BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-343B02
Chromosome4 (Build37)
Map Location 51,790,684 - 51,878,026
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100040979, LOC666681, LOC100040814
Downstream geneLOC384015, LOC100041026, LOC100041038, LOC666724, Smc2, LOC100040883, 4930547C10Rik, LOC100040908, LOC666761, Olfr275, Olfr274-ps1, Olfr273
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-343B02.bB6Ng01-343B02.g
ACCGA125946GA125947
length8731,143
definitionB6Ng01-343B02.b B6Ng01-343B02.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,877,157 - 51,878,026)(51,790,684 - 51,791,824)
sequence
gaattctatacatagaaatgattaatttaaaatattaaaacatatttaaa
caattcagagtactttgcttcatgttagaccagctgtggaaattttctgg
tgaaatctttagttttttttttttttttttttttttgtataaaatcatgc
agccttcaaataaagataccatttaatttttagattaatttaggagatca
ggtaaagtagctacagtttatacaagcttaacattcaccatacatgacaa
tgagaagaatgagctaagcttgcctgtcctgctaatctctgtattcaatt
tttcttttacaaactgaaagtgatttctttgccatctggccatacagacc
caatggcttcttaagccaaacttttagtacattactggatgataactcct
cctcagaggttgtggattacttttggaccagacctcagttcttctaagta
gcttgaggctaaagcttctctatgtacctggtggcaacactcccaattta
aactaaaagtttttacatatattctaagaactcctcttaaagaacattct
ttggatcttatgaacagctttttaaaagttgacaggggagaagtacagag
catcaggaatttgaaaggacatatgtagcagtaggggatggggaactgga
gtagccactagaaagtcccacatgccagggtcccaagagatttccaggac
ccaaaagagagggcattagaagaaatatccaactaaagagtacgcatgaa
tggactcatggctccatctgcatatgtagcatcaatgggagtggaggcac
ttggtcctatgaaggctggatgccccagtatagagtaatactagcatggt
gaggaggaagtggggtgggtgaa
gaattcagagactggggaggagtgatgcttgttctacacaagctgatgca
gtaatgactctgcaaaaggtgacatttaatcagtgacctgaataacaaga
agaaagcagatggcacaaacctgagctaagagcttgccagcatgccaagc
aggggagtcacaaagttctgggtgggaatgaccttggagtactggcagtg
ggtgagtatcctggaaagcttgtgcagggcattacctgtgacagaccagt
cagagatgcaccttttccaagggtgggtgagaagggttgagagctaggtt
ctcagaagcaaacacttgaggagaacttagaagtgcaagatactacattg
aaatcaattcatgagactgtggaaagtagtaaatggcagggttgtgccga
gaagaacccccaacatcaaagcacatcttaccttgttacagaaatgggaa
acttcacacctaggaaaacttcctagactgtggcatagaattcccatatg
cttattattgcttattttttttattgctattgtcagaagataatgactgc
acttactcatggggtatcgtgtgatgctttagctgattcatgactgtatt
ggtgcacttatatctaccatcacctctaaattgtttatggttgtggtgag
gacatttgagatcctgtagtctatttgttttatattatatagtacaatgg
tgttaatacaatcacagtctatgttagaacacaagttattccttctgtct
gcctttgattcagagttcattaactagtctccccctatccaatatcttct
caatcatgttctctacttggcctctaaaatctgtgactcttctctcctat
gagtttcataattaaagtcatgctgtagttgtctttctgtaccaagtgtt
ggcgaatttggtgaggaactctcaacaaaccttcactatgtatgtaaagg
tcatgtcatctgttgtggggagcgggtgtggcggcagtcccaaaggcgcc
agggactgcagctaagtcatatgacttgcacctgacttcctcatataaga
cacaaacatctttggagtgctgcgcagtgtaccaggaatacagggtgaaa
ttcattggtggagaattttgccccttgctgcctgatagctgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_51877157_51878026
seq2: B6Ng01-343B02.b_47_918 (reverse)

seq1  TCACCCA-CCCAC-TCCTCCTCACCATGCTAGTATTACTCTATACTGGGG  48
      ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCCACCCCACTTCCTCCTCACCATGCTAGTATTACTCTATACTGGGG  50

seq1  CATCCAGCCTTCATAGGACCAAGTGCCTCCACTCCCATTGATGCTACATA  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAGCCTTCATAGGACCAAGTGCCTCCACTCCCATTGATGCTACATA  100

