BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-332G20
Chromosome4 (Build37)
Map Location 150,847,857 - 150,959,695
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCamta1
Upstream geneRere, Slc45a1, LOC677027, Errfi1, Park7, Tnfrsf9, Uts2, Per3, Vamp3
Downstream geneLOC100041960, Dnajc11, Thap3, Phf13, Klhl21, Zbtb48, Tas1r1, Nol9, EG666980, Plekhg5, Tnfrsf25, Espn, LOC100043284, Hes2, Acot7, Gpr153, Hes3, Icmt, Rnf207, Rpl22, Chd5, Kcnab2, LOC100042028, Nphp4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-332G20.bB6Ng01-332G20.g
ACCGA118535GA118536
length1,185922
definitionB6Ng01-332G20.b B6Ng01-332G20.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(150,958,510 - 150,959,695)(150,847,857 - 150,848,779)
sequence
gaattctcagtctgtgacatgtggacaaggacaaaatcttcagcattgtc
agctggaaccaagattaggatgagatgtgttctgtgccccactggccctg
cgtgtggtccgtctatctgtcccgagctatggacgaacaggttctggctt
ttagaccgttccctccttagatggctgtagtcattaattttcttgttgct
tggacaaaacacctgaaggaaaaccaactcaaaaaagtgaagacttattt
tggctcaaggtctgaagttaaacagttcatctgggcagggaaggcatggt
ggcaggagggtgaagccactgggccacaatgagtttgtagtcaggatgca
gagagagatgaacacgacactcaactcacttcttattcaagtccaggatt
ccagcccttgggatgataccaccctcagttaaggtgtgtcttctcttctt
gataaacttatcataggaactgctaagaagcatacatgcggtttttctct
taggccattctagactctatcaagttactgatattggccaccatgcttct
tgaatccaagttggacaaaagaactatttacaaggccaggcgaagttctc
cagaacatggtgggttttaagcacgcacgcacacacgcaccacagtgctt
tagaacatagcaaggcgggagctctctttcatgtttaagaccaggaaatt
ggggatcaattgagaggaggacttatcttctggccacactgaactcagtg
actttttggagtatagtggaccaagagacttcttgacacgaggaagaggg
ataggtgcacgggagatggaatgaggggttctatggatctgtggaattgt
gactattgtgtgaaaatcttacactccttaaaaagtaccacgttgctcct
tccgtctttccttccttccctcattccctttcctacctcccctcccctct
cttcctcagatacccaactgttaggatcacatgtgtgcactgccatgcca
gccttcccccccaccaccccttttctcttctttattagagtagagctcta
ttcctgtcttccctggggtcctcagagcatcacaggtgaacataacatct
gtcacctgctgcagtttgactggtccatgtccttccaggccatcgctgct
atttgtcctgtgggccaggcttcagtctgctggag
gaattctcaatgctgcagagagtgtgtgccggactctctcggctgctcct
aggcaggcaagacaccaagaagagggagaagctgggcttaggaggagaga
acatgggaaaccaggattggagacacagtcagcttgttgacaaactcctc
tgtgaggcaagaaagtcaacacatggatgggacaccgccaaaggcagagg
ggtgtgctgtgcaaggagccatgaagtgtcccatgtggcggcatggcccc
tggagcacctctaggagggccagcattcacaacccaacagatgcaagttc
acccccacccaagcccagatactatttcaaagtcggggcatgaagtggga
cttgcaaggacatgcaaggacatggtctaaaaggtgccttagcctgtcgt
tgacagggcaaaggaaaggagcccggaacggggaagggacggcagggagt
gcaggaagggattaggtgtgccccacacgctaagcctctgcctcccccag
caggcacacgcagacctgcagctcggatcctcatagccagagggtccgag
gagctgggccaggcgatgaatcatcaccctgatggggacagaaaacatca
gctttgcaggtcccacggcctgtctgacacaacacgcaagggattttccc
gacagtatcatccgtttagctgatggccctgaagtatttcatttagctgg
aaatcacgcctggtccatttcccagagccggctgacattatgagaagccc
gtgtgacgtgcctgcaggaaggcagctcaataccccgtcacctgcagtca
gggccccactaccctcacacgggagcacggggctcagtggcttctagagc
agaattgctgcttcctgctaggatgggctcatagcaagcccgggtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_150958510_150959695
seq2: B6Ng01-332G20.b_44_1228 (reverse)

seq1  CTCCAGCAGACTGGAGGCCGTGGCTCACAGG--CAATAGCAGCGATGGCC  48
      ||||||||||||| ||  | |||| ||||||   ||||||||||||||||
seq2  CTCCAGCAGACTGAAG--CCTGGCCCACAGGACAAATAGCAGCGATGGCC  48

seq1  TGTGAAGGACATGGA-CAGTCATACCTGCAAGGCAGGTGACAGATGTTAT  97
      || |||||||||||| |||||| | |||||  ||||||||||||||||||
seq2  TG-GAAGGACATGGACCAGTCA-AACTGCA--GCAGGTGACAGATGTTAT  94

seq1  G-TCACCTGTGATGCTCTTGAGGA-CCCAGGGAAGACAGGATAGGAGCTC  145
      | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||
seq2  GTTCACCTGTGATGCTC-TGAGGACCCCAGGGAAGACAGGAATAGAGCTC  143

seq1  TACTTCTAATAAAGAAGAG-AAAGGGGT-GTGGGGGGG-AGGCTGGGCAT  192
      ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||
seq2  TAC-TCTAATAAAGAAGAGAAAAGGGGTGGTGGGGGGGAAGGCT-GGCAT  191

seq1  GGCAGTGCACACATGTGATCCTAACAGTTGGGTATCTGAGGAAGAGAGGG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGCACACATGTGATCCTAACAGTTGGGTATCTGAGGAAGAGAGGG  241

seq1  GAGGGGAGGTAGGAAAGGGAATGAGGGAAGGAAGGAAAGACGGAAGGAGC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGAGGTAGGAAAGGGAATGAGGGAAGGAAGGAAAGACGGAAGGAGC  291

seq1  AACGTGGTACTTTTTAAGGAGTGTAAGATTTTCACACAATAGTCACAATT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGGTACTTTTTAAGGAGTGTAAGATTTTCACACAATAGTCACAATT  341

seq1  CCACAGATCCATAGAACCCCTCATTCCATCTCCCGTGCACCTATCCCTCT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGATCCATAGAACCCCTCATTCCATCTCCCGTGCACCTATCCCTCT  391

seq1  TCCTCGTGTCAAGAAGTCTCTTGGTCCACTATACTCCAAAAAGTCACTGA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCGTGTCAAGAAGTCTCTTGGTCCACTATACTCCAAAAAGTCACTGA  441

seq1  GTTCAGTGTGGCCAGAAGATAAGTCCTCCTCTCAATTGATCCCCAATTTC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAGTGTGGCCAGAAGATAAGTCCTCCTCTCAATTGATCCCCAATTTC  491

seq1  CTGGTCTTAAACATGAAAGAGAGCTCCCGCCTTGCTATGTTCTAAAGCAC  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCTTAAACATGAAAGAGAGCTCCCGCCTTGCTATGTTCTAAAGCAC  541

seq1  TGTGGTGCGTGTGTGCGTGCGTGCTTAAAACCCACCATGTTCTGGAGAAC  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGCGTGTGTGCGTGCGTGCTTAAAACCCACCATGTTCTGGAGAAC  591

seq1  TTCGCCTGGCCTTGTAAATAGTTCTTTTGTCCAACTTGGATTCAAGAAGC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGCCTGGCCTTGTAAATAGTTCTTTTGTCCAACTTGGATTCAAGAAGC  641

seq1  ATGGTGGCCAATATCAGTAACTTGATAGAGTCTAGAATGGCCTAAGAGAA  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGGCCAATATCAGTAACTTGATAGAGTCTAGAATGGCCTAAGAGAA  691

seq1  AAACCGCATGTATGCTTCTTAGCAGTTCCTATGATAAGTTTATCAAGAAG  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCGCATGTATGCTTCTTAGCAGTTCCTATGATAAGTTTATCAAGAAG  741

seq1  AGAAGACACACCTTAACTGAGGGTGGTATCATCCCAAGGGCTGGAATCCT  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACACACCTTAACTGAGGGTGGTATCATCCCAAGGGCTGGAATCCT  791

seq1  GGACTTGAATAAGAAGTGAGTTGAGTGTCGTGTTCATCTCTCTCTGCATC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTGAATAAGAAGTGAGTTGAGTGTCGTGTTCATCTCTCTCTGCATC  841

seq1  CTGACTACAAACTCATTGTGGCCCAGTGGCTTCACCCTCCTGCCACCATG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTACAAACTCATTGTGGCCCAGTGGCTTCACCCTCCTGCCACCATG  891

seq1  CCTTCCCTGCCCAGATGAACTGTTTAACTTCAGACCTTGAGCCAAAATAA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCTGCCCAGATGAACTGTTTAACTTCAGACCTTGAGCCAAAATAA  941

seq1  GTCTTCACTTTTTTGAGTTGGTTTTCCTTCAGGTGTTTTGTCCAAGCAAC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCACTTTTTTGAGTTGGTTTTCCTTCAGGTGTTTTGTCCAAGCAAC  991

seq1  AAGAAAATTAATGACTACAGCCATCTAAGGAGGGAACGGTCTAAAAGCCA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAATTAATGACTACAGCCATCTAAGGAGGGAACGGTCTAAAAGCCA  1041

