  GGTATACATCTACACCCCAAACAGGTAAACAGAAGAAAATATATGGCCAA  150
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTACATCTACACCCCAAACAGGTAAACAGAAGAAAATATATGGCCAA  150

seq1  AGACTTCCAGTGAAAAACAGACAGCACATTCAACAAATGGTGCTGGATCA  200
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCCAGTGAAAAACAGACAGCATATTCAACAAATGGTGCTGGATCA  200

seq1  AGTGTCAGTCCACATTTAGAAGAATGCCAATTGATTCACTCTTACTGCCT  250
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
seq2  AGTGTCAGTCCACATGTAGAAGAATGCCAATTGATTCACTCCTACCGCCT  250

seq1  TGTACAATGCTCAAGTCAACGTGGGTCAAGAACCTCCACATAAAACCAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACAATGCTCAAGTCAACGTGGGTCAAGAACCTCCACATAAAACCAGA  300

seq1  TACATTGAATCTAATACAAGAGAAAGGGGGAAAAAAGCCTTCAACACATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTGAATCTAATACAAGAGAAAGGGGGAAAAAAGCCTTCAACACATC  350

seq1  TGCAAAGGGTAAATTTTCCTGAATAGAACAGAAATGGCTCAAGTTCAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAGGGTAAATTTTCCTGAATAGAACAGAAATGGCTCAAGTTCAAAG  400

seq1  GTCAACTATGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACTATGGGCTGGTGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTTC  450

seq1  TCTTCAGAAGGTCTGCAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGAAGGTCTGCAGTTCAAATCCCAGCAACCACATGGTGGCTCACA  500

seq1  ATCATCCGTAATGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCCGTAATGAGATCTGACTCCCTCTTCTGGAGTGTCTGAAGACAGC  550

seq1  TATAGTGTACTTACATATAAATAAATAAATCTTTTTTAAAAAAAAGGTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
seq2  TATAGTGTACTTACATATAAATAAATAAATCTTTAAAAAAAAAAAGGTCA  600

seq1  ACTATGGACAAATGGGATCTCATAAAATTGAAAAACTTCTG  641
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGACAAATGGGATCTCATAAAATTGAAAAACTTCTG  641

seq1: chr4_146713012_146713858
seq2: B6Ng01-332C24.g_66_916

seq1  GAATTCAATCTGGTCCTCCACAAGGGCAGCAGAGTGTTTTTAATTACTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATCTGGTCCTCCACAAGGGCAGCAGAGTGTTTTTAATTACTGA  50

seq1  GCTGCCTCCCCAAGCCTCTAAATCACTTCTTAAAATGCAGGAATGTATAT  100
      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCTCCCCAAGCCTCTAAATCACTTCTTAAAATGCAGGAATGTATAT  100

seq1  AAACTCACTGGCAGCATATCCTTGGCAATCTCACTAAAACTATGATGTAG  150
      ||||||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||
seq2  AAACTCACTGGCAACATATCCTCAGCAACCTCAGTAAAACTGTGATATAG  150

seq1  CTCTAAATGTCACACAGAAGGAGCAATGAAAAGTACGTACAAAAAAAAAA  200
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||
seq2  CTCTAAATGTCACACAGGAGGAGCAATGAAAAGTACTTAC--AAAAAAAA  198

seq1  AAAAAAGACTGGAGCGGGACACTTAGAGCTAGCTTCAAAGCACAAGGCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGACTGGAGCGGGACACTTAGAGCTAGCTTCAAAGCACAAGGCCC  248

seq1  TCTCCTGGCCTCTGCAGGTACCTGTACT----TGTGTATGTGTGTGTGTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||
seq2  TCTCCTGGCCTCTGCAGGTACCTGTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  298

seq1  TGTGTGTATTTGTGGCATGTACACATTTGTATGCATATACATATGTGTGT  346
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGTGTGTATTTGTGGCATGTACACGTTTGTATGCATATACATAAGTGTGT  348

seq1  GGTATGTTTGTGTGCATTTACATGTGTATGTGCAGTGTGTACAGTGTATG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGTTTGTGTGCATTTACATGTGTATGTGCAGTGTGTACAGTGTATG  398

seq1  TTTGCATGTGTATTAGCAGTGTGGTGTGCATGTGTGCATGTATGTTTCTG  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCATGTGTATTAGCAGTGTGGTGTGCATGTGTGCATGTATGTTTCTG  448

seq1  TGTGTAGGTATATTATGTGCAGCATGTGTGTGTGTATGCGTACATGCGTG  496
      ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||
seq2  TGTGTAGGTATATTATGTGCAGCA--TGTGTGTGTATGCGTATATGCGTG  496

seq1  TATGTGTCCCTGTGTATATAACAAAGGTAACCAAAAAATCTTTTTTAAAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGTCCCTGTGTATATAACAAAGGTAACCAAAAAATCTTTTTTAAAA  546

seq1  ATTAGTTAGGCTGGAGATATGGCTCAGTGGGTGGGAGCACTGACAGTTCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTAGGCTGGAGATATGGCTCAGTGGGTGGGAGCACTGACAGTTCT  596

seq1  GCAAGAGGTTCTGAGTTCAAGTTCAGCAACCGAATGGTGGCTCACAACCA  646
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||
seq2  GCAAGAGGTTCTGAGTTCAAGTTCAGCAACCGAATGATGGTTCACAACCA  646

seq1  TTTGTATTGGGATCTGATATCCTCTTATGGTGTATCTGAAGAGAGTGACA  696
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTATTAGGATCTGATATCCTCTTATGGTGTATCTGAAGAGAGTGACA  696

seq1  GTGCACACAGATACATAAAATAAATAAATC-TTTAAAAAGCTGAGTCAAA  745
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||
seq2  GTGCACACAGATACATAAAATAAATAAATCTTTTAAAAAGCTGAGTC-AA  745

seq1  ATAAATCCTATCTCAAAAATAAAAAGTTGTTTTGGC-TCTATTGGTAAAG  794
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
seq2  ATAAATCCTATCTCAAAAATAAAAAGTTGTTTTGGCTTGTATTGGTAAAG  795

seq1  AACCTGACAAAGCCTGA-CTGCCTG-AGGTTTGGATCCTCAGAACCTACA  842
      || |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| 
seq2  AAACTGACAAATCCTGACCTGCCTGAAGGTTTGAATCCTCAGAACCTACC  845

seq1  TAAAA-  847
      | ||| 
seq2  TTAAAA  851