seq1  TGCAGATGGAGCCATGAGTCCATTCATGCGTACTCTTTAGTTGGATATTT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGATGGAGCCATGAGTCCATTCATGCGTACTCTTTAGTTGGATATTT  150

seq1  CTTCTAATGCCCTCTCTTTTGGGTCCTGGAAATCTCTTGGGACCCTGGCA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAATGCCCTCTCTTTTGGGTCCTGGAAATCTCTTGGGACCCTGGCA  200

seq1  TGTGGGACTTTCTAGTGGCTACTCCAGTTCCCCATCCCCTACTGCTACAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGACTTTCTAGTGGCTACTCCAGTTCCCCATCCCCTACTGCTACAT  250

seq1  ATGTCCTTTCAAATTCCTGATGCTCTGTACTTCTCCCCTGTCAACTTTTA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCCTTTCAAATTCCTGATGCTCTGTACTTCTCCCCTGTCAACTTTTA  300

seq1  AAAAGCTGTTCATAAGATCCAAAGAATGTTCTTTAAGAGGAGTTCTTAGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCTGTTCATAAGATCCAAAGAATGTTCTTTAAGAGGAGTTCTTAGA  350

seq1  ATATATGTAAAAACTTTTAGTTTAAATTGGGAGTGTTGCCACCAGGTACA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATGTAAAAACTTTTAGTTTAAATTGGGAGTGTTGCCACCAGGTACA  400

seq1  TAGAGAAGCTTTAGCCTCAAGCTACTTAGAAGAACTGAGGTCTGGTCCAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAAGCTTTAGCCTCAAGCTACTTAGAAGAACTGAGGTCTGGTCCAA  450

seq1  AAGTAATCCACAACCTCTGAGGAGGAGTTATCATCCAGTAATGTACTAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAATCCACAACCTCTGAGGAGGAGTTATCATCCAGTAATGTACTAAA  500

seq1  AGTTTGGCTTAAGAAGCCATTGGGTCTGTATGGCCAGATGGCAAAGAAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGGCTTAAGAAGCCATTGGGTCTGTATGGCCAGATGGCAAAGAAAT  550

seq1  CACTTTCAGTTTGTAAAAGAAAAATTGAATACAGAGATTAGCAGGACAGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCAGTTTGTAAAAGAAAAATTGAATACAGAGATTAGCAGGACAGG  600

seq1  CAAGCTTAGCTCATTCTTCTCATTGTCATGTATGGTGAATGTTAAGCTTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTTAGCTCATTCTTCTCATTGTCATGTATGGTGAATGTTAAGCTTG  650

seq1  TATAAACTGTAGCTACTTTACCTGATCTCCTAAATTAATCTAAAAATTAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAACTGTAGCTACTTTACCTGATCTCCTAAATTAATCTAAAAATTAA  700

seq1  ATGGTATCTTTATTTGAAGGCTGCATGATTTTATACAAAAAAAAAAAAAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATCTTTATTTGAAGGCTGCATGATTTTATACAAAAAAAAAAAAAA  750

seq1  AAAAAAAAAACTAAAGATTTCACCAGAAAATTTCCACAGCTGGTCTAACA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAACTAAAGATTTCACCAGAAAATTTCCACAGCTGGTCTAACA  800

seq1  TGAAGCAAAGTACTCTGAATTGTTTAAATATGTTTTAATATTTTAAATTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCAAAGTACTCTGAATTGTTTAAATATGTTTTAATATTTTAAATTA  850

seq1  ATCATTTCTATGTATAGAATTC  870
      ||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTCTATGTATAGAATTC  872

seq1: chr4_51790684_51791824
seq2: B6Ng01-343B02.g_67_1209

seq1  GAATTCAGAGACTGGGGAGGAGTGATGCTTGTTCTACACAAGCTGATGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGACTGGGGAGGAGTGATGCTTGTTCTACACAAGCTGATGCA  50

seq1  GTAATGACTCTGCAAAAGGTGACATTTAATCAGTGACCTGAATAACAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGACTCTGCAAAAGGTGACATTTAATCAGTGACCTGAATAACAAGA  100

seq1  AGAAAGCAGATGGCACAAACCTGAGCTAAGAGCTTGCCAGCATGCCAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCAGATGGCACAAACCTGAGCTAAGAGCTTGCCAGCATGCCAAGC  150

seq1  AGGGGAGTCACAAAGTTCTGGGTGGGAATGACCTTGGAGTACTGGCAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAGTCACAAAGTTCTGGGTGGGAATGACCTTGGAGTACTGGCAGTG  200

seq1  GGTGAGTATCCTGGAAAGCTTGTGCAGGGCATTACCTGTGACAGACCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTATCCTGGAAAGCTTGTGCAGGGCATTACCTGTGACAGACCAGT  250

seq1  CAGAGATGCACCTTTTCCAAGGGTGGGTGAGAAGGGTTGAGAGCTAGGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATGCACCTTTTCCAAGGGTGGGTGAGAAGGGTTGAGAGCTAGGTT  300

seq1  CTCAGAAGCAAACACTTGAGGAGAACTTAGAAGTGCAAGATACTACATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAAGCAAACACTTGAGGAGAACTTAGAAGTGCAAGATACTACATTG  350

seq1  AAATCAATTCATGAGACTGTGGAAAGTAGTAAATGGCAGGGTTGTGCCGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAATTCATGAGACTGTGGAAAGTAGTAAATGGCAGGGTTGTGCCGA  400

seq1  GAAGAACCCCCAACATCAAAGCACATCTTACCTTGTTACAGAAATGGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAACCCCCAACATCAAAGCACATCTTACCTTGTTACAGAAATGGGAA  450

seq1  ACTTCACACCTAGGAAAACTTCCTAGACTGTGGCATAGAATTCCCATATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCACACCTAGGAAAACTTCCTAGACTGTGGCATAGAATTCCCATATG  500

seq1  CTTATTATTGCTTATTTTTTTTATTGCTATTGTCAGAAGATAATGACTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTATTGCTTATTTTTTTTATTGCTATTGTCAGAAGATAATGACTGC  550

seq1  ACTTACTCATGGGGTATCGTGTGATGCTTTAGCTGATTCATGACTGTATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACTCATGGGGTATCGTGTGATGCTTTAGCTGATTCATGACTGTATT  600

seq1  GGTGCACTTATATCTACCATCACCTCTAAATTGTTTATGGTTGTGGTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCACTTATATCTACCATCACCTCTAAATTGTTTATGGTTGTGGTGAG  650

seq1  GACATTTGAGATCCTGTAGTCTATTTGTTTTATATTATATAGTACAATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTTGAGATCCTGTAGTCTATTTGTTTTATATTATATAGTACAATGG  700

seq1  TGTTAATACAATCACAGTCTATGTTAGAACACAAGTTATTCCTTCTGTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATACAATCACAGTCTATGTTAGAACACAAGTTATTCCTTCTGTCT  750

seq1  GCCTTTGATTCAGAGTTCATTAACTAGTCTCCCCCTATCCAATATCTTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGATTCAGAGTTCATTAACTAGTCTCCCCCTATCCAATATCTTCT  800

seq1  CAATCATGTTCTCTACTTGGCCTCTAAAATCTGTGACTCTTCTCTCCTAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCATGTTCTCTACTTGGCCTCTAAAATCTGTGACTCTTCTCTCCTAT  850

seq1  GAGTTTCATAATTAAAGTCATGCTGTAGTTGTCTTTCTGTACCAAGTGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTCATAATTAAAGTCATGCTGTAGTTGTCTTTCTGTACCAAGTGTT  900

seq1  GGCGAATTTGGTGAGGAACTCTCAAACAAACCTTCACTATGTATGTAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGAATTTGGTGAGGAACTCTC-AACAAACCTTCACTATGTATGTAAAG  949

seq1  GTCATGTCATCTGTTGTGGGGAGCGGGTGTGGCGGCAGTCCCAAAGGCGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGTCATCTGTTGTGGGGAGCGGGTGTGGCGGCAGTCCCAAAGGCGC  999

seq1  CAGGGACTGCAGCTAAGTCATATGACTTGCACCTGACTTCCTCATATAAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGACTGCAGCTAAGTCATATGACTTGCACCTGACTTCCTCATATAAG  1049

seq1  ACACAAACATCTT--GAGTGCTGCGCAGGTGTACCAGG-ATACA-GGTG-  1095
      |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| 
seq2  ACACAAACATCTTTGGAGTGCTGCGCA-GTGTACCAGGAATACAGGGTGA  1098

seq1  AATCCAATTTGGTGGAGA--TTTGCCCC-TGCTGCCCTGATTAGCTGAA  1141
      ||| ||  ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||
seq2  AATTCA--TTGGTGGAGAATTTTGCCCCTTGCTG-CCTGA-TAGCTGAA  1143