seq1  GAACCTGTTCGTCCATAGCTCGGGACAGATAGACGGACCACACGCAGGGC  1092
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTGTTCGTCCATAGCTCGGGACAGATAGACGGACCACACGCAGGGC  1091

seq1  CAGTGGGGCACAGAACACATCTCATCCTAATCTTGGTTCCAGCTGACAAT  1142
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGGGCACAGAACACATCTCATCCTAATCTTGGTTCCAGCTGACAAT  1141

seq1  GCTGAAGATTTTGTCCTTGTCCACATGTCACAGACTGAGAATTC  1186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAGATTTTGTCCTTGTCCACATGTCACAGACTGAGAATTC  1185

seq1: chr4_150847857_150848779
seq2: B6Ng01-332G20.g_68_989

seq1  GAATTCTCAATGCTGCAGAGAGTGTGTGCCGGACTCTCTCGGCTGCTCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCAATGCTGCAGAGAGTGTGTGCCGGACTCTCTCGGCTGCTCCT  50

seq1  AGGCAGGCAAGACACCAAGAAGAGGGAGAAGCTGGGCTTAGGAGGAGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGCAAGACACCAAGAAGAGGGAGAAGCTGGGCTTAGGAGGAGAGA  100

seq1  ACATGGGAAACCAGGATTGGAGACACAGTCAGCTTGTTGACAAACTCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGAAACCAGGATTGGAGACACAGTCAGCTTGTTGACAAACTCCTC  150

seq1  TGTGAGGCAAGAAAGTCAACACATGGATGGGACACCGCCAAAGGCAGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGGCAAGAAAGTCAACACATGGATGGGACACCGCCAAAGGCAGAGG  200

seq1  GGTGTGCTGTGCAAGGAGCCATGAAGTGTCCCATGTGGCGGCATGGCCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGCTGTGCAAGGAGCCATGAAGTGTCCCATGTGGCGGCATGGCCCC  250

seq1  TGGAGCACCTCTAGGAGGGCCAGCATTCACAACCCAACAGATGCAAGTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCACCTCTAGGAGGGCCAGCATTCACAACCCAACAGATGCAAGTTC  300

seq1  ACCCCCACCCAAGCCCAGATACTATTTCAAAGTCGGGGCATGAAGTGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCACCCAAGCCCAGATACTATTTCAAAGTCGGGGCATGAAGTGGGA  350

seq1  CTTGCAAGGACATGCAAGGACATGGTCTAAAAGGTGCCTTAGCCTGTCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCAAGGACATGCAAGGACATGGTCTAAAAGGTGCCTTAGCCTGTCGT  400

seq1  TGACAGGGCAAAGGAAAGGAGCCCGGAACGGGGAAGGGACGGCAGGGAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGGCAAAGGAAAGGAGCCCGGAACGGGGAAGGGACGGCAGGGAGT  450

seq1  GCAGGAAGGGATTAGGTGTGCCCCACACGCTAAGCCTCTGCCTCCCCCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAAGGGATTAGGTGTGCCCCACACGCTAAGCCTCTGCCTCCCCCAG  500

seq1  CAGGCACACGCAGACCTGCAGCTCGGATCCTCATAGCCAGAGGGTCCGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCACACGCAGACCTGCAGCTCGGATCCTCATAGCCAGAGGGTCCGAG  550

seq1  GAGCTGGGCCAGGCGATGAATCATCACCCTGATGGGGACAGAAAACATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGGCCAGGCGATGAATCATCACCCTGATGGGGACAGAAAACATCA  600

seq1  GCTTTGCAGGTCCCACGGCCTGTCTGACACAACACGCAAGGGATTTTCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTGCAGGTCCCACGGCCTGTCTGACACAACACGCAAGGGATTTTCCC  650

seq1  GACAGTATCATCCGTTTAGCTGATGGCCCTGAAGTATTTCATTTAGCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGTATCATCCGTTTAGCTGATGGCCCTGAAGTATTTCATTTAGCTGG  700

seq1  AAATCACGCCTGGTCCATTTCCCAGAGCCGGCTGACATTATGAGAAGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCACGCCTGGTCCATTTCCCAGAGCCGGCTGACATTATGAGAAGCCC  750

seq1  GTGTGACGTGCCTGCAGGAAGGCAGCTCAATACCCCGTCACCTGCAGTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGACGTGCCTGCAGGAAGGCAGCTCAATACCCCGTCACCTGCAGTCA  800

seq1  GGGCCCCACTACCCTCACACGGGAGCACGGGGCTCAGGTGGCTTCTAGAG  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGGCCCCACTACCCTCACACGGGAGCACGGGGCTCA-GTGGCTTCTAGAG  849

seq1  CAGAATTGCTGCTTCCTGCTAGGATGGGCTCATAGCAAGCCGGGGTGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGAATTGCTGCTTCCTGCTAGGATGGGCTCATAGCAAGCCCGGGTGTGT  899

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  923
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  922