BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-334A18
Chromosome4 (Build37)
Map Location 73,077,702 - 73,206,856
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039726, LOC667722, LOC623115
Upstream geneAldoa-ps2, EG384113, LOC667713, LOC100039698, OTTMUSG00000001246
Downstream geneOTTMUSG00000000281, OTTMUSG00000000280, OTTMUSG00000000282, OTTMUSG00000000283, Gm428, Rasef, LOC667768, LOC545637, LOC623272, OTTMUSG00000014862, OTTMUSG00000004010, 2310002L09Rik, Frmd3, LOC100039774, Jmjd2c, LOC100040258
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-334A18.bB6Ng01-334A18.g
ACCGA119649GA119650
length3771,041
definitionB6Ng01-334A18.b B6Ng01-334A18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,077,702 - 73,078,084)(73,205,816 - 73,206,856)
sequence
tttgatatctgactatatatgattattagtgagacaaaacttgtttcttg
tactcctttaatgtcagaatcaatcgtgatatggagacaattaattcttg
acccatagtcaatttgtcacaatctgacactcatatcgcaagccatgagt
ggtggaataaagatgcttagaggtgtatgccatggatgatgccgttattc
cgacaaatgtagaacaacttctactgctttgtcagtgtgttaatgcacat
tcaaaaagaagtacttgctgcagtctatttaagggagtggggggggttat
gggggacttttgggatagcattggaaatgtaaatgaataaaatacataat
aataataataattataatattaataat

gaattctttctggaggcctctatgcattctttcatgtcagctccttactt
gcaggtccagaagagaaaggtcccagtcccactggggtctctccaggtct
gagtggaatggtgaatgtcaactgcccaaaagacacatattgagctggga
atcttgttgaagcaggaattcaactttatggcatcagcttctcacttata
taagtttgtaacatggggaggggaatttttggtcgggtaagacgatgtaa
taggcaggaaataccttttgcaaggaagatattgagtgactgacagggcc
aatggcgaagctctacattagcaactgcagggcagaggcagggccaaaca
gatcttgctgagttatctcggcacggaagtgactgagacaggtcccaaaa
tgtgagtcagcctcacgtttgtcgtcaaggcccaaaccagggccaaaatg
gggcccaacactttcatagttatttgggcttttaggagagaagaattttg
ttgccagacatctatgatttgtgtctattgtgtgacttttctgaggatag
agaacagatgacaaggtcaggaaataattacattcatatctcccatggtg
agctagtgagtttatttgggttacagaagtataagtgaagagtgactcag
agggtcctcagtgactcactgaagatgatccatgaatgattgtgtccctg
tagctccttacagaattttcaggaaacttggtgggagagtatctctgctt
ctattgtgtagctcacaatgttagctatcagcttcaagctccagccatct
tgacccttgtaggatcataaaaggcagcctgattcctggtagagctaaag
gctggaaatctcagtgaccccgagggacagcacttggttgggcctggttc
ccagacactaggctcctgacatgagccacagctctccatagatttgtggc
catcaatcatgtaaaggcaacacaccaagtccctccacaggtagtggtcg
catagcctcagagagatctccattttatgagatagctaaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_73077702_73078084
seq2: B6Ng01-334A18.b_48_430

seq1  GAATTCTTTGATATCTGACTATATATGATTATTAGTGAGACAAAACTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGATATCTGACTATATATGATTATTAGTGAGACAAAACTTGT  50

seq1  TTCTTGTACTCCTTTAATGTCAGAATCAATCGTGATATGGAGACAATTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTACTCCTTTAATGTCAGAATCAATCGTGATATGGAGACAATTAA  100

seq1  TTCTTGACCCATAGTCAATTTGTCACAATCTGACACTCATATCGCAAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGACCCATAGTCAATTTGTCACAATCTGACACTCATATCGCAAGCC  150

seq1  ATGAGTGGTGGAATAAAGATGCTTAGAGGTGTATGCCATGGATGATGCCG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTGGTGGAATAAAGATGCTTAGAGGTGTATGCCATGGATGATGCCG  200

seq1  TTATTCCGACAAATGTAGAACAACTTCTACTGCTTTGTCAGTGTGTTAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCCGACAAATGTAGAACAACTTCTACTGCTTTGTCAGTGTGTTAAT  250

seq1  GCACATTCAAAAAGAAGTACTTGCTGCAGTCTATTTAAGGGAGTGGGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATTCAAAAAGAAGTACTTGCTGCAGTCTATTTAAGGGAGTGGGGGG  300

seq1  GGTTATGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAATAAAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTATGGGGGACTTTTGGGATAGCATTGGAAATGTAAATGAATAAAATA  350

seq1  CATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT  383
      |||||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  CATAATAATAATAATAATTATAATATTAATAAT  383


seq1: chr4_73205816_73206856
seq2: B6Ng01-334A18.g_66_1106 (reverse)

seq1  CTTTAGCTATCTCATTAAAATGGAGATCTCTCTTGAGGCTATGCGACCAC  50
      |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CTTTAGCTATCTCA-TAAAATGGAGATCTCTC-TGAGGCTATGCGACCAC  48

seq1  TACCTGTGGAGGGACTTGGTGTGTTGCCCTTACATGATTGATGGCCACAA  100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGTGGAGGGACTTGGTGTGTTGCCTTTACATGATTGATGGCCACAA  98

seq1  ATCTATGGAGAGCTGTGGCTCATGTCAGGAGCCTAGTGTCTGGGAACCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGGAGAGCTGTGGCTCATGTCAGGAGCCTAGTGTCTGGGAACCAG  148

seq1  G-CCAACCAAGTGCTGTCCCTCGGGGTCACTGAGATTTCCAGCC-TTAGC  198
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCCCAACCAAGTGCTGTCCCTCGGGGTCACTGAGATTTCCAGCCTTTAGC  198

seq1  TCTACCAGGAATCAGGCTGCCTTTTATGATCCTACAAGGGTCAAGATGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACCAGGAATCAGGCTGCCTTTTATGATCCTACAAGGGTCAAGATGGC  248

seq1  TGGAGCTTGAAGCTGATAGCTAACATTGTGAGCTACACAATAGAAGCAGA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTTGAAGCTGATAGCTAACATTGTGAGCTACACAATAGAAGCAGA  298

seq1  GATACTCTCCCACCAAGTTTCCTGAAAATTCTGTAAGGAGCTACAGGGAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTCTCCCACCAAGTTTCCTGAAAATTCTGTAAGGAGCTACAGGGAC  348

seq1  ACAATCATTCATGGATCATCTTCAGTGAGTCACTGAGGACCCTCTGAGTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCATTCATGGATCATCTTCAGTGAGTCACTGAGGACCCTCTGAGTC  398

seq1  ACTCTTCACTTATACTTCTGTAACCCAAATAAACTCACTAGCTCACCATG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTTCACTTATACTTCTGTAACCCAAATAAACTCACTAGCTCACCATG  448

seq1  GGAGATATGAATGTAATTATTTCCTGACCTTGTCATCTGTTCTCTATCCT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATATGAATGTAATTATTTCCTGACCTTGTCATCTGTTCTCTATCCT  498

seq1  CAGAAAAGTCACACAATAGACACAAATCATAGATGTCTGGCAACAAAATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAAGTCACACAATAGACACAAATCATAGATGTCTGGCAACAAAATT  548

seq1  CTTCTCTCCTAAAAGCCCAAATAACTATGAAAGTGTTGGGCCCCATTTTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTCCTAAAAGCCCAAATAACTATGAAAGTGTTGGGCCCCATTTTG  598

seq1  GCCCTGGTTTGGGCCTTGACGACAAACGTGAGGCTGACTCACATTTTGGG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGGTTTGGGCCTTGACGACAAACGTGAGGCTGACTCACATTTTGGG  648

seq1  ACCTGTCTCAGTCACTTCCGTGCCGAGATAACTCAGCAAGATCTGTTTGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCTCAGTCACTTCCGTGCCGAGATAACTCAGCAAGATCTGTTTGG  698

seq1  CCCTGCCTCTGCCCTGCAGTTGCTAATGTAGAGCTTCGCCATTGGCCCTG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGCCTCTGCCCTGCAGTTGCTAATGTAGAGCTTCGCCATTGGCCCTG  748

seq1  TCAGTCACTCAATATCTTCCTTGCAAAAGGTATTTCCTGCCTATTACATC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCACTCAATATCTTCCTTGCAAAAGGTATTTCCTGCCTATTACATC  798

seq1  GTCTTACCCGACCAAAAATTCCCCTCCCCATGTTACAAACTTATATAAGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTACCCGACCAAAAATTCCCCTCCCCATGTTACAAACTTATATAAGT  848

seq1  GAGAAGCTGATGCCATAAAGTTGAATTCCTGCTTCAACAAGATTCCCAGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGCTGATGCCATAAAGTTGAATTCCTGCTTCAACAAGATTCCCAGC  898

seq1  TCAATATGTGTCTTTTGGGCAGTTGACATTCACCATTCCACTCAGACCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATGTGTCTTTTGGGCAGTTGACATTCACCATTCCACTCAGACCTG  948

seq1  GAGAGACCCCAGTGGGACTGGGACCTTTCTCTTCTGGACCTGCAAGTAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGACCCCAGTGGGACTGGGACCTTTCTCTTCTGGACCTGCAAGTAAG  998

seq1  GAGCTGACATGAAAGAATGCATAGAGGCCTCCAGAAAGAATTC  1041
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGACATGAAAGAATGCATAGAGGCCTCCAGAAAGAATTC  1041


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |